BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-398L20.T7 (MSMg01no398_l20.b1) | MSMg01-398L20.TJ (MSMg01no398_l20.g1) |
ACC | AG498771 | AG498772 |
length | 738 | 728 |
length of high quality (start - end) | 514 (51 - 564) | 199 (326 - 524) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no398_l20.b1 PHD_FILE: MSMg01no398_l20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:11:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no398_l20.g1 PHD_FILE: MSMg01no398_l20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:11:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCGTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCAAGAATTTCCAACTGTGCAACCCACATTTTCTCTGTTAAT
GAAAATCTGAGGGAGATTACACACACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACCTAACAAGCTAATTTCTTTATATACTAAATTA
AGTCCTGTATTAAGTTCTTATATAGGCTTCTAATTTGTCCTATGGGTGTA
TAAACCCTATTCAACTGTGACTTATAAAAGTTATCTACACATAGATAGTT
TTTCCTTGGCCAGGAATGTTATCTGAATGGTACAGCCCTGGCCTAGTATG
CAAAAAGGCCCTTGGTTTGATGTTCTGTATCACACAGACAGACATAGACA
CACACATACACACAGAGAGACACTGAAACAAAGGAAAGAATAAAATAGCA
AAGAAAGAAAAGAAATAGAATTGGCTTGGAACATACTTCAGTTGGAAAAG
TACTTGTCCAAATGTAAAGAGTACTGTTTGTTCCCCAGCACCCACATCAG
GAGTCAGACAAGATGGTGGACATTGTGTTTCCAATGCTGGGAAATATAAA
CACCAGGATACTGGAGCTTCTATCGAAACTTTCTAGTCTAATCAGAGATT
CCGTTCACTGGACGAAACAAGGTGCTGTATCCCCCAAAAACAACACTTTT
TGTTTCCCACAAGAATACTGGCTCCCCTGGATGGAAAN
| CCCTACGATGCTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXTCCCAGCAAAATTCAGGGAAGTCACCCTAGAGCCCC
CCAAGGAGTCAACGGACCTCTTGTGACCCTGTTGCCCTGGTTGGGCCTCA
GCGTAATCCTATTGAGCATGAATTTTATGTCATCACCTTTCTTCATGGCA
TTGGGTTGTCATCATTGACCCAGTCCTAGACAGAATTCGGCTACCTCTAC
TTGGATATCACCTAACCTAATCCAACCACTTACCTTCCTTTCCAAAACTG
GCTCAGAGTAGGAATGGTTTTATGTAACTGGAGAGGGATTGCTGGGACGA
AATGTCTTCCAAGGAAGCAAGGGCTCCCTTTCTTGATACTTGGAAGAATG
TCTTCCCTAAGGAGGAAAGGGAAAGAAGTCAAGACGCTTGTTGACCCTTC
TTTAAATAAAGGTCAGAGGAGAGAGACATTTTTCTGGAGCTCTACTTGTA
CAACTTCATTGTGCAGAAACTGTCCTGGGGTTACCTCTTGTATTACTAAC
AGTCCAGCACACACAAGTCTTCCTGGCTACCATAGAGAAACATCAGTGGA
TCCACAAAGGAATCCCTGTCATTCCAATAAAGATTTACTGCTTCCTTCTT
TAGCTACCGACACATTCCCAGCGGACCTTAGCCCCTCCCTTTTTGTAGGG
AATCACCCCTCTAGTTGGAATTTGCCCA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 8 8 10 10 10 10 10 17 18 15 24 24 25 9 10 8 8 8 15 21 10 10 10 21 25 44 28 22 20 19 20 14 17 10 10 10 9 11 9 11 11 10 10 12 15 20
27 37 47 43 21 21 15 17 18 23 37 27 25 18 12 11 9 9 9 9 10 14 18 21 20 24 29 37 37 47 47 57 57 57 53 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 59 57 53 68 68
68 68 68 68 68 43 43 47 68 57 57 57 57 27 27 20 25 23 29 37 40 43 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 57 57 52 57 57 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 54 54 57 59
59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59
59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 50 50 48 48 42 47 47 34 30 15 15 12 13 13 26 15 18 22 25 28 41 48 50 44 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59
59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 57 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 59 46 43 43 44 44 57 59 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 48 47 47 47 47 48 48 48 54 54 54 48 48 48 54 57 48 54 48 43 43 43
43 43 43 43 48 48 59 59 48 59 59 59 57 57 57 57 48 48 59 59 50 50 47 47 44 41 43 37 34 39 39 41 47 47 59 47 47 47 34 34 31 34 36 44 44 44 43 43 41 41
41 43 43 39 39 35 35 35 39 39 48 47 43 57 50 53 53 44 41 37 23 23 23 34 34 32 28 31 31 30 28 25 25 34 41 59 47 47 41 32 29 29 32 37 39 41 37 37 35 31
21 25 12 12 12 24 24 28 28 31 22 28 15 16 12 12 16 19 22 27 19 20 17 17 10 10 8 15 11 11 11 9 9 8 8 8 13 13 16 14 12 12 10 12 12 9 9 9 10 9
8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 13 20 24 19 19 16 24 27 20 14 16 10 12 12 18 15 18 18 22 21 16 17 19 15 19 11 10 10 9 9 9 10 11 10 13 12 11 10 11 9
9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 14 12 13 11 11 16 10 9 9 10 9 9 9 12 15 15 9 9 9 12 12 9 9 9 10 8 8 13 15 9 9 9 9 9 13 10 16 15 14 8
8 8 8 8 10 11 9 9 9 9 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 13 15 10 3 0 | Open.Hide. 8 17 6 6 6 6 8 8 8 9 9 7 8 7 7 9 7 10 8 9 9 15 21 19 3 0 3 3 0 3 23 23 23 23 9 9 9 7 6 6 6 6 6 10 16 17 23 21 23 37
32 33 33 33 33 33 37 47 41 27 23 9 9 9 9 14 7 6 6 6 6 8 9 9 9 12 16 15 23 27 33 41 50 50 53 53 57 57 57 57 57 59 57 57 57 44 43 48 57 48
48 47 48 42 51 54 54 42 42 48 48 42 51 44 44 35 30 30 28 36 31 41 32 32 32 37 42 42 57 59 48 59 59 59 57 54 59 59 57 59 59 68 68 57 57 43 46 57 57 48
57 57 59 50 48 42 42 42 42 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 57 52 54 54 57 57 68 57 57 57 59 57 59 48 48 59 59 59 57 54 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 59 68 68 59 59 57 43 42
30 32 14 14 18 32 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 57 57 59 57 57 57
59 57 43 59 39 59 59 59 59 59 59 47 27 27 18 11 11 11 8 8 7 7 7 7 9 18 16 30 31 41 47 50 50 50 59 53 53 50 44 44 42 43 37 43 43 59 57 57 57 57
57 57 57 57 54 54 47 44 39 43 43 39 46 44 57 48 48 48 57 47 57 57 44 44 36 40 46 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 54
57 57 44 59 48 48 43 44 44 57 57 59 59 43 43 35 43 26 24 13 18 24 44 44 59 59 57 57 48 48 48 48 50 57 57 59 59 59 57 43 43 46 57 44 46 40 44 44 48 47
44 44 28 23 27 44 41 57 54 48 57 47 37 37 35 47 47 57 47 43 43 47 47 43 46 46 43 43 43 57 59 59 59 59 59 57 57 47 47 35 39 43 43 48 48 39 43 39 48 48
48 48 48 48 37 37 36 36 36 37 39 37 25 25 15 15 17 27 39 37 29 24 20 17 18 18 12 12 12 10 16 13 13 21 24 26 30 28 30 24 30 30 30 30 30 30 30 28 28 24
24 20 24 20 28 20 28 28 32 30 24 22 22 22 20 27 30 14 18 23 30 24 22 28 22 22 24 21 24 24 24 25 28 20 32 23 24 17 20 15 23 19 16 10 10 9 9 6 6 6
6 8 8 10 11 15 15 21 16 14 15 10 8 8 8 8 15 8 11 9 9 10 13 12 9 9 9 8 8 8 9 10 10 10 10 16 13 21 28 28 21 21 16 11 8 10 8 8 8 8
8 6 6 6 8 11 8 8 8 8 10 8 9 9 10 9 8 9 9 9 9 9 9 10 12 13 13 13 15 10 9 9 8 8 8 6 8 8 8 8 10 10 25 19 10 9 8 8 8 8
9 9 9 14 12 10 9 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 10 16 11 14 14 13 12 10 |