BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-437K08.T7 (MSMg01no437_k08.b1) | MSMg01-437K08.TJ (MSMg01no437_k08.g1) |
ACC | AG528429 | AG528430 |
length | 753 | 765 |
length of high quality (start - end) | 345 (73 - 417) | 455 (80 - 534) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no437_k08.b1 PHD_FILE: MSMg01no437_k08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:03:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no437_k08.g1 PHD_FILE: MSMg01no437_k08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:03:06 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGTTTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCCAAACATTATTCCATGGCAAAAGCTGCTGGCAAAAGCACACT
CCTTCCTAGCTCATACAATGAATCATAATCAGCTGCTGTGGACAATCAGA
AGCAGCCCAATATCCCACACCTGGGATGAAAATGAAAACATTCTTATAAC
ATTTCTGTGTTTTTTAAAGAAACCAAATTTCTCACTACAAATGCTACTAA
AGTCAGATTTTGAAACTCTCTTCACCAAGTTCCATGTATTATATGTTACA
ATCCCCATGGAGGTAATAGAGCTTTTATATTTCAATGATAAGTACTTGGG
TTATTGAGATGTACATACTCTAGAAGACTAAAGGACTGTATTTGACATAT
TTCTTCTTTGCAGAAAAAAGCCCTTCTTTTAGTAAAAATTATTATAAATG
AAGTACATTAGTAATGAAATTCCTCAGAAGAAAGGAAGAATTCAGAGGCA
TATATCTCTGAAGATAAAAATATACTCCAAGAACAGAATTTACACACCAT
TGAAATATTTTGATCAACATTTTACAAAGTAGATGTTATAGTACATGGCA
TGTAGGACACACTGGCAATGGAGATACTCATGCTAGTAATATAATCCCCA
TATGTTTCAGAGGATGGCGACAATTCTTAATTATTTTATATTTTACAGCA
TTTACAACTTGAATATTATGATGTCTTATCTTATGTCAATTATGTCCCTT
TTN
| NCACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATG
GCTGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAAT
GCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACTTCACTCCAGTCAGAATGGCTA
ACATCAAAAACTCAGGTGACAGAAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGG
GGAACACCTCCCTTGTTGGTGGGATTTCAAGCTTGTACAACCACTCTGGA
AATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGAACATAGTACTACCGGAGGAT
CCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTCCCATCCGGTAA
GAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCA
GAAGCTGGAAAGAATCCAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAA
ATGTGGTACATTTACACAGTGGAATACTACTCAGCTATTAAAAAATGAAT
TTATGAAATTCCTAGGCAAATGGATGGTACTGGAGGGCATCATCCTGAGT
GAGGCAACCCACATTCCCAAGGAACTCGCACCATAAGTACTTCCCTGATA
AGCCCTGATATTATCCCATAACTTTACGGAATTTTCGGATATTAAAAATC
TCTCTGCTAAAAGCTCTTGAATTTTCTAACATGAATACTTCTTTCGTTGC
ACACTCTTACCCCTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 7 7 7 11 13 12 16 15 26 26 31 31 22 20 12 15 9 9 9 17 17 37 37 44 30 28 26 25 22 21 21 9 9 9 11 11 11 11 11 10 11 12 22 24 28 47
43 39 36 36 36 36 31 31 22 22 22 30 30 21 21 8 8 6 6 7 10 10 21 22 29 36 39 41 41 59 50 53 50 57 57 57 50 48 48 48 48 48 57 57 57 50 50 43 43 47
68 68 68 68 68 68 68 68 68 47 50 50 50 50 51 54 68 68 68 68 68 53 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 57 57 57 57 44
44 42 43 44 44 50 43 57 44 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 43 35 22 35 35 48 48 50 68 68 68 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57
57 68 57 57 57 57 52 57 57 54 54 57 57 59 59 59 57 57 52 52 54 54 57 54 54 54 54 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 47 50 50 43 43 43 57 57 59 59 59 54 57
57 57 57 48 48 48 46 57 43 47 44 44 43 43 46 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 42 42 42 42
48 48 59 59 48 48 43 43 43 43 43 39 37 39 39 33 37 37 43 43 41 41 47 30 27 16 15 10 10 10 10 15 18 18 30 37 37 43 43 43 47 39 41 43 43 43 37 37 23 23
23 37 37 59 39 39 35 39 39 59 48 59 59 47 47 39 43 43 43 32 30 18 18 18 19 24 30 42 44 43 43 43 43 43 46 48 46 43 43 57 43 43 43 33 33 42 42 43 46 46
48 48 59 59 59 48 48 47 59 41 30 21 13 13 15 21 24 28 19 12 10 11 10 10 11 25 25 37 34 34 28 33 30 28 32 32 37 37 37 37 43 59 59 59 57 57 47 47 43 42
39 30 39 42 47 59 37 27 25 12 12 15 24 21 28 28 30 28 32 32 43 44 48 32 28 15 14 14 15 23 28 32 28 39 30 33 28 25 28 34 36 30 26 21 14 14 21 28 32 32
32 37 21 15 8 8 8 19 19 39 32 22 24 19 24 24 23 28 32 43 43 43 43 34 41 24 24 19 26 23 28 28 31 32 18 15 13 21 21 33 25 28 12 12 12 10 10 10 10 15
15 30 19 23 23 32 37 33 39 39 36 36 37 39 30 28 25 28 28 31 31 31 25 29 17 17 17 22 20 21 12 11 11 22 18 24 16 16 16 12 12 18 21 21 18 18 14 14 14 21
15 20 18 9 9 9 10 10 10 13 15 13 13 13 26 18 17 14 15 12 11 9 9 9 9 8 8 10 10 10 10 11 11 8 8 8 9 10 10 10 11 15 12 18 18 19 13 8 8 8
8 13 20 24 15 12 11 11 11 11 11 20 10 10 10 12 10 11 11 21 16 15 12 16 12 15 15 11 10 10 10 10 10 21 12 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 12 11 11 11 17
19 18 19 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 24 8 8 8 8 8 13 11 15 11 10 8 8 10 15 16 13 15 8 8 8 7 12 8 8 8 8 10 10 11 12 18 16
11 3 0 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 10 13 10 8 8 7 8 7 8 9 9 18 19 37 41 39 35 39 37 37 37 37 39 36 34 39 35 34 29 19 12 9 9 9 9 9 10 10 12 12 28 25 37 37 37
41 36 36 36 36 36 36 47 59 59 59 50 34 27 17 10 12 10 10 11 15 17 25 16 28 24 24 31 35 47 47 47 47 36 42 50 50 50 37 42 40 40 42 42 57 50 50 50 50 57
68 57 57 57 57 57 57 50 68 68 68 68 51 68 68 68 68 68 53 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 68 57 68 68 68 68 50 50 50 50 57 68 68 68 50 50 50 50
50 50 50 48 46 46 46 46 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 68 68 62 62 62
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 43 35 35 35 35 34 38 38 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 41 59 57 59 59 59
59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 43 43 35 43 43 43 43 57 57 57 57 59 59 59 68 57 59 54 57 52 52 52 52 43 43 37 43 43
43 43 43 50 50 57 50 50 47 44 43 43 43 37 32 32 27 20 20 27 32 42 46 46 57 37 32 20 20 20 28 24 28 23 36 36 44 57 47 48 48 48 44 44 23 23 23 28 36 37
37 39 37 32 32 32 30 32 32 32 36 42 37 37 30 30 24 32 24 32 33 36 20 24 15 19 19 29 32 30 23 12 11 11 11 12 17 19 25 12 17 17 18 20 28 30 19 20 20 23
28 25 28 31 31 20 20 17 17 13 22 19 19 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 12 23 11 9 10 10 10 11 10 12 19 12 12 12 12 11 10 17 10 10 10 10 10 16 12 12 12
12 8 8 6 6 6 7 15 23 10 7 6 6 6 6 6 6 6 10 13 10 8 8 8 8 10 8 15 13 15 12 15 15 14 11 12 10 10 9 17 14 15 15 14 16 19 13 13 12 12
11 12 11 15 10 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 13 12 9 9 9 9 10 12 12 10 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 11 15 13 11 10 8 8 8 8 8
10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 12 12 12 10 10 10 10 11 11 9 9
9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 |