BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-459C06.T7 (MSMg01no459_c06.b1) | MSMg01-459C06.TJ (MSMg01no459_c06.g1) |
ACC | AG544805 | AG544806 |
length | 748 | 819 |
length of high quality (start - end) | 504 (47 - 550) | 164 (70 - 233) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no459_c06.b1 PHD_FILE: MSMg01no459_c06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:31:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no459_c06.g1 PHD_FILE: MSMg01no459_c06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:31:56 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCCTGGTTATCGTGGTCATTTTACTTAAGCCTTCCAAATAGTTGAA
TGTTGCTGTACCCAGTGTTCTAATTGTGATTTTAATTTGGACCTTTCCTA
TAAATAGTATTATTGAGTCTCTACATAGTTTAACAGGTTTTTTAAAATAT
CATTTATTGTGAGTTTACTGTTAAAATTAAAAGATCTATTTAAAGATGTT
ATTGATACTACCCTTCATGGAAAAATATTTAAAACCCTCAATAAAGATAT
TTTTTTGAAGCAAATTATTAACAACAGTGCAAAAAAATCATGACTGAGTA
GAATTTTTTCAAGGTATGGCTTTTTCAAGGCTGGACCAATATTCAGAGAT
CAATCAATACTATCGGTCACACCCACAGACTGAAGAAGAAAAATTACAAG
ATCATATTATCAAATGCAGAAAGAATACTATGAACCACCATCATTCACAA
TAAAAACTTGGAGCAGCTGGAGCTCAGGGGAATGTCACGTGTATAACACG
TCACGCGTATTGCATTTATGAAGCCCTGGCTTAGGTCCAACTCACCCTGT
GGGCTAAAACAAACTTAATACTCCCAGCAGATTATGAATAGAGGAAACCC
CCCACTTTGATGATAATGTCCAAAAACTTTTTGGTGGTTTGGCTGAACCC
CACGGGCCCGGTAATTGGCAATGTCGGCTTCCCACTTTTGTTAAGAAA
| CAATGCATTTGGAGGCCTGGNGGCCGCCTGTTCTAACCAATTTAGGTGAA
CTATAGAATTTTCCGAGGAATTCAGTACTCATTCATGTGCAAGCAAAAAA
ATAAATAAATAAACCTTTTCTATCCAAGGTTGAAAACAATACAAACTTCT
TCCCTGTGTTCAGGATTCCTGCTGCAAGGAACTTCTGGTATGCATGCCTG
TGATAATTTGTGACATTCTATGTCAGGTACNAATCATCGTGTAAAACTCT
TGTGCTGTAATGAGCAGGTTCATGAATTTCAAAGAACCAAGAGAAACAAA
CCAAAACACTTTCCCAGAAGATTTTTTTTTTGTAAGTCCTGACCCACCAA
ATTTGAAAAAAGAAGTAAAATTTTTTACTAAAACGAATTTCCACGGACCT
TTTTTATTAAAAAAAACCCCCTCGATCACTTTTATTATTAAATAAAAAAA
TCTCTTACAAAATAACTTTTCCTTATAAAATCTAAAACCCCCCTTCCTCC
CCCCNNTNNNNNNNAAGACAAAAATTTTTTCCGCATCTTTGCTCTTTACA
AAAAAAAGTTGGTATAAAACACCTATCCCCCATCTTCTCCTTAACTACAT
TTTTTTTAAAACAATTTCTATAAATGACAACCCCAACACCAATACTCCCC
TCCTACCCAATTCCGTTGCTCTCTCATTCCCCCTTCCCATTTCTTCATCT
TTTTTGTGTCTTTCTCTATTCCCCCCCTCTAAACTACCTCTTTACCTATA
TCCTTACTCTTTTCCTCCCTTTCCCTTCCTTTCTCTTTTTATTTTCCCCC
CTCTTTTCTCCTCTTCTTC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 18 18 30 30 30 30 25 23 23 30 37 33 33 33 37 39 44 42 47 31 30 21 19 9 9 8 10 9 9 8 8 15 22 28 29 29 31 28 28 35 59 59 59
41 41 37 37 37 37 34 27 14 10 10 9 9 9 9 9 12 23 27 37 37 37 37 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 43 47 42 57 57 68 68 68 48 47 43
43 43 43 48 54 59 57 57 68 68 68 53 50 48 48 48 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 59 59 68 68 68 57 57
57 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 59 59 52 52 52 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 33 22 8 8 8 8 10 16 43 43 43 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 52
52 59 59 59 68 68 68 57 57 52 52 52 57 43 57 39 57 43 52 52 59 59 59 57 57 52 52 43 57 57 43 35 43 43 52 57 52 43 43 57 59 44 44 32 28 28 43 44 57 57
57 57 57 52 52 43 43 52 59 59 57 57 57 57 48 48 48 50 57 48 48 47 50 43 43 43 43 35 42 42 59 44 42 35 35 33 31 31 42 35 35 35 47 59 41 34 20 20 20 32
34 42 35 35 35 42 42 57 57 48 43 40 40 43 44 32 19 17 17 24 30 39 46 42 43 40 43 43 43 48 43 37 30 32 23 23 28 28 30 30 39 32 35 35 39 33 36 39 37 37
37 40 39 39 39 39 37 34 34 24 24 28 32 23 23 23 23 28 34 37 36 39 47 28 32 20 28 28 28 25 28 34 27 22 22 20 20 17 26 17 16 16 26 29 28 30 30 28 26 19
19 16 13 8 8 8 8 13 10 31 31 23 23 24 19 19 15 14 14 18 13 12 12 12 11 13 12 11 11 17 12 18 9 9 9 9 9 9 12 18 21 24 15 12 12 11 10 10 10 10
10 13 15 18 16 16 26 26 28 23 19 15 13 15 10 9 9 9 9 10 12 12 12 12 8 10 8 8 8 10 11 12 18 11 11 12 18 18 22 11 11 11 10 10 10 12 11 21 17 11
10 12 9 9 9 16 11 17 19 28 16 16 11 12 15 14 15 10 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 9 8 8 10 8 9 12 9 9 9 9 11 8 10 10 8 8 9 12 16 19 15
8 8 8 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 7 7 7 6 6 9 11 11 11 13 12 17 9 9 9 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 12 12 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 6 9 10 11 8 8 8 8 8 21 20 21 23 3 0 3 21 16 25 23 23 19 9 9 9 11 8 8 8 8 6 6 6 8 15 17 25 21 30 27 23 12 12 11
26 25 42 25 25 8 8 8 8 8 6 7 7 10 8 10 11 9 9 19 22 25 28 37 37 41 50 53 47 53 53 47 47 42 42 42 47 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 59 48 48
57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 42 37 43 43 43 44 48 48 57 43 43 43 42 42 47 47 48 50 48 54 54 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 59 59 57 57 59 48 48 48 57 57 48 48 50 50 68 68 57 57 59 57 57 57 57 46 57 54 54 54 54 48 57 54
43 43 43 43 47 53 53 50 47 57 42 42 43 43 43 43 43 59 59 59 48 48 41 40 40 39 41 27 14 3 0 3 10 8 8 8 8 6 6 15 8 9 9 9 9 6 8 8 19 15
30 28 25 25 18 14 9 11 11 19 23 32 28 28 23 26 26 34 37 43 47 48 48 48 48 48 48 41 30 24 17 17 27 24 32 28 21 12 12 11 11 12 12 14 29 29 32 39 39 46
36 36 25 28 22 22 16 22 13 17 24 37 36 43 39 23 20 9 9 9 9 12 12 25 25 22 18 11 9 9 11 11 11 12 11 11 9 9 10 15 16 19 21 17 11 9 9 9 9 9
9 10 13 15 10 13 13 13 10 12 11 9 9 10 11 11 11 10 10 10 10 15 19 19 9 9 9 9 10 10 11 13 8 8 8 8 8 10 16 10 11 8 10 8 8 8 9 10 10 10
10 8 9 9 9 8 8 10 11 16 27 21 18 10 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 10 15 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 19 20 21 10 9
8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 8 10 8 8 8 8 13 12 8 8 6 6 8 6 7 9 9 9 15 22 28 27 22 9 8 8 8 8 8 10 10
15 10 21 3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 9 9 10 12 12 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 10 13 14 12 10 9
9 10 10 13 10 10 9 8 8 6 7 8 8 9 9 12 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 12 10 10 10 10 10 9 9 9 12 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 10
12 11 9 10 10 11 13 12 10 15 11 11 8 8 8 8 11 13 10 15 8 10 8 8 8 9 11 10 10 10 11 9 12 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 12 10 10 10
10 8 6 6 6 8 8 8 9 10 11 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 23 28 26 26 17 15 15 8 8 8 8 8 10 18 16 10 8 8 8 8 8 8
9 12 15 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 12 12 14 14 13 12 9 9 9 9 9 9 11 11 9 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 12 12 13 7 9 9 10 15 10 13 9 8 8 8 8 8 8 11 11 13 15 15 21 14 13 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 12 7 8 6 6 8 8 18 15 10 10 10 9
9 9 10 11 12 13 12 10 10 13 11 15 11 9 14 10 16 16 13 |