BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-488I09.T7 (MSMg01no488_i09.b1) | MSMg01-488I09.TJ (MSMg01no488_i09.g1) |
ACC | AG567226 | AG567227 |
length | 674 | 730 |
length of high quality (start - end) | 570 (59 - 628) | 272 (74 - 345) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_i09.b1 PHD_FILE: MSMg01no488_i09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:11:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_i09.g1 PHD_FILE: MSMg01no488_i09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:11:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | AACACTGACTGGAGCTGATGTGNGNGAANNCNCCAGGTACGGTACCGAGA
GTTTNAANGCAGTTGTGTCTTCTTACCCAGGAAAATACTACATACAACTT
GCAAAGCACAGACAATTAACAAGAGTTTTGAAGACAATACTGTCTCACTT
GATTTTCACTCAATTTTTCACCCAAGTCTTTCTATGTCTGCTCTTAATAA
AGCCCTGAAAACCACTGAGGAAGTGGTTCTTCAAATCATCTTGCTTTGCC
AGGTTGGTATTGCAGCTGTGGCCAACATTCTTCTGCTTGTCCANATTTTA
TCTCCTAACTTTGCTGGCCCTCAACTGAGACCAAAACATGTCATTCTTGC
CCACATTACTGTGGGCAATCTCTTGATTATCCTCCTCACTGGGTTTCCAA
GCAATATGACAGTTTTTGTTCCAAGGAATACTCTAAATGACCTCAACTGT
AAGCTTGAGTACTTCATTCGCCTGGTGGCTCGAAGTGCAAACATGTGTAC
TACTTGTATCCTGAGCACTTACCAGTTTATCGTTCTTGTTCTTGGTAAAT
GGAGTAGAGTGATACTCAGAGGAAATACCTCCACATTTGTGCACTATTCT
TGTAATAGTTGTTGGATTATCAGTGTCGTAAATAATGTCTACATCCCTAT
AAAAATCAGTGGCCCATGGAACAT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTACAAAAAAAAAGCCCTGGGCTCCAGGTTAGTTGAGACTC
CTGGTTTTTCTACAAGATCACCTTCCCCTTCATCTTCTTCATTCCTTCCC
CAAATCCAACCACAGGAGTCAATGACTTTAGTGCAATGACTGGGTGTAAG
TATCTGCATCAGTATCAGGTGCTGCTAGAGCCTCTCAGAGGACAGCCATG
ATAGACTCCGGTCTTCAGTCTCTTCCCATTTTTGTCTGTGCAGNTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACAG
GAACATTCCACCTGGGGTATGCTGCCTGGTTTGGGGTTCAATGTCTGAAA
AATCTCAGGGGCCCGGGCTAGTTGAAACTGATTGGCATCCTATGGAAACA
CCCTCCTTCTCAGCTTCTTCAAGTCTTTCCCTAATTCAACCACGGGGGTC
CCCCACTTCGGTCCATTGGTTGAATAAAGTCATCTGCATGAATCTCAACC
TGCTATTTTTTGAACCTTTCAAAAGAAAACAATGGTAGGCTTTTGTTTGC
AAGCACACCTTAACTTCAATAATAATGTCAGGCCTTGGACCCTCCCTTTT
AAATGGATCCCAAGTTGGGGAAGACACTGTATCTCCTTTCCTTCAGGCTT
TATATCCACATTTCCCCTGTAGAACTAATG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 8 6 7 7 7 7 7 7 7 7 8 6 6 8 7 7 9 9 3 0 3 0 3 17 3 0 0 3 0 3 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 6 8 8 8 8 8 12
10 11 11 3 0 3 3 0 3 25 25 39 41 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 50 40 40 40 57 47 47 57 57 57 43 27 19 10 10 10 10 13 15 11 12 12 16
21 34 44 68 68 57 57 54 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
59 59 59 59 57 57 57 57 53 53 57 57 57 57 50 48 53 48 50 50 50 37 34 26 15 8 8 8 8 13 21 30 47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 27 16 11 9 3 0 3 6 7 7 12 11
12 30 30 47 47 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 50 50 50 50 57 57 59 59 68 43 35 32 26 33 30 30 30 30 30 37 44 47 54 54 54 59 59 59 54 54 57
59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 50 48 48 57 57 57 57 57 57 54
54 54 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
59 59 68 59 59 59 59 57 59 59 68 59 59 68 68 68 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 68 68 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 38 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 54 57 57 68
68 68 68 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 44 37 23 23 36 38 46 57 57 57 57 57 57 57 50 50 47 47 47 47 47 46 59 48 48 43 46 43 48 48 57 57 57 57 43
43 36 43 43 43 43 48 48 43 43 30 35 35 25 27 19 23 23 34 29 37 22 22 15 23 24 25 25 21 19 14 25 24 22 18 25 21 28 28 37 33 30 30 37 37 43 41 41 41 41
37 37 41 41 41 37 37 30 30 33 30 35 35 35 34 34 28 22 22 26 14 13 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 10 11 11 9 8 10 15 8 8 8 8 10 23 30 22 22 22 33 33 50 42 41 44 27 25 9 9 9 9 12 9 9 9 9 10 10 8 8 8 10 10 10 21 21 33 37 37
39 37 37 59 27 27 9 9 9 9 9 9 9 8 8 9 10 10 10 9 8 8 11 11 19 23 34 43 59 50 48 41 47 47 39 47 47 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 44 43 48
48 47 59 43 48 48 57 46 54 54 33 32 22 16 15 15 21 24 16 20 20 36 44 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 50 44 44 43 50 43 50 50 50 50 50 57 59 57 57 54 54 54 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 48 48 48 57 57 57 59 59 59 68 57 57 68 57 57 57 57 57 47 47 48 59 59 59 59 36 44 23 36 36 57 48 34 29 17 15 18 12 18
16 18 18 20 59 59 68 68 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 47 47 47 59 27 27 3 0 3 27 27 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 44 19 12 9 9 9 9 41 41 41 44 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 20 20 15 23 12 17 17 22
21 31 18 18 12 12 11 15 12 11 11 11 19 21 26 26 24 24 17 24 24 32 32 35 35 35 32 32 32 32 32 42 34 33 33 42 37 26 24 13 13 12 15 15 15 18 18 27 41 38
44 28 20 17 15 15 20 21 24 34 12 12 11 12 12 16 16 30 30 14 12 12 19 19 18 27 14 14 14 21 16 15 18 13 14 14 18 20 28 32 33 29 29 29 36 32 23 23 20 24
19 31 28 28 31 28 24 17 17 12 24 12 14 12 32 24 24 24 24 24 24 15 12 13 13 13 34 30 39 39 35 35 35 32 28 28 28 28 24 26 17 17 17 29 29 41 41 23 17 17
12 12 11 16 12 18 18 28 18 23 18 15 15 13 13 14 24 28 32 32 30 24 24 12 12 11 16 10 9 9 9 10 11 13 19 15 18 13 13 13 18 13 13 13 15 15 16 11 11 11
15 13 13 13 13 15 15 41 41 39 32 24 20 17 17 19 24 28 22 23 19 24 15 13 13 13 16 16 11 11 12 21 21 12 12 12 23 23 20 15 15 21 18 18 21 14 15 15 12 12
15 21 21 11 15 12 15 13 11 11 11 11 11 11 11 16 12 12 11 11 11 11 11 11 11 12 15 15 14 14 15 14 14 14 21 18 12 12 11 11 11 12 10 10 10 10 10 18 17 17
15 15 13 15 10 12 9 9 8 9 13 16 16 13 14 17 24 27 17 17 12 13 9 9 9 13 10 10 9 9 9 13 10 12 14 26 30 34 20 19 15 15 12 20 12 11 12 12 18 12
9 9 9 9 9 12 9 8 8 8 8 15 16 13 11 9 6 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 7 7 |