BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-001O07
Chromosome8 (Build37)
Map Location 10,361,532 - 10,487,843
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMyo16
Upstream geneTmem28, Lig4, Abhd13, Tnfsf13b
Downstream geneLOC100040008, LOC384782, LOC100040507, LOC665306, Irs2, Col4a1, Col4a2, Rab20
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-001O07.bB6Ng01-001O07.g
ACCDH840084DH840085
length1,1731,112
definitionDH840084|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001O07, 5' end.DH840085|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-001O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(10,486,669 - 10,487,843)(10,361,532 - 10,362,647)
sequence
gaattcaatcaagtgggcagagagatctaaacaaaagatcgaaagaagca
acagccaggagctacgagctgcagacactgcatttaactgccatgaacat
cctcagctcttgtcacacacaggactagaatgggttcctctgggcactga
catcactgcactagcttcaaggggagtcctgggtttcacgtacagattct
ctactcagatatgggctctcttcattttccttccctgttaccatcacctc
attggtgaggtgcctcagaacaggtgcacacatagacaataggctgaatg
ctgatcccttgtctactgcctttgtaggtcaacatgttaaggccaagcca
aattgataattacattattatgcaatgttcctgagctggagaatgacatt
tccatgtggttgaagtgtcaaaagtcaaaagttcctctataaagctcccc
acagtgacagcttagcgtgtaagaacatcccaccttggacctgggaagac
taacatgtgcggctgtcacagtccatgttacatttttgcatgtgtacaag
tctgtctgtactgtatttaatatacgtgtgtgtgtgtgtgtgtattttgt
atcttcattactctcaacttaatgatctaattttgtgcccgtctttcaga
gtcatcactcctttaatgtcttgggaaaaagctgtagtcaatggtaatat
gaaaaaagctagatacatgcgagtcagacctcaccccaggaagatcaact
caaaaaccatcaagaagctgagacaggccctttgctccctgctggttggg
atgtaaattaggaaaagcagtataaaatcaagatggagagtcccttcaaa
agcaaaaattagaatcgccctatattgtgtccatcccattgttgtgtgta
tatttctaaatagaataaaaacattatgccaaaaaagattcctgtactct
ctcatatttatcatggtaccatatgcaatagctattgccttgagtcgact
ttgactatcagagacttaacgatacagaaaaaaagttaatcaaggctgtc
tgaagatctgtgttgcagaaaccccactgtgacaccagaaaaccgtcaaa
agaaaaggagcaatggtaggaaatcaagaaggaatgagtgccacgaatgg
tcacaagcattctgtatttaagg
gaattctccgtgacatttaaagtagaagcaccatgagaagaaagcctaga
tcagagagaaggctggcgtaaagaaatggggctgagccccctgtgtcact
caccaggacattaatgacatagccccagcatgatccagtgagtcagctca
gtgaggggggatgggagccactgccacacctggtagtaaagcttagaagg
gcaaatcccacccctcctcttttttgaagattacttgtaaataactactc
ctactccagcagtaaagccccttcaaggatttgctgaccagagacaatgt
tatggagtctttggagcctctgggggctgatggtgctcctttgtcttctt
tggagacgtgcttagctcactcccaacatgctttgcgtcctccagctcat
ttgtctcaaaggtttattttgaggatggcatagaataataattagtgctt
agcagccctgatttcttaacaagaactagtctcattaatttagaaagcaa
ggtaggagtggttgtccctgaggtgaaggctaccaaggcaagtttggggc
agaagcaagcttggggaggcatgaagcatcttgaactgcccactcagagt
ctgtgcaacacaggggtcaatgctcctcctcaagaccctccagactcccg
aggaggaggaggaggactcccttgctggatacaagaaccctgggctgtga
ctctctagagcaaagttaactgggtctaccaggaacaaaaccccaggtga
tgtgagtttcccagtgggcagttcagggctcagacctttgaagtgcttcc
caggcaggacagagttctgagtttgtataaaaactgtggaggagcctgag
gttaaaaaaagtgactcgaggactctttatgtggcatgttcttatcaccg
atagtattttggctagagtgaaaggcagctcaatgaaatggcttgtgctg
gcttgtgacctcaagcgatgagccccactattggttgtccaatgcagagt
gttcagccttgaaaccatatacacacagacatcagaaacagactcagcag
ttttgttggttttgtaatacatatatacacattattgtaggtcatacata
ctactttatata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_10486669_10487843
seq2: B6Ng01-001O07.b_46_1218 (reverse)

seq1  CCTTAAATACAGAAATGCTTGTGACCATTCTGTGCATCCATTCC-TCTTG  49
      |||||||||||| |||||||||||||||||   |||  |||||| |||||
seq2  CCTTAAATACAG-AATGCTTGTGACCATTCGTGGCACTCATTCCTTCTTG  49

seq1  ATTTCCCTAACATTGCTCCCTTTCCTCTGGACGGTTTTCTGTGGTCACAG  99
      |||| |||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||  |||||||
seq2  ATTT-CCTACCATTGCT-CCTTTTCTTTTGACGGTTTTCTGGTGTCACAG  97

seq1  TGGGGTTTCTGC-ACACAGATCTTCAGACAGCCTAGATTAACCTGTATTT  148
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || | |||
seq2  TGGGGTTTCTGCAACACAGATCTTCAGACAGCCTTGATTAA-CTTTTTTT  146

seq1  CTGTATCGTTAGGTCTCTGATAGTCAAAGTCGACTCAAGGCAATAGCTAT  198
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTATCGTTAAGTCTCTGATAGTCAAAGTCGACTCAAGGCAATAGCTAT  196

seq1  TGCATATGGTACCATGATAAATATGAGAGAGTACAGGAATCTTTTTTGGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATATGGTACCATGATAAATATGAGAGAGTACAGGAATCTTTTTTGGC  246

seq1  ATAATGTTTTTATTCTATTTAGAAATATACACACAACAATGGGATGGACA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTTTTTATTCTATTTAGAAATATACACACAACAATGGGATGGACA  296

seq1  CAATATAGGGCGATTCTAATTTTTGCTTTTGAAGGGACTCTCCATCTTGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATAGGGCGATTCTAATTTTTGCTTTTGAAGGGACTCTCCATCTTGA  346

seq1  TTTTATACTGCTTTTCCTAATTTACATCCCAACCAGCAGGGAGCAAAGGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATACTGCTTTTCCTAATTTACATCCCAACCAGCAGGGAGCAAAGGG  396

seq1  CCTGTCTCAGCTTCTTGATGGTTTTTGAGTTGATCTTCCTGGGGTGAGGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCTCAGCTTCTTGATGGTTTTTGAGTTGATCTTCCTGGGGTGAGGT  446

seq1  CTGACTCGCATGTATCTAGCTTTTTTCATATTACCATTGACTACAGCTTT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTCGCATGTATCTAGCTTTTTTCATATTACCATTGACTACAGCTTT  496

seq1  TTCCCAAGACATTAAAGGAGTGATGACTCTGAAAGACGGGCACAAAATTA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCAAGACATTAAAGGAGTGATGACTCTGAAAGACGGGCACAAAATTA  546

seq1  GATCATTAAGTTGAGAGTAATGAAGATACAAAATACACACACACACACAC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATTAAGTTGAGAGTAATGAAGATACAAAATACACACACACACACAC  596

seq1  ACGTATATTAAATACAGTACAGACAGACTTGTACACATGCAAAAATGTAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTATATTAAATACAGTACAGACAGACTTGTACACATGCAAAAATGTAA  646

seq1  CATGGACTGTGACAGCCGCACATGTTAGTCTTCCCAGGTCCAAGGTGGGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACTGTGACAGCCGCACATGTTAGTCTTCCCAGGTCCAAGGTGGGA  696

seq1  TGTTCTTACACGCTAAGCTGTCACTGTGGGGAGCTTTATAGAGGAACTTT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTACACGCTAAGCTGTCACTGTGGGGAGCTTTATAGAGGAACTTT  746

seq1  TGACTTTTGACACTTCAACCACATGGAAATGTCATTCTCCAGCTCAGGAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTTTGACACTTCAACCACATGGAAATGTCATTCTCCAGCTCAGGAA  796

seq1  CATTGCATAATAATGTAATTATCAATTTGGCTTGGCCTTAACATGTTGAC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCATAATAATGTAATTATCAATTTGGCTTGGCCTTAACATGTTGAC  846

seq1  CTACAAAGGCAGTAGACAAGGGATCAGCATTCAGCCTATTGTCTATGTGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAAAGGCAGTAGACAAGGGATCAGCATTCAGCCTATTGTCTATGTGT  896

seq1  GCACCTGTTCTGAGGCACCTCACCAATGAGGTGATGGTAACAGGGAAGGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTGTTCTGAGGCACCTCACCAATGAGGTGATGGTAACAGGGAAGGA  946

seq1  AAATGAAGAGAGCCCATATCTGAGTAGAGAATCTGTACGTGAAACCCAGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAGAGAGCCCATATCTGAGTAGAGAATCTGTACGTGAAACCCAGG  996

seq1  ACTCCCCTTGAAGCTAGTGCAGTGATGTCAGTGCCCAGAGGAACCCATTC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCCTTGAAGCTAGTGCAGTGATGTCAGTGCCCAGAGGAACCCATTC  1046

seq1  TAGTCCTGTGTGTGACAAGAGCTGAGGATGTTCATGGCAGTTAAATGCAG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCTGTGTGTGACAAGAGCTGAGGATGTTCATGGCAGTTAAATGCAG  1096

seq1  TGTCTGCAGCTCGTAGCTCCTGGCTGTTGCTTCTTTCGATCTTTTGTTTA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCAGCTCGTAGCTCCTGGCTGTTGCTTCTTTCGATCTTTTGTTTA  1146

seq1  GATCTCTCTGCCCACTTGATTGAATTC  1175
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTCTGCCCACTTGATTGAATTC  1173

seq1: chr8_10361532_10362647
seq2: B6Ng01-001O07.g_67_1178

seq1  GAATTCTCCGTGACATTTAAAGTAGAAGCACCATGAGAAGAAAGCCTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCGTGACATTTAAAGTAGAAGCACCATGAGAAGAAAGCCTAGA  50

seq1  TCAGAGAGAAGGCTGGCGTAAAGAAATGGGGCTGAGCCCCCTGTGTCACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGAGAAGGCTGGCGTAAAGAAATGGGGCTGAGCCCCCTGTGTCACT  100

seq1  CACCAGGACATTAATGACATAGCCCCAGCATGATCCAGTGAGTCAGCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGGACATTAATGACATAGCCCCAGCATGATCCAGTGAGTCAGCTCA  150

seq1  GTGAGGGGGGATGGGAGCCACTGCCACACCTGGTAGTAAAGCTTAGAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGGGGGATGGGAGCCACTGCCACACCTGGTAGTAAAGCTTAGAAGG  200

seq1  GCAAATCCCACCCCTCCTCTTTTTTGAAGATTACTTGTAAATAACTACTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATCCCACCCCTCCTCTTTTTTGAAGATTACTTGTAAATAACTACTC  250

seq1  CTACTCCAGCAGTAAAGCCCCTTCAAGGATTTGCTGACCAGAGACAATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCCAGCAGTAAAGCCCCTTCAAGGATTTGCTGACCAGAGACAATGT  300

seq1  TATGGAGTCTTTGGAGCCTCTGGGGGCTGATGGTGCTCCTTTGTCTTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGAGTCTTTGGAGCCTCTGGGGGCTGATGGTGCTCCTTTGTCTTCTT  350

seq1  TGGAGACGTGCTTAGCTCACTCCCAACATGCTTTGCGTCCTCCAGCTCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGACGTGCTTAGCTCACTCCCAACATGCTTTGCGTCCTCCAGCTCAT  400

seq1  TTGTCTCAAAGGTTTATTTTGAGGATGGCATAGAATAATAATTAGTGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCAAAGGTTTATTTTGAGGATGGCATAGAATAATAATTAGTGCTT  450

seq1  AGCAGCCCTGATTTCTTAACAAGAACTAGTCTCATTAATTTAGAAAGCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCCCTGATTTCTTAACAAGAACTAGTCTCATTAATTTAGAAAGCAA  500

seq1  GGTAGGAGTGGTTGTCCCTGAGGTGAAGGCTACCAAGGCAAGTTTGGGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGAGTGGTTGTCCCTGAGGTGAAGGCTACCAAGGCAAGTTTGGGGC  550

seq1  AGAAGCAAGCTTGGGGAGGCATGAAGCATCTTGAACTGCCCACTCAGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCAAGCTTGGGGAGGCATGAAGCATCTTGAACTGCCCACTCAGAGT  600

seq1  CTGTGCAACACAGGGGTCAATGCTCCTCCTCAAGACCCTCCAGACTCCCG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCAACACAGGGGTCAATGCTCCTCCTCAAGACCCTCCAGACTCCCG  650

seq1  AGGAGGAGGAGGAGGACTCCCTTGCTGGATACAAGAACCCTGGGCTGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGAGGAGGAGGACTCCCTTGCTGGATACAAGAACCCTGGGCTGTGA  700

seq1  CTCTCTAGAGCAAAGTTAACTGGGTCTACCAGGAACAAAA-CCCAGGTGA  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTCTCTAGAGCAAAGTTAACTGGGTCTACCAGGAACAAAACCCCAGGTGA  750

seq1  TGTGAGTTTCCCAGTGGGCAGTTCAGGGCTCAGACCTTTGAAGTGCTTCC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGTTTCCCAGTGGGCAGTTCAGGGCTCAGACCTTTGAAGTGCTTCC  800

seq1  CAGGCAGGACAGAGTTCTGAGTTTGTATAAAAACTGTGGAGGAGCCTGAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCAGGACAGAGTTCTGAGTTTGTATAAAAACTGTGGAGGAGCCTGAG  850

seq1  GTTAAAAAAAGTGACTCGAGGACTCTTTATGTGGCATGTTCTTATCACCG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAAAAAGTGACTCGAGGACTCTTTATGTGGCATGTTCTTATCACCG  900

seq1  ATAGTAATTTTGGCTAGAGTGAAAGGCAGCTCAATGAAATGGCTTGTGCT  949
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGT-ATTTTGGCTAGAGTGAAAGGCAGCTCAATGAAATGGCTTGTGCT  949

seq1  GGCTTGTGACCTCCAAGCGATGAGCCCCACTATTGGTTGTCCAATGCAGA  999
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTGACCT-CAAGCGATGAGCCCCACTATTGGTTGTCCAATGCAGA  998

seq1  GTGGTCAGCCTTGAAACCATATACACACAGACATCAGAAACAGACTCAGC  1049
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCAGCCTTGAAACCATATACACACAGACATCAGAAACAGACTCAGC  1048

seq1  AGGTTGTGTGTGTGTGTAAATACATATATACACATATATGTAAGTACATA  1099
      | ||| |||  || |   |||||||||||||||||   |||| || ||||
seq2  A-GTTTTGTTGGTTTTGTAATACATATATACACATTATTGTAGGT-CATA  1096

seq1  CATACTACTTTTATATA  1116
      |||||||| ||||||||
seq2  CATACTAC-TTTATATA  1112