BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-006G09
Chromosome8 (Build37)
Map Location 33,751,027 - 33,867,154
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG330731, LOC100041340, Nrg1, 2010007E15Rik, EG666589, EG546052
Downstream geneLOC100042715, LOC628408, EG628412, Wrn, Purg, LOC666630, Hmgb1-rs17, Tex15, Ppp2cb, Ubxd6, Gsr, Gtf2e2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-006G09.bB6Ng01-006G09.g
ACCDH843268DH843269
length1,1221,024
definitionDH843268|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006G09, 5' end.DH843269|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-006G09, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,751,027 - 33,752,152)(33,866,122 - 33,867,154)
sequence
gaattcatcatacccaaatctatcagtgatagaaagctcaggtgcctgca
atgacatgtcaccagaggctgggggatggtaagtcaaagaccagatagct
ctcagctcctctaatgattcaacaacacaccttagccacagctctcagct
tctctgatgatcctacagtatgccttaccctttagagtaaaagctgagaa
gaaaaaaaaaacattccaccgtggcttttcataagaaacaagagaaaagg
attgaatgacacttggtatttgcctgctagacagctgatattccacatgg
caatgaagaataaggcagccatgtgtatccaggtaacctcaggttgaagt
tcatgtaaatgtctgaaattaggtcatttctctctcctagaaacacaaga
gttagtatgttctcttcatcgtactttgacatttcacaagtgtatttaca
tagatacagttcactgatagataggtgcacagctgtgttgtataggacag
cgaactttatgtaacatttgaacccctcagtgtaggtctccagctctact
tcactagttgtttgatcatgaataaacagccagtgtcttcccaactgatt
tcttcagttctaacgtagaagcctgctgatcgagagagatgatggatgaa
gacaaacagcaagatgccttccctgaaagagggactcccttatccctgct
ttccttcctttatccctgtggagtctgccaggaaagcaacagttgtgcat
aggtcacattatcggactacgttcctgaatctatcaaggggatcattttc
gcctctcgatccatgccaacataaacctgtgtggtgacagaagagttctg
caacagttccgcgaatcatgtacaaatgaaagtgttcaccaaccacatgg
cttttccttcggaatgaagaataagcagttgcatccatgtgttatccaga
cactcccagcttttagagcactcacctccttatgaatctctgaacccttt
aatatcgaatcagtattttgggctatgaatgttatctgccacagtggcta
ggaatcactagatattacacgatgaagggcatctggtacttcagtagtcg
gattcatgaatgcatgatccca
gaattcctgtgtttctatccagccagtcttaggagaccctgtagtcccca
accgtctgacaaaagtagtctaagtgtgccgtccacgtagcaaacaaatc
ttcagcatcttcttagtctgaggtctgaatgcatgtgtaggggtaatgaa
gagcaactcatcttattgtggaaactactggctcgacattaaatcctctg
actagtggtgttctttgcaaagttaactttaattctgttcctgctgttct
ttgaacaaccttgcaaaacattcagtctttctatcaaatccaattaccat
tgtaagaaatgagcttttctgctatcctggttcattctctgccaatgctc
tttccacatagaaaaggttgctctccaaattggtcatatgcattaatgaa
attatcaaagagtaattaagaagttgggcttagcttactgatgagattcc
ccccaccttcacacatcatttatgaagacaacaacagaaatgttactcaa
ggattcaccagaaaataatcatagctgggaaattgaggcacaaaggtgtt
aaatatctcacttcatagtaaaagataaggccagcacttgaatccatgta
acatctgttaattgcatcccttccctcaaaggtgaaaaagaggaattgaa
tgtcagatagtaaaagaatatttttaaaaattttgataaatgcacataat
gcatcatgtgaccattatcctgtttataaggactttaacaaatgagaaaa
tgcagagtttaaatgttgagggaaacatttaaggtggtagtactatgatg
gtgactcaagaaaaatcaaaggatagagagggctcaaagccccaagcatt
tgccacaatgatcactcataacttcctgtcttcagatgtgctgggttata
acatagaaaagttacaactctcactcatgtaaattgcctaatctctcatt
acatactctatatcatttcagaaatgagtacctgctgtctcatatataat
agattccacattacaataaagtga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_33751027_33752152
seq2: B6Ng01-006G09.b_47_1168

seq1  GAATTCATCATACCCAAATCTATCAGTGATAGAAAGCTCAGGTGCCTGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCATACCCAAATCTATCAGTGATAGAAAGCTCAGGTGCCTGCA  50

seq1  ATGACATGTCACCAGAGGCTGGGGGATGGTAAGTCAAAGACCAGATAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATGTCACCAGAGGCTGGGGGATGGTAAGTCAAAGACCAGATAGCT  100

seq1  CTCAGCTCCTCTAATGATTCAACAACACACCTTAGCCACAGCTCTCAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCTCCTCTAATGATTCAACAACACACCTTAGCCACAGCTCTCAGCT  150

seq1  TCTCTGATGATCCTACAGTATGCCTTACCCTTTAGAGTAAAAGCTGAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGATGATCCTACAGTATGCCTTACCCTTTAGAGTAAAAGCTGAGAA  200

seq1  GAAAAAAAAAACATTCCACCGTGGCTTTTCATAAGAAACAAGAGAAAAGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAAAAAACATTCCACCGTGGCTTTTCATAAGAAACAAGAGAAAAGG  250

seq1  ATTGAATGACACTTGGTATTTGCCTGCTAGACAGCTGATATTCCACATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATGACACTTGGTATTTGCCTGCTAGACAGCTGATATTCCACATGG  300

seq1  CAATGAAGAATAAGGCAGCCATGTGTATCCAGGTAACCTCAGGTTGAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAAGAATAAGGCAGCCATGTGTATCCAGGTAACCTCAGGTTGAAGT  350

seq1  TCATGTAAATGTCTGAAATTAGGTCATTTCTCTCTCCTAGAAACACAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTAAATGTCTGAAATTAGGTCATTTCTCTCTCCTAGAAACACAAGA  400

seq1  GTTAGTATGTTCTCTTCATCGTACTTTGACATTTCACAAGTGTATTTACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGTATGTTCTCTTCATCGTACTTTGACATTTCACAAGTGTATTTACA  450

seq1  TAGATACAGTTCACTGATAGATAGGTGCACAGCTGTGTTGTATAGGACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATACAGTTCACTGATAGATAGGTGCACAGCTGTGTTGTATAGGACAG  500

seq1  CGAACTTTATGTAACATTTGAACCCCTCAGTGTAGGTCTCCAGCTCTACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAACTTTATGTAACATTTGAACCCCTCAGTGTAGGTCTCCAGCTCTACT  550

seq1  TCACTAGTTGTTTGATCATGAATAAACAGCCAGTGTCTTCCCAACTGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAGTTGTTTGATCATGAATAAACAGCCAGTGTCTTCCCAACTGATT  600

seq1  TCTTCAGTTCTAACGTAGAAGCCTGCTGATCGAGAGAGATGATGGATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAGTTCTAACGTAGAAGCCTGCTGATCGAGAGAGATGATGGATGAA  650

seq1  GACAAACAGCAAGATGCCTTCCCTGAAAGAGGGACTCCCTTATCCCTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAACAGCAAGATGCCTTCCCTGAAAGAGGGACTCCCTTATCCCTGCT  700

seq1  TTCCTTCCTTTATCCCTGTGGAGTCTGCCAGGAAAGCAACAGTTGTGCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCCTTTATCCCTGTGGAGTCTGCCAGGAAAGCAACAGTTGTGCAT  750

seq1  AGGTCACATTATCGGACTACGTTCCTGAATCTATCAAGGGGATCATTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCACATTATCGGACTACGTTCCTGAATCTATCAAGGGGATCATTTTC  800

seq1  GCCTCTCGATCCATGCCAACATAAACCTGTGTGGTGACAGAAGAGTTCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCGATCCATGCCAACATAAACCTGTGTGGTGACAGAAGAGTTCTG  850

seq1  CAACAGTTCCGCGAATCATGTACAAATGAAAGTGTTCACCAACCACATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTTCCGCGAATCATGTACAAATGAAAGTGTTCACCAACCACATGG  900

seq1  CTTTTCCTTCGGAATGAAGAATAAGCAGTTGCATCCATGTGTTATCCAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCTTCGGAATGAAGAATAAGCAGTTGCATCCATGTGTTATCCAGA  950

seq1  CACTCCCAGCTTTTAGGAGCACTCACCTCCTTATGAATCTCTGAACCCTT  1000
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCCAGCTTTTA-GAGCACTCACCTCCTTATGAATCTCTGAACCCTT  999

seq1  TAAATATCGAATCAGTATCTGGGGCTATGAAATGTTATCTGCCACAGT-G  1049
      | |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |
seq2  T-AATATCGAATCAGTATTTTGGGCTATG-AATGTTATCTGCCACAGTGG  1047

seq1  CTAGGAATCACTAAGTATATACACAGATGAGGGGCATCTGGTACTTCAGT  1099
      |||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||
seq2  CTAGGAATCACTAGATAT-TACAC-GATGAAGGGCATCTGGTACTTCAGT  1095

seq1  AGTCAGA-TCATGAATGCTATGAACCCA  1126
      |||| || |||||||||| |||| ||||
seq2  AGTCGGATTCATGAATGC-ATGATCCCA  1122

seq1: chr8_33866122_33867154
seq2: B6Ng01-006G09.g_68_1091 (reverse)

seq1  TCACTTTATTGTAATGTGGAATCCTATTATTATATTGGAGACAGCAGGTA  50
      |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||
seq2  TCACTTTATTGTAATGTGGAATC----TATTATATATGAGACAGCAGGTA  46

seq1  CTCATTTCTGAAAATGATAATAGAAGTATGTAAATTGAGAGATTAGGCAA  100
      |||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||
seq2  CTCATTTCTG-AAATGAT-ATAG-AGTATGTAA--TGAGAGATTAGGCAA  91

seq1  TTTACATGAGTGAGAGTTGTAACTTTTCTATGTTATAACCCAGCACATCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACATGAGTGAGAGTTGTAACTTTTCTATGTTATAACCCAGCACATCT  141

seq1  GAAGACAGGAAGTTATGAGTGATCATTGTGGCAAATGCTTGGGGCTTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGACAGGAAGTTATGAGTGATCATTGTGGCAAATGCTTGGGGCTTTGA  191

seq1  GCCCTCTCTATCCTTTGATTTTTCTTGAGTCACCATCATAGTACTACCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCTCTATCCTTTGATTTTTCTTGAGTCACCATCATAGTACTACCAC  241

seq1  CTTAAATGTTTCCCTCAACATTTAAACTCTGCATTTTCTCATTTGTTAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAATGTTTCCCTCAACATTTAAACTCTGCATTTTCTCATTTGTTAAA  291

seq1  GTCCTTATAAACAGGATAATGGTCACATGATGCATTATGTGCATTTATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTTATAAACAGGATAATGGTCACATGATGCATTATGTGCATTTATCA  341

seq1  AAATTTTTAAAAATATTCTTTTACTATCTGACATTCAATTCCTCTTTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTTTTAAAAATATTCTTTTACTATCTGACATTCAATTCCTCTTTTTC  391

seq1  ACCTTTGAGGGAAGGGATGCAATTAACAGATGTTACATGGATTCAAGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTGAGGGAAGGGATGCAATTAACAGATGTTACATGGATTCAAGTGC  441

seq1  TGGCCTTATCTTTTACTATGAAGTGAGATATTTAACACCTTTGTGCCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCTTATCTTTTACTATGAAGTGAGATATTTAACACCTTTGTGCCTCA  491

seq1  ATTTCCCAGCTATGATTATTTTCTGGTGAATCCTTGAGTAACATTTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCCAGCTATGATTATTTTCTGGTGAATCCTTGAGTAACATTTCTGT  541

seq1  TGTTGTCTTCATAAATGATGTGTGAAGGTGGGGGGAATCTCATCAGTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTCTTCATAAATGATGTGTGAAGGTGGGGGGAATCTCATCAGTAAG  591

seq1  CTAAGCCCAACTTCTTAATTACTCTTTGATAATTTCATTAATGCATATGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCCCAACTTCTTAATTACTCTTTGATAATTTCATTAATGCATATGA  641

seq1  CCAATTTGGAGAGCAACCTTTTCTATGTGGAAAGAGCATTGGCAGAGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTGGAGAGCAACCTTTTCTATGTGGAAAGAGCATTGGCAGAGAAT  691

seq1  GAACCAGGATAGCAGAAAAGCTCATTTCTTACAATGGTAATTGGATTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCAGGATAGCAGAAAAGCTCATTTCTTACAATGGTAATTGGATTTGA  741

seq1  TAGAAAGACTGAATGTTTTGCAAGGTTGTTCAAAGAACAGCAGGAACAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGACTGAATGTTTTGCAAGGTTGTTCAAAGAACAGCAGGAACAGA  791

seq1  ATTAAAGTTAACTTTGCAAAGAACACCACTAGTCAGAGGATTTAATGTCG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGTTAACTTTGCAAAGAACACCACTAGTCAGAGGATTTAATGTCG  841

seq1  AGCCAGTAGTTTCCACAATAAGATGAGTTGCTCTTCATTACCCCTACACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGTAGTTTCCACAATAAGATGAGTTGCTCTTCATTACCCCTACACA  891

seq1  TGCATTCAGACCTCAGACTAAGAAGATGCTGAAGATTTGTTTGCTACGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTCAGACCTCAGACTAAGAAGATGCTGAAGATTTGTTTGCTACGTG  941

seq1  GACGGCACACTTAGACTACTTTTGTCAGACGGTTGGGGACTACAGGGTCT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGGCACACTTAGACTACTTTTGTCAGACGGTTGGGGACTACAGGGTCT  991

seq1  CCTAAGACTGGCTGGATAGAAACACAGGAATTC  1033
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGACTGGCTGGATAGAAACACAGGAATTC  1024