BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010A22
Chromosome8 (Build37)
Map Location 19,470,621 - 19,573,836
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040528, LOC100041511, Defb7, LOC670326
Upstream geneLOC100040466, Mcph1, Angpt2, Agpat5, LOC100040486, Xkr5, Defb40, Defb37, Defb38, Defb39, Defb12, Defb34, EG546038, Spag11, Defb14, Defb4, EG654452, Defb6, EG574081, Defb5, Defb3, Defb54-ps, LOC100040504, LOC100040514, Defb8
Downstream geneLOC100040561, LOC624198, EG665730, 4930467E23Rik, LOC100041567, LOC547150, LOC100040599, EG665822, 6820431F20Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010A22.bB6Ng01-010A22.g
ACCDH845835DH845836
length1,216713
definitionDH845835|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010A22, 5' end.DH845836|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010A22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(19,572,575 - 19,573,836)(19,470,621 - 19,471,333)
sequence
gaattcaagccaccagagctgaagggaagttaatgccccttatttcaagc
cttaagtttatacattcagaatagtgacaggaaagtatcaaaatgtgcag
taacatatatgctaaggcctcttaaatttgttaaatgacaattccttcct
ccatctctccctcacctttcctgggaataaatttcatcatctctcaaaag
ggtagatgccaaagagtcccagctcctatgattcctaggataaggataaa
ataattagcatgatccacaaggacttgcttgtcctcaaatctgcttcctt
tctcagtcatatcttgtgctatggatacacattttctttccatgtgcaga
aaaataccccatccaccacaactcaaggatggcccaacctccatccttga
gtgcttgtgagtgtcagaacatagcttaggtatcaactcaacagaatttt
tgatctctcagactgtgttcatatggcacatacactaattacagttttat
gataacttaatgattttttttggttatatgtggctccccagatcaggagt
aagtcctcagggaaatggaagacataaaattgcagctgcttttaaatcca
tgctatctccagcatccaagaaggtgcagagcaagggatccccacacact
ttctaggtgatccacagagcccagaactgtctccaaatgtgtgcatgaac
atacttagtcattagtacttggatggattcattcccttctacaacacaat
tagaacaaatcagaaaggggtaatatggaaagaacttgagtggactcagc
aataactaagtatagtaccagcacctcaccttcttttgtgtgtaaatgtg
gtaaggggatacacatgtgtctatgtatgtggaggacagaggacaagctc
agtatcgttcttcaggaaccaggatggaactcagggactcttatggaaga
agagatgaggattgtggcctgacgggaaggactctagagaaagacaaaca
gagtcactaacctgacttggggctctcagagtcaacaaacaactactcag
ctagactaggctctctgctcatatgagcaaatttagagctaacttcaatg
gttcttaaacactgaacggaggctatctaacagtgcggtgtttgattgtt
catagcttgacttttgctgacataggtggaagaaaccttactgagagact
tgaatacaggggtgtg
gaattcctagtcttgtcttagtctctggttattctcagagctgatctcag
acctaagatagtttctttagccatcatattccctatatgctctagaacat
ttgaaggagatcattgacttgtgtcttagtcagggtttctattcctgcac
aaacatcatgaccaagaagcaagttggggagaaagggtttatttggctta
caattacatactgctgttcatcaccaaggaagtcaggactggaactcaaa
caggtcaggaaacaggagctgatgcagagaccatggagggatattcttta
ctggcttgcctcccctggcttgctcagactgctcttttatagaacccaag
actaccagcccagagatggtcccacccacaaggggcctttccaccttgat
cactaattgagaaaatgccttacagttggatcttatggaggcatttcctc
aactgaagctcctttctctgtgataactccagttgtgtcaagttgacaca
aaactagccagtacaacttgtgttgaggcacaggttgaccctgagtctgt
agggctgccctcccccagaggcttttccctatgttatctagacatgttgt
tctctcctctctcctcttctctctgcatgcaggctttcactccttctctt
cctagcccacctctgtctttgcttccctttgatacttccctggtctcctc
ctcctcctcctcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_19572575_19573836
seq2: B6Ng01-010A22.b_49_1264 (reverse)

seq1  CACACCCTGGTACTTCAAGTCTCTTCAAGGTTAGGTGTTTCCTCTCACCC  50
      |||||||  ||| |||||||||| |||  || ||  ||||| || |||| 
seq2  CACACCCCTGTA-TTCAAGTCTC-TCA--GTAAG--GTTTCTTC-CACC-  42

seq1  TTAGTCCAGTCAAAACAGTCCAGCTAGTAGAACATATCCAACTCACAGGC  100
       ||   ||| ||||  |||| |||||   ||||| ||| ||  ||| |  
seq2  -TATGTCAG-CAAA--AGTCAAGCTA--TGAACA-ATCAAA--CACCG--  81

seq1  AACTGTTTTGGGGATAGCCTCCGTTTCAGTTGTTTAGGACCCATGGGAAG  150
       ||||||     ||||||||||| ||||| |||||| || ||||  ||||
seq2  CACTGTT----AGATAGCCTCCG-TTCAG-TGTTTAAGAACCAT-TGAAG  124

seq1  GTTAAGCTCTAAATCTGCTACATATGAGCAGAGAGGCCTAGGTCTAGCTG  200
        | |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| 
seq2  --TTAGCTCTAAATTTGCT-CATATGAGCAGAGA-GCCTA-GTCTAGCT-  168

seq1  GAGTATGTTGTTTGGTTGGACTCTGAGAGCCCCCAAAGTCCGGGTTAGGT  250
      ||||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||| | ||||| ||
seq2  GAGTA-GTTGTTTG--TTGACTCTGAGAGCCCC--AAGT-CAGGTTA-GT  211

seq1  GACTCTGTTTGTCTTTCTCTAGAGTTCCTTTCCCCTTCAGGCCCACAATC  300
      |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||
seq2  GACTCTGTTTGTCTTTCTCTAGAG-TCCTT--CCCGTCAGG-CCACAATC  257

seq1  CTTCATCCTCTTCTTCCATAAGAGTCCCTGAGTTCCATCCTGGTTCCTGA  350
      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TCAT-CTCTTCTTCCATAAGAGTCCCTGAGTTCCATCCTGGTTCCTGA  305

seq1  AGAACGATACCTGAGCTTGTCCTCTGTCCTCCACATACATAGACACATGT  400
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACGATA-CTGAGCTTGTCCTCTGTCCTCCACATACATAGACACATGT  354

seq1  GTATCCCCTTACCACATTTACACACAAAAGAAGGTGAGGTGCTGGTACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCCCTTACCACATTTACACACAAAAGAAGGTGAGGTGCTGGTACTA  404

seq1  TACTTAGTTATTGCTGAGTCCACTCAAGTTCTTTCCATATTACCCCTTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTAGTTATTGCTGAGTCCACTCAAGTTCTTTCCATATTACCCCTTTC  454

seq1  TGATTTGTTCTAATTGTGTTGTAGAAGGGAATGAATCCATCCAAGTACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTGTTCTAATTGTGTTGTAGAAGGGAATGAATCCATCCAAGTACTA  504

seq1  ATGACTAAGTATGTTCATGCACACATTTGGAGACAGTTCTGGGCTCTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACTAAGTATGTTCATGCACACATTTGGAGACAGTTCTGGGCTCTGTG  554

seq1  GATCACCTAGAAAGTGTGTGGGGATCCCTTGCTCTGCACCTTCTTGGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACCTAGAAAGTGTGTGGGGATCCCTTGCTCTGCACCTTCTTGGATG  604

seq1  CTGGAGATAGCATGGATTTAAAAGCAGCTGCAATTTTATGTCTTCCATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGATAGCATGGATTTAAAAGCAGCTGCAATTTTATGTCTTCCATTT  654

seq1  CCCTGAGGACTTACTCCTGATCTGGGGAGCCACATATAACCAAAAAAAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGGACTTACTCCTGATCTGGGGAGCCACATATAACCAAAAAAAAT  704

seq1  CATTAAGTTATCATAAAACTGTAATTAGTGTATGTGCCATATGAACACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAGTTATCATAAAACTGTAATTAGTGTATGTGCCATATGAACACAG  754

seq1  TCTGAGAGATCAAAAATTCTGTTGAGTTGATACCTAAGCTATGTTCTGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAGATCAAAAATTCTGTTGAGTTGATACCTAAGCTATGTTCTGAC  804

seq1  ACTCACAAGCACTCAAGGATGGAGGTTGGGCCATCCTTGAGTTGTGGTGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACAAGCACTCAAGGATGGAGGTTGGGCCATCCTTGAGTTGTGGTGG  854

seq1  ATGGGGTATTTTTCTGCACATGGAAAGAAAATGTGTATCCATAGCACAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGGTATTTTTCTGCACATGGAAAGAAAATGTGTATCCATAGCACAAG  904

seq1  ATATGACTGAGAAAGGAAGCAGATTTGAGGACAAGCAAGTCCTTGTGGAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGACTGAGAAAGGAAGCAGATTTGAGGACAAGCAAGTCCTTGTGGAT  954

seq1  CATGCTAATTATTTTATCCTTATCCTAGGAATCATAGGAGCTGGGACTCT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTAATTATTTTATCCTTATCCTAGGAATCATAGGAGCTGGGACTCT  1004

seq1  TTGGCATCTACCCTTTTGAGAGATGATGAAATTTATTCCCAGGAAAGGTG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCATCTACCCTTTTGAGAGATGATGAAATTTATTCCCAGGAAAGGTG  1054

seq1  AGGGAGAGATGGAGGAAGGAATTGTCATTTAACAAATTTAAGAGGCCTTA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGAGATGGAGGAAGGAATTGTCATTTAACAAATTTAAGAGGCCTTA  1104

seq1  GCATATATGTTACTGCACATTTTGATACTTTCCTGTCACTATTCTGAATG  1200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATATGTTACTGCACATTTTGATACTTTCCTGTCACTATTCTGAATG  1154

seq1  TATAAACTTAAGGCTTGAAATAAGGGGCATTAACTTCCCTTCAGCTCTGG  1250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAACTTAAGGCTTGAAATAAGGGGCATTAACTTCCCTTCAGCTCTGG  1204

seq1  TGGCTTGAATTC  1262
      ||||||||||||
seq2  TGGCTTGAATTC  1216

seq1: chr8_19470621_19471333
seq2: B6Ng01-010A22.g_65_777

seq1  GAATTCCTAGTCTTGTCTTAGTCTCTGGTTATTCTCAGAGCTGATCTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTAGTCTTGTCTTAGTCTCTGGTTATTCTCAGAGCTGATCTCAG  50

seq1  ACCTAAGATAGTTTCTTTAGCCATCATATTCCCTATATGCTCTAGAACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTAAGATAGTTTCTTTAGCCATCATATTCCCTATATGCTCTAGAACAT  100

seq1  TTGAAGGAGATCATTGACTTGTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGAGATCATTGACTTGTGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCTGCAC  150

seq1  AAACATCATGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGAAAGGGTTTATTTGGCTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATCATGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAGAAAGGGTTTATTTGGCTTA  200

seq1  CAATTACATACTGCTGTTCATCACCAAGGAAGTCAGGACTGGAACTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTACATACTGCTGTTCATCACCAAGGAAGTCAGGACTGGAACTCAAA  250

seq1  CAGGTCAGGAAACAGGAGCTGATGCAGAGACCATGGAGGGATATTCTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCAGGAAACAGGAGCTGATGCAGAGACCATGGAGGGATATTCTTTA  300

seq1  CTGGCTTGCCTCCCCTGGCTTGCTCAGACTGCTCTTTTATAGAACCCAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTGCCTCCCCTGGCTTGCTCAGACTGCTCTTTTATAGAACCCAAG  350

seq1  ACTACCAGCCCAGAGATGGTCCCACCCACAAGGGGCCTTTCCACCTTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACCAGCCCAGAGATGGTCCCACCCACAAGGGGCCTTTCCACCTTGAT  400

seq1  CACTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTTGGATCTTATGGAGGCATTTCCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAATTGAGAAAATGCCTTACAGTTGGATCTTATGGAGGCATTTCCTC  450

seq1  AACTGAAGCTCCTTTCTCTGTGATAACTCCAGTTGTGTCAAGTTGACACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAAGCTCCTTTCTCTGTGATAACTCCAGTTGTGTCAAGTTGACACA  500

seq1  AAACTAGCCAGTACAACTTGTGTTGAGGCACAGGTTGACCCTGAGTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAGCCAGTACAACTTGTGTTGAGGCACAGGTTGACCCTGAGTCTGT  550

seq1  AGGGCTGCCCTCCCCCAGAGGCTTTTCCCTATGTTATCTAGACATGTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCTGCCCTCCCCCAGAGGCTTTTCCCTATGTTATCTAGACATGTTGT  600

seq1  TCTCTCCTCTCTCCTCTTCTCTCTGCATGCAGGCTTTCACTCCTTCTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCTCTCTCCTCTTCTCTCTGCATGCAGGCTTTCACTCCTTCTCTT  650

seq1  CCTAGCCCACCTCTGTCTTTGCTTCCCTTTGATACTTCCCTGGTCTCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGCCCACCTCTGTCTTTGCTTCCCTTTGATACTTCCCTGGTCTCCTC  700

seq1  CTCCTCCTCCTCC  713
      |||||||||||||
seq2  CTCCTCCTCCTCC  713