BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015D04
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,684,991 - 14,789,192
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2, C030037F17Rik
Upstream gene4932443I19Rik, LOC665516, Cdc16, Upf3a, AF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140
Downstream geneCln8, Arhgef10, 2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599, EG234097, EG665619
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015D04.bB6Ng01-015D04.g
ACCDH849522DH849523
length1,1501,100
definitionDH849522|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015D04, 5' end.DH849523|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015D04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,788,040 - 14,789,192)(14,684,991 - 14,686,090)
sequence
gaattccttataaccccatgggacaaggaatagttaaacatgctcattgc
accttaagaaattggcttttaaagacaaaacaggggcagttatatccccc
aaagtcaccaaaggcacatcttgcctttgctttatttgttctctttaaag
gatatatcttgtcctcagacgtatcttctgtcagcctctcttccctcttt
cctccctatgacattctgctctttcatgcaccctctgccaagacacctga
ctttgtcacaaaccccaaaccactagatcaagagaccttggctggatcct
aaagctatgatgtaaaattacctgtcacttctttaatagcaatgaaacat
tgaaacacagccagagccttcttggtaagttcattctctcattgcaatgg
cctctgagctcctgtagctgctgtcagatgagccgctgcctgaatccctg
tggccacagctgctggccctcctcagtggctgctcctctctgagttcctg
agtcacagcctcttgcattctcctcctgggatggatgtagacttcctcag
ctcaccctgtctcatcttgttctttattcatttctgaaggccatgctaac
ttgtagccctgacaacagggtctgccttggactgatgctcagacacaaga
aaaaggccaggtccctggacctaagcatattcctctaaacatccaacaca
ggggagggatttcaaagacacaatctggttttcaattcagcacagagatc
tggaggcttctcaagattcccagaagcccccggtgttggctgcttccgag
aagagaatgaggtagaccacagaactcgcagtgacaccttggacatccac
cggaaggaacccttcggaccgactttggcatgagatcgtggtggcctgtg
cagaaattctgatttgtgagcaggagaagatgtaagtttggcaatgtggg
ctctgaccccataggactttagactttagtcctgggtgtatttcccaaaa
gaaacatgggttcccacaaagtctagttgtcagaagagacttcagcactc
acccttgtccagttatcgagttcctcccaccacaaccctcccctcatgtt
ttactggacattcttggtagaacgaatgtacccgccccaacactgccacg

gaattctgtatgtaatcgagtgagtttcttcaattgtgtgtggcttccaa
acatggattttaactagcgttgttgaagaggagagattctgtttaaacct
gcggtcaccctgtgaggtcacccctatgccctgtgatgtgaaggtctgga
aaggcaaagtcacctatgcgcatgctgttgtgcaggatccgaatcctcaa
aacagcatccttctcacattccactaagtgcctgcacatacacacagcac
agtccagttcaaatatgtgtagtggatacccgagagttaaatgctgtgaa
ccaactgtctgtggagaaggctggacacgtgttacagcctcatcagaaga
gaaccccgcccctcccctccatttctaggatgcactagattccatgaaat
aagaaacatgggactattagtgtctccattacatgatatctttacattgg
aattccagggacacaaagagatggcttagcagttaaaagcactcctctgc
ttcttcagaagcctgggctcagttcccagcaccaacaacgtcaggcagcc
caccactgccagtaattccagctccaagggatccaacgcttctgtggtct
cacacgcatgaacacacatacacacgcagatgtgcatacacaaaaataaa
aactatatacatacatatgtacatatgtatgttatttttaaatggaatgt
cagtacttatgtgagctcaggggactcagctccaacagtagctttatgcc
gtgcccctgatagtctcaggatttctctcaacaaagccactcataagaaa
tgccagaggaaacaccagatgagggagggacatgaggaatctactccata
agtggtttgcacaccactgcttcccaccaccccacagcacacgcagcctc
acctcactgaacacggacacagggtttgcctcctgttgcacagagtcagc
tccgagtcagctctgagcttacacgtaggagggccgactttgatcaactt
acccacgagttgtccatgagtttggcattcttaagccaggttattccatt
catgggagaaggatgattcaagaatgggaggatctgacttcaggccctga

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14788040_14789192
seq2: B6Ng01-015D04.b_44_1193 (reverse)

seq1  CGTGGCAGTGTTGGGGCGGTGACA-TCTGTCTAACACAGAATGTCCCAGT  49
      |||||||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||||| |||||
seq2  CGTGGCAGTGTTGGGGCGGGTACATTCGTTCTACCA-AGAATGT-CCAGT  48

seq1  AAACACTGA-GTGAGTG-TGTGTGTGAAGGAAACTTCGATAAACTGGGAC  97
      |||   ||| | ||| | ||||   | |||||   ||||| |||| ||||
seq2  AAAACATGAGGGGAGGGTTGTGGTGGGAGGAA--CTCGAT-AACT-GGAC  94

seq1  AAGGGTGAGTGCTGAAGTCTC-TCTGAC-ACTAGACTTTGTGGGAACCCA  145
      ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGTGAGTGCTGAAGTCTCTTCTGACAACTAGACTTTGTGGGAACCCA  144

seq1  TGTTTCTTTTGGGAAAATACACCCAGGACTAAAGTCTAAAGTCCTATGGG  195
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCTTTTGGG-AAATACACCCAGGACTAAAGTCTAAAGTCCTATGGG  193

seq1  GTCAGAGCCCACATTGCCAAACTTACATCTTCTCCTGCTCACAATATCAG  245
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GTCAGAGCCCACATTGCCAAACTTACATCTTCTCCTGCTCACAA-ATCAG  242

seq1  AATTTCTGCACAGGCCACCACGATCTCATGCCAAAGTCGGTCCGAAGGGT  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCTGCACAGGCCACCACGATCTCATGCCAAAGTCGGTCCGAAGGGT  292

seq1  TCCTTCCGGTGGATGTCCAAGGTGTCACTGCGAGTTCTGTGGTCTACCTC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCCGGTGGATGTCCAAGGTGTCACTGCGAGTTCTGTGGTCTACCTC  342

seq1  ATTCTCTTCTCGGAAGCAGCCAACACCGGGGGCTTCTGGGAATCCTGAGA  395
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATTCTCTTCTCGGAAGCAGCCAACACCGGGGGCTTCTGGGAATCTTGAGA  392

seq1  AGCCTCCAGATCTCTGTGCTGAATTGAAAACCAGATTGTGTCTTTGAAAT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCAGATCTCTGTGCTGAATTGAAAACCAGATTGTGTCTTTGAAAT  442

seq1  CCCTCCCCTGTGTTGGATGTTTAGAGGAATATGCTTAGGTCCAGGGACCT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCCTGTGTTGGATGTTTAGAGGAATATGCTTAGGTCCAGGGACCT  492

seq1  GGCCTTTTTCTTGTGTCTGAGCATCAGTCCAAGGCAGACCCTGTTGTCAG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTTTCTTGTGTCTGAGCATCAGTCCAAGGCAGACCCTGTTGTCAG  542

seq1  GGCTACAAGTTAGCATGGCCTTCAGAAATGAATAAAGAACAAGATGAGAC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACAAGTTAGCATGGCCTTCAGAAATGAATAAAGAACAAGATGAGAC  592

seq1  AGGGTGAGCTGAGGAAGTCTACATCCATCCCAGGAGGAGAATGCAAGAGG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGAGCTGAGGAAGTCTACATCCATCCCAGGAGGAGAATGCAAGAGG  642

seq1  CTGTGACTCAGGAACTCAGAGAGGAGCAGCCACTGAGGAGGGCCAGCAGC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGACTCAGGAACTCAGAGAGGAGCAGCCACTGAGGAGGGCCAGCAGC  692

seq1  TGTGGCCACAGGGATTCAGGCAGCGGCTCATCTGACAGCAGCTACAGGAG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCCACAGGGATTCAGGCAGCGGCTCATCTGACAGCAGCTACAGGAG  742

seq1  CTCAGAGGCCATTGCAATGAGAGAATGAACTTACCAAGAAGGCTCTGGCT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGAGGCCATTGCAATGAGAGAATGAACTTACCAAGAAGGCTCTGGCT  792

seq1  GTGTTTCAATGTTTCATTGCTATTAAAGAAGTGACAGGTAATTTTACATC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCAATGTTTCATTGCTATTAAAGAAGTGACAGGTAATTTTACATC  842

seq1  ATAGCTTTAGGATCCAGCCAAGGTCTCTTGATCTAGTGGTTTGGGGTTTG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTTTAGGATCCAGCCAAGGTCTCTTGATCTAGTGGTTTGGGGTTTG  892

seq1  TGACAAAGTCAGGTGTCTTGGCAGAGGGTGCATGAAAGAGCAGAATGTCA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAAGTCAGGTGTCTTGGCAGAGGGTGCATGAAAGAGCAGAATGTCA  942

seq1  TAGGGAGGAAAGAGGGAAGAGAGGCTGACAGAAGATACGTCTGAGGACAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGAGGAAAGAGGGAAGAGAGGCTGACAGAAGATACGTCTGAGGACAA  992

seq1  GATATATCCTTTAAAGAGAACAAATAAAGCAAAGGCAAGATGTGCCTTTG  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATATCCTTTAAAGAGAACAAATAAAGCAAAGGCAAGATGTGCCTTTG  1042

seq1  GTGACTTTGGGGGATATAACTGCCCCTGTTTTGTCTTTAAAAGCCAATTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTTGGGGGATATAACTGCCCCTGTTTTGTCTTTAAAAGCCAATTT  1092

seq1  CTTAAGGTGCAATGAGCATGTTTAACTATTCCTTGTCCCATGGGGTTATA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAGGTGCAATGAGCATGTTTAACTATTCCTTGTCCCATGGGGTTATA  1142

seq1  AGGAATTC  1153
      ||||||||
seq2  AGGAATTC  1150

seq1: chr8_14684991_14686090
seq2: B6Ng01-015D04.g_68_1167

seq1  GAATTCTGTATGTAATCGAGTGAGTTTCTTCAATTGTGTGTGGCTTCCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTATGTAATCGAGTGAGTTTCTTCAATTGTGTGTGGCTTCCAA  50

seq1  ACATGGATTTTAACTAGCGTTGTTGAAGAGGAGAGATTCTGTTTAAACCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGGATTTTAACTAGCGTTGTTGAAGAGGAGAGATTCTGTTTAAACCT  100

seq1  GCGGTCACCCTGTGAGGTCACCCCTATGCCCTGTGATGTGAAGGTCTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTCACCCTGTGAGGTCACCCCTATGCCCTGTGATGTGAAGGTCTGGA  150

seq1  AAGGCAAAGTCACCTATGCGCATGCTGTTGTGCAGGATCCGAATCCTCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAAGTCACCTATGCGCATGCTGTTGTGCAGGATCCGAATCCTCAA  200

seq1  AACAGCATCCTTCTCACATTCCACTAAGTGCCTGCACATACACACAGCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGCATCCTTCTCACATTCCACTAAGTGCCTGCACATACACACAGCAC  250

seq1  AGTCCAGTTCAAATATGTGTAGTGGATACCCGAGAGTTAAATGCTGTGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCAGTTCAAATATGTGTAGTGGATACCCGAGAGTTAAATGCTGTGAA  300

seq1  CCAACTGTCTGTGGAGAAGGCTGGACACGTGTTACAGCCTCATCAGAAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTGTCTGTGGAGAAGGCTGGACACGTGTTACAGCCTCATCAGAAGA  350

seq1  GAACCCCGCCCCTCCCCTCCATTTCTAGGATGCACTAGATTCCATGAAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCCCGCCCCTCCCCTCCATTTCTAGGATGCACTAGATTCCATGAAAT  400

seq1  AAGAAACATGGGACTATTAGTGTCTCCATTACATGATATCTTTACATTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAACATGGGACTATTAGTGTCTCCATTACATGATATCTTTACATTGG  450

seq1  AATTCCAGGGACACAAAGAGATGGCTTAGCAGTTAAAAGCACTCCTCTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAGGGACACAAAGAGATGGCTTAGCAGTTAAAAGCACTCCTCTGC  500

seq1  TTCTTCAGAAGCCTGGGCTCAGTTCCCAGCACCAACAACGTCAGGCAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCAGAAGCCTGGGCTCAGTTCCCAGCACCAACAACGTCAGGCAGCC  550

seq1  CACCACTGCCAGTAATTCCAGCTCCAAGGGATCCAACGCTTCTGTGGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACTGCCAGTAATTCCAGCTCCAAGGGATCCAACGCTTCTGTGGTCT  600

seq1  CACACGCATGAACACACATACACACGCAGATGTGCATACACAAAAATAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACGCATGAACACACATACACACGCAGATGTGCATACACAAAAATAAA  650

seq1  AACTATATACATACATATGTACATATGTATGTTATTTTTAAATGGAATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATATACATACATATGTACATATGTATGTTATTTTTAAATGGAATGT  700

seq1  CAGTACTTATGTGAGCTCAGGGGACTCAGCTCCAACAGTAGCTTTATGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACTTATGTGAGCTCAGGGGACTCAGCTCCAACAGTAGCTTTATGCC  750

seq1  GTGCCCCTGATAGTCTCAGGATTTCTCTCAACAAAGCCACTCATAAGAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCCTGATAGTCTCAGGATTTCTCTCAACAAAGCCACTCATAAGAAA  800

seq1  TGCCAGAGGAAACACCAGATGAGGGAGGGACATGAGGAATCTACTCCATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAGGAAACACCAGATGAGGGAGGGACATGAGGAATCTACTCCATA  850

seq1  AGTGGTCTGCACACCACTGCTTCCCACCACCCCACAGCACACGCAGCCTC  900
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTTTGCACACCACTGCTTCCCACCACCCCACAGCACACGCAGCCTC  900

seq1  ACCTCACTGAACACGGACACAGGGTTGGCCTCCTGTTGCACAGAGTCAGC  950
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCACTGAACACGGACACAGGGTTTGCCTCCTGTTGCACAGAGTCAGC  950

seq1  TCCGAGTCAGCTCTGAGCTTACACGTAGGAGGGCCGACTTTGATCAACTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAGTCAGCTCTGAGCTTACACGTAGGAGGGCCGACTTTGATCAACTT  1000

seq1  ACCCACGAG-TGTCAATGAGTTTGGCA-TCTTAGAGCCAGGATA-TCCAT  1047
      ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||
seq2  ACCCACGAGTTGTCCATGAGTTTGGCATTCTTA-AGCCAGGTTATTCCAT  1049

seq1  TCAGGGGAGAAGAATGATTTCAAGAATGGGAGGATCTGACTTCAGGCACC  1097
      ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TCATGGGAGAAGGATGA-TTCAAGAATGGGAGGATCTGACTTCAGGC-CC  1097

seq1  TGA  1100
      |||
seq2  TGA  1100