BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018G06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 67,515,683 - 67,673,371
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTrim60, LOC665388, LOC665396
Upstream geneTll1, LOC100040989, Cpe, Sc4mol, Klhl2, LOC100040903, LOC619647, 3110005G23Rik, Trim75
Downstream geneLOC100040949, LOC665405, Vaultrc-ps1, LOC100040967, March1, LOC100040986
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018G06.bB6Ng01-018G06.g
ACCDH851806DH851807
length6711,076
definitionDH851806|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018G06, 5' end.DH851807|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018G06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,515,683 - 67,516,353)(67,672,294 - 67,673,371)
sequence
gaattcctcttactctgaatacttaacacctgactccaggcacctggccc
tcctttaagcaagcttaccactgtgaatccttcctttgtttctttgatac
atatgttgttgaagtctacctccctagcatagctgtagccattttgttct
gtgcttgtcagctatttcatattgttgctgtaatatgcctgcaagtcatt
gatacagaaaaaggacttgattcagagcagggtcacatactctgttatgt
tctgaatgttatgagattttgttttttgtttttggtttggtttggttttt
tgagacagggtttctatgtatagccctggttgtcctggaactcactttgt
agaccaggctggccttgaactcagaaatccacctgcctctgcctcccaag
tgctgggattaaaagcatgcgccaccacgccgaaattccacaactataag
cttcacataggtcccatccaattaaatgccattatgaactgttaatgtct
aatatagcttgagtcagggccaaccaccgggcagcacttcagaattagtg
tatgagctcattgtgttttttttgcagttttagcttttataagctgatgc
agaaaaatgttcagtcagagaagatgcacccaaccctcaagtgacgtggg
gaggtctggtggggtgagggt
gaattctgttccacctctcactgaacctagagctcaccaattggtctaga
ggggctggcaaggcagccaacacccaccttcctgtctaaccacaagccct
ggagtgaaagacacttgcctggtttttactgcgactcccaactcaggtac
tcatgcttgagaggcaagcacatagtgctaagcaatctcccccaaatctg
aagctccctttaagtcatataagtatatgagaagctctaactgaaaaacc
cagacacactggaaatttgtccaagaaaatatatttacactccaaaaaga
acctactgctaagtcatctttgaagttcaattatggccaaaccaccaaat
ctgaagaaagacacacacatactaaatgtgtaaacatttaatccactaac
gctggcaaagctgcctgcagggagtctagagtctgtttcccatagtctga
agctctgaatgcagccttgctccctgggcaaggacctacagccacatcct
ggctgtgctcagctggagatagagttcctcctccgctcagtctttcctcc
tggaaggcatgcttactaggtagcctgtgaagtaagtcactggaaagttt
tatttttgttagcaaaacaaaaacgcttattccttttctattgctggtta
aaaaaaaaaaaataccagaagcatgactatgttgggtcccattttggccc
tgatttgggccttgaggacaaatccgagcctggctcgatttttgagtttt
gagacctgcctcagtcacttccatatcaggatgactcagcaagacctgtt
tggccctgactctgcccaggctgttgctgatgtagagctttgccattggc
cctgtcagtcactccataccctccatcacccttccccgactcctatgtca
tcttaccccacaaaaatccccctccctatgttctgaacttatataagcaa
aacactgatgccataaagtgagttcctgctttgacagactcctagcccta
gtgtatttcttgtcagcactcaccattctgctcagcccccgagaagaccc
acagaattggggcctctatgcctgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_67515683_67516353
seq2: B6Ng01-018G06.b_44_714

seq1  GAATTCCTCTTACTCTGAATACTTAACACCTGACTCCAGGCACCTGGCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCTTACTCTGAATACTTAACACCTGACTCCAGGCACCTGGCCC  50

seq1  TCCTTTAAGCAAGCTTACCACTGTGAATCCTTCCTTTGTTTCTTTGATAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTAAGCAAGCTTACCACTGTGAATCCTTCCTTTGTTTCTTTGATAC  100

seq1  ATATGTTGTTGAAGTCTACCTCCCTAGCATAGCTGTAGCCATTTTGTTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTGTTGAAGTCTACCTCCCTAGCATAGCTGTAGCCATTTTGTTCT  150

seq1  GTGCTTGTCAGCTATTTCATATTGTTGCTGTAATATGCCTGCAAGTCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTTGTCAGCTATTTCATATTGTTGCTGTAATATGCCTGCAAGTCATT  200

seq1  GATACAGAAAAAGGACTTGATTCAGAGCAGGGTCACATACTCTGTTATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACAGAAAAAGGACTTGATTCAGAGCAGGGTCACATACTCTGTTATGT  250

seq1  TCTGAATGTTATGAGATTTTGTTTTTTGTTTTTGGTTTGGTTTGGTTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAATGTTATGAGATTTTGTTTTTTGTTTTTGGTTTGGTTTGGTTTTT  300

seq1  TGAGACAGGGTTTCTATGTATAGCCCTGGTTGTCCTGGAACTCACTTTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGACAGGGTTTCTATGTATAGCCCTGGTTGTCCTGGAACTCACTTTGT  350

seq1  AGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAG  400

seq1  TGCTGGGATTAAAAGCATGCGCCACCACGCCGAAATTCCACAACTATAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGATTAAAAGCATGCGCCACCACGCCGAAATTCCACAACTATAAG  450

seq1  CTTCACATAGGTCCCATCCAATTAAATGCCATTATGAACTGTTAATGTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCACATAGGTCCCATCCAATTAAATGCCATTATGAACTGTTAATGTCT  500

seq1  AATATAGCTTGAGTCAGGGCCAACCACCGGGCAGCACTTCAGAATTAGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAGCTTGAGTCAGGGCCAACCACCGGGCAGCACTTCAGAATTAGTG  550

seq1  TATGAGCTCATTGTGTTTTTTTTGCAGTTTTAGCTTTTATAAGCTGATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGCTCATTGTGTTTTTTTTGCAGTTTTAGCTTTTATAAGCTGATGC  600

seq1  AGAAAAATGTTCAGTCAGAGAAGATGCACCCAACCCTCAAGTGACGTGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAATGTTCAGTCAGAGAAGATGCACCCAACCCTCAAGTGACGTGGG  650

seq1  GAGGTCTGGTGGGGTGAGGGT  671
      |||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCTGGTGGGGTGAGGGT  671

seq1: chr8_67672294_67673371
seq2: B6Ng01-018G06.g_68_1143 (reverse)

seq1  TCCAGGC-TAGAGGCCCCAATTCTGTTGGGGTC-TCTCGGGGGCTGAGCA  48
      ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||
seq2  TCCAGGCATAGAGGCCCCAATTCTGT--GGGTCTTCTCGGGGGCTGAGCA  48

seq1  GGATGGTGAGTGCTGACAAGAAATACACTAGGGCTAGGAGTCTGTCAAAG  98
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGTGAGTGCTGACAAGAAATACACTAGGGCTAGGAGTCTGTCAAAG  98

seq1  CAGGAACTCAACTTTATGGCATCAGTGTTTTGCTTATATAAGTTCAGAAC  148
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAACTC-ACTTTATGGCATCAGTGTTTTGCTTATATAAGTTCAGAAC  147

seq1  ATAGGGAGGGGGATTTTTGGTGGGGTAAGATGACATAGGAGTCGGGGAAG  198
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGAGGGGGATTTTT-GTGGGGTAAGATGACATAGGAGTCGGGGAAG  196

seq1  GGTGATGGAGGGTATGGAGTGACTGACAGGGCCAATGGCAAAGCTCTACA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATGGAGGGTATGGAGTGACTGACAGGGCCAATGGCAAAGCTCTACA  246

seq1  TCAGCAACAGCCTGGGCAGAGTCAGGGCCAAACAGGTCTTGCTGAGTCAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAACAGCCTGGGCAGAGTCAGGGCCAAACAGGTCTTGCTGAGTCAT  296

seq1  CCTGATATGGAAGTGACTGAGGCAGGTCTCAAAACTCAAAAATCGAGCCA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATATGGAAGTGACTGAGGCAGGTCTCAAAACTCAAAAATCGAGCCA  346

seq1  GGCTCGGATTTGTCCTCAAGGCCCAAATCAGGGCCAAAATGGGACCCAAC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCGGATTTGTCCTCAAGGCCCAAATCAGGGCCAAAATGGGACCCAAC  396

seq1  ATAGTCATGCTTCTGGTATTTTTTTTTTTTTAACCAGCAATAGAAAAGGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCATGCTTCTGGTATTTTTTTTTTTTTAACCAGCAATAGAAAAGGA  446

seq1  ATAAGCGTTTTTGTTTTGCTAACAAAAATAAAACTTTCCAGTGACTTACT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCGTTTTTGTTTTGCTAACAAAAATAAAACTTTCCAGTGACTTACT  496

seq1  TCACAGGCTACCTAGTAAGCATGCCTTCCAGGAGGAAAGACTGAGCGGAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGGCTACCTAGTAAGCATGCCTTCCAGGAGGAAAGACTGAGCGGAG  546

seq1  GAGGAACTCTATCTCCAGCTGAGCACAGCCAGGATGTGGCTGTAGGTCCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAACTCTATCTCCAGCTGAGCACAGCCAGGATGTGGCTGTAGGTCCT  596

seq1  TGCCCAGGGAGCAAGGCTGCATTCAGAGCTTCAGACTATGGGAAACAGAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGGGAGCAAGGCTGCATTCAGAGCTTCAGACTATGGGAAACAGAC  646

seq1  TCTAGACTCCCTGCAGGCAGCTTTGCCAGCGTTAGTGGATTAAATGTTTA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGACTCCCTGCAGGCAGCTTTGCCAGCGTTAGTGGATTAAATGTTTA  696

seq1  CACATTTAGTATGTGTGTGTCTTTCTTCAGATTTGGTGGTTTGGCCATAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTAGTATGTGTGTGTCTTTCTTCAGATTTGGTGGTTTGGCCATAA  746

seq1  TTGAACTTCAAAGATGACTTAGCAGTAGGTTCTTTTTGGAGTGTAAATAT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACTTCAAAGATGACTTAGCAGTAGGTTCTTTTTGGAGTGTAAATAT  796

seq1  ATTTTCTTGGACAAATTTCCAGTGTGTCTGGGTTTTTCAGTTAGAGCTTC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTTGGACAAATTTCCAGTGTGTCTGGGTTTTTCAGTTAGAGCTTC  846

seq1  TCATATACTTATATGACTTAAAGGGAGCTTCAGATTTGGGGGAGATTGCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATACTTATATGACTTAAAGGGAGCTTCAGATTTGGGGGAGATTGCT  896

seq1  TAGCACTATGTGCTTGCCTCTCAAGCATGAGTACCTGAGTTGGGAGTCGC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACTATGTGCTTGCCTCTCAAGCATGAGTACCTGAGTTGGGAGTCGC  946

seq1  AGTAAAAACCAGGCAAGTGTCTTTCACTCCAGGGCTTGTGGTTAGACAGG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAAACCAGGCAAGTGTCTTTCACTCCAGGGCTTGTGGTTAGACAGG  996

seq1  AAGGTGGGTGTTGGCTGCCTTGCCAGCCCCTCTAGACCAATTGGTGAGCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGGGTGTTGGCTGCCTTGCCAGCCCCTCTAGACCAATTGGTGAGCT  1046

seq1  CTAGGTTCAGTGAGAGGTGGAACAGAATTC  1078
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGTTCAGTGAGAGGTGGAACAGAATTC  1076