BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018I06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 68,918,340 - 69,043,326
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMarch1, 1810029B16Rik, Tktl2
Upstream geneLOC100040967, LOC100040986
Downstream geneNpy5r, Npy1r, BC053440, LOC665453, Nat1, Nat2, LOC100041265
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018I06.bB6Ng01-018I06.g
ACCDH851898DH851899
length1,1471,062
definitionDH851898|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018I06, 5' end.DH851899|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018I06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,918,340 - 68,919,488)(69,042,251 - 69,043,326)
sequence
gaattccttcccttatttctttaaaaggggaaagctaaaagccagtgata
attcctaaagatgctctggtttatgtgacttgcctagagtcagaagatac
tacatggtaacttttatatatattctggatggtcttgtttttattaagcc
tggggtctcacacctttaatccatatgtttggtaagaagatgcagattga
tctctgtgagttaaggccaggctaacctatgtaacaagttccaggtcagc
cagacctacatggtgaaatacatagccaaacagtatcaaaggaattttta
gagccacaagaccatgcttcttgaaaaacaaaatctaactctgagcattg
agcctaagaacctacaagaagtatattttaagttgatcttgatacccatt
cacttgttattcaaacagatctcacaaagaattcataaagcattggtgga
tgagatggctcagtgggtaaaagtacttgaaatcaagcatgacttagttc
aatccctaggacccacatggtagaacgagccaaatacctacccacataaa
caaattacagatttacaatttaaattaaaacatgtgactgaaatggatgc
attggctatggtacataaaataggcacatcttctttgcactacaagtaga
gtacataggtttcgggtacatatagatctatagaacttggaagttttgtt
tggtgacttttttaagatcttccccaaactaacgacattggttatagagt
caaatattcaataaaagttgcattttagacaagaaataaagaagcgttca
tagggacataatagtactacaacaatattcacttgtccgagtttctccga
gcttcaaattgagatggacatcttatgtattcttttaagggtcgcaagaa
taaaatatgagaagatagacaatattctcggaatcatgtaagaactcctt
actataatcatgaatactgctgtatgtaggaaagtattattttgcctcta
cacaagctcattccagtatagcatagccaaaggaggcaggagtgacaata
caccgactttggatatttaccacaatttacaatgcctgattaaatttttg
aagaatatgaagctaggacaagggaggcaggaagatttctaagtaaa
gaattcttaggatacaagtatggaggggaaggacatgtccaaagtacgtt
cataagcttgcataagaatagtcttatgtaacccactatgatgtaatcag
aattaaaagatacaagcagaaactctgaaggggtcagaatgaaactgcag
atgccatgggcatagttcttgttttcaggatttgtagactcaggatttat
aataaattaaagtcacctctattttattcaactgtctgaacacaatttta
ttaagagagttcaaataaataacaaagtaactatgaggcttactgtttta
gatcaacaacacaaaagaaaccagagcaagtcagtccagaacaggggcta
gattttggcatttttataaacacatttaagaatacaattccaaaagtgac
ctgctatagctctgcactggagaactcctggaacacagctctattatggg
cagtggacacctttagataacatgtgtgaggatgccactcagttggcaga
atgtttgtctagcacgcagcaagctccaggtctgatctctgtgtctgcat
aagacaggcctgttacagcagccctgtaatcccagtgcttggcagttaga
ggcaggacaatcagaagtgggagggcactgggggcagcctggaagggata
ggtcagattctatgtctgatgatgctggtgggtgatgacggtgatgatga
taaattatatcactattagcaacaatatgtcatttgttgcccagtgttat
tagacagagatttgttcaacatgctgcaaaatatgtgaagacaggaagaa
tacgttctatgtctttcctttgatattgatggaaagtatctacagaattc
cacagggtatgaaatattttcaaatattggaattaataaaattctattct
caaagtttagaataaagattggttaatctctcatagatgtaatttgagat
attttaaactataaaaacatttcctaaaatattagcagtatttgatttat
attcaaattgtgttactagctatcaaaaggaatgtttttttcctttagga
tacattgcaatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_68918340_68919488
seq2: B6Ng01-018I06.b_43_1189

seq1  GAATTCCTTCCCTTATTTCTTTAAAAGGGGAAAGCTAAAAGCCAGTGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCCTTATTTCTTTAAAAGGGGAAAGCTAAAAGCCAGTGATA  50

seq1  ATTCCTAAAGATGCTCTGGTTTATGTGACTTGCCTAGAGTCAGAAGATAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTAAAGATGCTCTGGTTTATGTGACTTGCCTAGAGTCAGAAGATAC  100

seq1  TACATGGTAACTTTTATATATATTCTGGATGGTCTTGTTTTTATTAAGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGGTAACTTTTATATATATTCTGGATGGTCTTGTTTTTATTAAGCC  150

seq1  TGGGGTCTCACACCTTTAATCCATATGTTTGGTAAGAAGATGCAGATTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTCTCACACCTTTAATCCATATGTTTGGTAAGAAGATGCAGATTGA  200

seq1  TCTCTGTGAGTTAAGGCCAGGCTAACCTATGTAACAAGTTCCAGGTCAGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGTGAGTTAAGGCCAGGCTAACCTATGTAACAAGTTCCAGGTCAGC  250

seq1  CAGACCTACATGGTGAAATACATAGCCAAACAGTATCAAAGGAATTTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACCTACATGGTGAAATACATAGCCAAACAGTATCAAAGGAATTTTTA  300

seq1  GAGCCACAAGACCATGCTTCTTGAAAAACAAAATCTAACTCTGAGCATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCACAAGACCATGCTTCTTGAAAAACAAAATCTAACTCTGAGCATTG  350

seq1  AGCCTAAGAACCTACAAGAAGTATATTTTAAGTTGATCTTGATACCCATT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTAAGAACCTACAAGAAGTATATTTTAAGTTGATCTTGATACCCATT  400

seq1  CACTTGTTATTCAAACAGATCTCACAAAGAATTCATAAAGCATTGGTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGTTATTCAAACAGATCTCACAAAGAATTCATAAAGCATTGGTGGA  450

seq1  TGAGATGGCTCAGTGGGTAAAAGTACTTGAAATCAAGCATGACTTAGTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATGGCTCAGTGGGTAAAAGTACTTGAAATCAAGCATGACTTAGTTC  500

seq1  AATCCCTAGGACCCACATGGTAGAACGAGCCAAATACCTACCCACATAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCTAGGACCCACATGGTAGAACGAGCCAAATACCTACCCACATAAA  550

seq1  CAAATTACAGATTTACAATTTAAATTAAAACATGTGACTGAAATGGATGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTACAGATTTACAATTTAAATTAAAACATGTGACTGAAATGGATGC  600

seq1  ATTGGCTATGGTACATAAAATAGGCACATCTTCTTTGCACTACAAGTAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTATGGTACATAAAATAGGCACATCTTCTTTGCACTACAAGTAGA  650

seq1  GTACATAGGTTTC-GGTACATATAGATCTATAGAACTTGGAAGTTTTGTT  699
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATAGGTTTCGGGTACATATAGATCTATAGAACTTGGAAGTTTTGTT  700

seq1  TGGTGAC-TTTTTAAGATCTTCCCCAAACTAACGACATTGGTTATAGAGT  748
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGACTTTTTTAAGATCTTCCCCAAACTAACGACATTGGTTATAGAGT  750

seq1  CAAATATTCAATAAAAGTTGCATTTAAGACAAGAAATAAAGAAGCGTTCA  798
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATATTCAATAAAAGTTGCATTTTAGACAAGAAATAAAGAAGCGTTCA  800

seq1  TAGGGACATAATAGTACTACAACAATATTCACTTGTCCGAGTTTCTCCGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGACATAATAGTACTACAACAATATTCACTTGTCCGAGTTTCTCCGA  850

seq1  GCTTCAAATTGAGATGGACATCTTATGTATTCTTTTAAGGGTCGCAAGAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAAATTGAGATGGACATCTTATGTATTCTTTTAAGGGTCGCAAGAA  900

seq1  T-AAATATGAGAAGATAGACAATATTCTCGAAATCATGTAAGAACTCCTT  947
      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATGAGAAGATAGACAATATTCTCGGAATCATGTAAGAACTCCTT  950

seq1  ACTATAATCATGAATACTGCTGTATGTAGG-AAGTA-TAATTTGCCTCTA  995
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||
seq2  ACTATAATCATGAATACTGCTGTATGTAGGAAAGTATTATTTTGCCTCTA  1000

seq1  CACAAGCTCATTCAAGTAAAGGCATAGCCAAGGAAGGCAGGAGTGACATC  1045
      ||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||  
seq2  CACAAGCTCATTCCAGTATA-GCATAGCCAAAGGAGGCAGGAGTGACAAT  1049

seq1  ACA-CAACTTTTGATATTTACCACAATTTTACATATGCATGATTAAA-TT  1093
      ||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||
seq2  ACACCGACTTTGGATATTTACCACAA-TTTACA-ATGCCTGATTAAATTT  1097

seq1  TTGTAGAGATATGAAAGCTAGGACAAATGTGATGCAGGTAAGATTTCTAA  1143
      ||| ||| ||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||| |
seq2  TTGAAGA-ATATG-AAGCTAGGACAA--GGGAGGCAGG-AAGATTTCT-A  1141

seq1  AGTAAA  1149
      ||||||
seq2  AGTAAA  1147

seq1: chr8_69042251_69043326
seq2: B6Ng01-018I06.g_69_1130 (reverse)

seq1  AATTGCAATGTATTTCATTAAAGTGAAAAAAAAACACTTCCTTTTGATAG  50
      |||||||||||||     |||||    ||||||||| |||||||||||||
seq2  AATTGCAATGTAT---CCTAAAG---GAAAAAAACA-TTCCTTTTGATAG  43

seq1  ACTAGTAACAACAAATATGAAATTATAAATCAAATACTGCTAATATTTTA  100
       |||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||
seq2  -CTAGTAACA--CAATTTGAA--TATAAATCAAATACTGCTAATATTTTA  88

seq1  GGAAATGTTTTTTATAGTTTAAAATATCTCAAATTTACATTCTTATGAGA  150
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||
seq2  GGAAATG-TTTTTATAGTTTAAAATATCTCAAA-TTACAT--CTATGAGA  134

seq1  GATTAACCAATCTTTATTCTAAACTTTTGAGAATAGAATTTTATTAATTC  200
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAACCAATCTTTATTCTAAAC-TTTGAGAATAGAATTTTATTAATTC  183

seq1  CAATATTTG-AAATATTTCATACCTTGTGGAATTCTGTAGATACTTTCCA  249
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATATTTGAAAATATTTCATACCCTGTGGAATTCTGTAGATACTTTCCA  233

seq1  TCATTATCAAAGGAAAGACATAGAACGTATTCTTCCTGTCTTCACATATT  299
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATATCAAAGGAAAGACATAGAACGTATTCTTCCTGTCTTCACATATT  283

seq1  TTGCAGCATGTTGAAC-AATCTCTGTCTAATAACACTGGGCAAC-AATGA  347
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTGCAGCATGTTGAACAAATCTCTGTCTAATAACACTGGGCAACAAATGA  333

seq1  CATATTGTTGCTAATAGTGATATAATTTATCATCATCACCGTCATCACCC  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATTGTTGCTAATAGTGATATAATTTATCATCATCACCGTCATCACCC  383

seq1  ACCAGCATCATCAGACATAGAATCTGACCTATCCCTTCCAGGCTGCCCCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCATCATCAGACATAGAATCTGACCTATCCCTTCCAGGCTGCCCCC  433

seq1  AGTGCCCTCCCACTTCTGATTGTCCTGCCTCTAACTGCCAAGCACTGGGA  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCCTCCCACTTCTGATTGTCCTGCCTCTAACTGCCAAGCACTGGGA  483

seq1  TTACAGGGCTGCTGTAACAGGCCTGTCTTATGCAGACACAGAGATCAGAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGGGCTGCTGTAACAGGCCTGTCTTATGCAGACACAGAGATCAGAC  533

seq1  CTGGAGCTTGCTGCGTGCTAGACAAACATTCTGCCAACTGAGTGGCATCC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGCTTGCTGCGTGCTAGACAAACATTCTGCCAACTGAGTGGCATCC  583

seq1  TCACACATGTTATCTAAAGGTGTCCACTGCCCATAATAGAGCTGTGTTCC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACATGTTATCTAAAGGTGTCCACTGCCCATAATAGAGCTGTGTTCC  633

seq1  AGGAGTTCTCCAGTGCAGAGCTATAGCAGGTCACTTTTGGAATTGTATTC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTTCTCCAGTGCAGAGCTATAGCAGGTCACTTTTGGAATTGTATTC  683

seq1  TTAAATGTGTTTATAAAAATGCCAAAATCTAGCCCCTGTTCTGGACTGAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATGTGTTTATAAAAATGCCAAAATCTAGCCCCTGTTCTGGACTGAC  733

seq1  TTGCTCTGGTTTCTTTTGTGTTGTTGATCTAAAACAGTAAGCCTCATAGT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCTGGTTTCTTTTGTGTTGTTGATCTAAAACAGTAAGCCTCATAGT  783

seq1  TACTTTGTTATTTATTTGAACTCTCTTAATAAAATTGTGTTCAGACAGTT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTGTTATTTATTTGAACTCTCTTAATAAAATTGTGTTCAGACAGTT  833

seq1  GAATAAAATAGAGGTGACTTTAATTTATTATAAATCCTGAGTCTACAAAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAATAGAGGTGACTTTAATTTATTATAAATCCTGAGTCTACAAAT  883

seq1  CCTGAAAACAAGAACTATGCCCATGGCATCTGCAGTTTCATTCTGACCCC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAAACAAGAACTATGCCCATGGCATCTGCAGTTTCATTCTGACCCC  933

seq1  TTCAGAGTTTCTGCTTGTATCTTTTAATTCTGATTACATCATAGTGGGTT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAGTTTCTGCTTGTATCTTTTAATTCTGATTACATCATAGTGGGTT  983

seq1  ACATAAGACTATTCTTATGCAAGCTTATGAACGTACTTTGGACATGTCCT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAGACTATTCTTATGCAAGCTTATGAACGTACTTTGGACATGTCCT  1033

seq1  TCCCCTCCATACTTGTATCCTAAGAATTC  1076
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCCATACTTGTATCCTAAGAATTC  1062