BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023K02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 95,631,544 - 95,780,524
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEs1, LOC676523, Ces3, Es22, AU018778
Upstream gene4933436C20Rik, Irx5, Irx6, LOC100041325, Mmp2, Aytl1, Capns2, LOC100040752, Slc6a2, EG244595, LOC382044
Downstream geneCes1, 2310039D24Rik, Ces7, Gnao1, Amfr, Nudt21, Ogfod1, Bbs2, Mt4, Mt3, Mt2, Mt1, Nup93, LOC100041555
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023K02.bB6Ng01-023K02.g
ACCDH855496DH855497
length1,0541,068
definitionDH855496|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023K02, 5' end.DH855497|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023K02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,631,544 - 95,632,606)(95,779,454 - 95,780,524)
sequence
gaattccagtaaattaagaagaaccaaacagaaaaaaacaggaaaaccaa
atgaagtaaaggtgcttagggggtggtgttaacagatatgggagtttatg
attctcaaaaaaatcagcaagcaaaactaatggacttatattaataaagc
taagccatagagagaagacagtcacgtgactgtatttcatacactaggag
gatcaacattcctcaaggcagcagatctttcaggccagtgtcatatggaa
gccgaatgctcagggacagagtacacaggccacacaccctcagactcagg
tgacaggggaaagaggtcctcgcattgtgtttctctgtctatgtttctgt
gatgccccatgaggtccttctgcaagagagttgcagaacactgggaatgt
gctgagcctgctcatgtttgcattcagagatctgctctggtttcagtgtg
tcttttagcattggaaaccacgccacaggccaaaaccagggccctaaaat
gtctgctggagagagctcaacattgctgagtttggtggtgggcagtcaag
gccctgagcccctcttgagtagctactttagaaagtttctaattattaat
tccttttctggcacagatataaattaacactgaaggggctttatcaagaa
ttctcaaaacaaatttactttgtaaagatataagcctctttaaatggtag
tcatctgggtgcataaacctcagtcagagcagggagcatgatggctgaac
ctctgtggagtgtatctaagaggtctgtacattctcaccattggaattat
ccagccaaactcttgcttgttgaagcccactatgtaggggacagtgttga
aactcttctcagccaggatctcttctggtgcctttggcagcaccactccg
tcaatcatggtggacagggagatattgtactgggtaaacaggaatgcagt
actatgaataccatagcttacctttgagcacatctcccctttgctggttt
gagagcttgccaagcataaaacttctgtacctagaccagaaacccatgtt
taaa
gaattctatttgattctgttcccaggaaccctaatggcaaagggctgcct
cattggccaaagtatgatcagaaagaaggatatcttcatattggtggcac
cacccagcaagcccagagactgaaggaagaggaagtgactttctggacac
agtcccttgccaagaaacaaccccagccataccacaatgagctgtgaatg
caaagctctgccaggcttataccagagaagccaagatatggttcttccac
taacagtgtatgtaaatccaagatggatcttggaggatcctgaagaactt
tgtcatagatataggcagagcccagggaagggaaatgttgtatttatgtc
tttaatttagagaataaatgttctttatatggtcaaataagtatttgtgt
tttagactgactataaatgcatgtatcccagaaagagagtaagaggtggg
ggaagggagagagaaacaaaaaagggagagaaaggagacagaattcataa
aaaaagatctttcacaagaagtaccttggcaaaacagttactttgaaatc
aaagagaaaagaaacatgttgcagaaaaaaacaggttttgaatttaggct
tttcttatacctccgatgggagacatcatccagcatcaaggagaacaata
ctaacatttcataacgttctagagatgaagtgagagacgaatatgagagt
ttgaaagctactggaactgcatattgaaggaaacactacagacttctcta
tgtatattgtcaagtgctcatggaaaaattcagatgcatgtttaagacct
tagatgtcttatctcccgctgggctacacccccagactgtgaagcaaaag
aaccctacctttgtcagtcatttgattatggcaatgtaaacagtaataag
tacacagtttttttggccttcagttcttccctgagaggtctgaagttact
ctgaggagtttgtgagaggctgacattctttctcttccgactttaacatt
gtgactagactaatgagagatacgaattggtttctgtgggaacttttcct
cccaattccagctcttca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_95631544_95632606
seq2: B6Ng01-023K02.b_39_1092

seq1  GAATTCCAGTAAATTAAGAAGAACCAAACAGAAAAAAACAGGAAAACCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTAAATTAAGAAGAACCAAACAGAAAAAAACAGGAAAACCAA  50

seq1  ATGAAGTAAAGGTGCTTAGGGGGTGGTGTTAACAGATATGGGAGTTTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGTAAAGGTGCTTAGGGGGTGGTGTTAACAGATATGGGAGTTTATG  100

seq1  ATTCTCAAAAAAATCAGCAAGCAAAACTAATGGACTTATATTAATAAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTCAAAAAAATCAGCAAGCAAAACTAATGGACTTATATTAATAAAGC  150

seq1  TAAGCCATAGAGAGAAGACAGTCACGTGACTGTATTTCATACACTAGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCCATAGAGAGAAGACAGTCACGTGACTGTATTTCATACACTAGGAG  200

seq1  GATCAACATTCCTCAAGGCAGCAGATCTTTCAGGCCAGTGTCATATGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAACATTCCTCAAGGCAGCAGATCTTTCAGGCCAGTGTCATATGGAA  250

seq1  GCCGAATGCTCAGGGACAGAGTACACAGGCCACACACCCTCAGACTCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCGAATGCTCAGGGACAGAGTACACAGGCCACACACCCTCAGACTCAGG  300

seq1  TGACAGGGGAAAGAGGTCCTCGCATTGTGTTTCTCTGTCTATGTTTCTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGGGGAAAGAGGTCCTCGCATTGTGTTTCTCTGTCTATGTTTCTGT  350

seq1  GATGCCCCATGAGGTCCTTCTGCAAGAGAGTTGCAGAACACTGGGAATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCCCATGAGGTCCTTCTGCAAGAGAGTTGCAGAACACTGGGAATGT  400

seq1  GCTGAGCCTGCTCATGTTTGCATTCAGAGATCTGCTCTGGTTTCAGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGCCTGCTCATGTTTGCATTCAGAGATCTGCTCTGGTTTCAGTGTG  450

seq1  TCTTTTAGCATTGGAAACCACGCCACAGGCCAAAACCAGGGCCCTAAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTAGCATTGGAAACCACGCCACAGGCCAAAACCAGGGCCCTAAAAT  500

seq1  GTCTGCTGGAGAGAGCTCAACATTGCTGAGTTTGGTGGTGGGCAGTCAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCTGGAGAGAGCTCAACATTGCTGAGTTTGGTGGTGGGCAGTCAAG  550

seq1  GCCCTGAGCCCCTCTTGAGTAGCTACTTTAGAAAGTTTCTAATTATTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGAGCCCCTCTTGAGTAGCTACTTTAGAAAGTTTCTAATTATTAAT  600

seq1  TCCTTTTCTGGCACAGATATAAATTAACACTGAAGGGGCTTTATCAAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTCTGGCACAGATATAAATTAACACTGAAGGGGCTTTATCAAGAA  650

seq1  TTCTCAAAACAAATTTACTTTGTAAAGATATAAGCCTCTTTAAATGGTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAAAACAAATTTACTTTGTAAAGATATAAGCCTCTTTAAATGGTAG  700

seq1  TCATCTGGGTGCATAAACCTCAGTCAGAGCAGGGAGCATGATGGCTGAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTGGGTGCATAAACCTCAGTCAGAGCAGGGAGCATGATGGCTGAAC  750

seq1  CTCTGTGGAGTGTATCTAAGAGGTCTGTACATTCTCACCATTGGAATTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGGAGTGTATCTAAGAGGTCTGTACATTCTCACCATTGGAATTAT  800

seq1  CCAGCCAAACTCTTGCTTGTTGAAGCCCACTATGTAGGGGACAGTGTTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCAAACTCTTGCTTGTTGAAGCCCACTATGTAGGGGACAGTGTTGA  850

seq1  AACTCTTCTCAGCCAGGATCTCTTCTGGTGCCTTTGGCAGCACCACTCCG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTTCTCAGCCAGGATCTCTTCTGGTGCCTTTGGCAGCACCACTCCG  900

seq1  TCAATCATGGTGGACAGGGAGATATTGTACTGGGTAAAACAGGAATGCAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCAATCATGGTGGACAGGGAGATATTGTACTGGGT-AAACAGGAATGCAG  949

seq1  TACTTATGAATACCATAGCTTACCTTTGAGCCACATCTCCCCTTTGCTGG  1000
      ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TAC-TATGAATACCATAGCTTACCTTTGAG-CACATCTCCCCTTTGCTGG  997

seq1  TCTGAGAGCTTGCCAAGCATAAAGACTTCTGTAGCTATAGACACAGAAAC  1050
      | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||
seq2  TTTGAGAGCTTGCCAAGCATAAA-ACTTCTGTACC--TAGAC-CAGAAAC  1043

seq1  CCAATGTTCTAAA  1063
      || ||||| ||||
seq2  CC-ATGTT-TAAA  1054

seq1: chr8_95779454_95780524
seq2: B6Ng01-023K02.g_68_1135 (reverse)

seq1  TGAAGAGCTGGAATTTGGGGAGAGAAGGTTCCCACAGGAACCAATTCG-A  49
      |||||||||||||||  |||||  || |||||||||| |||||||||| |
seq2  TGAAGAGCTGGAATT--GGGAGGAAAAGTTCCCACAGAAACCAATTCGTA  48

seq1  TCTCCTCA-TAGTCTAGTCACAATGTTAAAAGTCGGAAGAGAAAG-ATGT  97
      ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
seq2  TCT-CTCATTAGTCTAGTCACAATGTT-AAAGTCGGAAGAGAAAGAATGT  96

seq1  CAGCCTTCTCACAAACTCCTCAGAGTAACTTCAGACCTCTCAGGGAAGAA  147
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCC-TCTCACAAACTCCTCAGAGTAACTTCAGACCTCTCAGGGAAGAA  145

seq1  CTGAAGGCCAGAAAAACCTGTGTACTTATTACTGTTTACATTGCCATAAT  197
      |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAGGCCA-AAAAAACTGTGTACTTATTACTGTTTACATTGCCATAAT  194

seq1  CAAATGACTGACAAAGGTAGGGTTTCTTTTGCTTCACAGTCTGGGGGTGT  247
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGACTGACAAAGGTAGGG-TTCTTTTGCTTCACAGTCTGGGGGTGT  243

seq1  AGCCCAGCGGGAGATAAGACATCTAAGGTCTTAAACATGCATCTGAATTT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGCGGGAGATAAGACATCTAAGGTCTTAAACATGCATCTGAATTT  293

seq1  TTCCATGAGCACTTGACAATATACATAGAGAAGTCTGTAGTG-TTCCTTC  346
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTCCATGAGCACTTGACAATATACATAGAGAAGTCTGTAGTGTTTCCTTC  343

seq1  AATATGCAGTTCCAGTAGCTTTCAAACTCTCATATTCGTCTCTCACTTCA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCAGTTCCAGTAGCTTTCAAACTCTCATATTCGTCTCTCACTTCA  393

seq1  TCTCTAGAACGTTATGAAATGTTAGTATTGTTCTCCTTGATGCTGGATGA  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAGAACGTTATGAAATGTTAGTATTGTTCTCCTTGATGCTGGATGA  443

seq1  TGTCTCCCATCGGAGGTATAAGAAAAGCCTAAATTCAAAACCTGTTTTTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCCATCGGAGGTATAAGAAAAGCCTAAATTCAAAACCTGTTTTTT  493

seq1  TCTGCAACATGTTTCTTTTCTCTTTGATTTCAAAGTAACTGTTTTGCCAA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAACATGTTTCTTTTCTCTTTGATTTCAAAGTAACTGTTTTGCCAA  543

seq1  GGTACTTCTTGTGAAAGATCTTTTTTTATGAATTCTGTCTCCTTTCTCTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACTTCTTGTGAAAGATCTTTTTTTATGAATTCTGTCTCCTTTCTCTC  593

seq1  CCTTTTTTGTTTCTCTCTCCCTTCCCCCACCTCTTACTCTCTTTCTGGGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTTGTTTCTCTCTCCCTTCCCCCACCTCTTACTCTCTTTCTGGGA  643

seq1  TACATGCATTTATAGTCAGTCTAAAACACAAATACTTATTTGACCATATA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCATTTATAGTCAGTCTAAAACACAAATACTTATTTGACCATATA  693

seq1  AAGAACATTTATTCTCTAAATTAAAGACATAAATACAACATTTCCCTTCC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACATTTATTCTCTAAATTAAAGACATAAATACAACATTTCCCTTCC  743

seq1  CTGGGCTCTGCCTATATCTATGACAAAGTTCTTCAGGATCCTCCAAGATC  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCTCTGCCTATATCTATGACAAAGTTCTTCAGGATCCTCCAAGATC  793

seq1  CATCTTGGATTTACATACACTGTTAGTGGAAGAACCATATCTTGGCTTCT  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTGGATTTACATACACTGTTAGTGGAAGAACCATATCTTGGCTTCT  843

seq1  CTGGTATAAGCCTGGCAGAGCTTTGCATTCACAGCTCATTGTGGTATGGC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTATAAGCCTGGCAGAGCTTTGCATTCACAGCTCATTGTGGTATGGC  893

seq1  TGGGGTTGTTTCTTGGCAAGGGACTGTGTCCAGAAAGTCACTTCCTCTTC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGTTGTTTCTTGGCAAGGGACTGTGTCCAGAAAGTCACTTCCTCTTC  943

seq1  CTTCAGTCTCTGGGCTTGCTGGGTGGTGCCACCAATATGAAGATATCCTT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGTCTCTGGGCTTGCTGGGTGGTGCCACCAATATGAAGATATCCTT  993

seq1  CTTTCTGATCATACTTTGGCCAATGAGGCAGCCCTTTGCCATTAGGGTTC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGATCATACTTTGGCCAATGAGGCAGCCCTTTGCCATTAGGGTTC  1043

seq1  CTGGGAACAGAATCAAATAGAATTC  1071
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGAACAGAATCAAATAGAATTC  1068