BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-025P17
Chromosome8 (Build37)
Map Location 33,708,681 - 33,867,154
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG330731, LOC100041340, Nrg1, 2010007E15Rik, EG666589, EG546052
Downstream geneLOC100042715, LOC628408, EG628412, Wrn, Purg, LOC666630, Hmgb1-rs17, Tex15, Ppp2cb, Ubxd6, Gsr, Gtf2e2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-025P17.bB6Ng01-025P17.g
ACCDH857160DH857161
length1,0311,033
definitionDH857160|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025P17, 5' end.DH857161|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-025P17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,708,681 - 33,709,576)(33,866,117 - 33,867,154)
sequence
gaattcttacacatgcatctctgttttaaggagcgaggataacattaaag
aaggcaagtatgccctgaaaaagaagagaaatgaatgaatatatatttca
cggacattctagttgaatatttgtccttgcccaagttcacaatgaaattt
aatcgttctcatgttggtactggaaggtgggacttaagatattgaggtta
ttatggttatgcattcacacgcaagtactgtaatcttataaagctgtttg
ccctctcgtaggaatattttgcatttctctttctgcttccccaccctgcg
ccccttgccttcctaccaggtgatgcctcctgccatatgatgactcaata
aaaggtttacaccagaatccatcattttaacattagatttctcaaccaac
tcccaatccccaccccttgcagctgcatattcttattcattcttctggcc
atctgggcttctccctcccatacctcatcctgccccctttccctcctatc
cctctcaggtccctcccttcttctgccccaccccatggttattttattcc
cctttttaaatgggattgaagcattttcacttgggctttccttcttttaa
acctcttatggtcaatgagttgtatcatgggtgaaagtcccagagacatg
gatgtgaggatctcaggacacaatagagatgatctaatccaaatgctcaa
cactggggagatggaacctagagagaccttccagtagacagacagggccc
ccagtagagagatggagccacccacccatcttcaaagtctttgacccaga
attgttcctttctaaaggaagcgcaggaataaaaatggaaaggccatcct
gtgattggcccaatttgtgatccaacctatgtataggcaccaaacctcga
cacaattactaatgccactttgtgcttgtagacaggaacagagcatgatt
gtcctctgagagctctaccagcagctgactgagacagatgcagatacttc
cagccaagcattggactgaggtcagaaccct
gaattcctgtgtttctatccagccagtcttaggagaccctgtagtcccca
accgtctgacaaaagtagtctaagtgtgccgtccacgtagcaaacaaatc
ttcagcatcttcttagtctgaggtctgaatgcatgtgtaggggtaatgaa
gagcaactcatcttattgtggaaactactggctcgacattaaatcctctg
actagtggtgttctttgcaaagttaactttaattctgttcctgctgttct
ttgaacaaccttgcaaaacattcagtctttctatcaaatccaattaccat
tgtaagaaatgagcttttctgctatcctggttcattctctgccaatgctc
tttccacatagaaaaggttgctctccaaattggtcatatgcattaatgaa
attatcaaagagtaattaagaagttgggcttagcttactgatgagattcc
ccccaccttcacacatcatttatgaagacaacaacagaaatgttactcaa
ggattcaccagaaaataatcatagctgggaaattgaggcacaaaggtgtt
aaatatctcacttcatagtaaaagataaggccagcacttgaatccatgta
acatctgttaattgcatcccttccctcaaaggtgaaaaagaggaattgaa
tgtcagatagtaaaagaatatttttaaaaattttgataaatgcacataat
gcatcatgtgaccattatcctgtttataaggactttaacaaatgagaaaa
tgcagagtttaaatgttgagggaaacatttaaggtggtagtactatgatg
gtgactcaagaaaaatcaaaggatagagagggctcaaagccccaagcatt
tgccacaatgatcactcataacttcctgtcttcagatgtgctgggttata
acatagaaaagttacactctcactcatgtaaattgcctaatctctcattt
acatactctattatcattttcagaaatgagtacctgctgtctccatataa
taataggattcacattacaataaagtgaacaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_33708681_33709576
seq2: B6Ng01-025P17.b_45_940

seq1  GAATTCTTACACATGCATCTCTGTTTTAAGGAGCGAGGATAACATTAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTACACATGCATCTCTGTTTTAAGGAGCGAGGATAACATTAAAG  50

seq1  AAGGCAAGTATGCCCTGAAAAAGAAGAGAAATGAATGAATATATATTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAAGTATGCCCTGAAAAAGAAGAGAAATGAATGAATATATATTTCA  100

seq1  CGGACATTCTAGTTGAATATTTGTCCTTGCCCAAGTTCACAATGAAATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGACATTCTAGTTGAATATTTGTCCTTGCCCAAGTTCACAATGAAATTT  150

seq1  AATCGTTCTCATGTTGGTACTGGAAGGTGGGACTTAAGATATTGAGGTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCGTTCTCATGTTGGTACTGGAAGGTGGGACTTAAGATATTGAGGTTA  200

seq1  TTATGGTTATGCATTCACACGCAAGTACTGTAATCTTATAAAGCTGTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGGTTATGCATTCACACGCAAGTACTGTAATCTTATAAAGCTGTTTG  250

seq1  CCCTCTCGTAGGAATATTTTGCATTTCTCTTTCTGCTTCCCCACCCTGCG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCTCGTAGGAATATTTTGCATTTCTCTTTCTGCTTCCCCACCCTGCG  300

seq1  CCCCTTGCCTTCCTACCAGGTGATGCCTCCTGCCATATGATGACTCAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTTGCCTTCCTACCAGGTGATGCCTCCTGCCATATGATGACTCAATA  350

seq1  AAAGGTTTACACCAGAATCCATCATTTTAACATTAGATTTCTCAACCAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTTTACACCAGAATCCATCATTTTAACATTAGATTTCTCAACCAAC  400

seq1  TCCCAATCCCCACCCCTTGCAGCTGCATATTCTTATTCATTCTTCTGGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAATCCCCACCCCTTGCAGCTGCATATTCTTATTCATTCTTCTGGCC  450

seq1  ATCTGGGCTTCTCCCTCCCATACCTCATCCTGCCCCCTTTCCCTCCTATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGGCTTCTCCCTCCCATACCTCATCCTGCCCCCTTTCCCTCCTATC  500

seq1  CCTCTCAGGTCCCTCCCTTCTTCTGCCCCACCCCATGGTTATTTTATTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCAGGTCCCTCCCTTCTTCTGCCCCACCCCATGGTTATTTTATTCC  550

seq1  CCTTTTTAAATGGGATTGAAGCATTTTCACTTGGGCTTTCCTTCTTTTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTAAATGGGATTGAAGCATTTTCACTTGGGCTTTCCTTCTTTTAA  600

seq1  ACCTCTTATGGTCAATGAGTTGTATCATGGGTGAAAGTCCCAGAGACATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTTATGGTCAATGAGTTGTATCATGGGTGAAAGTCCCAGAGACATG  650

seq1  GATGTGAGGATCTCAGGACACAATAGAGATGATCTAATCCAAATGCTCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGAGGATCTCAGGACACAATAGAGATGATCTAATCCAAATGCTCAA  700

seq1  CACTGGGGAGATGGAACCTAGAGAGACCTTCCAGTAGACAGACAGGGCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGGGAGATGGAACCTAGAGAGACCTTCCAGTAGACAGACAGGGCCC  750

seq1  CCAGTAGAGAGATGGAGCCACCCACCCATCTTCAAAGTCTTTGACCCAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAGAGAGATGGAGCCACCCACCCATCTTCAAAGTCTTTGACCCAGA  800

seq1  ATTGTTCCTTTCTAAAGGAAGCGCAGGAATAAAAATGGAAAGGCCATCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTCCTTTCTAAAGGAAGCGCAGGAATAAAAATGGAAAGGCCATCCT  850

seq1  GTGATTGGCCCAATTTGTGATCCAACCTATGTATAGGCACCAAACC  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTGGCCCAATTTGTGATCCAACCTATGTATAGGCACCAAACC  896

seq1: chr8_33866117_33867154
seq2: B6Ng01-025P17.g_67_1099 (reverse)

seq1  ATTGTTCACTTTATTGTAATGTGGAATCCTATTATTATATTGGAGACAGC  50
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ATTGTTCACTTTATTGTAATGT-GAATCCTATTATTATA-TGGAGACAGC  48

seq1  AGGTACTCATTTCTGAAAATGATAATAGAAGTATGTAAATTGAGAGATTA  100
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  AGGTACTCATTTCTGAAAATGATAATAG-AGTATGTAAA-TGAGAGATTA  96

seq1  GGCAATTTACATGAGTGAGAGTTGTAACTTTTCTATGTTATAACCCAGCA  150
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAATTTACATGAGTGAGAG-TGTAACTTTTCTATGTTATAACCCAGCA  145

seq1  CATCTGAAGACAGGAAGTTATGAGTGATCATTGTGGCAAATGCTTGGGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGAAGACAGGAAGTTATGAGTGATCATTGTGGCAAATGCTTGGGGC  195

seq1  TTTGAGCCCTCTCTATCCTTTGATTTTTCTTGAGTCACCATCATAGTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGCCCTCTCTATCCTTTGATTTTTCTTGAGTCACCATCATAGTACT  245

seq1  ACCACCTTAAATGTTTCCCTCAACATTTAAACTCTGCATTTTCTCATTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCTTAAATGTTTCCCTCAACATTTAAACTCTGCATTTTCTCATTTG  295

seq1  TTAAAGTCCTTATAAACAGGATAATGGTCACATGATGCATTATGTGCATT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTCCTTATAAACAGGATAATGGTCACATGATGCATTATGTGCATT  345

seq1  TATCAAAATTTTTAAAAATATTCTTTTACTATCTGACATTCAATTCCTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAAAATTTTTAAAAATATTCTTTTACTATCTGACATTCAATTCCTCT  395

seq1  TTTTCACCTTTGAGGGAAGGGATGCAATTAACAGATGTTACATGGATTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCACCTTTGAGGGAAGGGATGCAATTAACAGATGTTACATGGATTCA  445

seq1  AGTGCTGGCCTTATCTTTTACTATGAAGTGAGATATTTAACACCTTTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGGCCTTATCTTTTACTATGAAGTGAGATATTTAACACCTTTGTG  495

seq1  CCTCAATTTCCCAGCTATGATTATTTTCTGGTGAATCCTTGAGTAACATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAATTTCCCAGCTATGATTATTTTCTGGTGAATCCTTGAGTAACATT  545

seq1  TCTGTTGTTGTCTTCATAAATGATGTGTGAAGGTGGGGGGAATCTCATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTGTTGTCTTCATAAATGATGTGTGAAGGTGGGGGGAATCTCATCA  595

seq1  GTAAGCTAAGCCCAACTTCTTAATTACTCTTTGATAATTTCATTAATGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCTAAGCCCAACTTCTTAATTACTCTTTGATAATTTCATTAATGCA  645

seq1  TATGACCAATTTGGAGAGCAACCTTTTCTATGTGGAAAGAGCATTGGCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGACCAATTTGGAGAGCAACCTTTTCTATGTGGAAAGAGCATTGGCAG  695

seq1  AGAATGAACCAGGATAGCAGAAAAGCTCATTTCTTACAATGGTAATTGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGAACCAGGATAGCAGAAAAGCTCATTTCTTACAATGGTAATTGGA  745

seq1  TTTGATAGAAAGACTGAATGTTTTGCAAGGTTGTTCAAAGAACAGCAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATAGAAAGACTGAATGTTTTGCAAGGTTGTTCAAAGAACAGCAGGA  795

seq1  ACAGAATTAAAGTTAACTTTGCAAAGAACACCACTAGTCAGAGGATTTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAATTAAAGTTAACTTTGCAAAGAACACCACTAGTCAGAGGATTTAA  845

seq1  TGTCGAGCCAGTAGTTTCCACAATAAGATGAGTTGCTCTTCATTACCCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCGAGCCAGTAGTTTCCACAATAAGATGAGTTGCTCTTCATTACCCCT  895

seq1  ACACATGCATTCAGACCTCAGACTAAGAAGATGCTGAAGATTTGTTTGCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGCATTCAGACCTCAGACTAAGAAGATGCTGAAGATTTGTTTGCT  945

seq1  ACGTGGACGGCACACTTAGACTACTTTTGTCAGACGGTTGGGGACTACAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTGGACGGCACACTTAGACTACTTTTGTCAGACGGTTGGGGACTACAG  995

seq1  GGTCTCCTAAGACTGGCTGGATAGAAACACAGGAATTC  1038
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCCTAAGACTGGCTGGATAGAAACACAGGAATTC  1033