BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032D15
Chromosome8 (Build37)
Map Location 37,578,585 - 37,732,154
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlc1, LOC100042892
Upstream geneMfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23, LOC671641, D8Ertd82e, Lonrf1, EG544878, 6430573F11Rik
Downstream geneA730069N07Rik, AI429214, LOC666877, LOC100041616, 1700016D18Rik, LOC641121, LOC621149, Sgcz
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032D15.bB6Ng01-032D15.g
ACCDH861623DH861624
length1,096857
definitionDH861623|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032D15, 5' end.DH861624|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032D15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,731,053 - 37,732,154)(37,578,585 - 37,579,445)
sequence
gaattcaggcagtatgatcaagaaggtgttaagaaacaagccaattagtt
tgcatttatagttacagtgcaaaatacaagacaggtgcttctaccactaa
ctgatttgaaaagccttctctccacttagtcatctgtaaaggcaacagag
gaatttgaccacaagcattctcataaaaaagtttaaaaaacagtcctctg
gctgagttaataaaggactggaacagttcagaatttccagccagagtgtg
acaggtaattggttgagatcggcaaaataccgagcgactatttaaaaaga
ggtcatgttttcagatcattaaagcacagtgttttatttgccagtgattt
attttatttgtaacataccctgctcataatgaaactaaacacccatgccc
tgagctccatgaaatactttattgcttctaaaacctgtgagcatacgtgt
gtctgtgtgtgtttggaatgtgttaaaaaaaaaaagttaaaattattcca
agatggtgtataattatttatttctaggtttaaaaagttgtttgattttt
ttttccttaactctggaatttgaactttgcctatcagagcttatcaacag
aaagctaacgctaactcaaaagtctacaggaaacagtagtgtgtttaacc
ttaacctgggtttgaagtcctcgttaccttgacctgcaaataactgaaag
tgaatggatttggtagacaactactcttgtcaagtccagggctgccccag
cttctgaatggttagtgagcacagcctgaaaggcttgcccatcaatggct
ccgggtggtatacctccggggattcactatgccaaatgagtcttggaaca
tctctcacctggtagcgagattttccttaatcggagacttttgtcactga
acatttttgtttcacaacaaaaatgacccaatgcacatcaaagatccaag
aagcactaatgttgtggctacataaaggggtcctacagatgtctctcata
gcaacagcaccagggaggtgactctaaagtgagtcaccttctcatgaaga
gattaactgaaatcaatctaactacaaaggctctttcttatcatgt
gaattcaaaagtacttaagtactatttattggtcactgaacaaacaaatg
aacactggtggatctttcacatacatgggcttccaggagagcagaaaatg
ggaccctagttgtactcactatggaagcgaatgccttaaaagtaaggtgt
gaggggctagggagtggcttactgattttagagtgcctactgttccttca
gaggacctgaaattggttcctagtgcccatgtccggtggcccacagtgcc
tctttaagactccaagagtaactgcacttgcatgtgtacagacctatcca
tacatgcacgcacacacacacacacacacacaaaataaatattttttaaa
accatgctatgaacacccagctcggataaggatactggcataactattca
ctactctgtccttcacagcctgttctgacggtaaagaacaaagcaagcca
agtctcacttttcctgaacagaaaaagagggagctgtaataatagcagct
aactaatatttatcatttttatctgtaacccccaatagctgtctcaaata
aatataattcccaatttgcagataagaaaatctaaggcaggaaaaaaata
ataataatgtgctaagttaccaaaatctacataagcagtaagtatcacac
atttagtgaaaggcggagctaagattcagtcctaatggtctggatccagt
ctgagttcagaaccagggtgtcctacatgccctcctgctggatcccaggc
tctatgctaagcaggcaaccaagtgttcagatactgtgattgtgcctgca
agaatgcataaagcaggctaagaaaagactacgcatctttctccctttat
gtcttcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_37731053_37732154
seq2: B6Ng01-032D15.b_44_1139 (reverse)

seq1  ACATGATAAGAAAGCAGCTTTGTAGTTTAGATTGATTTTCAGTCTAATCT  50
      ||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||
seq2  ACATGATAAGAAAGAGCCTTTGTAG-TTAGATTGA-TTTCAGT-TAATCT  47

seq1  CTTCATGAAGAAGGTGACTCACTTTAGAGTCACCTCCACTGTTGCTGTTG  100
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||
seq2  CTTCATG-AGAAGGTGACTCACTTTAGAGTCACCTCC-CTGGTGCTGTTG  95

seq1  CTTATGAGAGACATCTGTAGGACCCCTTTATGTAGCCACAACATTAGTGC  150
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-TATGAGAGACATCTGTAGGACCCCTTTATGTAGCCACAACATTAGTGC  144

seq1  TTCTTGGATCTTTGATGTGCATTGGGTCATTTTTGTTGTGGAAACAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTCTTGGATCTTTGATGTGCATTGGGTCATTTTTGTTGT-GAAACAAAAA  193

seq1  TGTTCAGTGAC-AAAGTCTCCGATTAAGGAAAATCTCGCTACCAGGTGAG  249
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGTGACAAAAGTCTCCGATTAAGGAAAATCTCGCTACCAGGTGAG  243

seq1  AGATGTTCCAAGACTCATTTGGCATAGTGAATCCCCGGAGGTATACCACC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGTTCCAAGACTCATTTGGCATAGTGAATCCCCGGAGGTATACCACC  293

seq1  CGGAGCCATTGATGGGCAAGCCTTTCAGGCTGTGCTCACTAACCATTCAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGAGCCATTGATGGGCAAGCCTTTCAGGCTGTGCTCACTAACCATTCAG  343

seq1  AAGCTGGGGCAGCCCTGGACTTGACAAGAGTAGTTGTCTACCAAATCCAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGGGGCAGCCCTGGACTTGACAAGAGTAGTTGTCTACCAAATCCAT  393

seq1  TCACTTTCAGTTATTTGCAGGTCAAGGTAACGAGGACTTCAAACCCAGGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTTCAGTTATTTGCAGGTCAAGGTAACGAGGACTTCAAACCCAGGT  443

seq1  TAAGGTTAAACACACTACTGTTTCCTGTAGACTTTTGAGTTAGCGTTAGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTTAAACACACTACTGTTTCCTGTAGACTTTTGAGTTAGCGTTAGC  493

seq1  TTTCTGTTGATAAGCTCTGATAGGCAAAGTTCAAATTCCAGAGTTAAGGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTGATAAGCTCTGATAGGCAAAGTTCAAATTCCAGAGTTAAGGA  543

seq1  AAAAAAAATCAAACAACTTTTTAAACCTAGAAATAAATAATTATACACCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAATCAAACAACTTTTTAAACCTAGAAATAAATAATTATACACCA  593

seq1  TCTTGGAATAATTTTAACTTTTTTTTTTTAACACATTCCAAACACACACA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGAATAATTTTAACTTTTTTTTTTTAACACATTCCAAACACACACA  643

seq1  GACACACGTATGCTCACAGGTTTTAGAAGCAATAAAGTATTTCATGGAGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACGTATGCTCACAGGTTTTAGAAGCAATAAAGTATTTCATGGAGC  693

seq1  TCAGGGCATGGGTGTTTAGTTTCATTATGAGCAGGGTATGTTACAAATAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGCATGGGTGTTTAGTTTCATTATGAGCAGGGTATGTTACAAATAA  743

seq1  AATAAATCACTGGCAAATAAAACACTGTGCTTTAATGATCTGAAAACATG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATCACTGGCAAATAAAACACTGTGCTTTAATGATCTGAAAACATG  793

seq1  ACCTCTTTTTAAATAGTCGCTCGGTATTTTGCCGATCTCAACCAATTACC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTTTTTAAATAGTCGCTCGGTATTTTGCCGATCTCAACCAATTACC  843

seq1  TGTCACACTCTGGCTGGAAATTCTGAACTGTTCCAGTCCTTTATTAACTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACACTCTGGCTGGAAATTCTGAACTGTTCCAGTCCTTTATTAACTC  893

seq1  AGCCAGAGGACTGTTTTTTAAACTTTTTTATGAGAATGCTTGTGGTCAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGAGGACTGTTTTTTAAACTTTTTTATGAGAATGCTTGTGGTCAAA  943

seq1  TTCCTCTGTTGCCTTTACAGATGACTAAGTGGAGAGAAGGCTTTTCAAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCTGTTGCCTTTACAGATGACTAAGTGGAGAGAAGGCTTTTCAAAT  993

seq1  CAGTTAGTGGTAGAAGCACCTGTCTTGTATTTTGCACTGTAACTATAAAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAGTGGTAGAAGCACCTGTCTTGTATTTTGCACTGTAACTATAAAT  1043

seq1  GCAAACTAATTGGCTTGTTTCTTAACACCTTCTTGATCATACTGCCTGAA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAACTAATTGGCTTGTTTCTTAACACCTTCTTGATCATACTGCCTGAA  1093

seq1  TTC  1102
      |||
seq2  TTC  1096

seq1: chr8_37578585_37579445
seq2: B6Ng01-032D15.g_70_925

seq1  GAATTCAAAAGTACTTAAGTACTATTTATTGGTCACTGAACAAACAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAAGTACTTAAGTACTATTTATTGGTCACTGAACAAACAAATG  50

seq1  AACACTGGTGGATCTTTCACATACATGGGCTTCCAGGAGAGCAGAAAATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTGGTGGATCTTTCACATACATGGGCTTCCAGGAGAGCAGAAAATG  100

seq1  GGACCCTAGTTGTACTCACTATGGAAGCGAATGCCTTAAAAGTAAGGTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCCTAGTTGTACTCACTATGGAAGCGAATGCCTTAAAAGTAAGGTGT  150

seq1  GAGGGGCTAGGGAGTGGCTTACTGATTTTAGAGTGCCTACTGTTCCTTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGCTAGGGAGTGGCTTACTGATTTTAGAGTGCCTACTGTTCCTTCA  200

seq1  GAGGACCTGAAATTGGTTCCTAGTGCCCATGTCCGGTGGCCCACAGTGCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACCTGAAATTGGTTCCTAGTGCCCATGTCCGGTGGCCCACAGTGCC  250

seq1  TCTTTAAGACTCCAAGAGTAACTGCACTTGCATGTGTACAGACCTATCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAAGACTCCAAGAGTAACTGCACTTGCATGTGTACAGACCTATCCA  300

seq1  TACATGCACGCACACACACACACACACACACAAAATAAATATTTTTTAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGCACGCACACACACACACACACACACAAAATAAATATTTTTTAAA  350

seq1  ACCATGCTATGAACACCCAGCTCGGATAAGGATACTGGCATAACTATTCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGCTATGAACACCCAGCTCGGATAAGGATACTGGCATAACTATTCA  400

seq1  CTACTCTGTCCTTCACAGCCTGTTCTGACGGTAAAGAACAAAGCAAGCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCTGTCCTTCACAGCCTGTTCTGACGGTAAAGAACAAAGCAAGCCA  450

seq1  AGTCTCACTTTTCCTGAACAGAAAAAGAGGGAGCTGTAATAATAGCAGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTCACTTTTCCTGAACAGAAAAAGAGGGAGCTGTAATAATAGCAGCT  500

seq1  AACTAATATTTATCATTTTTATCTGTAACCCCCAATAGCTGTCTCAAATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAATATTTATCATTTTTATCTGTAACCCCCAATAGCTGTCTCAAATA  550

seq1  AATATAATTCCCAATTTGCAGATAAGAAAATCTAAGGCAGGAAAAAAATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAATTCCCAATTTGCAGATAAGAAAATCTAAGGCAGGAAAAAAATA  600

seq1  ATAATAATGTGCTAAGTTACCAAAATCTACATAAGCAGTAAGTATCACAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAATGTGCTAAGTTACCAAAATCTACATAAGCAGTAAGTATCACAC  650

seq1  ATTTAGTG-AAGGCGGAGCTAAGATTCAGTCCTAGATGGTCTGGATCCAG  699
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATTTAGTGAAAGGCGGAGCTAAGATTCAGTCCTA-ATGGTCTGGATCCAG  699

seq1  TCTGAGTTCAGAACCAGGGTGTCCTACATGCCCTCCTGCTGGATCCCAGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGTTCAGAACCAGGGTGTCCTACATGCCCTCCTGCTGGATCCCAGG  749

seq1  CTCTATGCTAAGCAGGCAACCAAGTGTTCAAGATTAACTGTGATTGTTGC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||
seq2  CTCTATGCTAAGCAGGCAACCAAGTGTTC-AGAT--ACTGTGATTG-TGC  795

seq1  CTGCAAGAATGCATTAAGCAGGCTAAGAAAAGACTACGCATCTTTCTCCC  849
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTGCAAGAATGCATAAAGCAGGCTAAGAAAAGACTACGCATCTTTCT-CC  844

seq1  CTTTATGTCTTC  861
      ||||||||||||
seq2  CTTTATGTCTTC  856