BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-038K14
Chromosome8 (Build37)
Map Location 116,124,391 - 116,145,607
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCntnap4, LOC100042061
Downstream geneMon1b, 4930481F22Rik, Adamts18, Nudt7, AI427515, Clec3a, Wwox
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-038K14.bB6Ng01-038K14.g
ACCDH866154DH866155
length8931,126
definitionDH866154|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-038K14, 5' end.DH866155|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-038K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(116,124,391 - 116,125,077)(116,144,462 - 116,145,607)
sequence
gaattctcttgcttctgcctctgtggaggtcttccagctctaactgtata
agcttgatcagctctggcaatgtaggccaaaccaaaatgtcctgtctacc
agaaagatgaattacttctcttgtctcagatgacaaggggatgaattctc
ttgcctaatggagtatctcagagactgtgtctccatctgcaatactgcaa
acaacagaggcaaatagcaattgctcagccctcagcgtctcctctgacgt
atggggatgatgtgaacagggaaaccttgcacctaagcctacctcttagg
ctatgggacctgtgagctagttcaattggccatgccctttaccctggctc
tcagttcttcttcatagctagctcacactaattccagggtccactcccta
actacccatgaccctcaataaaaggaggctgccagagatattctgccgcc
aaaggcgcagtttgaggcagttattcagaatacccaagcactatctttgc
cagttggttttgtagccatagagacaacaagtgattttgtcaggaggaga
tgatgacttggatgaaggaggcttgctccaacctggacacacctgtggtg
ccttgagaacataatctcgcctctacccagatagagctgctgggccagca
cctgtgctcttaaccttgaagcctatagagtataaggtctttggctgtag
tagttgtttatttttaaccactactttaaaataaagcctgaggtcactat
gttgaatgtgcctgggtcaaaaagaggcaatgcctgttatccaggagaga
tgtttgtggatgttaggttttctcagaaattctgaaagttaatatttgct
aaagctcatttcatttagttatcttgccttagcaaggggagag
gaattcacagttatcatctgcatagacaggtctactgtgctctcactatt
acacctccagatgggtcaggtagaaagtggtggttccaaaaggaaggaga
atccttataatgtgtcttagttaaggatttattgctgtgaacagacacca
tgaccaatgcaactcttttaaggacaacatttaattggactggcttacag
gttcacaagttcagtccattatcatcaaagcagaaacatggcagcatcca
ggcaggcatggtgcagaaggagctgagagttctacatcttcatctgaagg
atgcatggaagactggctcccaggaagctaggataaaggtatgaaagccc
atatccacaaggccacacctacttcaacaaggctataccttccaacagtg
ccactccttgagcccagcatctacaaaccatctcactggtcatcaagttt
cccattggtttcattttatattgtttcttctttaaggaaaaaaaatgagt
tttgattctcataatattagatttcaagaaaagatacacaaacattgcta
acaattctcatagacagttggctcaactgttcctaatggtaaattctctc
taacagtgtgaaaacagaattaatgctggtatgatactgtcaacaaaacc
tcagagctgacacaggttcctccatgtttccactgtgcccactgtactgc
cgttctgggccagggccttctcctaggagccaccctgggtttggtgccat
atttcaaaaggaagggcaactcacgctttccttccttctggatctaattt
cagctttgggaagcactgcttaggtgtgttgtagatatcagcactcgctc
ttgcttaacgaatagactgaggtatggggtgaagggctttctagtaaggc
ttgagcttggccaagatctgtcaacaagtttgccctttacccttctcccc
ttgctaagaatggtagactgtactctaaagctagacccatggtcagtcca
ttatttggtcactgactcattcctgaacaaacaccaagtcccattaccaa
atcatattgctatggtgtcatcaggattagaccagacttataacatgact
ttctgtcgcagctttcataattgcca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_116124391_116125077
seq2: B6Ng01-038K14.b_253_938

seq1  AGGCAAATAGCAATTGCTCAGCCCTCAGCGTCTCCTCTGACGTATGGGGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAAATAGCAATTGCTCAGCCCTCAGCGTCTCCTCTGACGTATGGGGA  50

seq1  TGATGTGAACAGGGAAACCTTGCACCTAAGCCTACCTCTTAGGCTATGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTGAACAGGGAAACCTTGCACCTAAGCCTACCTCTTAGGCTATGGG  100

seq1  ACCTGTGAGCTAGTTCAATTGGCCATGCCCTTTACCCTGGCTCTCAGTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTGAGCTAGTTCAATTGGCCATGCCCTTTACCCTGGCTCTCAGTTC  150

seq1  TTCTTCATAGCTAGCTCACACTAATTCCAGGGTCCACTCCCTAACTACCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCATAGCTAGCTCACACTAATTCCAGGGTCCACTCCCTAACTACCC  200

seq1  ATGACCCTCAATAAAAGGAGGCTGCCAGAGATATTCTGCCGCCAAAGGCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCCTCAATAAAAGGAGGCTGCCAGAGATATTCTGCCGCCAAAGGCG  250

seq1  CAGTTTGAGGCAGTTATTCAGAATACCCAAGCACTATCTTTGCCAGTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTGAGGCAGTTATTCAGAATACCCAAGCACTATCTTTGCCAGTTGG  300

seq1  TTTTGTAGCCATAGAGACAACAAGTGATTTTGTCAGGAGGAGATGATGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTAGCCATAGAGACAACAAGTGATTTTGTCAGGAGGAGATGATGAC  350

seq1  TTGGATGAAGGAGGCTTGCTCCAACCTGGACACACCTGTGGTGCCTTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGATGAAGGAGGCTTGCTCCAACCTGGACACACCTGTGGTGCCTTGAG  400

seq1  AACATAATCTCGCCTCTACCCAGATAGAGCTGCTGGGCCAGCACCTGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAATCTCGCCTCTACCCAGATAGAGCTGCTGGGCCAGCACCTGTGC  450

seq1  TCTTAACCTTGAAGCCTATAGAGTATAAGGTCTTTGGCTGTAGTAGTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAACCTTGAAGCCTATAGAGTATAAGGTCTTTGGCTGTAGTAGTTGT  500

seq1  TTATTTTTAACCACTACTTTAAAATAAAGCCTGAGGTCACTATGTTGAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTAACCACTACTTTAAAATAAAGCCTGAGGTCACTATGTTGAAT  550

seq1  GTGCCTGGGTCAAAAAGAGGCAATGCCTGTTATCCAGGAGAGATGTTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTGGGTCAAAAAGAGGCAATGCCTGTTATCCAGGAGAGATGTTTGT  600

seq1  GGATGTTAGGTTTTCTCAGAAATTCTGAAAGTTAATATTTGCTAAAGCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGTTAGGTTTTCTCAGAAATTCTGAAAGTTAATATTTGCTAAAGCTC  650

seq1  ATTTCATTTAGTTATCTTGCCTTAGCAAGGGAGAGAG  687
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATTTCATTTAGTTATCTTGCCTTAGCAAGGG-GAGAG  686

seq1: chr8_116144462_116145607
seq2: B6Ng01-038K14.g_70_1195 (reverse)

seq1  TGGC-ATTATTGGAAAGCTGGCGGACCAAGAAAGTCATGTTATAAGTCTG  49
      |||| |||||  ||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAATTAT--GAAAGCTG--CGAC--AGAAAGTCATGTTATAAGTCTG  44

seq1  TGCTAAATCCTGATTGGACACATTAGCCAAATAATGATTTGGTAATGGGA  99
        || |||||||||  |||||  ||||  ||| |||||||||||||||||
seq2  GTCT-AATCCTGAT--GACACCATAGC--AAT-ATGATTTGGTAATGGGA  88

seq1  CCTTGGTGTTTTGTCTCAGGAATGAGTCAGTGACCAAATAATGGACTGGA  149
       ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  -CTTGGTG-TTTGT-TCAGGAATGAGTCAGTGACCAAATAATGGACT-GA  134

seq1  CCATGGGGTCTAGCTTTAGGAGTACAGTCTAACCATTCTTAGCAAGGGGG  199
      |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  CCAT-GGGTCTAGCTTTA-GAGTACAGTCT-ACCATTCTTAGCAA-GGGG  180

seq1  AGAAGGGTAAAGGGCAAAACTTGTTGACAAGATCTTGGCCAAGCTCAAGC  249
      ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGGTAAAGGGC-AAACTTGTTGAC-AGATCTTGGCCAAGCTCAAGC  228

seq1  C-TACTAGAAAGCCCTTCACCCCATAACCTCAGTCTATTCGTTAAGCAAG  298
      | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTAGAAAGCCCTTCACCCCAT-ACCTCAGTCTATTCGTTAAGCAAG  277

seq1  AGCGAGTGCTGATATCTACAACACACCTAAGCAGTGCTTCCCAAAGCTG-  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  AGCGAGTGCTGATATCTACAACACACCTAAGCAGTGCTTCCCAAAGCTGA  327

seq1  AATTAGATCCAGAAGGAAGGAAAGCCTGAGTTGCCCTTCCTTTTGAAATA  397
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAGATCCAGAAGGAAGGAAAGCGTGAGTTGCCCTTCCTTTTGAAATA  377

seq1  TGGCACCAAACCCAGGGTGGCTCCTAGGAGAAGGCCCTGGCCCAGAACGG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACCAAACCCAGGGTGGCTCCTAGGAGAAGGCCCTGGCCCAGAACGG  427

seq1  CAGTACAGTGGGCACAGTGGAAACATGGAGGAACCTGTGTCAGCTCTGAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACAGTGGGCACAGTGGAAACATGGAGGAACCTGTGTCAGCTCTGAG  477

seq1  GTTTTGTTGACAGTATCATACCAGCATTAATTCTGTTTTCACACTGTTAG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGTTGACAGTATCATACCAGCATTAATTCTGTTTTCACACTGTTAG  527

seq1  AGAGAATTTACCATTAGGAACAGTTGAGCCAACTGTCTATGAGAATTGTT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAATTTACCATTAGGAACAGTTGAGCCAACTGTCTATGAGAATTGTT  577

seq1  AGCAATGTTTGTGTATCTTTTCTTGAAATCTAATATTATGAGAATCAAAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATGTTTGTGTATCTTTTCTTGAAATCTAATATTATGAGAATCAAAA  627

seq1  CTCATTTTTTTTCCTTAAAGAAGAAACAATATAAAATGAAACCAATGGGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTTTTTTTCCTTAAAGAAGAAACAATATAAAATGAAACCAATGGGA  677

seq1  AACTTGATGACCAGTGAGATGGTTTGTAGATGCTGGGCTCAAGGAGTGGC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGATGACCAGTGAGATGGTTTGTAGATGCTGGGCTCAAGGAGTGGC  727

seq1  ACTGTTGGAAGGTATAGCCTTGTTGAAGTAGGTGTGGCCTTGTGGATATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTGGAAGGTATAGCCTTGTTGAAGTAGGTGTGGCCTTGTGGATATG  777

seq1  GGCTTTCATACCTTTATCCTAGCTTCCTGGGAGCCAGTCTTCCATGCATC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTTCATACCTTTATCCTAGCTTCCTGGGAGCCAGTCTTCCATGCATC  827

seq1  CTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCCTTCTGCACCATGCCTGCCT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGATGAAGATGTAGAACTCTCAGCTCCTTCTGCACCATGCCTGCCT  877

seq1  GGATGCTGCCATGTTTCTGCTTTGATGATAATGGACTGAACTTGTGAACC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTGCCATGTTTCTGCTTTGATGATAATGGACTGAACTTGTGAACC  927

seq1  TGTAAGCCAGTCCAATTAAATGTTGTCCTTAAAAGAGTTGCATTGGTCAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGCCAGTCCAATTAAATGTTGTCCTTAAAAGAGTTGCATTGGTCAT  977

seq1  GGTGTCTGTTCACAGCAATAAATCCTTAACTAAGACACATTATAAGGATT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTGTTCACAGCAATAAATCCTTAACTAAGACACATTATAAGGATT  1027

seq1  CTCCTTCCTTTTGGAACCACCACTTTCTACCTGACCCATCTGGAGGTGTA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCCTTTTGGAACCACCACTTTCTACCTGACCCATCTGGAGGTGTA  1077

seq1  ATAGTGAGAGCACAGTAGACCTGTCTATGCAGATGATAACTGTGAATTC  1146
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGAGAGCACAGTAGACCTGTCTATGCAGATGATAACTGTGAATTC  1126