BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-039F08
Chromosome8 (Build37)
Map Location 98,726,934 - 98,883,792
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneBC016201, Map1lc3-ps6, 1700055M20Rik, Zfp319, AA960436, Mmp15, Gtl3, Csnk2a2, 4933406B17Rik, Ccdc113, 4931432M23Rik, EG546088, LOC100041040, Gins3, LOC547022, Ndrg4, Setd6, Cnot1, LOC100041953, LOC100041088, BC031853, LOC100041972, Got2, LOC667445
Downstream geneLOC333331
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-039F08.bB6Ng01-039F08.g
ACCDH866631DH866632
length671905
definitionDH866631|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-039F08, 5' end.DH866632|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-039F08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,883,122 - 98,883,792)(98,726,934 - 98,727,837)
sequence
gaattcagggcaggaactgaagcagaagccatggtagagtgatgcttact
gacttgttcctcagtgcttgttcctcttgctttcttggaccacccaggat
cacctgattagagttagccacacctaaaatgaacaggatcctcccatgtc
aatcattaaacaagaaaatgttcagcagacatgtaggccaatcttttgga
ggcatcttgtttgaataagagtgcctcttcccaaattattctagtttata
tttacataaaactaaccaccacagctactcaacactgctatctccagtgt
gatgtgagaatcgccatatttcttattttagggataaggaaagtgaagtg
agatcttaaccaatcagcttgtgctcacatggccaggagcgcacatggct
gtgatacagttcctcacctacacagctggtcgtagggatcccccgaggac
cccttaaattctccacatctcactcctttaaatttaattattaaattttt
gttttaaaattgcaattcaccaagggacccatggctcgagctgcatatgt
agcagaggatggccctgtcgggcaccaatgggagaggaggcccttggttc
tgtgaagactcgatgccctagcataggggaatgctagagcagtgaggtag
aagtgtgggtggggtggggga
gaattccttaacaagttgatatctaatgtcactcatatcaaaatttaaga
gaaacaaagatggctgtttctggctaagagggagcagatttgcccatttg
cctgcaagatactgaacatcaatcaacaatgactacccagagatgacaaa
gaaatcggatggattatcaacttttcaaacagcttaagggaaaccaaggt
gcagcctgcagttaaagaaacatagcggaaggtacaaggagaccaatact
aagtgtggcagaagaggaagctacacaaagaaagaactccaatggtctca
agagagtcctgctcagatattcagccaagtactgaaaagaggaaaataca
tgagaggaagttatctgccatgaggaacacagctatgtgaagagatgagg
ttacagggctagaaatactctgtaccactgagcagacttaaaaggcacac
ggctcctggcgtgtctggcagagttcatggaaggatcttgctttaggatt
ggggaataaccatctctggatggagcactgtcagagagtcacggaaggag
tagccgcagaaagatgcagaaagcccacactgtttcaagtcatttagttt
gcatccaagaacaaagctcaacagtacttatgaggatacacaaataccca
actgtcagcatggtaaactctcaagctctggtgttcagcacacacttaag
aggcaggcaaaataataaggaaaacactattcctaatgaggaatcaataa
atcaaaatcaaataggaactggtagatcttaagatgatcagacactggca
ataagacagttttattgtgtcctatgtgttatgaaaataaacataccagt
agccatgtgtgtgtgtgtgtgtaaactggtgaattgattctaaaatctat
gtgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_98883122_98883792
seq2: B6Ng01-039F08.b_47_717 (reverse)

seq1  TCCCCCACCCCACCCACACTTCTACCTCACTGCTCTAGCATTCCCCTATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCACCCCACCCACACTTCTACCTCACTGCTCTAGCATTCCCCTATG  50

seq1  CTAGGGCATCGAGTCTTCACAGAACCAAGGGCCTCCTCTCCCATTGGTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGCATCGAGTCTTCACAGAACCAAGGGCCTCCTCTCCCATTGGTGC  100

seq1  CCGACAGGGCCATCCTCTGCTACATATGCAGCTCGAGCCATGGGTCCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGACAGGGCCATCCTCTGCTACATATGCAGCTCGAGCCATGGGTCCCTT  150

seq1  GGTGAATTGCAATTTTAAAACAAAAATTTAATAATTAAATTTAAAGGAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAATTGCAATTTTAAAACAAAAATTTAATAATTAAATTTAAAGGAGT  200

seq1  GAGATGTGGAGAATTTAAGGGGTCCTCGGGGGATCCCTACGACCAGCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATGTGGAGAATTTAAGGGGTCCTCGGGGGATCCCTACGACCAGCTGT  250

seq1  GTAGGTGAGGAACTGTATCACAGCCATGTGCGCTCCTGGCCATGTGAGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGTGAGGAACTGTATCACAGCCATGTGCGCTCCTGGCCATGTGAGCA  300

seq1  CAAGCTGATTGGTTAAGATCTCACTTCACTTTCCTTATCCCTAAAATAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCTGATTGGTTAAGATCTCACTTCACTTTCCTTATCCCTAAAATAAG  350

seq1  AAATATGGCGATTCTCACATCACACTGGAGATAGCAGTGTTGAGTAGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGGCGATTCTCACATCACACTGGAGATAGCAGTGTTGAGTAGCTG  400

seq1  TGGTGGTTAGTTTTATGTAAATATAAACTAGAATAATTTGGGAAGAGGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTTAGTTTTATGTAAATATAAACTAGAATAATTTGGGAAGAGGCA  450

seq1  CTCTTATTCAAACAAGATGCCTCCAAAAGATTGGCCTACATGTCTGCTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTATTCAAACAAGATGCCTCCAAAAGATTGGCCTACATGTCTGCTGA  500

seq1  ACATTTTCTTGTTTAATGATTGACATGGGAGGATCCTGTTCATTTTAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTTCTTGTTTAATGATTGACATGGGAGGATCCTGTTCATTTTAGGT  550

seq1  GTGGCTAACTCTAATCAGGTGATCCTGGGTGGTCCAAGAAAGCAAGAGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCTAACTCTAATCAGGTGATCCTGGGTGGTCCAAGAAAGCAAGAGGA  600

seq1  ACAAGCACTGAGGAACAAGTCAGTAAGCATCACTCTGCCATGGCTTCTGC  650
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACAAGCACTGAGGAACAAGTCAGTAAGCATCACTCTACCATGGCTTCTGC  650

seq1  TTCAGTTCCTGCCCTGAATTC  671
      |||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTTCCTGCCCTGAATTC  671

seq1: chr8_98726934_98727837
seq2: B6Ng01-039F08.g_70_974

seq1  GAATTCCTTAACAAGTTGATATCTAATGTCACTCATATCAAAATTTAAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTAACAAGTTGATATCTAATGTCACTCATATCAAAATTTAAGA  50

seq1  GAAACAAAGATGGCTGTTTCTGGCTAAGAGGGAGCAGATTTGCCCATTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAAGATGGCTGTTTCTGGCTAAGAGGGAGCAGATTTGCCCATTTG  100

seq1  CCTGCAAGATACTGAACATCAATCAACAATGACTACCCAGAGATGACAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAAGATACTGAACATCAATCAACAATGACTACCCAGAGATGACAAA  150

seq1  GAAATCGGATGGATTATCAACTTTTCAAACAGCTTAAGGGAAACCAAGGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATCGGATGGATTATCAACTTTTCAAACAGCTTAAGGGAAACCAAGGT  200

seq1  GCAGCCTGCAGTTAAAGAAACATAGCGGAAGGTACAAGGAGACCAATACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCTGCAGTTAAAGAAACATAGCGGAAGGTACAAGGAGACCAATACT  250

seq1  AAGTGTGGCAGAAGAGGAAGCTACACAAAGAAAGAACTCCAATGGTCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGGCAGAAGAGGAAGCTACACAAAGAAAGAACTCCAATGGTCTCA  300

seq1  AGAGAGTCCTGCTCAGATATTCAGCCAAGTACTGAAAAGAGGAAAATACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGTCCTGCTCAGATATTCAGCCAAGTACTGAAAAGAGGAAAATACA  350

seq1  TGAGAGGAAGTTATCTGCCATGAGGAACACAGCTATGTGAAGAGATGAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGGAAGTTATCTGCCATGAGGAACACAGCTATGTGAAGAGATGAGG  400

seq1  TTACAGGGCTAGAAATACTCTGTACCACTGAGCAGACTTAAAAGGCACAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGGGCTAGAAATACTCTGTACCACTGAGCAGACTTAAAAGGCACAC  450

seq1  GGCTCCTGGCGTGTCTGGCAGAGTTCATGGAAGGATCTTGCTTTAGGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCTGGCGTGTCTGGCAGAGTTCATGGAAGGATCTTGCTTTAGGATT  500

seq1  GGGGAATAACCATCTCTGGATGGAGCACTGTCAGAGAGTCACGGAAGGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAATAACCATCTCTGGATGGAGCACTGTCAGAGAGTCACGGAAGGAG  550

seq1  TAGCCGCAGAAAGATGCAGAAAGCCCACACTGTTTCAAGTCATTTAG-TT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TAGCCGCAGAAAGATGCAGAAAGCCCACACTGTTTCAAGTCATTTAGTTT  600

seq1  GCATCCAAGAACAAAGCTCAACAGTACTTATGAGGATACACAAATACCCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCAAGAACAAAGCTCAACAGTACTTATGAGGATACACAAATACCCA  650

seq1  ACTGTCAGCATGGTAAACTCTCAAGCTCTGGTGTTCAGCACACACTTAAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTCAGCATGGTAAACTCTCAAGCTCTGGTGTTCAGCACACACTTAAG  700

seq1  AGGCAGGC-AAATAATAAGGAAAACACTATTCCTAATGAGGAATCAATAA  748
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGCAAAATAATAAGGAAAACACTATTCCTAATGAGGAATCAATAA  750

seq1  ATCAAAATCAAATAGGAACTGGTAGATCTTAAGATGATCAGACACTGGCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAATCAAATAGGAACTGGTAGATCTTAAGATGATCAGACACTGGCA  800

seq1  ATAAGACAGTTTTATTGTGTCCTATGTGTTATGAAAATTAAACATACCAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATAAGACAGTTTTATTGTGTCCTATGTGTTATGAAAA-TAAACATACCAG  849

seq1  TAGCCATGTGTGTGTGTGTGTGTAAACTGATGAATTGATTCTAAAATCTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATGTGTGTGTGTGTGTGTAAACTGGTGAATTGATTCTAAAATCTA  899

seq1  TGTGGA  904
      ||||||
seq2  TGTGGA  905