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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-042K06
Chromosome	8 (Build37)
Map Location	88,614,606 - 88,615,734
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Man2b1, EG244556, EG624855, Olfr371, Vps35, Orc6l, D830007F02Rik, 4921524J17Rik, Gpt2, Dnaja2, Neto2, Itfg1, LOC100040798, Phkb
Downstream gene	LOC671665, LOC100040165, Abcc12, Lonp2, Siah1a, ENSMUSG00000074178, BC004022, LOC666960, EG625298
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-042K06.b	B6Ng01-042K06.g
ACC	DH868952	DH868953
length	1,217	1,132
definition	DH868952\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-042K06, 5' end.	DH868953\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-042K06, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattccatcctgtagatcaggcctcacgttaagtcagcaagttgtttgc tacccccaatatagccatgcctgtttctcttaatacagcttacctggcag actggtagtgtaaaacacaggtaatactgggtaacctggtgatgacattt tgacgcgccccccccccccccatcccctgccctggatagcacttcccagt attaccaaagcttgtgagcaaggaggaagctttcaggtcagttccaacat tttttctctgttaaatgacatatgtggtatcattatcattcataatatga tctttagtaatagtaatagatgtctttagtaatttctagtgagcagccag cagcaatggcagtggcctatgggagcctctgggactacattgaccaactc ataaaatggtttctctacttgcactgggaattttgtttaataatttgtgg attatgggagcaggattacccatgctgattacccatccatgaaaaggttt gattgttttttatttgctggtttagtttggcttgttcttttgagacagga tgttactttgtagctctgggtagcttggaacttgctgtatagatcatgct ggcctcaaactcacagagatctgcctacctctgcctctcaaatggtgtta ttatagacatgtaccacacccagcctcagttttcctttttaattatattt tttacacagcttagacagtagataggtttccataaagctttctcatatat tcttggtttggattaaggttccctcttacctccatcttggcgtaaacctt cccatgctgtgttcctcccctatatccttattgtatatgttctattacct gccctcctatggccttcaccttcactctcccttgcatcttctgacctgct gggcctctacagacactccagattgaacatacaaacctgaaactcaaagc tagcatctgcagatgaaagaacatgcagtgcttgtctttctgggcctggg ttactcatatataaatgtatgtttaattttcactgtgcatcatcagttgt gggcatctagtgatttgtcagagcatttgtaataaaacaacatggagtgg ggatgagcagtatctctgattctgtaaggtctgggatatgctcaggtatg taagaggtccattgatttcacttgagacccaactgaagttcgtgatgttt gcaggtacctcctttaa	gaattctcatgtccaggtaaataaaatgactaacaaaggaagtttacaag tagttaagtgcttggctctttgattagaaataaagaaaccatcttcccat tgctagcgttcttcaggagctgaatatgtatggtgggcatatctgagaac acagcagcagagatcagtactttacacagtcagtggtccagagatactag agctgttttgctatgagctaggtaagttaaaggaggtcatggagaagtca agaaaccagtagaaagattgagataccatttattaattagatacacttta gaagtatgacctggctggatgactttatacacacacacacacacacacac acacacacacacacacacactgttgtatgtgcctcaatgaactgtccttg tcttttgggaatctctagggagacagcactatagccattgccatttcttc atgttaccttgagctagaaaccacctaggacaggcagactcctagagaaa aaaatggccccaactgttaaccattgagacaagagcatcctatgcatggg aatgaggaaaaaacggcacaaaagcaccataaaatcttgtggcatgtccc tgtgaataggagttcttagaaagctttgtatgagatgccatctgggtata gctatcacagtgataaaatagttcttgctctgcctctatctgtgattata tcttgaaattatctatgtttccaaggtgtctgagccaaggtttttaaaaa ttaaagaaaacgttatctttgcatacagttgggtttgcgatacaattgta atccatttccccaaattccaagaaaagtattttgcatctgagctaggaag gtgtgaactttttagggtattttttctttcttgcttcttgaactatgctc tcactaattgggatagtggaattagattagctctgtgttcaaataggcgt gagctgaatgcagggaggagagctgggaaacctggaagggagccacactg attcaaaatgtatcccagatccttgaattcacacggcgagatttctaccc ttctcaagacctcgttgctgtcatccatggaaaacacaatcctcacgggt ggagtggagggcgttggtcactgacgaatcct
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\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| seq2 ACAGAGCTAATCTAATTCCACTATCCCAATTAGTGAGAGCATAGTTCAAG 246 seq1 AAGCAAG-AAGAAAAAATACCCTAAAAAGTTCACACCTTCCTAGCTCAGA 294 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAGCAAGAAAGAAAAAATACCCTAAAAAGTTCACACCTTCCTAGCTCAGA 296 seq1 TGCAAAATACTTTTCTTGGAATTTGGGGAAATGGATTACAATTGTATCGC 344 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCAAAATACTTTTCTTGGAATTTGGGGAAATGGATTACAATTGTATCGC 346 seq1 AAA-CCAACTGTATGCAAAGATAACGTTTTCTTTAATTTTTAAAAACCTT 393 \|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAACCCAACTGTATGCAAAGATAACGTTTTCTTTAATTTTTAAAAACCTT 396 seq1 GGCTCAGACACCTTGGAAACATAGATAATTTCAAGATATAATCACAGATA 443 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCTCAGACACCTTGGAAACATAGATAATTTCAAGATATAATCACAGATA 446 seq1 GAGGCAGAGCAAGAACTATTTTATCACTGTGATAGCTATACCCAGATGGC 493 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGGCAGAGCAAGAACTATTTTATCACTGTGATAGCTATACCCAGATGGC 496 seq1 ATCTCATACAAAGCTTTCTAAGAACTCCTATTCACAGGGACATGCCACAA 543 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATCTCATACAAAGCTTTCTAAGAACTCCTATTCACAGGGACATGCCACAA 546 seq1 GATTTTATGGTGCTTTTGTGCCGTTTTTTCCTCATTCCCATGCATAGGAT 593 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GATTTTATGGTGCTTTTGTGCCGTTTTTTCCTCATTCCCATGCATAGGAT 596 seq1 GCTCTTGTCTCAATGGTTAACAGTTGGGGCCATTTTTTTCTCTAGGAGTC 643 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTCTTGTCTCAATGGTTAACAGTTGGGGCCATTTTTTTCTCTAGGAGTC 646 seq1 TGCCTGTCCTAGGTGGTTTCTAGCTCAAGGTAACATGAAGAAATGGCAAT 693 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCCTGTCCTAGGTGGTTTCTAGCTCAAGGTAACATGAAGAAATGGCAAT 696 seq1 GGCTATAGTGCTGTCTCCCTAGAGATTCCCAAAAGACAAGGACAGTTCAT 743 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCTATAGTGCTGTCTCCCTAGAGATTCCCAAAAGACAAGGACAGTTCAT 746 seq1 TGAGGCACATACAACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 793 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAGGCACATACAACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT 796 seq1 GTGTGTGTATAAAGTCATCCAGCCAGGTCATACTTCTAAAGTGTATCTAA 843 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGTGTGTATAAAGTCATCCAGCCAGGTCATACTTCTAAAGTGTATCTAA 846 seq1 TTAATAAATGGTATCTCAATCTTTCTACTGGTTTCTTGACTTCTCCATGA 893 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTAATAAATGGTATCTCAATCTTTCTACTGGTTTCTTGACTTCTCCATGA 896 seq1 CCTCCTTTAACTTACCTAGCTCATAGCAAAACAGCTCTAGTATCTCTGGA 943 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTCCTTTAACTTACCTAGCTCATAGCAAAACAGCTCTAGTATCTCTGGA 946 seq1 CCACTGACTGTGTAAAGTACTGATCTCTGCTGCTGTGTTCTCAGATATGC 993 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCACTGACTGTGTAAAGTACTGATCTCTGCTGCTGTGTTCTCAGATATGC 996 seq1 CCACCATACATATTCAGCTCCTGAAGAACGCTAGCAATGGGAAGATGGTT 1043 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCACCATACATATTCAGCTCCTGAAGAACGCTAGCAATGGGAAGATGGTT 1046 seq1 TCTTTATTTCTAATCAAAGAGCCAAGCACTTAACTACTTGTAAACTTCCT 1093 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTTTATTTCTAATCAAAGAGCCAAGCACTTAACTACTTGTAAACTTCCT 1096 seq1 TTGTTAGTCATTTTATTTACCTGGACATGAGAATTC 1129 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGTTAGTCATTTTATTTACCTGGACATGAGAATTC 1132

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr8_88614606_88615734
seq2: B6Ng01-042K06.g_65_1196 (reverse)

seq1  AGGA-TCGTCAGTGACCAACGCC--TCACTCCACCCGTGAGGATTGTG-T  46
      |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |
seq2  AGGATTCGTCAGTGACCAACGCCCTCCACTCCACCCGTGAGGATTGTGTT  50

seq1  CTCATTGGATGACAGCGACCGAGTCTTGAGGAGGGTAGAAATCCTCGCCG  96
       ||  ||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  TTCCATGGATGACAGCAACGAGGTCTTGAGAAGGGTAGAAAT-CTCGCCG  99

seq1  TGTGGAATTCAAGGATCTGGTGATACATTTTTGAATCAGTGTGGCTCCCT  146
      ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGT-GAATTCAAGGATCTGG-GATACA-TTTTGAATCAGTGTGGCTCCCT  146

seq1  TCCAGGTTTCCCAGCTCTCCTCCCTGCATTCAGCTCACGCCTATTTGAAC  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGTTTCCCAGCTCTCCTCCCTGCATTCAGCTCACGCCTATTTGAAC  196

seq1  ACAGAGCTAATCTAATTCCACTAT-CCAATTAGTGAGAGCATAGTTCAGG  245
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
seq2  ACAGAGCTAATCTAATTCCACTATCCCAATTAGTGAGAGCATAGTTCAAG  246

seq1  AAGCAAG-AAGAAAAAATACCCTAAAAAGTTCACACCTTCCTAGCTCAGA  294
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGAAAGAAAAAATACCCTAAAAAGTTCACACCTTCCTAGCTCAGA  296

seq1  TGCAAAATACTTTTCTTGGAATTTGGGGAAATGGATTACAATTGTATCGC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAAATACTTTTCTTGGAATTTGGGGAAATGGATTACAATTGTATCGC  346

seq1  AAA-CCAACTGTATGCAAAGATAACGTTTTCTTTAATTTTTAAAAACCTT  393
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCAACTGTATGCAAAGATAACGTTTTCTTTAATTTTTAAAAACCTT  396

seq1  GGCTCAGACACCTTGGAAACATAGATAATTTCAAGATATAATCACAGATA  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGACACCTTGGAAACATAGATAATTTCAAGATATAATCACAGATA  446

seq1  GAGGCAGAGCAAGAACTATTTTATCACTGTGATAGCTATACCCAGATGGC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCAGAGCAAGAACTATTTTATCACTGTGATAGCTATACCCAGATGGC  496

seq1  ATCTCATACAAAGCTTTCTAAGAACTCCTATTCACAGGGACATGCCACAA  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCATACAAAGCTTTCTAAGAACTCCTATTCACAGGGACATGCCACAA  546

seq1  GATTTTATGGTGCTTTTGTGCCGTTTTTTCCTCATTCCCATGCATAGGAT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTATGGTGCTTTTGTGCCGTTTTTTCCTCATTCCCATGCATAGGAT  596

seq1  GCTCTTGTCTCAATGGTTAACAGTTGGGGCCATTTTTTTCTCTAGGAGTC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTTGTCTCAATGGTTAACAGTTGGGGCCATTTTTTTCTCTAGGAGTC  646

seq1  TGCCTGTCCTAGGTGGTTTCTAGCTCAAGGTAACATGAAGAAATGGCAAT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTCCTAGGTGGTTTCTAGCTCAAGGTAACATGAAGAAATGGCAAT  696

seq1  GGCTATAGTGCTGTCTCCCTAGAGATTCCCAAAAGACAAGGACAGTTCAT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATAGTGCTGTCTCCCTAGAGATTCCCAAAAGACAAGGACAGTTCAT  746

seq1  TGAGGCACATACAACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCACATACAACAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  796

seq1  GTGTGTGTATAAAGTCATCCAGCCAGGTCATACTTCTAAAGTGTATCTAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTATAAAGTCATCCAGCCAGGTCATACTTCTAAAGTGTATCTAA  846

seq1  TTAATAAATGGTATCTCAATCTTTCTACTGGTTTCTTGACTTCTCCATGA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATAAATGGTATCTCAATCTTTCTACTGGTTTCTTGACTTCTCCATGA  896

seq1  CCTCCTTTAACTTACCTAGCTCATAGCAAAACAGCTCTAGTATCTCTGGA  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTTTAACTTACCTAGCTCATAGCAAAACAGCTCTAGTATCTCTGGA  946

seq1  CCACTGACTGTGTAAAGTACTGATCTCTGCTGCTGTGTTCTCAGATATGC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGACTGTGTAAAGTACTGATCTCTGCTGCTGTGTTCTCAGATATGC  996

seq1  CCACCATACATATTCAGCTCCTGAAGAACGCTAGCAATGGGAAGATGGTT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATACATATTCAGCTCCTGAAGAACGCTAGCAATGGGAAGATGGTT  1046

seq1  TCTTTATTTCTAATCAAAGAGCCAAGCACTTAACTACTTGTAAACTTCCT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTATTTCTAATCAAAGAGCCAAGCACTTAACTACTTGTAAACTTCCT  1096

seq1  TTGTTAGTCATTTTATTTACCTGGACATGAGAATTC  1129
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAGTCATTTTATTTACCTGGACATGAGAATTC  1132

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