BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-045O10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 35,788,846 - 35,938,604
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDusp4, LOC675578, Tnks
Upstream geneGsr, Gtf2e2, Rbpms, LOC100042769, Dctn6, LOC100042777, Mboat4, Leprotl1, LOC666694, Tmem66, LOC619780, LOC666718, EG234159, LOC666746
Downstream geneLOC666792, LOC666797, LOC666804, Ppp1r3b, Thex1, Mfhas1, LOC100041572, Gm501, Cldn23
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-045O10.bB6Ng01-045O10.g
ACCDH871224DH871225
length1,133742
definitionDH871224|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045O10, 5' end.DH871225|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045O10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,937,469 - 35,938,604)(35,788,846 - 35,789,583)
sequence
gaattcccatttgcgatatcaactcagtgcttccagagccctaactctct
tcttggagaaaagcaggccctgatacctggacattgttacataggagaca
tgagttttgtttggacaagccattgcagtgacactggagatagattgtcc
cttgtcccttgtgtagttataagctgagtagagaccaaaggctatttctt
ttttaacccgaagaggtgatgagctttcctttgtctttccagtctactcc
gttacacctggcagcaggctacaacagagttcggatagttcagctgcttc
tacagcatggtgctgatgtccacgcgaaagacaaagggtatgtagtgcca
ccatcccatgggcagagaattatgctgttgtcatcatttgatagcctgag
gttttagctccaaagaagctcatattacccattcattaagaatgttctcg
aggggctggagaggtggctcagtggttagagcactggcttggcttccagg
agactggggtttgattcctggcagcacacatggcagcgcacagggatctc
taactctcatttcacaggattcagcgccctcttctggcctccgtgggcac
aagtacataaacatgcaatacagacatacatgtaagcataacacccacac
acacaaaatagcaatagtaaattataaaataaagttgtcaggtttgagct
cagatcttactttatgaacctactatagacttctcacaatcatctgctgc
accaatttaattttattgtaattctatttgaaattatttttccagttaga
atcattttcatctcttaaatcgcattttaaaaagatttaaaaatactgaa
aaatttgataatctagtatagtggctattaagagaatctcctcatattaa
taaactatattaatttataaatgatttttaatttagtttttttaaatcca
cttaagctaattcaatctagatgatctttatgaaaatgatataggaaaca
aaaagtgggtccttatgaataaattataaaaagcttaccaattttttttc
tagttccatgatctgtgggaaattgtttacagtcctatatgaaaaagcaa
acattgctccgtatctggccttaattccaagga
gaattccttctcaaactgatgtagccaggctgacctgagtttcagaaacc
aggcttctgagagaattattaattggcagaggttgggaaagcaaagacag
gaaacatccagcttaaggttttagaatgttcagtggtagatgggactggc
tttagataagggtgatcaaccaggcttgaatccctccctgtatctcagga
catagtcagcaagttcaccgtagccaggatactaaatactatgtcattca
tagtattgagacccaaaaacaaatctccaaacaatctcttttggttgtca
ccaatttcttttgtgtttatttatctttcctaagattagcaggttgaccc
gaactatagaataactgtttcttcttctgcttggaaagatagccccagat
tatgttgagctgcctccattcatcaaacaccatacatctaaatgcaagct
gactagagatagtgaaatgagctggcctgcctaaaggccttctgcagata
ggaaggaattaagtatgtgctctctttgtattcatagcccacagaaaagc
tcagcagcagataaacagcacatcgttaatctcactgtgacttcctgtgg
gggatagggagtggaggaagccgtccctcttccttgtccagactccaata
gaatggttctgaaccttcctaatgcttgtgacccttgaatacaggttcct
ccaggttgtggtggcccccaactataaactttattcttgctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_35937469_35938604
seq2: B6Ng01-045O10.b_47_1179 (reverse)

seq1  TCCTTGGGATCTTAAGGCCAGATAACGAGCAATGTTAGC-TTTTCATATA  49
      ||||||| |  |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||
seq2  TCCTTGGAA--TTAAGGCCAGATACGGAGCAATGTTTGCTTTTTCATATA  48

seq1  GGACTGTGAACAAATATCCACAGATCATTGGAAACTAGAAAAAAAATTGG  99
      ||||||| ||||| |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||
seq2  GGACTGTAAACAATTTCCCACAGATCAT--GGAACTAGAAAAAAAATTGG  96

seq1  TAAGCTTTTAAT-ATTTATTCATAATGACCCACTTTTTGTTTCCTATATC  148
      ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTTTTTATAATTTATTCATAAGGACCCACTTTTTGTTTCCTATATC  146

seq1  AATCTTCATAAAGATCATCTAGATTGAATTAGCTTAAGTGGATTTAAAAA  198
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -ATTTTCATAAAGATCATCTAGATTGAATTAGCTTAAGTGGATTTAAAAA  195

seq1  AACTAAATTAAAAATCATTTATAAATTAATATAGTTTATTAATATGAGGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAATTAAAAATCATTTATAAATTAATATAGTTTATTAATATGAGGA  245

seq1  GATTCTCTTAATAGCCACTATACTAGATTATCAAATTTTTCAGTATTTTT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTCTTAATAGCCACTATACTAGATTATCAAATTTTTCAGTATTTTT  295

seq1  AAATCTTTTTAAAATGCGATTTAAGAGATGAAAATGATTCTAACTGGAAA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTTTTAAAATGCGATTTAAGAGATGAAAATGATTCTAACTGGAAA  345

seq1  AATAATTTCAAATAGAATTACAATAAAATTAAATTGGTGCAGCAGATGAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTTCAAATAGAATTACAATAAAATTAAATTGGTGCAGCAGATGAT  395

seq1  TGTGAGAAGTCTATAGTAGGTTCATAAAGTAAGATCTGAGCTCAAACCTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGAAGTCTATAGTAGGTTCATAAAGTAAGATCTGAGCTCAAACCTG  445

seq1  ACAACTTTATTTTATAATTTACTATTGCTATTTTGTGTGTGTGGGTGTTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTTTATTTTATAATTTACTATTGCTATTTTGTGTGTGTGGGTGTTA  495

seq1  TGCTTACATGTATGTCTGTATTGCATGTTTATGTACTTGTGCCCACGGAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTACATGTATGTCTGTATTGCATGTTTATGTACTTGTGCCCACGGAG  545

seq1  GCCAGAAGAGGGCGCTGAATCCTGTGAAATGAGAGTTAGAGATCCCTGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAAGAGGGCGCTGAATCCTGTGAAATGAGAGTTAGAGATCCCTGTG  595

seq1  CGCTGCCATGTGTGCTGCCAGGAATCAAACCCCAGTCTCCTGGAAGCCAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGCCATGTGTGCTGCCAGGAATCAAACCCCAGTCTCCTGGAAGCCAA  645

seq1  GCCAGTGCTCTAACCACTGAGCCACCTCTCCAGCCCCTCGAGAACATTCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTGCTCTAACCACTGAGCCACCTCTCCAGCCCCTCGAGAACATTCT  695

seq1  TAATGAATGGGTAATATGAGCTTCTTTGGAGCTAAAACCTCAGGCTATCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGAATGGGTAATATGAGCTTCTTTGGAGCTAAAACCTCAGGCTATCA  745

seq1  AATGATGACAACAGCATAATTCTCTGCCCATGGGATGGTGGCACTACATA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATGACAACAGCATAATTCTCTGCCCATGGGATGGTGGCACTACATA  795

seq1  CCCTTTGTCTTTCGCGTGGACATCAGCACCATGCTGTAGAAGCAGCTGAA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTGTCTTTCGCGTGGACATCAGCACCATGCTGTAGAAGCAGCTGAA  845

seq1  CTATCCGAACTCTGTTGTAGCCTGCTGCCAGGTGTAACGGAGTAGACTGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCGAACTCTGTTGTAGCCTGCTGCCAGGTGTAACGGAGTAGACTGG  895

seq1  AAAGACAAAGGAAAGCTCATCACCTCTTCGGGTTAAAAAAGAAATAGCCT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACAAAGGAAAGCTCATCACCTCTTCGGGTTAAAAAAGAAATAGCCT  945

seq1  TTGGTCTCTACTCAGCTTATAACTACACAAGGGACAAGGGACAATCTATC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCTCTACTCAGCTTATAACTACACAAGGGACAAGGGACAATCTATC  995

seq1  TCCAGTGTCACTGCAATGGCTTGTCCAAACAAAACTCATGTCTCCTATGT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGTGTCACTGCAATGGCTTGTCCAAACAAAACTCATGTCTCCTATGT  1045

seq1  AACAATGTCCAGGTATCAGGGCCTGCTTTTCTCCAAGAAGAGAGTTAGGG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATGTCCAGGTATCAGGGCCTGCTTTTCTCCAAGAAGAGAGTTAGGG  1095

seq1  CTCTGGAAGCACTGAGTTGATATCGCAAATGGGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGAAGCACTGAGTTGATATCGCAAATGGGAATTC  1133

seq1: chr8_35788846_35789583
seq2: B6Ng01-045O10.g_71_812

seq1  GAATTCCTTCTCAAACTGATGTAGCCAGGCTGACCTGAGTTTCAGAAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCTCAAACTGATGTAGCCAGGCTGACCTGAGTTTCAGAAACC  50

seq1  AGGCTTCTGAGAGAATTATTAATTGGCAGAGGTTGGGAAAGCAAAGACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTCTGAGAGAATTATTAATTGGCAGAGGTTGGGAAAGCAAAGACAG  100

seq1  GAAACATCCAGCTTAAGGTTTTAGAATGTTCAGTGGTAGATGGGACTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACATCCAGCTTAAGGTTTTAGAATGTTCAGTGGTAGATGGGACTGGC  150

seq1  TTTAGATAAGGGTGATCAACCAGGCTTGAATCCCTCCCTGTATCTCAGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATAAGGGTGATCAACCAGGCTTGAATCCCTCCCTGTATCTCAGGA  200

seq1  CATAGTCAGCAAGTTCACCGTAGCCAGGATACTAAATACTATGTCATTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTCAGCAAGTTCACCGTAGCCAGGATACTAAATACTATGTCATTCA  250

seq1  TAGTATTGAGACCCAAAAACAAATCTCCAAACAATCTCTTTTGGTTGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATTGAGACCCAAAAACAAATCTCCAAACAATCTCTTTTGGTTGTCA  300

seq1  CCAATTTCTTTTGTGTTTATTTATCTTTCCTAAGATTAGCAGGTTGACCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTCTTTTGTGTTTATTTATCTTTCCTAAGATTAGCAGGTTGACCC  350

seq1  GAACTATAGAATAACTGTTTCTTCTTCTGCTTGGAAAGATAGCCCCAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTATAGAATAACTGTTTCTTCTTCTGCTTGGAAAGATAGCCCCAGAT  400

seq1  TATGTTGAGCTGCCTCCATTCATCAAACACCATACATCTAAATGCAAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTGAGCTGCCTCCATTCATCAAACACCATACATCTAAATGCAAGCT  450

seq1  GACTAGAGATAGTGAAATGAGCTGGCCTGCCTAAAGGCCTTCTGCAGATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAGAGATAGTGAAATGAGCTGGCCTGCCTAAAGGCCTTCTGCAGATA  500

seq1  GGAAGGAATTAAGTATGTGCTCTCTTTGTATTCATAGCCCACAGAAAAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGAATTAAGTATGTGCTCTCTTTGTATTCATAGCCCACAGAAAAGC  550

seq1  TCAGCAGCAGATAAACAGCACATCGTTAATCTCACTGTGACTTCCTGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAGCAGATAAACAGCACATCGTTAATCTCACTGTGACTTCCTGTGG  600

seq1  GGGATAGGGAGTGGAGGAAGCCGTCCCTCTTCCTTGTCCAGACTCGAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGGATAGGGAGTGGAGGAAGCCGTCCCTCTTCCTTGTCCAGACTCCAATA  650

seq1  GAATGGTTCTGAACCTTCCTAATGC-TGTGACCCTTGAATACA-GTTCCT  698
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||
seq2  GAATGGTTCTGAACCTTCCTAATGCTTGTGACCCTTGAATACAGGTTCCT  700

seq1  -CAGGTTGTGGTGGCCCCCAACTAT-AACATTATTCTTGCTG  738
       |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||
seq2  CCAGGTTGTGGTGGCCCCCAACTATAAACTTTATTCTTGCTG  742