BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051E23
Chromosome8 (Build37)
Map Location 67,634,552 - 67,755,262
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665396, LOC100040949
Upstream geneTll1, LOC100040989, Cpe, Sc4mol, Klhl2, LOC100040903, LOC619647, 3110005G23Rik, Trim75, Trim60, LOC665388
Downstream geneLOC665405, Vaultrc-ps1, LOC100040967, March1, LOC100040986
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051E23.bB6Ng01-051E23.g
ACCDH874990DH874991
length890759
definitionDH874990|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051E23, 5' end.DH874991|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051E23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(67,634,552 - 67,635,440)(67,754,505 - 67,755,262)
sequence
gaattcagggatgccacatgattgcctgtgtgataccacgtactagtgta
aaatgaccttacagaccccccagcttcattccatgcctggaacaacactc
ttgcttgagtgtggtggtgcaggactttaatcctagcttcaggagacaga
ggtaggtggatctctgtgagttctaggccagcctgggctacagagtgaat
ccttgtttcaaagtaaacaaacaaacaacccccccactccccccaaaaaa
aagcaaaaccctgaaacaaaagcaaaataaaaacccactttagcttgttt
gttttgagtcagggtcgtgtcacatagcccaggcccgcctttaactggtt
atgtttgtcctgccccagctttccccgtgctaggtttgtgcttccatgcc
tggctttatataaccttctacttgtctatctatttgcttacttagtggct
agggggctgaaccttgtgtctattgggcaggtgctttacagctgagttgt
agccttaggtgaaacactgatgttagtgtaggcgttcaggatggagggaa
tcacggatgttttctggacataggtcacatacagtgggctctttctgtgc
cagcatccctcaggctgtcattctagtaacaatacacaaaagtagcattg
tttctgttgagaagggaaaatctgggtgaaaagacacagtaggtgggtga
tactgtcagacgcttttgacttctcaaggaggaacctttaggtctgttgg
aggtttgagggcaaagagcccatgaacaggcactctctaccaccatgacc
ttaattccacaaaagaagctctttaccaccatcatctggatgtgagaact
agtcaacatgtattgtcttcaggctggggggggggggaag
gaattcctagcatttggggctgctggtacatggtcaaagcagctctcaca
tacagcatcttactgcagacatcctcattttccatcgacagactgtccat
catcctcagacactgacaacaaaattgagagtattggcttcagagtcggg
tgccctgttattgtgtctgtgggcaagctacccaaacactatcttttcac
ttcatagaggaactgttttccaaacaattactggtgacacatgcaagcac
ttgtgatgcttcctagacatacaacatttttaaaatattcaacattatta
tttatttgttcttagttctctaagattaattaagtaattatggataataa
tacatattaccaaaaataacattagtgtttaattatctactaacagtaat
ttaaaacttgtttttcattgttattgttgttttatgtgttttgctttaaa
caaagtcttacttcagagttgaaagtagcatcaaattctctgtgtttcat
aggctagcctcaaactcttgatcatctctccatcacctcccagatattaa
aattacaggcatgtaccaccatgcctggataagattggaataatttgcgg
cacatgtctttaatccaacatttgggaggcagaaatagtcccatctattt
actttgagactgagttggtctacatagcaagttcttggatatccagctct
acatggagagaatgtatcatagaggggggaaaaaaagagaagggaggggg
gaagggaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_67634552_67635440
seq2: B6Ng01-051E23.b_42_931

seq1  GAATTCAGGGATGCCACATGATTGCCTGTGTGATACCACGTACTAGTGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGGATGCCACATGATTGCCTGTGTGATACCACGTACTAGTGTA  50

seq1  AAATGACCTTACAGACCCCCCAGCTTCATTCCATGCCTGGAACAACACTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACCTTACAGACCCCCCAGCTTCATTCCATGCCTGGAACAACACTC  100

seq1  TTGCTTGAGTGTGGTGGTGCAGGACTTTAATCCTAGCTTCAGGAGACAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTGAGTGTGGTGGTGCAGGACTTTAATCCTAGCTTCAGGAGACAGA  150

seq1  GGTAGGTGGATCTCTGTGAGTTCTAGGCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGTGGATCTCTGTGAGTTCTAGGCCAGCCTGGGCTACAGAGTGAAT  200

seq1  CCTTGTTTCAAAGTAAACAAACAAACAACCCCCCCACTCCCCCCAAAAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTTTCAAAGTAAACAAACAAACAACCCCCCCACTCCCCCCAAAAAA  250

seq1  AAGCAAAACCCTGAAACAAAAGCAAAATAAAAACCCACTTTAGCTTGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAAACCCTGAAACAAAAGCAAAATAAAAACCCACTTTAGCTTGTTT  300

seq1  GTTTTGAGTCAGGGTCGTGTCACATAGCCCAGGCCCGCCTTTAACTGGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGAGTCAGGGTCGTGTCACATAGCCCAGGCCCGCCTTTAACTGGTT  350

seq1  ATGTTTGTCCTGCCCCAGCTTTCCCCGTGCTAGGTTTGTGCTTCCATGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTGTCCTGCCCCAGCTTTCCCCGTGCTAGGTTTGTGCTTCCATGCC  400

seq1  TGGCTTTATATAACCTTCTACTTGTCTATCTATTTGCTTACTTAGTGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTTTATATAACCTTCTACTTGTCTATCTATTTGCTTACTTAGTGGCT  450

seq1  AGGGGGCTGAACCTTGTGTCTATTGGGCAGGTGCTTTACAGCTGAGTTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGCTGAACCTTGTGTCTATTGGGCAGGTGCTTTACAGCTGAGTTGT  500

seq1  AGCCTTAGGTGAAACACTGATGTTAGTGTAGGCGTTCAGGATGGAGGGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTAGGTGAAACACTGATGTTAGTGTAGGCGTTCAGGATGGAGGGAA  550

seq1  TCACGGATGTTTTCTGGACATAGGTCACATACAGTGGGCTCTTTCTGTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGGATGTTTTCTGGACATAGGTCACATACAGTGGGCTCTTTCTGTGC  600

seq1  CAGCATCCCTCAGGCTGTCATTCTAGTAACAATACACAAAAGTAGCATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCCCTCAGGCTGTCATTCTAGTAACAATACACAAAAGTAGCATTG  650

seq1  TTTCTGTTGAGAAGGGAAAATCTGGGTGAAAAGACACAGTAGGTGGGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTTGAGAAGGGAAAATCTGGGTGAAAAGACACAGTAGGTGGGTGA  700

seq1  TACTGTCAGACGCTTTTGACTTCTCAAGGAGGAACCTTTAGGTCTGTTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTCAGACGCTTTTGACTTCTCAAGGAGGAACCTTTAGGTCTGTTGG  750

seq1  AGGTTTGAGGGCAAAGAGCCCATGAACAGGCACTCTCTACCACCATGACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTGAGGGCAAAGAGCCCATGAACAGGCACTCTCTACCACCATGACC  800

seq1  TTAATTCCACAAAAGAAGCTC-TTACCACCATCATCTGGATGTGAGAACT  849
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTCCACAAAAGAAGCTCTTTACCACCATCATCTGGATGTGAGAACT  850

seq1  AGTCAACATGTATTGTCTTCAGGCTGGGGGGGGGGGGAGG  889
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AGTCAACATGTATTGTCTTCAGGCTGGGGGGGGGGGGAAG  890

seq1: chr8_67754505_67755262
seq2: B6Ng01-051E23.g_65_823 (reverse)

seq1  TCTCCCTT-CCCCCTCCCTTCTCTTTTTTTCCCCCCTCTATGATACATTC  49
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTTCCCCCCTCCCTTCTCTTTTTTTCCCCCCTCTATGATACATTC  50

seq1  TCTCCATGTAGAGCTGGATATCCAAGAACTTGCTATGTAGACCAACTCAG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCATGTAGAGCTGGATATCCAAGAACTTGCTATGTAGACCAACTCAG  100

seq1  TCTCAAAGTAAATAGATGGGACTATTTCTGCCTCCCAAATGTTGGATTAA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAAAGTAAATAGATGGGACTATTTCTGCCTCCCAAATGTTGGATTAA  150

seq1  AGACATGTGCCGCAAATTATTCCAATCTTATCCAGGCATGGTGGTACATG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATGTGCCGCAAATTATTCCAATCTTATCCAGGCATGGTGGTACATG  200

seq1  CCTGTAATTTTAATATCTGGGAGGTGATGGAGAGATGATCAAGAGTTTGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAATTTTAATATCTGGGAGGTGATGGAGAGATGATCAAGAGTTTGA  250

seq1  GGCTAGCCTATGAAACACAGAGAATTTGATGCTACTTTCAACTCTGAAGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTAGCCTATGAAACACAGAGAATTTGATGCTACTTTCAACTCTGAAGT  300

seq1  AAGACTTTGTTTAAAGCAAAACACATAAAACAACAATAACAATGAAAAAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTTTGTTTAAAGCAAAACACATAAAACAACAATAACAATGAAAAAC  350

seq1  AAGTTTTAAATTACTGTTAGTAGATAATTAAACACTAATGTTATTTTTGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTTAAATTACTGTTAGTAGATAATTAAACACTAATGTTATTTTTGG  400

seq1  TAATATGTATTATTATCCATAATTACTTAATTAATCTTAGAGAACTAAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATGTATTATTATCCATAATTACTTAATTAATCTTAGAGAACTAAGA  450

seq1  ACAAATAAATAATAATGTTGAATATTTTAAAAATGTTGTATGTCTAGGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATAAATAATAATGTTGAATATTTTAAAAATGTTGTATGTCTAGGAA  500

seq1  GCATCACAAGTGCTTGCATGTGTCACCAGTAATTGTTTGGAAAACAGTTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCACAAGTGCTTGCATGTGTCACCAGTAATTGTTTGGAAAACAGTTC  550

seq1  CTCTATGAAGTGAAAAGATAGTGTTTGGGTAGCTTGCCCACAGACACAAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTATGAAGTGAAAAGATAGTGTTTGGGTAGCTTGCCCACAGACACAAT  600

seq1  AACAGGGCACCCGACTCTGAAGCCAATACTCTCAATTTTGTTGTCAGTGT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGGCACCCGACTCTGAAGCCAATACTCTCAATTTTGTTGTCAGTGT  650

seq1  CTGAGGATGATGGACAGTCTGTCGATGGAAAATGAGGATGTCTGCAGTAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGATGATGGACAGTCTGTCGATGGAAAATGAGGATGTCTGCAGTAA  700

seq1  GATGCTGTATGTGAGAGCTGCTTTGACCATGTACCAGCAGCCCCAAATGC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCTGTATGTGAGAGCTGCTTTGACCATGTACCAGCAGCCCCAAATGC  750

seq1  TAGGAATTC  758
      |||||||||
seq2  TAGGAATTC  759