BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051M08
Chromosome8 (Build37)
Map Location 79,888,504 - 80,000,358
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArhgap10
Upstream geneLOC666226, LOC100039211, LOC384847, Nr3c2
Downstream geneLOC100039235, AI931714, Tmem34, Ednra, EG622803, Ttc29, Pou4f2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051M08.bB6Ng01-051M08.g
ACCDH875315DH875316
length966759
definitionDH875315|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051M08, 5' end.DH875316|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051M08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,888,504 - 79,889,467)(79,999,600 - 80,000,358)
sequence
gaattcactcctggcgtcctccagcctgcgatgccaaggaacgctgcgtt
atcagcacagatggagcatggttctggagaagagcctggtgagaactgca
aacaacgaatccccgagacgcaggccctccctgacagatgacagtctgcg
aaactaaaaatgagcgagtccccgtgatcttgtctaaccaaaagtactgt
caggattctggacaggcaatctggaaaccatgcagagcacagaggcctga
ctccaactctactgtgagaggcatgtacctatgagctgcattcttctgtc
ctcctgcttattaagtcccaggaacgtggataatctcagcctccgctgag
gacacaacccacccaagtaagcggtacaagagaagatgtgttcctaagtg
catcatatatatcaaatattaagttgcaaagtcaatgagcataaacagtt
aatgcatggaaaaatgattaaagaggcatacccatcaacatactcagaag
tctctggacctttgaactcacccccacaactctgtacagtccttggtcat
ttatacctattgagagagagaaagggttagcaggttataagaccaccgtg
tttcaaaagctatcaaacagttgcattccaaaatctctgataactcgcaa
cagcagcattcctgcagactataaaaatatttgacaaaaacaagtgttca
ttgtcaaagtgctatattagcttcgtacgtgagctgagacccaaagatga
ccacatgcagcagagttccacatggataaaggatgcccacagttatgaga
ccatgctgaggcacagcctgatgtagtgcctacaggtgcacttccatgtt
ttgtttattttattacttggggtttttttttttttttttggaaagtggat
aggtttacaaaaaaaagtgtttaaatgattttctgagaaccacactgaat
ctgcgtttttaaaaaa
gaattcctaagttctcacagatctaaacatttaaaggacatgtgtccaga
gatgatcttaatgtatgaatgaacaccactccagattgaaggcccctgta
acttcccttctttctctttctagaaggatccattatcttagatttggaat
gtagcattgttatgcatttttaatacttttatcacacttatatttgtaag
aaataaatattctaaagctttatggaagtgatagcacactctatataaga
gaaaaggccatgttttgaaaattgtctcattttgatttacttctgtgtca
tttttaaatgtatgtattccatcccatggttattctatagtgtgtgttta
cctgtgaggtgttttagatggtttccaaattttcactaaggttcatagaa
gtactgtgggtatgtatgcttgcacaaagctgcagataggcacagccgag
tgtctctggagacctgcagctacgctatagtcctgttcagttttactcca
ttcatttacatagcctgtctgtaaccccttcaatgtgatgtcactggcca
gtgtcttctcttatacttaagattaaatatctgaatttttcaccaattgt
tatgtatgagcttattgtcctcacttgaatatagaatttgcccgagagct
ccagtagttatcttttcaaacatgtattgatctttcagttgtgtatgtgt
gtgcatctgtgtgttgtgttgcactgtatgtatttgtttgtatgtgtagg
tattgtgca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_79888504_79889467
seq2: B6Ng01-051M08.b_42_1007

seq1  GAATTCACTCCTGGCGTCCTCCAGCCTGCGATGCCAAGGAACGCTGCGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCCTGGCGTCCTCCAGCCTGCGATGCCAAGGAACGCTGCGTT  50

seq1  ATCAGCACAGATGGAGCATGGTTCTGGAGAAGAGCCTGGTGAGAACTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCACAGATGGAGCATGGTTCTGGAGAAGAGCCTGGTGAGAACTGCA  100

seq1  AACAACGAATCCCCGAGACGCAGGCCCTCCCTGACAGATGACAGTCTGCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACGAATCCCCGAGACGCAGGCCCTCCCTGACAGATGACAGTCTGCG  150

seq1  AAACTAAAAATGAGCGAGTCCCCGTGATCTTGTCTAACCAAAAGTACTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAAAAATGAGCGAGTCCCCGTGATCTTGTCTAACCAAAAGTACTGT  200

seq1  CAGGATTCTGGACAGGCAATCTGGAAACCATGCAGAGCACAGAGGCCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATTCTGGACAGGCAATCTGGAAACCATGCAGAGCACAGAGGCCTGA  250

seq1  CTCCAACTCTACTGTGAGAGGCATGTACCTATGAGCTGCATTCTTCTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAACTCTACTGTGAGAGGCATGTACCTATGAGCTGCATTCTTCTGTC  300

seq1  CTCCTGCTTATTAAGTCCCAGGAACGTGGATAATCTCAGCCTCCGCTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCTTATTAAGTCCCAGGAACGTGGATAATCTCAGCCTCCGCTGAG  350

seq1  GACACAACCCACCCAAGTAAGCGGTACAAGAGAAGATGTGTTCCTAAGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAACCCACCCAAGTAAGCGGTACAAGAGAAGATGTGTTCCTAAGTG  400

seq1  CATCATATATATCAAATATTAAGTTGCAAAGTCAATGAGCATAAACAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATATATATCAAATATTAAGTTGCAAAGTCAATGAGCATAAACAGTT  450

seq1  AATGCATGGAAAAATGATTAAAGAGGCATACCCATCAACATACTCAGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCATGGAAAAATGATTAAAGAGGCATACCCATCAACATACTCAGAAG  500

seq1  TCTCTGGACCTTTGAACTCACCCCCACAACTCTGTACAGTCCTTGGTCAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGACCTTTGAACTCACCCCCACAACTCTGTACAGTCCTTGGTCAT  550

seq1  TTATACCTATTGAGAGAGAGAAAGGGTTAGCAGGTTATAAGACCACCGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATACCTATTGAGAGAGAGAAAGGGTTAGCAGGTTATAAGACCACCGTG  600

seq1  TTTCAAAAGCTATCAAACAGTTGCATTCCAAAATCTCTGATAACTCGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAAAGCTATCAAACAGTTGCATTCCAAAATCTCTGATAACTCGCAA  650

seq1  CAGCAGCATTCCTGCAGACTATAAAAATATTTGACAAAAACAAGTGTTCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCATTCCTGCAGACTATAAAAATATTTGACAAAAACAAGTGTTCA  700

seq1  TTGTCAAAGTGCTATATTAGCTTCGTACGTGAGCTGAGACCCAAAGATGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCAAAGTGCTATATTAGCTTCGTACGTGAGCTGAGACCCAAAGATGA  750

seq1  CCACATGCAGCAGAGTTCCACATGGAT-AAGGATGCCCACAGTTATGAGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATGCAGCAGAGTTCCACATGGATAAAGGATGCCCACAGTTATGAGA  800

seq1  CCATGCTGAGGCACAGCCTGATGTAGTGCCTACAGGTGCACTTCCATGGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CCATGCTGAGGCACAGCCTGATGTAGTGCCTACAGGTGCACTTCCAT-GT  849

seq1  TTTGTTTATTTATTTACTTGGG--TTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAGTGGA  897
      |||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTATTTTATTACTTGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAAGTGGA  899

seq1  TAGGTATACAGAAGAAAGTGTTTAGATGA-TTTCTGAAGACCAGCACTGA  946
      ||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||  |||| ||||||
seq2  TAGGTTTACAAAAAAAAGTGTTTAAATGATTTTCTGAGAACCA-CACTGA  948

seq1  ATCTGTGTTTTTAAAAAA  964
      ||||| ||||||||||||
seq2  ATCTGCGTTTTTAAAAAA  966

seq1: chr8_79999600_80000358
seq2: B6Ng01-051M08.g_67_825 (reverse)

seq1  TGCACAATACCTACACATACAAACAAATACATACAGTGCAACACAACACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACAATACCTACACATACAAACAAATACATACAGTGCAACACAACACA  50

seq1  CAGATGCACACACATACACAACTGAAAGATCAATACATGTTTGAAAAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGCACACACATACACAACTGAAAGATCAATACATGTTTGAAAAGAT  100

seq1  AACTACTGGAGCTCTCGGGCAAATTCTATATTCAAGTGAGGACAATAAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACTGGAGCTCTCGGGCAAATTCTATATTCAAGTGAGGACAATAAGC  150

seq1  TCATACATAACAATTGGTGAAAAATTCAGATATTTAATCTTAAGTATAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACATAACAATTGGTGAAAAATTCAGATATTTAATCTTAAGTATAAG  200

seq1  AGAAGACACTGGCCAGTGACATCACATTGAAGGGGTTACAGACAGGCTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGACACTGGCCAGTGACATCACATTGAAGGGGTTACAGACAGGCTAT  250

seq1  GTAAATGAATGGAGTAAAACTGAACAGGACTATAGCGTAGCTGCAGGTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAATGAATGGAGTAAAACTGAACAGGACTATAGCGTAGCTGCAGGTCT  300

seq1  CCAGAGACACTCGGCTGTGCCTATCTGCAGCTTTGTGCAAGCATACATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGACACTCGGCTGTGCCTATCTGCAGCTTTGTGCAAGCATACATAC  350

seq1  CCACAGTACTTCTATGAACCTTAGTGAAAATTTGGAAACCATCTAAAACA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGTACTTCTATGAACCTTAGTGAAAATTTGGAAACCATCTAAAACA  400

seq1  CCTCACAGGTAAACACACACTATAGAATAACCATGGGATGGAATACATAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACAGGTAAACACACACTATAGAATAACCATGGGATGGAATACATAC  450

seq1  ATTTAAAAATGACACAGAAGTAAATCAAAATGAGACAATTTTCAAAACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAAATGACACAGAAGTAAATCAAAATGAGACAATTTTCAAAACAT  500

seq1  GGCCTTTTCTCTTATATAGAGTGTGCTATCACTTCCATAAAGCTTTAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTTCTCTTATATAGAGTGTGCTATCACTTCCATAAAGCTTTAGAA  550

seq1  TATTTATTTCTTACAAATATAAGTGTGATAAAAGTATTAAAAATGCATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATTTCTTACAAATATAAGTGTGATAAAAGTATTAAAAATGCATAA  600

seq1  CAATGCTACATTCCAAATCTAAGATAATGGATCCTTCTAGAAAGAGAAAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCTACATTCCAAATCTAAGATAATGGATCCTTCTAGAAAGAGAAAG  650

seq1  AAGGGAAGTTACAGGGGCCTTCAATCTGGAGTGGTGTTCATTCATACATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGAAGTTACAGGGGCCTTCAATCTGGAGTGGTGTTCATTCATACATT  700

seq1  AAGATCATCTCTGGACACATGTCCTTTAAATGTTTAGATCTGTGAGAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATCATCTCTGGACACATGTCCTTTAAATGTTTAGATCTGTGAGAACT  750

seq1  TAGGAATTC  759
      |||||||||
seq2  TAGGAATTC  759