BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063I21
Chromosome8 (Build37)
Map Location 47,509,558 - 47,653,366
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC667337, Acsl1, Mlf1ip
Upstream geneSorbs2, Pdlim3, Ccdc110, 1700029J07Rik, 1810047C23Rik, Ankrd37, Lrp2bp, Snx25, 4933411K20Rik, Slc25a4, LOC621269, LOC100039875, LOC667325, Helt
Downstream geneCcdc111, Casp3, Irf2, Enpp6, Stox2, 4930448N21Rik, D030016E14Rik, Rwdd4a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063I21.bB6Ng01-063I21.g
ACCDH883611DH883612
length1,1281,094
definitionDH883611|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063I21, 5' end.DH883612|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063I21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,652,229 - 47,653,366)(47,509,558 - 47,510,664)
sequence
gaattctatcaacaacttgaaaactctttaaggatgaatccaagtctcat
gtgatagccctggatagcccttgatttcagctctgagcagagaagccagc
taaattgaagctggactctgggccaggaatagtgaaatgctaagtgtgta
catttaagtaactaactttgtggtagtcataaagcaattataaacagaga
gaaagccctactaagtcagatactgggaaaatgtcttaggctttctacac
tcaccctagcagagggcaaaagcaagcctgtgacatcaaaatacccagcc
aaaagtcagactgtctgctgggacagtacttaacgctactcacacaagga
tgggacacagagttcaaaaatctcttaacaccacggactacagtttcaag
ttctagactaaaactaacacacaagaaaatgtagggcacaagaaaatgtg
acccagagtcaagacaaaaacagaccaaagacaaattggcccaaagatga
accagacaatggctggatccaaacaaagggtgaagcagctgtcatcatgt
ctaggaagggaagggacagtcttaatagagaccctccctgtggaacagaa
gacacaggcagcacagccctcccccagcaaagtctggagcaaagctgttc
tctgttgattccagtggctgcgggctgtgactggtgtcatagctgttcca
tccatcttcacatcacccactctttctcgctcacaagaatacctatggtg
acatttgtggctacccatacaatttacatgtgagagtatctttagctacc
catatgagcagaatgtggacagatctctggggtgtaattaaaccactcca
cgtgggcttaagcaaaccaatgttgacggctgggaatgtggctcaatttg
tacagagtgaagttctgagttccaccctctgtgccacataaacttagcat
agtgatgcaccctgccagatggtcatgtcacatgcagcaaacgtgctggt
gcggtagctgagactgacattgaatcccaagtacatgccaaaaagacaga
aacactgggtctgggttagcccattctccagtgacaaacctcgtccctca
gtctacttcttacccgaggggcattctc
gaattcttgctgtgcaagcaagaggaactgagctgagatcccaaacctat
gcaaaaagctgggtgttcctgcatgtacctgtaatcctagcgtttagagg
gcagagacatgagggttgctggtagatccgacgtgtctactgccttcacc
atgctttcaacatgaattctaagatgggtggatacatacataaagagaga
atatcctaacactgtacagctcatttaggtctgctgacctattaaaaaac
agtataaaaatgacggctggagagacgacacagcggttaagagaagtcgc
tgctgtttcagaaaacccaagttcagttcagttcccagcatccacaaggc
aacccacaaccatctgcaactgcagtctcagggaatccaacacctcctgg
tcccccacgggcatcagacatgcatgtggtgcacatacatacgtgcaggc
aaaacactcatacatataaaaacttgaaaaaatactataaaaatgatgtg
ccccatgaagtagcagaaatcaatattcatttctgggtacctgacacaca
ttcacagcagttttcaagtgtggattcaggggcaaaaggtatgtagctag
atagccttaattcatagcttagtcttttggctatttgagctttgatcttc
ttctttatgaaaaagcaaatactaaccccaatggttgctgagccaaagga
agtatataggcctattagaattatataaccatttatattataattaatta
tatatactatatatactctacagctatataattagaattatagaattata
tagccattcacaattccagatgagttacaacaaacctgtaaaccctaaag
acaaagaaaagattcgtctgtaacgacatgacagcagaggaagaaaactg
tgcactactcaatgcagatgggctgcagttactagacctcagcctgactt
atcatacatacaatgtaatgctcccatttctcactgtgtcttctctcccg
tcctcccaattgcctgtcatctgctttcaatggaaattctctccgttaga
atcagacctgctgtgtaatacaaagatattgtttaaggaattga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_47652229_47653366
seq2: B6Ng01-063I21.b_49_1176 (reverse)

seq1  GAGAATGCCCCCCCTGCGGTTAGGAAGTGTGGCCTTGGAGGACGAGGTTT  50
      |||||||||||     ||| || |||  || | | ||  |||||||||||
seq2  GAGAATGCCCC----TCGGGTAAGAA--GTAGAC-TGAGGGACGAGGTTT  43

seq1  GTCACTGGAG-ATGGGCTTACACCAGACCCAGTGTTTCTGTCTTTTTGCC  99
      |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GTCACTGGAGAATGGGCTAAC-CCAGACCCAGTGTTTCTGTCTTTTTGGC  92

seq1  ATGTACTTGTGAATCAAATGTCAGTTCTCAGCTACCGCACCAGCACGTTT  149
      ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTACTTGGGATTC-AATGTCAG-TCTCAGCTACCGCACCAGCACGTTT  140

seq1  GCTGCCATGTGACATGACCATCTGGCAGGGTGCATCACTATGCTAAGTTT  199
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTG-CATGTGACATGACCATCTGGCAGGGTGCATCACTATGCTAAGTTT  189

seq1  ATGTGGCACAGGGGGTGGAACTCAGAACTTCACTCTGTACAAATTGAGCC  249
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGCACAGAGGGTGGAACTCAGAACTTCACTCTGTACAAATTGAGCC  239

seq1  ACATTCCCAGCCGTCAACATTGGTTTGCTTAAGCCCACGTGGAGTGGTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCCCAGCCGTCAACATTGGTTTGCTTAAGCCCACGTGGAGTGGTTT  289

seq1  AATTACACCCCAGAGATCTGTCCACATTCTGCTCATATGGGTAGCTAAAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACACCCCAGAGATCTGTCCACATTCTGCTCATATGGGTAGCTAAAG  339

seq1  ATACTCTCACATGTAAATTGTATGGGTAGCCACAAATGTCACCATAGGTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTCTCACATGTAAATTGTATGGGTAGCCACAAATGTCACCATAGGTA  389

seq1  TTCTTGTGAGCGAGAAAGAGTGGGTGATGTGAAGATGGATGGAACAGCTA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGTGAGCGAGAAAGAGTGGGTGATGTGAAGATGGATGGAACAGCTA  439

seq1  TGACACCAGTCACAGCCCGCAGCCACTGGAATCAACAGAGAACAGCTTTG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACACCAGTCACAGCCCGCAGCCACTGGAATCAACAGAGAACAGCTTTG  489

seq1  CTCCAGACTTTGCTGGGGGAGGGCTGTGCTGCCTGTGTCTTCTGTTCCAC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAGACTTTGCTGGGGGAGGGCTGTGCTGCCTGTGTCTTCTGTTCCAC  539

seq1  AGGGAGGGTCTCTATTAAGACTGTCCCTTCCCTTCCTAGACATGATGACA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGGGTCTCTATTAAGACTGTCCCTTCCCTTCCTAGACATGATGACA  589

seq1  GCTGCTTCACCCTTTGTTTGGATCCAGCCATTGTCTGGTTCATCTTTGGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTTCACCCTTTGTTTGGATCCAGCCATTGTCTGGTTCATCTTTGGG  639

seq1  CCAATTTGTCTTTGGTCTGTTTTTGTCTTGACTCTGGGTCACATTTTCTT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTGTCTTTGGTCTGTTTTTGTCTTGACTCTGGGTCACATTTTCTT  689

seq1  GTGCCCTACATTTTCTTGTGTGTTAGTTTTAGTCTAGAACTTGAAACTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCTACATTTTCTTGTGTGTTAGTTTTAGTCTAGAACTTGAAACTGT  739

seq1  AGTCCGTGGTGTTAAGAGATTTTTGAACTCTGTGTCCCATCCTTGTGTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCGTGGTGTTAAGAGATTTTTGAACTCTGTGTCCCATCCTTGTGTGA  789

seq1  GTAGCGTTAAGTACTGTCCCAGCAGACAGTCTGACTTTTGGCTGGGTATT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCGTTAAGTACTGTCCCAGCAGACAGTCTGACTTTTGGCTGGGTATT  839

seq1  TTGATGTCACAGGCTTGCTTTTGCCCTCTGCTAGGGTGAGTGTAGAAAGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGTCACAGGCTTGCTTTTGCCCTCTGCTAGGGTGAGTGTAGAAAGC  889

seq1  CTAAGACATTTTCCCAGTATCTGACTTAGTAGGGCTTTCTCTCTGTTTAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGACATTTTCCCAGTATCTGACTTAGTAGGGCTTTCTCTCTGTTTAT  939

seq1  AATTGCTTTATGACTACCACAAAGTTAGTTACTTAAATGTACACACTTAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTTTATGACTACCACAAAGTTAGTTACTTAAATGTACACACTTAG  989

seq1  CATTTCACTATTCCTGGCCCAGAGTCCAGCTTCAATTTAGCTGGCTTCTC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCACTATTCCTGGCCCAGAGTCCAGCTTCAATTTAGCTGGCTTCTC  1039

seq1  TGCTCAGAGCTGAAATCAAGGGCTATCCAGGGCTATCACATGAGACTTGG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCAGAGCTGAAATCAAGGGCTATCCAGGGCTATCACATGAGACTTGG  1089

seq1  ATTCATCCTTAAAGAGTTTTCAAGTTGTTGATAGAATTC  1138
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATCCTTAAAGAGTTTTCAAGTTGTTGATAGAATTC  1128

seq1: chr8_47509558_47510664
seq2: B6Ng01-063I21.g_68_1161

seq1  GAATTCTTGCTGTGCAAGCAAGAGGAACTGAGCTGAGATCCCAAACCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGCTGTGCAAGCAAGAGGAACTGAGCTGAGATCCCAAACCTAT  50

seq1  GCAAAAAGCTGGGTGTTCCTGCATGTACCTGTAATCCTAGCGTTTAGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAAGCTGGGTGTTCCTGCATGTACCTGTAATCCTAGCGTTTAGAGG  100

seq1  GCAGAGACATGAGGGTTGCTGGTAGATCCGACGTGTCTACTGCCTTCACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGACATGAGGGTTGCTGGTAGATCCGACGTGTCTACTGCCTTCACC  150

seq1  ATGCTTTCAACATGAATTCTAAGATGGGTGGATACATACATAAAGAGAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTTCAACATGAATTCTAAGATGGGTGGATACATACATAAAGAGAGA  200

seq1  ATATCCTAACACTGTACAGCTCATTTAGGTCTGCTGACCTATTAAAAAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCTAACACTGTACAGCTCATTTAGGTCTGCTGACCTATTAAAAAAC  250

seq1  AGTATAAAAATGACGGCTGGAGAGACGACACAGCGGTTAAGAGAAGTCGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATAAAAATGACGGCTGGAGAGACGACACAGCGGTTAAGAGAAGTCGC  300

seq1  TGCTGTTTCAGAAAACCCAAGTTCAGTTCAGTTCCCAGCATCCACAAGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTTTCAGAAAACCCAAGTTCAGTTCAGTTCCCAGCATCCACAAGGC  350

seq1  AACCCACAACCATCTGCAACTGCAGTCTCAGGGAATCCAACACCTCCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCACAACCATCTGCAACTGCAGTCTCAGGGAATCCAACACCTCCTGG  400

seq1  TCCCCCACGGGCATCAGACATGCATGTGGTGCACATACATACGTGCAGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCACGGGCATCAGACATGCATGTGGTGCACATACATACGTGCAGGC  450

seq1  AAAACACTCATACATATAAAAACTTGAAAAAATACTATAAAAATGATGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACACTCATACATATAAAAACTTGAAAAAATACTATAAAAATGATGTG  500

seq1  CCCCATGAAGTAGCAGAAATCAATATTCATTTCTGGGTACCTGACACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGAAGTAGCAGAAATCAATATTCATTTCTGGGTACCTGACACACA  550

seq1  TTCACAGCAGTTTTCAAGTGTGGATTCAGGGGCAAAAGGTATGTAGCTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACAGCAGTTTTCAAGTGTGGATTCAGGGGCAAAAGGTATGTAGCTAG  600

seq1  ATAGCCTTAATTCATAGCTTAGTCTTTTGGCTATTTGAGCTTTGATCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCTTAATTCATAGCTTAGTCTTTTGGCTATTTGAGCTTTGATCTTC  650

seq1  TTCTTTATGAAAAAGCAAATACTAACCCCAATGGTTGCTGAGCCAAAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTATGAAAAAGCAAATACTAACCCCAATGGTTGCTGAGCCAAAGGA  700

seq1  AGTATATAGGCCTATTAGAATTATATAACCATTTATATTATAATTAATTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATATAGGCCTATTAGAATTATATAACCATTTATATTATAATTAATTA  750

seq1  TATATACTATATATACTCTACAGCTATATAATTAGAATTATAGAATTATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATACTATATATACTCTACAGCTATATAATTAGAATTATAGAATTATA  800

seq1  TAGCCATTCACAATTCCAGATGAGTTACAACAAACCTGTAAACCCTAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCATTCACAATTCCAGATGAGTTACAACAAACCTGTAAACCCTAAAG  850

seq1  ACAAAGAAAAGATTCGTCTGTAACGACATGACAGCAGAGGAAGAGACCTG  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||
seq2  ACAAAGAAAAGATTCGTCTGTAACGACATGACAGCAGAGGAAGAAAACTG  900

seq1  TGCACTACTCAAATGCAGATGGGCTGCAGTTACTAGACCCCAGCCTGACC  950
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  TGCACTACTC-AATGCAGATGGGCTGCAGTTACTAGACCTCAGCCTGA-C  948

seq1  TAATCATACATACAATGTAATGCTCCCCATTTCTCACTGTGTCCTCTCCT  1000
      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||
seq2  TTATCATACATACAATGTAATGCT-CCCATTTCTCACTGTGTCTTCT-CT  996

seq1  CCCGTCCTCCCAATTGCCTGTCATCTGCCTCTCCCATTGTAAATTCCTCT  1050
      |||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||| ||||
seq2  CCCGTCCTCCCAATTGCCTGTCATCTG---CTTTCAATGGAAATT-CTCT  1042

seq1  CCTGTTAGAATCAGACCTGCTGTGTAGATACAAAAGGATA-TGTTTAAGG  1099
      || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||
seq2  CC-GTTAGAATCAGACCTGCTGTGTA-ATACAAA--GATATTGTTTAAGG  1088

seq1  GAAATTGA  1107
        ||||||
seq2  --AATTGA  1094