BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067P16
Chromosome8 (Build37)
Map Location 53,408,469 - 53,568,057
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1190028D05Rik
Upstream geneLOC623872, LOC100040220, LOC623935
Downstream geneLOC676688
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067P16.bB6Ng01-067P16.g
ACCDH886704DH886705
length1,070868
definitionDH886704|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067P16, 5' end.DH886705|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067P16, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(53,566,972 - 53,568,057)(53,408,469 - 53,409,332)
sequence
gaattcatctgggaggatgaaagtttaatcgatattttatcgatattttt
tgcaaacaatggtaatatctataatcagaccagaacaagccttgccattc
ccatgagcaagaccattcccatgagtctgaggaattaggatcctttcacg
gcaatccacattcccttcataggctccacatatatcagtccctgagtcca
cccaccaagtatcagctgaaaacgataattgtgcattatgtgtgaattag
ctgtataattggttaaaacacagacagtgaagctaaatttttccaatgat
ttcttttaaataatagaagctagtttttaagtagtagttgtgaatcttca
acaaattggcacataactactaatacaagaactgaaatgaatttgttatg
ataatagtctcttcatttgctgcatcttgctatacccaatcactttagtt
ttgtaaaacagtaaaagagtgatattcaatagaagtaaaaaaatggtaga
atttatctagtaataatttctaaggagctgtaacacctaatgaaaatact
tcattatgaaggctggcataatattaaagaagaacgaagtaagagaaact
gaagaaaactacctcataactcatctgaagggatatgcatttgagttcaa
ggacagaaggtaacttataaggaaagtcttagatggcatgtaaaaagtaa
ggattggcactcaaggagtatgatgaaagtataataattgtgatgtttaa
atgagtgtatttatatctgcatgtatgcttcattttgtgtaatatgaaaa
gattggaagtgacatcagtgtctttgattttattattctagtctcaatta
aatggatatgaatgcatgtatgcagttattattttacagtatgctgaata
tattaaaatgtatatgatggtgggacactcagttaccagggcatatttgc
agttagatgaccgttttcaggaatgcacttgggaaagcagccttgtaagt
gaatttccttatagtgagaaacaacagcacataacaaagtccagtgtttc
tcactctaatgcacttgtgt
gaattcatgacattaaagtacaaaaaaagattaggggaagaaggtggtcc
aaaagacgtaaagaaaacacggggtaaagaagtgctgatagtagcataat
ctaaacaagtttcatgagtgtccttgtttgttacccagtgtcctgtgaaa
tgaacatgcatcacacccttactgaacctttctttagtaaacgacaagaa
tctctaaagcagcagtgttatttatatattgatgatatgggagtttgtat
gtcccacctctacaggctcatgtgttggaatgtttgccctatggggatga
catgagtagaaggtacagctttgttggagtaggtggagccttgctggagg
aagtgtgtcactgtgggactgtgggattgagctttgaggtctcttatgct
caagtttcaagcagtgtggatgccagtatccttcagctgacttcaggtca
aaatgaagaactctcagctccttatctaataccatgtgtacctgaatgct
attgtctttcccaccaaaaaaaggaaggactaaacatctgaaacgttaag
ccagcccaattaaatgctttcttttataagagccttggtcttgatgtcaa
ctcacagcaatgaagccctaagtaagacaaataatgattaatgcatgtgt
gtgtgtgtgtgttgaaagacaaatttttttccttaaatctctcttgagat
ttaaaatcaaagacacataattcagtggttttacttctgtcttctatttc
ctcattattttctgacatactacatctcaaatacatgtctgagaaatact
tcagcttttctctgttccataaaagggagcaacattctcttcattatttg
gatgcatatcacaaactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_53566972_53568057
seq2: B6Ng01-067P16.b_48_1117 (reverse)

seq1  ACACAAAGTGCAATTAAGGAGTGAAGAAAACACTTGTGACCTTTGTTATT  50
      |||| |||||| ||||  ||||||   ||||||   ||  ||||||||| 
seq2  ACAC-AAGTGC-ATTA--GAGTGA--GAAACAC---TGGACTTTGTTAT-  40

seq1  GTTGCTGTTTGTTTCTCACTATAAGGAAATTTCACTTACAAGGCTGGCTT  100
        ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  -GTGCTG-TTGTTTCTCACTATAAGGAAA-TTCACTTACAAGGCT-GCTT  86

seq1  TCCCAAGTGCATTCCCTGAAAACGGTCATCTAACCTGCAAATATGCCCTG  150
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGTGCATT-CCTGAAAACGGTCATCTAA-CTGCAAATATGCCCTG  134

seq1  GTAACTGAGTGTCCCACCATCATATACATTTTAATATATTCAGCATACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTGAGTGTCCCACCATCATATACATTTTAATATATTCAGCATACTG  184

seq1  TAAAATAATAACTGCATACATGCATTCATATCCATTTAATTGAGACTAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATAATAACTGCATACATGCATTCATATCCATTTAATTGAGACTAGA  234

seq1  ATAATAAAATCAAAGACACTGATGTCACTTCCAATCTTTTCATATTACAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAAAATCAAAGACACTGATGTCACTTCCAATCTTTTCATATTACAC  284

seq1  AAAATGAAGCATACATGCAGATATAAATACACTCATTTAAACATCACAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAAGCATACATGCAGATATAAATACACTCATTTAAACATCACAAT  334

seq1  TATTATACTTTCATCATACTCCTTGAGTGCCAATCCTTACTTTTTACATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATACTTTCATCATACTCCTTGAGTGCCAATCCTTACTTTTTACATG  384

seq1  CCATCTAAGACTTTCCTTATAAGTTACCTTCTGTCCTTGAACTCAAATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTAAGACTTTCCTTATAAGTTACCTTCTGTCCTTGAACTCAAATGC  434

seq1  ATATCCCTTCAGATGAGTTATGAGGTAGTTTTCTTCAGTTTCTCTTACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATCCCTTCAGATGAGTTATGAGGTAGTTTTCTTCAGTTTCTCTTACTT  484

seq1  CGTTCTTCTTTAATATTATGCCAGCCTTCATAATGAAGTATTTTCATTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCTTCTTTAATATTATGCCAGCCTTCATAATGAAGTATTTTCATTAG  534

seq1  GTGTTACAGCTCCTTAGAAATTATTACTAGATAAATTCTACCATTTTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTACAGCTCCTTAGAAATTATTACTAGATAAATTCTACCATTTTTTT  584

seq1  ACTTCTATTGAATATCACTCTTTTACTGTTTTACAAAACTAAAGTGATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTATTGAATATCACTCTTTTACTGTTTTACAAAACTAAAGTGATTG  634

seq1  GGTATAGCAAGATGCAGCAAATGAAGAGACTATTATCATAACAAATTCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATAGCAAGATGCAGCAAATGAAGAGACTATTATCATAACAAATTCAT  684

seq1  TTCAGTTCTTGTATTAGTAGTTATGTGCCAATTTGTTGAAGATTCACAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTTCTTGTATTAGTAGTTATGTGCCAATTTGTTGAAGATTCACAAC  734

seq1  TACTACTTAAAAACTAGCTTCTATTATTTAAAAGAAATCATTGGAAAAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTACTTAAAAACTAGCTTCTATTATTTAAAAGAAATCATTGGAAAAAT  784

seq1  TTAGCTTCACTGTCTGTGTTTTAACCAATTATACAGCTAATTCACACATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTTCACTGTCTGTGTTTTAACCAATTATACAGCTAATTCACACATA  834

seq1  ATGCACAATTATCGTTTTCAGCTGATACTTGGTGGGTGGACTCAGGGACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACAATTATCGTTTTCAGCTGATACTTGGTGGGTGGACTCAGGGACT  884

seq1  GATATATGTGGAGCCTATGAAGGGAATGTGGATTGCCGTGAAAGGATCCT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATATGTGGAGCCTATGAAGGGAATGTGGATTGCCGTGAAAGGATCCT  934

seq1  AATTCCTCAGACTCATGGGAATGGTCTTGCTCATGGGAATGGCAAGGCTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCTCAGACTCATGGGAATGGTCTTGCTCATGGGAATGGCAAGGCTT  984

seq1  GTTCTGGTCTGATTATAGATATTACCATTGTTTGCAAAAAATATCGATAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTGGTCTGATTATAGATATTACCATTGTTTGCAAAAAATATCGATAA  1034

seq1  AATATCGATTAAACTTTCATCCTCCCAGATGAATTC  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCGATTAAACTTTCATCCTCCCAGATGAATTC  1070

seq1: chr8_53408469_53409332
seq2: B6Ng01-067P16.g_70_936

seq1  GAATTCATGACATTAAAGTACAAAAAAAGATTAGGGGAAGAAGGTGGTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGACATTAAAGTACAAAAAAAGATTAGGGGAAGAAGGTGGTCC  50

seq1  AAAAGACGTAAAGAAAACACGGGGTAAAGAAGTGCTGATAGTAGCATAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACGTAAAGAAAACACGGGGTAAAGAAGTGCTGATAGTAGCATAAT  100

seq1  CTAAACAAGTTTCATGAGTGTCCTTGTTTGTTACCCAGTGTCCTGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACAAGTTTCATGAGTGTCCTTGTTTGTTACCCAGTGTCCTGTGAAA  150

seq1  TGAACATGCATCACACCCTTACTGAACCTTTCTTTAGTAAACGACAAGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACATGCATCACACCCTTACTGAACCTTTCTTTAGTAAACGACAAGAA  200

seq1  TCTCTAAAGCAGCAGTGTTATTTATATATTGATGATATGGGAGTTTGTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTAAAGCAGCAGTGTTATTTATATATTGATGATATGGGAGTTTGTAT  250

seq1  GTCCCACCTCTACAGGCTCATGTGTTGGAATGTTTGCCCTATGGGGATGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCACCTCTACAGGCTCATGTGTTGGAATGTTTGCCCTATGGGGATGA  300

seq1  CATGAGTAGAAGGTACAGCTTTGTTGGAGTAGGTGGAGCCTTGCTGGAGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGTAGAAGGTACAGCTTTGTTGGAGTAGGTGGAGCCTTGCTGGAGG  350

seq1  AAGTGTGTCACTGTGGGACTGTGGGATTGAGCTTTGAGGTCTCTTATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTGTCACTGTGGGACTGTGGGATTGAGCTTTGAGGTCTCTTATGCT  400

seq1  CAAGTTTCAAGCAGTGTGGATGCCAGTATCCTTCAGCTGACTTCAGGTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTTCAAGCAGTGTGGATGCCAGTATCCTTCAGCTGACTTCAGGTCA  450

seq1  AAATGAAGAACTCTCAGCTCCTTATCTAATACCATGTGTACCTGAATGCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAGAACTCTCAGCTCCTTATCTAATACCATGTGTACCTGAATGCT  500

seq1  ATTGTCTTTCCCACCAAAAAAAGGAAGGACTAAACATCTGAAACGTTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCTTTCCCACCAAAAAAAGGAAGGACTAAACATCTGAAACGTTAAG  550

seq1  CCAGCCCAATTAAATGCTTTCTTTTATAAGAGCCTTGGTCTTGATGTCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCCAATTAAATGCTTTCTTTTATAAGAGCCTTGGTCTTGATGTCAA  600

seq1  CTCACAGCAATGAAGCCCTAAGTAAGACAAATAATGATTAATGCATGTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACAGCAATGAAGCCCTAAGTAAGACAAATAATGATTAATGCATGTGT  650

seq1  GTGTGTGTGTGTTGAAAGACAAA-TTTTTTCCTTAAATCTCTCTTGAGAT  699
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTTGAAAGACAAATTTTTTTCCTTAAATCTCTCTTGAGAT  700

seq1  TTAAAATCAAAGACACATAATTCAGTGG-TTTACTTCTGTCTTCTATTTC  748
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAATCAAAGACACATAATTCAGTGGTTTTACTTCTGTCTTCTATTTC  750

seq1  CTCATTATTTTCTGAACATACTACATCCCAAATACATGTCTGAGAAATAC  798
      |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTATTTTCTG-ACATACTACATCTCAAATACATGTCTGAGAAATAC  799

seq1  TTCAGCTTTTCTCTGTTCCAT-AAAGGGAGCAACA-TCTCTTCATTATTT  846
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TTCAGCTTTTCTCTGTTCCATAAAAGGGAGCAACATTCTCTTCATTATTT  849

seq1  GTATGCATATCACAAACT  864
      | ||||||||||||||||
seq2  GGATGCATATCACAAACT  867