BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-068B07
Chromosome8 (Build37)
Map Location 104,040,342 - 104,181,964
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042086, LOC100042092, LOC384895
Downstream geneCdh11
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-068B07.bB6Ng01-068B07.g
ACCDH886774DH886775
length1,104448
definitionDH886774|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068B07, 5' end.DH886775|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-068B07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,180,837 - 104,181,964)(104,040,342 - 104,040,795)
sequence
gaattccctgtgttatgtcacccattaacatcttcaccaccagtaactgt
gttgaaatgtaattcattttcactgaaacagccattcatccatgtcctat
tacccctgtaaataaaatgtggcatgatttgatattaacacatacttttt
ttttcccatttagggaactccttagtcaatacaatattttcagattacat
gctgactctacatatatactagtgtacacaatatgtataaaacattaata
aatgcaacccaatagcaaacatggaacactgtaaggcagcaatatttgac
atgtaattacttggaatggcaggggtgccatacacatttaaaaatgtaat
cagccttgtaacaaaaggcagagtgcttttcccatttaaaattaattgtc
cagaggaactctgttctgcatgctgaaattgttttcagagcgcaattaaa
aaaaaaagtggtaagtgttccaaacttcttcattgtctgtctatatttaa
gaaaattcatttggcccagacccacagagcttaaaagcaaatggtgcata
ttatcacataattagaagcaaataagtttgaaatctgctgctaggagatg
tgtttataataagtgttagttgaccaaaaattaccagaacgtttttcaaa
aatgttaaaccataattactcatctctttttgtgtcatattaacacagtt
acctcttaggttatcatcctaactatagtcaattaaactgaggtcaattt
tacctggaagtaattattacatatcaagtgagaaaattataggttattta
aattgccacaatcccaggagaaagcagtatctactttataaggttaaaag
aaagtagtgggcatgatggcacatgctcaaattcccaatacctggaggta
aaaggaagacaccacaaaatcaaggacagcctggttcagatgtagatctt
gcattaataataataattaattaaaaatttattacgcatacattctgatc
catacacttgacatgtgtctatactagtttcatacataatagctaaattt
attatcatctatatcttttatattgatatctgtacatgtggggtataaac
catg
aatgccatcttctgcctattgtgaacaggcacatacatgttacatataca
tacatacatacatacatacatacatacatacatacactcaaaacactcat
agatatgattttcccatgaagtcaacttaaaaacacagaaagatgccttt
ctttctatagcatgactcaaagtcatcactatcaaagacaaaggaacacc
ggaatctgttcccaaagccatgtgagtcctcaggcatggaagcaggagtg
ggtgggttggggagcagggcagggggatgatataggggacttttggagag
gaaactaggaaaggggatagcatttgagatgtaaatgaagaaaatatcta
ataaaaaataacacagtgttatacaatccttcttgtccatagctactcac
ctgttcattaatcttagtgtataagaaactaagaagagttttgtagcg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_104180837_104181964
seq2: B6Ng01-068B07.b_47_1150 (reverse)

seq1  CATGTGTTTATACACCCACATGGTACAGATATCATATATAAAAGATAATA  50
      |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  CATG-GTTTATAC-CCCACAT-GTACAGATATCA-ATATAAAAGAT-ATA  45

seq1  AGGATGATAATAATATTTAGCTATTATGTATGAAAACTAGGTATTAGACA  100
        ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||
seq2  --GATGATAATAA-ATTTAGCTATTATGTATG-AAACTA-GTA-TAGACA  89

seq1  CAATGTCAAGTGGTATGGAATCAGAATTGTATGCGTAATAAATTTTTTAA  150
      | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||
seq2  C-ATGTCAAGT-GTATGG-ATCAGAA-TGTATGCGTAATAAA-TTTTTAA  134

seq1  TTAATTAATTAATTAATTAATGCAAGATCTACATTCCTGAACCCAGGCTG  200
      |||||| ||||  | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||
seq2  TTAATT-ATTA--TTATTAATGCAAGATCTACAT--CTGAA-CCAGGCTG  178

seq1  TCCTTGATTTTGTGGTTGTCTTCCTTTTACCTCCCAGGTATTGGGAATTT  250
      ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCCTTGATTTTGTGG-TGTCTTCCTTTTACCT-CCAGGTATTGGGAATTT  226

seq1  GAGCATGTGCCATCATGCCCACTACCTTCTTTTAACCTTATAAAGTAGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGTGCCATCATGCCCACTACTTTCTTTTAACCTTATAAAGTAGAT  276

seq1  ACTGCTTTCTCCTGGGATTGTGGCAATTTAAATAACCTATAATTTTCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTTCTCCTGGGATTGTGGCAATTTAAATAACCTATAATTTTCTCA  326

seq1  CTTGATATGTAATAATTACTTCCAGGTAAAATTGACCTCAGTTTAATTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATATGTAATAATTACTTCCAGGTAAAATTGACCTCAGTTTAATTGA  376

seq1  CTATAGTTAGGATGATAACCTAAGAGGTAACTGTGTTAATATGACACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGTTAGGATGATAACCTAAGAGGTAACTGTGTTAATATGACACAAA  426

seq1  AAGAGATGAGTAATTATGGTTTAACATTTTTGAAAAACGTTCTGGTAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATGAGTAATTATGGTTTAACATTTTTGAAAAACGTTCTGGTAATT  476

seq1  TTTGGTCAACTAACACTTATTATAAACACATCTCCTAGCAGCAGATTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCAACTAACACTTATTATAAACACATCTCCTAGCAGCAGATTTCA  526

seq1  AACTTATTTGCTTCTAATTATGTGATAATATGCACCATTTGCTTTTAAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTATTTGCTTCTAATTATGTGATAATATGCACCATTTGCTTTTAAGC  576

seq1  TCTGTGGGTCTGGGCCAAATGAATTTTCTTAAATATAGACAGACAATGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGGTCTGGGCCAAATGAATTTTCTTAAATATAGACAGACAATGAA  626

seq1  GAAGTTTGGAACACTTACCACTTTTTTTTTTAATTGCGCTCTGAAAACAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTTGGAACACTTACCACTTTTTTTTTTAATTGCGCTCTGAAAACAA  676

seq1  TTTCAGCATGCAGAACAGAGTTCCTCTGGACAATTAATTTTAAATGGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGCATGCAGAACAGAGTTCCTCTGGACAATTAATTTTAAATGGGAA  726

seq1  AAGCACTCTGCCTTTTGTTACAAGGCTGATTACATTTTTAAATGTGTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACTCTGCCTTTTGTTACAAGGCTGATTACATTTTTAAATGTGTATG  776

seq1  GCACCCCTGCCATTCCAAGTAATTACATGTCAAATATTGCTGCCTTACAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCCCTGCCATTCCAAGTAATTACATGTCAAATATTGCTGCCTTACAG  826

seq1  TGTTCCATGTTTGCTATTGGGTTGCATTTATTAATGTTTTATACATATTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCATGTTTGCTATTGGGTTGCATTTATTAATGTTTTATACATATTG  876

seq1  TGTACACTAGTATATATGTAGAGTCAGCATGTAATCTGAAAATATTGTAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACACTAGTATATATGTAGAGTCAGCATGTAATCTGAAAATATTGTAT  926

seq1  TGACTAAGGAGTTCCCTAAATGGGAAAAAAAAAGTATGTGTTAATATCAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTAAGGAGTTCCCTAAATGGGAAAAAAAAAGTATGTGTTAATATCAA  976

seq1  ATCATGCCACATTTTATTTACAGGGGTAATAGGACATGGATGAATGGCTG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGCCACATTTTATTTACAGGGGTAATAGGACATGGATGAATGGCTG  1026

seq1  TTTCAGTGAAAATGAATTACATTTCAACACAGTTACTGGTGGTGAAGATG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGTGAAAATGAATTACATTTCAACACAGTTACTGGTGGTGAAGATG  1076

seq1  TTAATGGGTGACATAACACAGGGAATTC  1128
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGGGTGACATAACACAGGGAATTC  1104

seq1: chr8_104040342_104040795
seq2: B6Ng01-068B07.g_68_521

seq1  GAATTCAATGCCATCTTCTGCCTATTGTGAACAGGCACATACATGTTACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGCCATCTTCTGCCTATTGTGAACAGGCACATACATGTTACA  50

seq1  TATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACACTCAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATACATACATACATACATACATACATACATACATACACTCAAAAC  100

seq1  ACTCATAGATATGATTTTCCCATGAAGTCAACTTAAAAACACAGAAAGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATAGATATGATTTTCCCATGAAGTCAACTTAAAAACACAGAAAGAT  150

seq1  GCCTTTCTTTCTATAGCATGACTCAAAGTCATCACTATCAAAGACAAAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTCTTTCTATAGCATGACTCAAAGTCATCACTATCAAAGACAAAGG  200

seq1  AACACCGGAATCTGTTCCCAAAGCCATGTGAGTCCTCAGGCATGGAAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACCGGAATCTGTTCCCAAAGCCATGTGAGTCCTCAGGCATGGAAGCA  250

seq1  GGAGTGGGTGGGTTGGGGAGCAGGGCAGGGGGATGATATAGGGGACTTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGGGTGGGTTGGGGAGCAGGGCAGGGGGATGATATAGGGGACTTTT  300

seq1  GGAGAGGAAACTAGGAAAGGGGATAGCATTTGAGATGTAAATGAAGAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGGAAACTAGGAAAGGGGATAGCATTTGAGATGTAAATGAAGAAAA  350

seq1  TATCTAATAAAAAATAACACAGTGTTATACAATCCTTCTTGTCCATAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTAATAAAAAATAACACAGTGTTATACAATCCTTCTTGTCCATAGCT  400

seq1  ACTCACCTGTTCATTAATCTTAGTGTATAAGAAACTAAGAAGAGTTTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACCTGTTCATTAATCTTAGTGTATAAGAAACTAAGAAGAGTTTTGT  450

seq1  AGCG  454
      ||||
seq2  AGCG  454