BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070B20
Chromosome8 (Build37)
Map Location 85,072,722 - 85,207,490
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666564
Upstream geneInpp4b, LOC671182, Il15
Downstream geneLOC675800, EG666289, Zfp330, Rnf150, LOC100039688, Tbc1d9, Ucp1, Elmod2, 4933434I20Rik, Clgn, Scoc, LOC546077, LOC675854, Olfr370, Ndufb7, Gpsn2, Dnajb1, Gipc1, Ptger1, Pkn1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070B20.bB6Ng01-070B20.g
ACCDH888217DH888218
length1,1651,087
definitionDH888217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070B20, 5' end.DH888218|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070B20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,072,722 - 85,073,893)(85,206,408 - 85,207,490)
sequence
gaattcttgtaagttcaaataactgcatgtagcctgggctataacctcca
tgctagatttagatttccatataatcacactcttcttacatggttactct
ttagtttctcattgtaagtttttgttatgtgtatgtgaaagtatatacaa
ggggtagggagatggatcagtaggaaaattgcctactacccttgtatgag
aacctgagttaggatttccaacaccaacataaaagcctagtgtcatggca
cacatgtgcaatgcctgggctgggagaacagaaaagagctggggctcgag
ccagctgagcaaaacagtgcagtgcaggttctctgaaaatatcctagcta
aaaacctaacatggagagccaatggaggaaattactcaaagttgagttct
agcctacaaataaatacacaggtatagatgcccctcctcctcctcctcct
cctcctcctccacacacacacacacacacacacacacacacacacgcaca
tacacacatatgcgcactcacacgtgcatgcatctacagacaagcattca
aaaatcatgcagataaatgaatgaaatgggcacaagccaatcaaacaatg
aacatttgttcctgtctatcaaggcccacaggagaaggcaaactagattt
gtgcacaaatcgactgcttccctatgcttgggctttcttctgggcttact
cagacagggaaatgtaataatgttacatcctgactttggggatatacaag
agaaacttgaaattccatttaatcagccctgtaaatagcatatttttcct
cagtgcactgtatggctggtttagaggtctgaattatgatagagaaggaa
tgaaatagaaaagattatacaaaggaacaaaatgagaaaatgagaacaga
gagatgtacttcatccccaaccaacggtggcatgggagatgaacggtgaa
gcacagagagctgtttctcacattcatttcatctgtgtgctcacttgcca
ttcactttaggtgatgtacagctcatcacagttagtgtacacttctcaat
tggatggaattacccacatttacacaatggataacctttgtaattgcctt
tcttttctatggaacccactttggggggtgtttcgggtttgcataaaagt
accacggaaaatgca
gaattcatcagctcaggagagttaattccttaggcgttctatgggaattc
agtgagtgagtgcactccatccagcatgcatccccccaactccagtctct
tttatgaatcagtactgttgactcctgggatatactgagtgcttggtgag
tggcaggccgagataaagagtgacctaggcagtaacttacacagcgtttt
aaagctgcagaaggtgctaaaatatttctggaaatgtttcagtacagaga
aaattgtcattaccagaagtcatgtcagtgagcattttatgtggtctgga
gaagtttctttagaagatgctcggaatgggagtagagtcggcaggcgtgg
tgtttcttggtaagtctacatgtccttccttgcggaagagagttgacacc
tgttgtactggtggcctgttactctcaggactctcagggtagaaggtaaa
ccacatggtctttctacatcagggccactgtgtgtgtcagaggttttatt
gctgtgataaatgcaggatggaaagtatttgaaggaagatctatttgtgc
tcatagttttaaaggttttaatgtgaggtctgctgactccattgtttaga
atttatgatgagctacttcatagcagctaggagggaggatggctggagtg
agttgtgagaaacagggcagggtgatacaatgttgcaaagcatgcttcca
ttgactttctgcctttactttggccctacctctgaaagtttctattactt
cctaaaaagacttccaattacaaatccatcaatgaattaatccacttatg
gagtcagagcccttacaatcctcacagccctttcagtccctacacctcac
agtgattcattagatcagttggggaccaaatccccaacctctaaactttc
ttggggggggcttcatatctgagccataaatacacattcaaataacgtta
atcggtcacatacttaccctttgtgggaagaggaacttttttcatgtgca
gtttgggaagctcatatgatggtgtacaagcttgtcttgttttcacattg
gagaagctggagcatttaggtgccggtaaccctttta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_85072722_85073893
seq2: B6Ng01-070B20.b_17_1202

seq1  ACTTATA--------------GAATTCTTGTAAGTTCAAATAACTGCATG  36
      |||||||              |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTATAGGGAGAGGTCCGCGGAATTCTTGTAAGTTCAAATAACTGCATG  50

seq1  TAGCCTGGGCTATAACCTCCATGCTAGATTTAGATTTCCATATAATCACA  86
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCTGGGCTATAACCTCCATGCTAGATTTAGATTTCCATATAATCACA  100

seq1  CTCTTCTTACATGGTTACTCTTTAGTTTCTCATTGTAAGTTTTTGTTATG  136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTTACATGGTTACTCTTTAGTTTCTCATTGTAAGTTTTTGTTATG  150

seq1  TGTATGTGAAAGTATATACAAGGGGTAGGGAGATGGATCAGTAGGAAAAT  186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGAAAGTATATACAAGGGGTAGGGAGATGGATCAGTAGGAAAAT  200

seq1  TGCCTACTACCCTTGTATGAGAACCTGAGTTAGGATTTCCAACACCAACA  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTACTACCCTTGTATGAGAACCTGAGTTAGGATTTCCAACACCAACA  250

seq1  TAAAAGCCTAGTGTCATGGCACACATGTGCAATGCCTGGGCTGGGAGAAC  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGCCTAGTGTCATGGCACACATGTGCAATGCCTGGGCTGGGAGAAC  300

seq1  AGAAAAGAGCTGGGGCTCGAGCCAGCTGAGCAAAACAGTGCAGTGCAGGT  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGAGCTGGGGCTCGAGCCAGCTGAGCAAAACAGTGCAGTGCAGGT  350

seq1  TCTCTGAAAATATCCTAGCTAAAAACCTAACATGGAGAGCCAATGGAGGA  386
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAAAATATCCTAGCTAAAAACCTAACATGGAGAGCCAATGGAGGA  400

seq1  AATTACTCAAAGTTGAGTTCTAGCCTACAAATAAATACACAGGTATAGAT  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACTCAAAGTTGAGTTCTAGCCTACAAATAAATACACAGGTATAGAT  450

seq1  GCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACACACACACACACACAC  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCACACACACACACACACAC  500

seq1  ACACACACACACACACGCACATACACACATATGCGCACTCACACGTGCAT  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACGCACATACACACATATGCGCACTCACACGTGCAT  550

seq1  GCATCTACAGACAAGCATTCAAAAATCATGCAGATAAATGAATGAAATGG  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTACAGACAAGCATTCAAAAATCATGCAGATAAATGAATGAAATGG  600

seq1  GCACAAGCCAATCAAACAATGAACATTTGTTCCTGTCTATCAAGGCCCAC  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAGCCAATCAAACAATGAACATTTGTTCCTGTCTATCAAGGCCCAC  650

seq1  AGGAGAAGGCAAACTAGATTTGTGCACAAATCGACTGCTTCCCTATGCTT  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAAGGCAAACTAGATTTGTGCACAAATCGACTGCTTCCCTATGCTT  700

seq1  GGGCTTTCTTCTGGGCTTACTCAGACAGGGAAATGTAATAATGTTACATC  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTTTCTTCTGGGCTTACTCAGACAGGGAAATGTAATAATGTTACATC  750

seq1  CTGACTTTGGGGATATACAAGAGAAACTTGAAATTCCATTTAATCAGCCC  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTTTGGGGATATACAAGAGAAACTTGAAATTCCATTTAATCAGCCC  800

seq1  TGTAAATAGCATA-TTTTCCTCAGTGCACTGTATGGCTGGTTTAGAGGTC  835
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAATAGCATATTTTTCCTCAGTGCACTGTATGGCTGGTTTAGAGGTC  850

seq1  TGAATTATGATTAGAGAAAGAATGAAATAG-AAAGATTATACAAAGGAAC  884
      |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TGAATTATGA-TAGAGAAGGAATGAAATAGAAAAGATTATACAAAGGAAC  899

seq1  AAAATGAGAAAATGAGAACAGAGAGATGTACTTCATCCCCAACCAACGGT  934
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGAGAAAATGAGAACAGAGAGATGTACTTCATCCCCAACCAACGGT  949

seq1  GGCATGGGAGATGAACGGTGAAGCACAGAGAGCTGTTTCTCACATTCA-T  983
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GGCATGGGAGATGAACGGTGAAGCACAGAGAGCTGTTTCTCACATTCATT  999

seq1  TCATCTGTGTGCTCACTTTGCCATTCACTTTAAGGTGATGTACAGCTCAT  1033
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TCATCTGTGTGCTCAC-TTGCCATTCACTTT-AGGTGATGTACAGCTCAT  1047

seq1  CACAGTATAGTGTACACTTCTCAAATTGATGAAATTACACACA-TTACAG  1082
      |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||||| 
seq2  CACAGT-TAGTGTACACTTCTCAATTGGATGGAATTACCCACATTTACA-  1095

seq1  CAAT-GATAACCCTTGTATATGCCTTTCTTTCCTATGGAACCAGTTTTGG  1131
      |||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||   |||||
seq2  CAATGGATAACCTTTGTAATTGCCTTTCTTTTCTATGGAACCCACTTTGG  1145

seq1  GGGTTGTTTTGGGTTTTGCATAGAAGTTACCA--GGAAATGCA  1172
      ||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||  | |||||||
seq2  GGGGTGTTTCGGG-TTTGCATAAAAG-TACCACGGAAAATGCA  1186

seq1: chr8_85206408_85207490
seq2: B6Ng01-070B20.g_65_1151 (reverse)

seq1  TAAAAGGGTTAACGGCA-CTAAATGCT-CAGCTTCTCCAATGTGAAAACA  48
      ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGGTTACCGGCACCTAAATGCTCCAGCTTCTCCAATGTGAAAACA  50

seq1  AGACAAGCTTGTACA-CATCATATGAGCTTCCCAAACTGCACATGAAAAA  97
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGCTTGTACACCATCATATGAGCTTCCCAAACTGCACATGAAAAA  100

seq1  AGTTCCTC-TCCCACAAAGGGTAAGTATGTGACCGATTAACGTTATTTGA  146
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCTCTTCCCACAAAGGGTAAGTATGTGACCGATTAACGTTATTTGA  150

seq1  ATGTGTATTTATGGCTCAGATATGAAGCCCCCCCCAAGAAAGTTTAGAGG  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTATTTATGGCTCAGATATGAAGCCCCCCCCAAGAAAGTTTAGAGG  200

seq1  TTGGGGATTTGGTCCCCAACTGATCTAATGAATCACTGTGAGGTGTAGGG  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGATTTGGTCCCCAACTGATCTAATGAATCACTGTGAGGTGTAGGG  250

seq1  ACTGAAAGGGCTGTGAGGATTGTAAGGGCTCTGACTCCATAAGTGGATTA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAAAGGGCTGTGAGGATTGTAAGGGCTCTGACTCCATAAGTGGATTA  300

seq1  ATTCATTGATGGATTTGTAATTGGAAGTCTTTTTAGGAAGTAATAGAAAC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCATTGATGGATTTGTAATTGGAAGTCTTTTTAGGAAGTAATAGAAAC  350

seq1  TTTCAGAGGTAGGGCCAAAGTAAAGGCAGAAAGTCAATGGAAGCATGCTT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAGAGGTAGGGCCAAAGTAAAGGCAGAAAGTCAATGGAAGCATGCTT  400

seq1  TGCAACATTGTATCACCCTGCCCTGTTTCTCACAACTCACTCCAGCCATC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACATTGTATCACCCTGCCCTGTTTCTCACAACTCACTCCAGCCATC  450

seq1  CTCCCTCCTAGCTGCTATGAAGTAGCTCATCATAAATTCTAAACAATGGA  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCTCCTAGCTGCTATGAAGTAGCTCATCATAAATTCTAAACAATGGA  500

seq1  GTCAGCAGACCTCACATTAAAACCTTTAAAACTATGAGCACAAATAGATC  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCAGACCTCACATTAAAACCTTTAAAACTATGAGCACAAATAGATC  550

seq1  TTCCTTCAAATACTTTCCATCCTGCATTTATCACAGCAATAAAACCTCTG  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTCAAATACTTTCCATCCTGCATTTATCACAGCAATAAAACCTCTG  600

seq1  ACACACACAGTGGCCCTGATGTAGAAAGACCATGTGGTTTACCTTCTACC  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACAGTGGCCCTGATGTAGAAAGACCATGTGGTTTACCTTCTACC  650

seq1  CTGAGAGTCCTGAGAGTAACAGGCCACCAGTACAACAGGTGTCAACTCTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAGTCCTGAGAGTAACAGGCCACCAGTACAACAGGTGTCAACTCTC  700

seq1  TTCCGCAAGGAAGGACATGTAGACTTACCAAGAAACACCACGCCTGCCGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCGCAAGGAAGGACATGTAGACTTACCAAGAAACACCACGCCTGCCGA  750

seq1  CTCTACTCCCATTCCGAGCATCTTCTAAAGAAACTTCTCCAGACCACATA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACTCCCATTCCGAGCATCTTCTAAAGAAACTTCTCCAGACCACATA  800

seq1  AAATGCTCACTGACATGACTTCTGGTAATGACAATTTTCTCTGTACTGAA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTCACTGACATGACTTCTGGTAATGACAATTTTCTCTGTACTGAA  850

seq1  ACATTTCCAGAAATATTTTAGCACCTTCTGCAGCTTTAAAACGCTGTGTA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTCCAGAAATATTTTAGCACCTTCTGCAGCTTTAAAACGCTGTGTA  900

seq1  AGTTACTGCCTAGGTCACTCTTTATCTCGGCCTGCCACTCACCAAGCACT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACTGCCTAGGTCACTCTTTATCTCGGCCTGCCACTCACCAAGCACT  950

seq1  CAGTATATCCCAGGAGTCAACAGTACTGATTCATAAAAGAGACTGGAGTT  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTATATCCCAGGAGTCAACAGTACTGATTCATAAAAGAGACTGGAGTT  1000

seq1  GGGGGGATGCATGCTGGATGGAGTGCACTCACTCACTGAATTCCCATAGA  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGGATGCATGCTGGATGGAGTGCACTCACTCACTGAATTCCCATAGA  1050

seq1  ACGCCTAAGGAATTAACTCTCCTGAGCTGATGAATTC  1083
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCCTAAGGAATTAACTCTCCTGAGCTGATGAATTC  1087