BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070E24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 47,817,186 - 47,970,090
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIrf2
Upstream geneSorbs2, Pdlim3, Ccdc110, 1700029J07Rik, 1810047C23Rik, Ankrd37, Lrp2bp, Snx25, 4933411K20Rik, Slc25a4, LOC621269, LOC100039875, LOC667325, Helt, LOC667337, Acsl1, Mlf1ip, Ccdc111, Casp3
Downstream geneEnpp6, Stox2, 4930448N21Rik, D030016E14Rik, Rwdd4a, LOC384819, LOC667422, Ing2, LOC546058, Cdkn2aip, LOC100039801, Cldn22, Wwc2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070E24.bB6Ng01-070E24.g
ACCDH888353DH888354
length1,163206
definitionDH888353|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070E24, 5' end.DH888354|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070E24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(47,817,186 - 47,818,367)(47,969,885 - 47,970,090)
sequence
gaattcaaggccagtctggattgctctagacctaatttcaaaaccaaaca
tacagagaggagcttaaagtcaggatccttagtttgaagttcaaaaacaa
acagacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaa
gcatgactgactgtttagttgcaaagttccacacatgataaaaaaaaaaa
cttaaaattttaggaactattacaaaagaagttgttcgtggacaaaacaa
acaaacacccccccccaaaccaaaccaaaccaaaaacctaaaagaatgtt
agaaatcaaactataaaacacatcccagaaccattatcatgacacaatct
caaaaaaaaaaatcattatttttttttcactcaaaaacctgagataagta
gagtatgcctaaaatttgtgtgtcccccacctgccaccgtaaggtgtttt
gggtatgtgcctcaagagtcattaattagattcacattatttacttgtga
agaaggaaataagaggggaagttggacagaaattagtatttttgcttaag
aagtaaacacactgaccggagttcagcatgtttctcagcaaatccctgga
attatggattaagaggcaaggagggaacagtcacaaatgcctccaggggg
ccagcaagttaagaaacctttgtgcttctctgatgtagaagaggcgattt
ggaaatttacagcatgatttttgaaaccgtacgtggattccataattccc
actgctcataaagtccagactccttgatctagctctgcccacctcttacc
acacgttatgtcctcccaactctttctgccaactctcagaagatgccagg
tctccgactcatggggcattggtcccagcttgttcctctgttcaggttcc
ttatccacactggtatgtgatgtcacggcttcctccctgtttacatgctg
aaatctaacttccactaccagaatgtgaccttatatttacatacttatgt
gtttgtttagagacagggcttactatgtagccctggctagcccagaaatc
tctatgtagacaggctagcctcacattcagatctgctgctgatcagcatg
cacattccatcgagctttagtgggtgctgagacttgaacttgtccgattc
cccaggactactt
tgaatgtaggcctttgatgcatgcataaacacacaactaaatacattttt
taaaatgtgctattagatactatgcatttctgtaggtagaagagacaaga
atgagcggaaaagagaaccagggagaaagaggaccaaaggatgtggtttc
cttaaacttgtgataatgccttgggggtagggggagtaaattagtagaga
gaggtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_47817186_47818367
seq2: B6Ng01-070E24.b_47_1209

seq1  GAATTCAAGGCCAGTCTGGATTGCTCTAGACCTAATTTCAAAACCAAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAGTCTGGATTGCTCTAGACCTAATTTCAAAACCAAACA  50

seq1  TACAGAGAGGAGCTTAAAGTCAGGATCCTTAGTTTGAAGTTCAAAAACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGAGAGGAGCTTAAAGTCAGGATCCTTAGTTTGAAGTTCAAAAACAA  100

seq1  ACAGACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAA  150

seq1  GCATGACTGACTGTTTAGTTGCAAAGTTCCACACATGATAAAAAAAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGACTGACTGTTTAGTTGCAAAGTTCCACACATGATAAAAAAAAAAA  200

seq1  CTTAAAATTTTAGGAACTATTACAAAAGAAGTTGTTCGTGGACAAAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAAAATTTTAGGAACTATTACAAAAGAAGTTGTTCGTGGACAAAACAA  250

seq1  ACAAACACCCCCCCCCAAACCAAACCAAACCAAAAACCTAAAAGAATGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACACCCCCCCCCAAACCAAACCAAACCAAAAACCTAAAAGAATGTT  300

seq1  AGAAATCAAACTATAAAACACATCCCAGAACCATTATCATGACACAATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATCAAACTATAAAACACATCCCAGAACCATTATCATGACACAATCT  350

seq1  CAAAAAAAAAAATCATTATTTTTTTTTCACTCAAAAACCTGAGATAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAAAAAAATCATTATTTTTTTTTCACTCAAAAACCTGAGATAAGTA  400

seq1  GAGTATGCCTAAAATTTGTGTGTCCCCCACCTGCCACCGTAAGGTGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTATGCCTAAAATTTGTGTGTCCCCCACCTGCCACCGTAAGGTGTTTT  450

seq1  GGGTATGTGCCTCAAGAGTCATTAATTAGATTCACATTATTTACTTGTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTATGTGCCTCAAGAGTCATTAATTAGATTCACATTATTTACTTGTGA  500

seq1  AGAAGGAAATAAGAGGGGAAGTTGGACAGAAATTAGTATTTTTGCTTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGAAATAAGAGGGGAAGTTGGACAGAAATTAGTATTTTTGCTTAAG  550

seq1  AAGTAAACACACTGACCGGAGTTCAGCATGTTTCTCAGCAAATCCCTGGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAAACACACTGACCGGAGTTCAGCATGTTTCTCAGCAAATCCCTGGA  600

seq1  ATTATGGATTAAGAGGCAAGGAGGGAACAGTCACAAATGCCTCCAGGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGGATTAAGAGGCAAGGAGGGAACAGTCACAAATGCCTCCAGGGGG  650

seq1  CCAGCAAGTTAAGAAACCTTTGTGCTTCTCTGATGTAGAAGAGGCGATTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCAAGTTAAGAAACCTTTGTGCTTCTCTGATGTAGAAGAGGCGATTT  700

seq1  GGAAATTTACAGCATGATTTTTGAAACCGTACGTGGATTCCATAATTCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATTTACAGCATGATTTTTGAAACCGTACGTGGATTCCATAATTCCC  750

seq1  ACTGCTCATAAAGTCCAGACTCCTTGATCTAGCTCTGCCCACCTCTTACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTCATAAAGTCCAGACTCCTTGATCTAGCTCTGCCCACCTCTTACC  800

seq1  ACACGTTATGTCCTCCCAACTCTTTCTGCCAACTCTCAGAAGATGCCAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGTTATGTCCTCCCAACTCTTTCTGCCAACTCTCAGAAGATGCCAGG  850

seq1  TCTCCGACTCATGGGGCATTGGTCCCAGCTTGTTCCTCTGTTCAGGTTCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCGACTCATGGGGCATTGGTCCCAGCTTGTTCCTCTGTTCAGGTTCC  900

seq1  TTATCCACACTGGTATGTGATGTCACGGCTTCCTCCCTGTTTACATGCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCACACTGGTATGTGATGTCACGGCTTCCTCCCTGTTTACATGCTG  950

seq1  AAATCTAACTTCCACTACCCAGAATGTGACCTTATATTTACATACTTATG  1000
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTAACTTCCACTA-CCAGAATGTGACCTTATATTTACATACTTATG  999

seq1  TGTTTGTTTAGAGACAGGGCCTTACTATGTAGCCCTGGCTAGCCCAGAAA  1050
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTTTAGAGACAGGG-CTTACTATGTAGCCCTGGCTAGCCCAGAAA  1048

seq1  TCTCTATGTAGACCAGGCTAGCCTCACATTCAGATCTGCCTGCTGGAATC  1100
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||
seq2  TCTCTATGTAGA-CAGGCTAGCCTCACATTCAGATCTG-CTGCTG--ATC  1094

seq1  CAGGCATGCACCATCCCATCGAGCCTTTAGGTGGGTGCTGAGGACTTGAA  1150
         ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||
seq2  --AGCATGCA-CATTCCATCGAG-CTTTA-GTGGGTGCTGA-GACTTGAA  1138

seq1  CTCTGGTCCTCGTATCCCCCCAGGAACTACTT  1182
        || ||||   |    ||||||| |||||||
seq2  --CTTGTCCGATT----CCCCAGG-ACTACTT  1163

seq1: chr8_47969885_47970090
seq2: B6Ng01-070E24.g_73_278 (reverse)

seq1  CACCTCTCTCTACTAATTTACTCCCCCTACCCCCAAGGCATTATCACAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTCTCTCTACTAATTTACTCCCCCTACCCCCAAGGCATTATCACAAG  50

seq1  TTTAAGGAAACCACATCCTTTGGTCCTCTTTCTCCCTGGTTCTCTTTTCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGGAAACCACATCCTTTGGTCCTCTTTCTCCCTGGTTCTCTTTTCC  100

seq1  GCTCATTCTTGTCTCTTCTACCTACAGAAATGCATAGTATCTAATAGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCATTCTTGTCTCTTCTACCTACAGAAATGCATAGTATCTAATAGCAC  150

seq1  ATTTTAAAAAATGTATTTAGTTGTGTGTTTATGCATGCATCAAAGGCCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAAAAATGTATTTAGTTGTGTGTTTATGCATGCATCAAAGGCCTA  200

seq1  CATTCA  206
      ||||||
seq2  CATTCA  206