BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070F06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 64,558,422 - 64,693,846
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAnxa10, LOC100040775
Upstream geneNek1, Sh3rf1, EG664975, Cbr4, Palld, LOC100040872, BC013672
Downstream geneLOC384830, LOC100040804, LOC665267, Spock3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070F06.bB6Ng01-070F06.g
ACCDH888365DH888366
length1,1641,205
definitionDH888365|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070F06, 5' end.DH888366|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070F06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,692,678 - 64,693,846)(64,558,422 - 64,559,650)
sequence
gaattcactctcgcgcctgtgtacaaggcttgtttactagttaggcacag
cggaggccagtgccatcttataatggcgattgctcgcggcacacatggct
ctcctcagcgattgctcgcggcacggctctccacaagaaggtgtattgta
gatgtgtcacttagaacagggctgcaagactctgctttttgattggttgt
ggttttctgtaatggtctccatctgttgcagagagaaattttcctgatga
gaggtttaggaatatgcttttttggtgtctatgaggacaaatatttagaa
tgtagttagggattatggttagtaaagtgatagttgtgtgctctcctcca
agatctgtgaccttacttgctctgggtaactggcaaggtcttcagaacca
gatatgatttctctcttgctgaatggatcttaaatgcaattagagtgatg
ttagttgccagtaaggtgttcacgccactactgcacctgtaaggttacaa
taaccttgattaaattggacctatacaggttctcttactctaaaaggtca
catcatagttctaggatctttgtcagctattgtctatcatctacctgcgt
gacacaaaacttttcaaattttcctttttctctttacattgcacaccaga
gatgtccttgctttattgttcaggcttttacacttcaagccatgaaggct
atgaaccatgcatgaccctttggaggcccaacaatcctttcacaagggat
acttaaaactaccagaaaacatcgatgtttgcattataatttataacagt
aaaaattatacttatgatgtagcaataaaaataatttaatggttgggaat
caccacgatataaggagctgtattaaagggctgcatcattctgaagttgt
gatccactactctaagagtcctttagccattagcactgtacagagccttc
ttactgcataagatatctagaaatatctatgtactatgtacctgacttgc
atcttcagtcagtgtgggaaaagttttagcttgggcatgtgttaaacaat
cctctggaaacagatactatgctgatcattttccgctgtacaaatgaggt
caatccatgtggtccgcagcttgggttcattttttttcctcactttcagt
tggtcccaataatc
gaattcactatcctcctgcctcagcctcctgaatactataagtataggta
catgccaccatgcctagccagtctgttttgtaatggtgtgtaggaaacag
ggagcctagatagtaaatacagcatacttttgagaatgaggagtttatgt
taacttagatatgatacagtggattgaaaatattaatgcatgcagacata
ttcaatataccattatgaagagatagcaatgctcagacagctaatacaaa
ggtttaatacttgaactggttcctgagccaccagtctttctctaatccta
aatcaattgcttatttgatatatcaataattttaaatgtattatattaca
acaatcaaggtatatgataaaactgcatatgcatatattttctagtgtct
atgaacgcatagattatcttaaaaattttcctaaagtcagaatttgacta
tatgatagtattgtacaacatatggatagaacatatgtaatatgtaagta
gatacataaaaatgagagaataaaaaaccacatgaataaatgagtatgga
aagagaaatagattttattatctgcaaagaatatttgttctcttcaagtt
gaagattacgtgagcattccaaatctttgatttaatcttttagcatattt
gatcactgcacttatcccatatgtatataacatctcctttgtttctttac
acattatatcaattttagacaatattgaatatgtattccactactaacag
gttggaattgccactagatggcgatatatgtctttattttgtatctttct
gtgtgtgtgcaagacaaagagagaatgctatagtaaagtttgctttaaaa
aattcaattaaacaacagtttagtgaaagaagccaggttttttgatactc
tttactgacactatgttatagtttaatcttgtgtataatattggcatgag
attgaaagatattactaaatttctttgtatatgttacctgagtaaagaaa
aacaaaagccctcctcacaggacgagcacaagtattgtagtcttaaggga
actgttaaaatactttcaacacctccaatgtactccaagtgtcatccttc
aaaatactcaaagcttgcatattaatagtcttagctaaaatatggccatg
tagtgtgcttcatcttcttgctcagaacgttttcttacatccccagctca
gagcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_64692678_64693846
seq2: B6Ng01-070F06.b_46_1207 (reverse)

seq1  GATTATTTGGAACCAACTGAAAGTGAGGAAAAAATATGGACCCCAGCTTG  50
      ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||
seq2  GATTA-TTGGGACCAACTGAAAGTGAGGAAAAAAAATGAACCCAAGC-TG  48

seq1  CCGACAACATGGATTGA-CTCATTTGTACAAGCGGAAAATGATCAGCATA  99
      | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CGGACCACATGGATTGACCTCATTTGTAC-AGCGGAAAATGATCAGCATA  97

seq1  GTATCTGTTTCCAGA-GATTGTTTTAACACATGCCAAAGCTAAAAACTTT  148
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  GTATCTGTTTCCAGAGGATTG-TTTAACACATGCCCAAGCT-AAAACTTT  145

seq1  TCCCACACTGACTTGAAGATGCAAGTCAGGTACATAGTACATAGATATTT  198
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACACTGAC-TGAAGATGCAAGTCAGGTACATAGTACATAGATATTT  194

seq1  CTAGATATCTTATGCAGTAAGAAGGCTCTTGTACAGTGCTAATGGCTAAA  248
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTAGATATCTTATGCAGTAAGAAGGCTC-TGTACAGTGCTAATGGCTAAA  243

seq1  GGACTCCTTAGAGTAGTGGATCACAACCTTCAGAATGATGCAGCCCTTTA  298
      ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGACT-CTTAGAGTAGTGGATCACAA-CTTCAGAATGATGCAGCCCTTTA  291

seq1  ATACAGCTCCTTATATCGTGGTGATTCCCAACCATTAAATTATTTTTATT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGCTCCTTATATCGTGGTGATTCCCAACCATTAAATTATTTTTATT  341

seq1  GCTACATCATAAGTATAATTTTTACTGTTATAAATTATAATGCAAACATC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACATCATAAGTATAATTTTTACTGTTATAAATTATAATGCAAACATC  391

seq1  GATGTTTTCTGGTAGTTTTAAGTATCCCTTGTGAAAGGATTGTTGGGCCT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTTTCTGGTAGTTTTAAGTATCCCTTGTGAAAGGATTGTTGGGCCT  441

seq1  CCAAAGGGTCATGCATGGTTCATAGCCTTCATGGCTTGAAGTGTAAAAGC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGGGTCATGCATGGTTCATAGCCTTCATGGCTTGAAGTGTAAAAGC  491

seq1  CTGAACAATAAAGCAAGGACATCTCTGGTGTGCAATGTAAAGAGAAAAAG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACAATAAAGCAAGGACATCTCTGGTGTGCAATGTAAAGAGAAAAAG  541

seq1  GAAAATTTGAAAAGTTTTGTGTCACGCAGGTAGATGATAGACAATAGCTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAATTTGAAAAGTTTTGTGTCACGCAGGTAGATGATAGACAATAGCTG  591

seq1  ACAAAGATCCTAGAACTATGATGTGACCTTTTAGAGTAAGAGAACCTGTA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGATCCTAGAACTATGATGTGACCTTTTAGAGTAAGAGAACCTGTA  641

seq1  TAGGTCCAATTTAATCAAGGTTATTGTAACCTTACAGGTGCAGTAGTGGC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTCCAATTTAATCAAGGTTATTGTAACCTTACAGGTGCAGTAGTGGC  691

seq1  GTGAACACCTTACTGGCAACTAACATCACTCTAATTGCATTTAAGATCCA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACACCTTACTGGCAACTAACATCACTCTAATTGCATTTAAGATCCA  741

seq1  TTCAGCAAGAGAGAAATCATATCTGGTTCTGAAGACCTTGCCAGTTACCC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGCAAGAGAGAAATCATATCTGGTTCTGAAGACCTTGCCAGTTACCC  791

seq1  AGAGCAAGTAAGGTCACAGATCTTGGAGGAGAGCACACAACTATCACTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCAAGTAAGGTCACAGATCTTGGAGGAGAGCACACAACTATCACTTT  841

seq1  ACTAACCATAATCCCTAACTACATTCTAAATATTTGTCCTCATAGACACC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACCATAATCCCTAACTACATTCTAAATATTTGTCCTCATAGACACC  891

seq1  AAAAAAGCATATTCCTAAACCTCTCATCAGGAAAATTTCTCTCTGCAACA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGCATATTCCTAAACCTCTCATCAGGAAAATTTCTCTCTGCAACA  941

seq1  GATGGAGACCATTACAGAAAACCACAACCAATCAAAAAGCAGAGTCTTGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGAGACCATTACAGAAAACCACAACCAATCAAAAAGCAGAGTCTTGC  991

seq1  AGCCCTGTTCTAAGTGACACATCTACAATACACCTTCTTGTGGAGAGCCG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTGTTCTAAGTGACACATCTACAATACACCTTCTTGTGGAGAGCCG  1041

seq1  TGCCGCGAGCAATCGCTGAGGAGAGCCATGTGTGCCGCGAGCAATCGCCA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCGCGAGCAATCGCTGAGGAGAGCCATGTGTGCCGCGAGCAATCGCCA  1091

seq1  TTATAAGATGGCACTGGCCTCCGCTGTGCCTAACTAGTAAACAAGCCTTG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAAGATGGCACTGGCCTCCGCTGTGCCTAACTAGTAAACAAGCCTTG  1141

seq1  TACACAGGCGCGAGAGTGAAT  1169
      |||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGGCGCGAGAGTGAAT  1162

seq1: chr8_64558422_64559650
seq2: B6Ng01-070F06.g_65_1269

seq1  GAATTCACTATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATACTATAAGTATAGGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAATACTATAAGTATAGGTA  50

seq1  CATGCCACCATGCCTAGCCAGTCTGTTTTGTAATGGTGTGTAGGAAACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCCACCATGCCTAGCCAGTCTGTTTTGTAATGGTGTGTAGGAAACAG  100

seq1  GGAGCCTAGATAGTAAATACAGCATACTTTTGAGAATGAGGAGTTTATGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCTAGATAGTAAATACAGCATACTTTTGAGAATGAGGAGTTTATGT  150

seq1  TAACTTAGATATGATACAGTGGATTGAAAATATTAATGCATGCAGACATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTAGATATGATACAGTGGATTGAAAATATTAATGCATGCAGACATA  200

seq1  TTCAATATACCATTATGAAGAGATAGCAATGCTCAGACAGCTAATACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATATACCATTATGAAGAGATAGCAATGCTCAGACAGCTAATACAAA  250

seq1  GGTTTAATACTTGAACTGGTTCCTGAGCCACCAGTCTTTCTCTAATCCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAATACTTGAACTGGTTCCTGAGCCACCAGTCTTTCTCTAATCCTA  300

seq1  AATCAATTGCTTATTTGATATATCAATAATTTTAAATGTATTATATTACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCAATTGCTTATTTGATATATCAATAATTTTAAATGTATTATATTACA  350

seq1  ACAATCAAGGTATATGATAAAACTGCATATGCATATATTTTCTAGTGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCAAGGTATATGATAAAACTGCATATGCATATATTTTCTAGTGTCT  400

seq1  ATGAACGCATAGATTATCTTAAAAATTTTCCTAAAGTCAGAATTTGACTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAACGCATAGATTATCTTAAAAATTTTCCTAAAGTCAGAATTTGACTA  450

seq1  TATGATAGTATTGTACAACATATGGATAGAACATATGTAATATGTAAGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGATAGTATTGTACAACATATGGATAGAACATATGTAATATGTAAGTA  500

seq1  GATACATAAAAATGAGAGAATAAAAAACCACATGAATAAATGAGTATGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACATAAAAATGAGAGAATAAAAAACCACATGAATAAATGAGTATGGA  550

seq1  AAGAGAAATAGATTTTATTATCTGCAAAGAATATTTGTTCTCTTCAAGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGAAATAGATTTTATTATCTGCAAAGAATATTTGTTCTCTTCAAGTT  600

seq1  GAAGATTACGTGAGCATTCCAAATCTTTGATTTAATCTTTTAGCATATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTACGTGAGCATTCCAAATCTTTGATTTAATCTTTTAGCATATTT  650

seq1  GATCACTGCACTTATCCCATATGTATATAACATCTCCTTTGTTTCTTTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACTGCACTTATCCCATATGTATATAACATCTCCTTTGTTTCTTTAC  700

seq1  ACATTATATCAATTTTAGACAATATTGAATATGTATTCCACTACTAACAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTATATCAATTTTAGACAATATTGAATATGTATTCCACTACTAACAG  750

seq1  GTTGGAATTGCCACTAGATGGCGATATATGTCTTTATTTTGTATCTTTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAATTGCCACTAGATGGCGATATATGTCTTTATTTTGTATCTTTCT  800

seq1  GTGTGTGTGCAAGACAAAGAGAGAATGCTATAGTAAAGTTTGCTTTAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGCAAGACAAAGAGAGAATGCTATAGTAAAGTTTGCTTTAAAA  850

seq1  AATTCAATTAAACAACAGTTTAGTGAAAGAAGCCAGGTTTTTTGATACTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCAATTAAACAACAGTTTAGTGAAAGAAGCCAGGTTTTTTGATACTC  900

seq1  TTTACTGACACTATGTTATAGTTTTAATCTTGTGTATAATATTGGCATGA  950
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTGACACTATGTTATAG-TTTAATCTTGTGTATAATATTGGCATGA  949

seq1  GATTGAAAGAATATTACTAAATTTCTTTGTATATGTTACCTGAGTAAAG-  999
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GATTGAAAG-ATATTACTAAATTTCTTTGTATATGTTACCTGAGTAAAGA  998

seq1  AAAACAAAAGCCCTCCTCACAGGACGAGCACAAGTATTGTAAGTCTTAAA  1049
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  AAAACAAAAGCCCTCCTCACAGGACGAGCACAAGTATTGT-AGTCTT-AA  1046

seq1  GGGAACTGTTAAAAATACTTTCAACA-CTCCAAAATGTACTCCAAAAGTG  1098
      |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||
seq2  GGGAACTGTT-AAAATACTTTCAACACCTCC--AATGTACTCC--AAGTG  1091

seq1  TCATTCCTTCCAAAATACTCAAAAAGCTTGCATATTAATAGTCTTTAGCT  1148
      ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TCA-TCCTT-CAAAATACTC--AAAGCTTGCATATTAATAGTC-TTAGCT  1136

seq1  ACAAATAATGGCAATGTAGTGTGGCTTCCATCTTCTTGTCTTCACAGTAC  1198
      | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    | ||| ||
seq2  A-AAAT-ATGGCCATGTAGTGT-GCTT-CATCTTCTTG----CTCAGAAC  1178

seq1  GTGTCTCTTACTATCCCCACAGCTCAGAGCC  1229
      || | |||||| |||||  ||||||||||||
seq2  GT-TTTCTTAC-ATCCC--CAGCTCAGAGCC  1205