BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075K13
Chromosome8 (Build37)
Map Location 13,433,174 - 13,610,688
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGm687, Gas6, LOC434282, 1700029H14Rik, Rasa3
Upstream geneEG434280, 1700094C09Rik, Tubgcp3, Atp11a, LOC100040229, Mcf2l, F7, F10, Proz, Pcid2, Cul4a, Lamp1, Grtp1, Adprhl1, Dcun1d2, Tmco3, Tfdp1, Atp4b, Grk1
Downstream gene4932443I19Rik, LOC665516, Cdc16, Upf3a, AF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, Dlgap2, LOC100041140
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075K13.bB6Ng01-075K13.g
ACCDH892158DH892159
length670856
definitionDH892158|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075K13, 5' end.DH892159|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075K13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,433,174 - 13,433,843)(13,609,831 - 13,610,688)
sequence
gaattcaaccttaggtcaagttcttgaagatggggtctgaacccaagatg
gagctggtctggtctctcagaggcaggctcctaagttccctttactgtta
gcaagctagcaagcagggttcctccaaggttgctgcttcagttcctgcct
cggcttcttccaatggtggactgtggtcagatgcataagccagagaagct
tttcttctcaagctgcttttggttaagatgtgccttgtctgctcacttgt
ttcctgccgtgaccccaccccaccccaccccaccccaccccaccctaccc
ccgctcccccccagcagccttcactcagcctgccaaaaaatgacctaatc
gtcaaccgtgtcttgctaaggaaacagccctcaagtgccttccttggtga
ggaggggttgatttccatcactcgcatcctccctccttcccacccgtctg
cctctgtttttgcagctagagatcaagcaggcagcctcatgcttaccata
catactatgtaagcaccctactaaagaactgtgtgagtactctactactg
agctatgtaagcaccctactatggacctgtgtaagtactctaccactgtg
ctatgtaagcactcaactatggaactgtgtaagtacccctaccactgaga
ttgtaagcaccctaccatgg
gaattccagttttttcaccaattgcattgcaccatcacaaatagaaaata
gacgtgaactattagggagacattagaggaccccagtttgcagactgtct
tgaccttgttcttgcaaaaattatgggtggccaggctctacctccctttc
ctgagcaccctcaagaaaactatactcttcttccctcctcctcccacaca
gatctctgtgtgtctgtgtagggagtgtttcctggtctctgctgtaggct
ttccttattgttccctctcctgcgtaggccagttcagccatgacccacag
taccctccagcaccctgagcaccgtctgtgtaggacatttctaggcctgt
gggttttgggttggcacctcattttcttttctttttcctggacaaggtct
catgaaacaaccacctcagacttaccgtggtgaacttgaacttctggcct
ttctaccttcacctcccaagtgcagacactgataagatagtacatactgt
tgtgcatggtttatgcgatgtcagagatgtactctggggccctgtgcatg
gtcagcactcactctgccaactgagttacatccctacccggttatatctt
ttcgttaggtagagtggcagctggtggaagactgaaccagggtagcagga
gggcctgctcttctctgcttgtttcatatgcctgagccagctgaggcttc
tgttagcaatggacaggaaaaccccaaatctgccaccgccagcagtctct
cccccacgatttcagtgtcacctggagaaaaactgactgtccctcactcc
aacaagccatgtgcatcccaacatgccaagggaagattagtcatggttcc
aagatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_13433174_13433843
seq2: B6Ng01-075K13.b_43_712

seq1  GAATTCAACCTTAGGTCAAGTTCTTGAAGATGGGGTCTGAACCCAAGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCTTAGGTCAAGTTCTTGAAGATGGGGTCTGAACCCAAGATG  50

seq1  GAGCTGGTCTGGTCTCTCAGAGGCAGGCTCCTAAGTTCCCTTTACTGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGGTCTGGTCTCTCAGAGGCAGGCTCCTAAGTTCCCTTTACTGTTA  100

seq1  GCAAGCTAGCAAGCAGGGTTCCTCCAAGGTTGCTGCTTCAGTTCCTGCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGCTAGCAAGCAGGGTTCCTCCAAGGTTGCTGCTTCAGTTCCTGCCT  150

seq1  CGGCTTCTTCCAATGGTGGACTGTGGTCAGATGCATAAGCCAGAGAAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGCTTCTTCCAATGGTGGACTGTGGTCAGATGCATAAGCCAGAGAAGCT  200

seq1  TTTCTTCTCAAGCTGCTTTTGGTTAAGATGTGCCTTGTCTGCTCACTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTCAAGCTGCTTTTGGTTAAGATGTGCCTTGTCTGCTCACTTGT  250

seq1  TTCCTGCCGTGACCCCACCCCACCCCACCCCACCCCACCCCACCCTACCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGCCGTGACCCCACCCCACCCCACCCCACCCCACCCCACCCTACCC  300

seq1  CCGCTCCCCCCCAGCAGCCTTCACTCAGCCTGCCAAAAAATGACCTAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCTCCCCCCCAGCAGCCTTCACTCAGCCTGCCAAAAAATGACCTAATC  350

seq1  GTCAACCGTGTCTTGCTAAGGAAACAGCCCTCAAGTGCCTTCCTTGGTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACCGTGTCTTGCTAAGGAAACAGCCCTCAAGTGCCTTCCTTGGTGA  400

seq1  GGAGGGGTTGATTTCCATCACTCGCATCCTCCCTCCTTCCCACCCGTCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGGTTGATTTCCATCACTCGCATCCTCCCTCCTTCCCACCCGTCTG  450

seq1  CCTCTGTTTTTGCAGCTAGAGATCAAGCAGGCAGCCTCATGCTTACCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGTTTTTGCAGCTAGAGATCAAGCAGGCAGCCTCATGCTTACCATA  500

seq1  CATACTATGTAAGCACCCTACTAAAGAACTGTGTGAGTACTCTACTACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACTATGTAAGCACCCTACTAAAGAACTGTGTGAGTACTCTACTACTG  550

seq1  AGCTATGTAAGCACCCTACTATGGACCTGTGTAAGTACTCTACCACTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGTAAGCACCCTACTATGGACCTGTGTAAGTACTCTACCACTGTG  600

seq1  CTATGTAAGCACTCAACTATGGAACTGTGTAAGTA-CCCTACCACTGAGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CTATGTAAGCACTCAACTATGGAACTGTGTAAGTACCCCTACCACTGAGA  650

seq1  TATGTAAGCACCCTACCATGG  670
      | |||||||||||||||||||
seq2  T-TGTAAGCACCCTACCATGG  670

seq1: chr8_13609831_13610688
seq2: B6Ng01-075K13.g_69_924 (reverse)

seq1  ATTCTTGGAAACCATGACCTAATCTTCCCTTGGCATGTTGGGATGCACAT  50
      | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTGG-AACCATGA-CTAATCTTCCCTTGGCATGTTGGGATGCACAT  48

seq1  GGCTTGTTGGAGCTGAGGGACAGTCAGTTTTTCTCCAGGTGACACTGAAA  100
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTTGGAG-TGAGGGACAGTCAGTTTTTCTCCAGGTGACACTGAAA  97

seq1  TCGTGGGGGAGAGACTGCTGGCGGTGGCAGATTTGGGGTTTTCCTGTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGGGGGAGAGACTGCTGGCGGTGGCAGATTTGGGGTTTTCCTGTCCA  147

seq1  TTGCTAACAGAAGCCTCAGCTGGCTCAGGCATATGAAACAAGCAGAGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTAACAGAAGCCTCAGCTGGCTCAGGCATATGAAACAAGCAGAGAAG  197

seq1  AGCAGGCCCTCCTGCTACCCTGGTTCAGTCTTCCACCAGCTGCCACTCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGCCCTCCTGCTACCCTGGTTCAGTCTTCCACCAGCTGCCACTCTA  247

seq1  CCTAACG-AAAGATATAACCGGGTAGGGATGTAACTCAGTTGGCAGAGTG  299
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACGAAAAGATATAACCGGGTAGGGATGTAACTCAGTTGGCAGAGTG  297

seq1  AGTGCTGACCATGCACAGGGCCCCAGAGTACATCTCTGACATCGCATAAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTGACCATGCACAGGGCCCCAGAGTACATCTCTGACATCGCATAAA  347

seq1  CCATGCACAACAGTATGTACTATCTTATCAGTGTCTGCACTTGGGAGGTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCACAACAGTATGTACTATCTTATCAGTGTCTGCACTTGGGAGGTG  397

seq1  AAGGTAGAAAGGCCAGAAGTTCAAGTTCACCACGGTAAGTCTGAGGTGGT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTAGAAAGGCCAGAAGTTCAAGTTCACCACGGTAAGTCTGAGGTGGT  447

seq1  TGTTTCATGAGACCTTGTCCAGGAAAAAGAAAAGAAAATGAGGTGCCAAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTCATGAGACCTTGTCCAGGAAAAAGAAAAGAAAATGAGGTGCCAAC  497

seq1  CCAAAACCCACAGGCCTAGAAATGTCCTACACAGACGGTGCTCAGGGTGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAACCCACAGGCCTAGAAATGTCCTACACAGACGGTGCTCAGGGTGC  547

seq1  TGGAGGGTACTGTGGGTCATGGCTGAACTGGCCTACGCAGGAGAGGGAAC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGGGTACTGTGGGTCATGGCTGAACTGGCCTACGCAGGAGAGGGAAC  597

seq1  AATAAGGAAAGCCTACAGCAGAGACCAGGAAACACTCCCTACACAGACAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGGAAAGCCTACAGCAGAGACCAGGAAACACTCCCTACACAGACAC  647

seq1  ACAGAGATCTGTGTGGGAGGAGGAGGGAAGAAGAGTATAGTTTTCTTGAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAGATCTGTGTGGGAGGAGGAGGGAAGAAGAGTATAGTTTTCTTGAG  697

seq1  GGTGCTCAGGAAAGGGAGGTAGAGCCTGGCCACCCATAATTTTTGCAAGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGCTCAGGAAAGGGAGGTAGAGCCTGGCCACCCATAATTTTTGCAAGA  747

seq1  ACAAGGTCAAGACAGTCTGCAAACTGGGGTCCTCTAATGTCTCCCTAATA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGGTCAAGACAGTCTGCAAACTGGGGTCCTCTAATGTCTCCCTAATA  797

seq1  GTTCACGTCTATTTTCTATTTGTGATGGTGCAATGCAATTGGTGAAAAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCACGTCTATTTTCTATTTGTGATGGTGCAATGCAATTGGTGAAAAAA  847

seq1  CTGGAATTC  858
      |||||||||
seq2  CTGGAATTC  856