BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076E23
Chromosome8 (Build37)
Map Location 65,756,499 - 65,878,377
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSpock3
Upstream geneLOC384830, LOC100040804, LOC665267
Downstream geneLOC384831, EG244495, Tll1, LOC100040989
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076E23.bB6Ng01-076E23.g
ACCDH892614DH892615
length1,1061,079
definitionDH892614|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076E23, 5' end.DH892615|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076E23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,877,279 - 65,878,377)(65,756,499 - 65,757,574)
sequence
gaattctatcagaccttcagagaagacctaataccactaactcttcaaac
tgttccacaaaatagaagcagaaggaacattacccagttcattctatgaa
gccacagttacgctgaatattttcccttggggatggaacagtttctgtct
aatcaggaacttgtcacaattttctttcatagtcatattgtttagacata
cttacttgatattggttcagaaatccttatttaatttgatttaaattata
taattgttataacaatgttacttaaaaatcttcaaaggcaatttgatgac
cacatggatggtgatgaagttccaccttttattcaaactttactttttaa
aagacattagatactcctataatatgcatcgatgtgtatattatatattt
gaagtatatataagcatttatctaccagtttttaaaagttgcagctaggt
ttttgatgttgtaactttaagtttcttattttttacaatattacaggtgt
acgagcaacttgcaacttaactgagatataaaacctcattctttccatgt
gtcaaccaaacattgaaataaacactgaaaattatcacaaccaaatcgaa
gaaatcattaaattacctttaaagataaaaagtaatctaatgtccataag
catctgaacaattcttctctgctcaccttcatattttcattatttcacat
gtgcttgaaatgttataggcattgattaagtattttaagaacagtggaga
aattgggaagagggaacaaaacaactttacaaacaatgaaaggaggaagg
ggaaggaaacagatctttctgatgccaaccatacaccatgtgctgacttg
ctggtttcctacacagctatagtgacagatagactgtaacctgcactgtg
ctatcacaacattccagtatcaaatgtgtgcagaatttgtaaatgatcat
cacgtttgcttcaattttcaggatatataaaggttttgtaataaattttc
aatgtgatttgagaattttatagcattggatatgatcagtatttccctct
tatggtattaatcataaaaaatgccttctcaaggaagaactctcccaaaa
caatat
gaattccagaggaccagaagaataaatagaattatgtagcagtggaaggt
ttagaatgggggaagccactagaaagccctagactccgggtatgcaagag
gctcccaggacccagtggtgatgacattagctgaaacacccaacagagaa
gagatagaccttgaagagaccaccttaaatagatagacatggcacccatt
tgagggaaggtactactctcatctcaaatttttaacccagaattgttcct
gtctaaaggaaatgcagggacaaaaaatgagcaaagactgaaggaaatgc
cctacattgggatccaccccatttgcagacaccacaccatgacactattg
ctgatgccaagaagtgtttgcaaacaggagcaaactgttttttaacccaa
gatattattattgaaaaaattataataagcctttaaattattcgtcttag
cactgagtcactatacctattgaaaatatggtaaaaatgcagaccagaat
acttgcatatttagataaaattcatatagcttgtatgatgtctatgtata
attgtcaactagactacatctagaattaggtaaaactcaaatgtctgggt
ataactcagtgatttgttttaattaagaccttttaaactaagaagataca
ctttgaatctgagctacacattcttctagttatcactagttggacatgga
aaaaggaagcttgccctcctcacctgctcccatttgctctcactgacaag
tccatactctcactggcactagagccagtttctttaggattacagaatat
gctgaagaccaatatagatattcagaaaagtgaactgaacagctattgga
tacttggtccttcttttggtagatagttgtgctaactggaccacaaactg
tatgccattccaaaaatcccctttgtatatacacataaagattcagtcta
taaatttctaatccactagagaatacagctaaataagatgatatcttatg
tgactggtgcatcacagctgataaccaaggatgtaactgatgccaattct
tattcttctatcttactggagttcttaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_65877279_65878377
seq2: B6Ng01-076E23.b_47_1152 (reverse)

seq1  ATATTGTTTT--GTGAGTTCATCCTTGAGAAGGCA-TATTTATGA-TAAT  46
      ||||||||||  | |||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||
seq2  ATATTGTTTTGGGAGAGTTCTTCCTTGAGAAGGCATTTTTTATGATTAAT  50

seq1  A-CATAAGAGGG-AATACTGATCATATACAATGCTATAAAA-TCTCAAAT  93
      | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2  ACCATAAGAGGGAAATACTGATCATATCCAATGCTATAAAATTCTCAAAT  100

seq1  CACATTGAAAATTTATTACAAAACCTTAATATATCCTGAAAATTGGAGCA  143
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
seq2  CACATTGAAAATTTATTACAAAACCTTTATATATCCTGAAAATTGAAGCA  150

seq1  AACGTGATGATCATTTACAAATTCTGCACACATTTGATACTGGAATGTTG  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTGATGATCATTTACAAATTCTGCACACATTTGATACTGGAATGTTG  200

seq1  TGATAGCACAGTGCAGGTTACAGTCTATCTGTCACTATAGCTGTGTAGGA  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCACAGTGCAGGTTACAGTCTATCTGTCACTATAGCTGTGTAGGA  250

seq1  AACCAGCAAGTCAGCACATGGTGTATGGTTGGCATCAGAAAGATCTGTTT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCAGCAAGTCAGCACATGGTGTATGGTTGGCATCAGAAAGATCTGTTT  300

seq1  CCTTCCCCTTCCTCCTTTCATTGTTTGTAAAGTTGTTTTGTTCCCTCTTC  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCCCTTCCTCCTTTCATTGTTTGTAAAGTTGTTTTGTTCCCTCTTC  350

seq1  CCAATTTCTCCACTGTTCTTAAAATACTTAATCAATGCCTATAACATTTC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTTCTCCACTGTTCTTAAAATACTTAATCAATGCCTATAACATTTC  400

seq1  AAGCACATGTGAAATAATGAAAATATGAAGGTGAGCAGAGAAGAATTGTT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACATGTGAAATAATGAAAATATGAAGGTGAGCAGAGAAGAATTGTT  450

seq1  CAGATGCTTATGGACATTAGATTACTTTTTATCTTTAAAGGTAATTTAAT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGCTTATGGACATTAGATTACTTTTTATCTTTAAAGGTAATTTAAT  500

seq1  GATTTCTTCGATTTGGTTGTGATAATTTTCAGTGTTTATTTCAATGTTTG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTTCGATTTGGTTGTGATAATTTTCAGTGTTTATTTCAATGTTTG  550

seq1  GTTGACACATGGAAAGAATGAGGTTTTATATCTCAGTTAAGTTGCAAGTT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGACACATGGAAAGAATGAGGTTTTATATCTCAGTTAAGTTGCAAGTT  600

seq1  GCTCGTACACCTGTAATATTGTAAAAAATAAGAAACTTAAAGTTACAACA  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCGTACACCTGTAATATTGTAAAAAATAAGAAACTTAAAGTTACAACA  650

seq1  TCAAAAACCTAGCTGCAACTTTTAAAAACTGGTAGATAAATGCTTATATA  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAAACCTAGCTGCAACTTTTAAAAACTGGTAGATAAATGCTTATATA  700

seq1  TACTTCAAATATATAATATACACATCGATGCATATTATAGGAGTATCTAA  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCAAATATATAATATACACATCGATGCATATTATAGGAGTATCTAA  750

seq1  TGTCTTTTAAAAAGTAAAGTTTGAATAAAAGGTGGAACTTCATCACCATC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTTTAAAAAGTAAAGTTTGAATAAAAGGTGGAACTTCATCACCATC  800

seq1  CATGTGGTCATCAAATTGCCTTTGAAGATTTTTAAGTAACATTGTTATAA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGGTCATCAAATTGCCTTTGAAGATTTTTAAGTAACATTGTTATAA  850

seq1  CAATTATATAATTTAAATCAAATTAAATAAGGATTTCTGAACCAATATCA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTATATAATTTAAATCAAATTAAATAAGGATTTCTGAACCAATATCA  900

seq1  AGTAAGTATGTCTAAACAATATGACTATGAAAGAAAATTGTGACAAGTTC  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGTATGTCTAAACAATATGACTATGAAAGAAAATTGTGACAAGTTC  950

seq1  CTGATTAGACAGAAACTGTTCCATCCCCAAGGGAAAATATTCAGCGTAAC  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTAGACAGAAACTGTTCCATCCCCAAGGGAAAATATTCAGCGTAAC  1000

seq1  TGTGGCTTCATAGAATGAACTGGGTAATGTTCCTTCTGCTTCTATTTTGT  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTTCATAGAATGAACTGGGTAATGTTCCTTCTGCTTCTATTTTGT  1050

seq1  GGAACAGTTTGAAGAGTTAGTGGTATTAGGTCTTCTCTGAAGGTCTGATA  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAGTTTGAAGAGTTAGTGGTATTAGGTCTTCTCTGAAGGTCTGATA  1100

seq1  GAATTC  1099
      ||||||
seq2  GAATTC  1106

seq1: chr8_65756499_65757574
seq2: B6Ng01-076E23.g_69_1147

seq1  GAATTCCAGAGGACCAGAAGAATAAATAGAATTATGTAGCAGTGGAAGGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGAGGACCAGAAGAATAAATAGAATTATGTAGCAGTGGAAGGT  50

seq1  TTAGAATGGGGGAAGCCACTAGAAAGCCCTAGACTCCGGGTATGCAAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAATGGGGGAAGCCACTAGAAAGCCCTAGACTCCGGGTATGCAAGAG  100

seq1  GCTCCCAGGACCCAGTGGTGATGACATTAGCTGAAACACCCAACAGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCAGGACCCAGTGGTGATGACATTAGCTGAAACACCCAACAGAGAA  150

seq1  GAGATAGACCTTGAAGAGACCACCTTAAATAGATAGACATGGCACCCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAGACCTTGAAGAGACCACCTTAAATAGATAGACATGGCACCCATT  200

seq1  TGAGGGAAGGTACTACTCTCATCTCAAATTTTTAACCCAGAATTGTTCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGAAGGTACTACTCTCATCTCAAATTTTTAACCCAGAATTGTTCCT  250

seq1  GTCTAAAGGAAATGCAGGGACAAAAAATGAGCAAAGACTGAAGGAAATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAAAGGAAATGCAGGGACAAAAAATGAGCAAAGACTGAAGGAAATGC  300

seq1  CCTACATTGGGATCCACCCCATTTGCAGACACCACACCATGACACTATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACATTGGGATCCACCCCATTTGCAGACACCACACCATGACACTATTG  350

seq1  CTGATGCCAAGAAGTGTTTGCAAACAGGAGCAAACTGTTTTTTAACCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGCCAAGAAGTGTTTGCAAACAGGAGCAAACTGTTTTTTAACCCAA  400

seq1  GATATTATTATTGAAAAAATTATAATAAGCCTTTAAATTATTCGTCTTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTATTATTGAAAAAATTATAATAAGCCTTTAAATTATTCGTCTTAG  450

seq1  CACTGAGTCACTATACCTATTGAAAATATGGTAAAAATGCAGACCAGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAGTCACTATACCTATTGAAAATATGGTAAAAATGCAGACCAGAAT  500

seq1  ACTTGCATATTTAGATAAAATTCATATAGCTTGTATGATGTCTATGTATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCATATTTAGATAAAATTCATATAGCTTGTATGATGTCTATGTATA  550

seq1  ATTGTCAACTAGACTACATCTAGAATTAGGTAAAACTCAAATGTCTGGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCAACTAGACTACATCTAGAATTAGGTAAAACTCAAATGTCTGGGT  600

seq1  ATAACTCAGTGATTTGTTTTAATTAAGACCTTTTAAACTAAGAAGATACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTCAGTGATTTGTTTTAATTAAGACCTTTTAAACTAAGAAGATACA  650

seq1  CTTTGAATCTGAGCTACACATTCTTCTAGTTATCACTAGTTGGACATGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGAATCTGAGCTACACATTCTTCTAGTTATCACTAGTTGGACATGGA  700

seq1  AAAAGGAAGCTTGCCCTCCTCACCTGCTCCCATTTGCTCTCACTGACAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGAAGCTTGCCCTCCTCACCTGCTCCCATTTGCTCTCACTGACAAG  750

seq1  TCCATACTCTCACTGGCACTAGAGCCAGTTTCTTTAGGATTACAGAATAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATACTCTCACTGGCACTAGAGCCAGTTTCTTTAGGATTACAGAATAT  800

seq1  GCTGAAGACCAATATAGATATTCAGAAAAGTGAACTGAACAGCTATTGGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAAGACCAATATAGATATTCAGAAAAGTGAACTGAACAGCTATTGGA  850

seq1  TACTTGGTCCTTCTTTTGGTAGATAGTTGTGCTAACTGGACCACAAACTG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTGGTCCTTCTTTTGGTAGATAGTTGTGCTAACTGGACCACAAACTG  900

seq1  TATGCCATTCCAAAAATCCCCTTTGTATATACACATAAAGATTCAGTCTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCATTCCAAAAATCCCCTTTGTATATACACATAAAGATTCAGTCTA  950

seq1  TAAA-TTCTAATCCACTAGAGAATACAAGCTAAATAAGATGATAATCTAT  999
      |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||
seq2  TAAATTTCTAATCCACTAGAGAATAC-AGCTAAATAAGATGATATCTTAT  999

seq1  GTGACT-GTGCATCACAGCTGATAACCCAAGGATTGTAACTGATGCC-AT  1047
      |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||
seq2  GTGACTGGTGCATCACAGCTGATAA-CCAAGGA-TGTAACTGATGCCAAT  1047

seq1  TCTTATTC-TCTATC-TACT-GAGTTCTTACA  1076
      |||||||| |||||| |||| |||||||||||
seq2  TCTTATTCTTCTATCTTACTGGAGTTCTTACA  1079