BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-086L01
Chromosome8 (Build37)
Map Location 92,197,144 - 92,325,737
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNod2, Cyld, LOC675985, Sall1, LOC100041089, EG625801, EG384862
Downstream geneTox3, LOC100041133
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-086L01.bB6Ng01-086L01.g
ACCDH900021DH900022
length8781,093
definitionDH900021|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-086L01, 5' end.DH900022|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-086L01, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,197,144 - 92,198,017)(92,324,637 - 92,325,737)
sequence
gaattcattcacttttaggagtggagtggtttgtgatggaagatacaaag
tcgtcctgtaatgataattttggaactttggtttcttaaataacaataac
aacaacaataacaacaacaacaacaacaacataagaatattgtaagaaag
tgtttttgttttaatacctggtgtgggaaattgggcttcttcaggctgtc
ctcagcagctgcctttgatttgcctcgtgctctaccagaggcatggtttt
gccagttgcagatagtttctgcgacggtgtgatatttggaactctgggaa
cttttcagaggatatataaatgctacagtcctgataggtggatgtggttg
ttgctcagggagtttggttgcagtttcttagtagttgtgctcaaagaaga
aagagattagattcagatctctctctccctctccctccctccctcacccc
cctctctctcttcctccctccatttctccctccctccctccctccctccc
tccctctatcttttctttcctatctagtgataggggctataaagcgtgga
ataaagaatagcccacaaagcagctaagacctgctacatttcccttaatt
caacttctgtgtggaattctgaagacacaggcctcctcaatcttttcttt
cctaaatgtgtttgtcctgacagataatttccagagttaccccagattca
aggcagtccttacccagttcatttatcaccgaagagtcttgcttaaggaa
agctgagattaaccatataacagatgctctagatgaatttcccagaattc
cactttcccagcctgaagctcctgatggggaactttcgggcatggtgctc
accccagttgccttgaggtataagtgct
gaattcttaaaagagattaaagtggcaaattttatgaaaatattacttgg
ggttggaggaagaagaggaagaagaggaggaggtctatgaattgaattgg
cttggtttctaataaactaacattcctacttttctttctcttagtgttgg
ccataggtcacactgctatttaatgtactcaggaatgatctgagctcctg
agaagtagcaggcagaaatcatcagcattatggaaggcatcttacatctt
ccaaaaggtgggaatgagatgtgctctgagggttaatttacacataacag
accttcagataaagaactaaagacccagtcaactactttatccatccatc
tgtccattcacccactcatcactgtgtctattctgttgatctttaagaag
catcaacagtgagccagacctccagccaaattgaaggagtcacatttctc
atcagactcaatcagcatgaggtcctgtcattctataagaagttagaata
aggcatggagaatcatggctacttcttacatcattttcaccatgtgactt
tggatatgtttcttccctttctgagtttataacatgacctcaaagatgac
ccttactcaaatttactcatttcatccatagaattattatctgaataccc
ataaacatgttcaaatatgcccaaaagcctatggaggactcagactcttc
acaaattgtaggaatttgtcctcatgtttgcaccaacagaaaggagtgga
gttgtacctgtcccagtcagcatctggtgcttaatgttaatgaggatcgt
gacagcaaggagaacacattcaagggagcatgtgattacgattcatggaa
ctgaaacaaagcatagtgtttaccagcaaaaaaatattttataaagcacc
aatggaagctacctccacactggcaccatgaagagtgcttaataaagggg
aaacaggcttttctgcagtgtgtgtatctttaacaaatatgacctgttca
ttagtgctttactttaacatgagagtaatcaaataaggtgtcttttatgg
gaccctctgttaatatcggtcatttaattttaaacctaagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_92197144_92198017
seq2: B6Ng01-086L01.b_45_922

seq1  GAATTCATTCACTTTTAGGAGTGGAGTGGTTTGTGATGGAAGATACAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCACTTTTAGGAGTGGAGTGGTTTGTGATGGAAGATACAAAG  50

seq1  TCGTCCTGTAATGATAATTTTGGAACTTTGGTTTCTTAAATAACAATAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTCCTGTAATGATAATTTTGGAACTTTGGTTTCTTAAATAACAATAAC  100

seq1  AACAACAATAACAACAACAACAACAACAACATAAGAATATTGTAAGAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAATAACAACAACAACAACAACAACATAAGAATATTGTAAGAAAG  150

seq1  TGTTTTTGTTTTAATACCTGGTGTGGGAAATTGGGCTTCTTCAGGCTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTGTTTTAATACCTGGTGTGGGAAATTGGGCTTCTTCAGGCTGTC  200

seq1  CTCAGCAGCTGCCTTTGATTTGCCTCGTGCTCTACCAGAGGCATGGTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCAGCTGCCTTTGATTTGCCTCGTGCTCTACCAGAGGCATGGTTTT  250

seq1  GCCAGTTGCAGATAGTTTCTGCGACGGTGTGATATTTGGAACTCTGGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTTGCAGATAGTTTCTGCGACGGTGTGATATTTGGAACTCTGGGAA  300

seq1  CTTTTCAGAGGATATATAAATGCTACAGTCCTGATAGGTGGATGTGGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCAGAGGATATATAAATGCTACAGTCCTGATAGGTGGATGTGGTTG  350

seq1  TTGCTCAGGGAGTTTGGTTGCAGTTTCTTAGTAGTTGTGCTCAAAGAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCAGGGAGTTTGGTTGCAGTTTCTTAGTAGTTGTGCTCAAAGAAGA  400

seq1  AAGAGATTAGATTCAGATCTCTCTCTCCCTCTCCCTCCCTCCCTCACCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATTAGATTCAGATCTCTCTCTCCCTCTCCCTCCCTCCCTCACCCC  450

seq1  CCTCTCTCTCTTCCTCCCTCCATTTCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTCTCTTCCTCCCTCCATTTCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC  500

seq1  TCCCTCTATCTTTTCTTTCCTATCTAGTGATAGGGGCTATAAAGCGTGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTATCTTTTCTTTCCTATCTAGTGATAGGGGCTATAAAGCGTGGA  550

seq1  ATAAAGAATAGCCCACAAAGCAGCTAAGACCTGCTACATTTCCCTTAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAATAGCCCACAAAGCAGCTAAGACCTGCTACATTTCCCTTAATT  600

seq1  CAACTTCTGTGTGGAATTCTGAAGACACAGGCCTCCTCAATCTTTTCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTCTGTGTGGAATTCTGAAGACACAGGCCTCCTCAATCTTTTCTTT  650

seq1  CCTAAATGTGTTTGTCCTGACAGATAATTTCCAGAGTTACCCCAGATTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CCTAAATGTGTTTGTCCTGACAGATAATTTCCAGAGTTACCCCAGATTCA  700

seq1  AGGCAGTCCTTACCCAGTTCATTTATCACCGAAGAGTCTTGCTTAAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTCCTTACCCAGTTCATTTATCACCGAAGAGTCTTGCTTAAGGAA  750

seq1  AGCTGAGATTAACCATATAGACAGATGCTCTAGATGAATTTCCCAGAATT  800
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGATTAACCATATA-ACAGATGCTCTAGATGAATTTCCCAGAATT  799

seq1  CCACTTT-CCAGCCTGAAGCTCCTGAT-GGGAACTTT-GGGCATGGTGCC  847
      ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| 
seq2  CCACTTTCCCAGCCTGAAGCTCCTGATGGGGAACTTTCGGGCATGGTGCT  849

seq1  CACCCCAG-TGCCTTGA-GCAGAAGTGCT  874
      |||||||| |||||||| | | |||||||
seq2  CACCCCAGTTGCCTTGAGGTATAAGTGCT  878

seq1: chr8_92324637_92325737
seq2: B6Ng01-086L01.g_66_1158 (reverse)

seq1  TCTCTTAGGTATTAAAAATTAAATGACAGATAATAAAACAAGAGAGTCCC  50
      |||||||||  || ||||||||||||| |||| |||    |||| |||||
seq2  TCTCTTAGG--TTTAAAATTAAATGACCGATATTAA---CAGAGGGTCCC  45

seq1  ATAAAAGACACCTTATTTTGATTTACTCTCATGTTAAAGTAAAGCACTAA  100
      ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGACACCTTA-TTTGA-TTACTCTCATGTTAAAGTAAAGCACTAA  93

seq1  TGGACAGGTCAATATTTGTTAAAGATACACACACTGCAGAAAAGCCTGTT  150
      || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAGGTC-ATATTTGTTAAAGATACACACACTGCAGAAAAGCCTGTT  142

seq1  TCCCCTTTATTAGGCACTCTTTCATGGTGCCAGTGTGGAGGTAGCTTTCC  200
      |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TCCCCTTTATTAAGCACTC-TTCATGGTGCCAGTGTGGAGGTAGC-TTCC  190

seq1  ATTGGTGC-TTATAAAATATTTTTTTGCTGGTAAACACTATGCTTTGTTT  249
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGTGCTTTATAAAATATTTTTTTGCTGGTAAACACTATGCTTTGTTT  240

seq1  CAGTTCCATGAATCGTAATCACATGCTCCCTTG-ATGTGTTCTCCTTGCT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  CAGTTCCATGAATCGTAATCACATGCTCCCTTGAATGTGTTCTCCTTGCT  290

seq1  GTCACGATCCTCATTAACATTAAGCACCAGATGCTGACTGGGACAGGTAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACGATCCTCATTAACATTAAGCACCAGATGCTGACTGGGACAGGTAC  340

seq1  AACTCCACTCCTTTCTGTTGGTGCAAACATGAGGACAAATTCCTACAATT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCACTCCTTTCTGTTGGTGCAAACATGAGGACAAATTCCTACAATT  390

seq1  TGTGAAGAGTCTGAGTCCTCCATAGGCTTTTGGGCATATTTGAACATGTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAGAGTCTGAGTCCTCCATAGGCTTTTGGGCATATTTGAACATGTT  440

seq1  TATGGGTATTCAGATAATAATTCTATGGATGAAATGAGTAAATTTGAGTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGGTATTCAGATAATAATTCTATGGATGAAATGAGTAAATTTGAGTA  490

seq1  AGGGTCATCTTTGAGGTCATGTTATAAACTCAGAAAGGGAAGAAACATAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCATCTTTGAGGTCATGTTATAAACTCAGAAAGGGAAGAAACATAT  540

seq1  CCAAAGTCACATGGTGAAAATGATGTAAGAAGTAGCCATGATTCTCCATG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGTCACATGGTGAAAATGATGTAAGAAGTAGCCATGATTCTCCATG  590

seq1  CCTTATTCTAACTTCTTATAGAATGACAGGACCTCATGCTGATTGAGTCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATTCTAACTTCTTATAGAATGACAGGACCTCATGCTGATTGAGTCT  640

seq1  GATGAGAAATGTGACTCCTTCAATTTGGCTGGAGGTCTGGCTCACTGTTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGAAATGTGACTCCTTCAATTTGGCTGGAGGTCTGGCTCACTGTTG  690

seq1  ATGCTTCTTAAAGATCAACAGAATAGACACAGTGATGAGTGGGTGAATGG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTTCTTAAAGATCAACAGAATAGACACAGTGATGAGTGGGTGAATGG  740

seq1  ACAGATGGATGGATAAAGTAGTTGACTGGGTCTTTAGTTCTTTATCTGAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGATGGATGGATAAAGTAGTTGACTGGGTCTTTAGTTCTTTATCTGAA  790

seq1  GGTCTGTTATGTGTAAATTAACCCTCAGAGCACATCTCATTCCCACCTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGTTATGTGTAAATTAACCCTCAGAGCACATCTCATTCCCACCTTT  840

seq1  TGGAAGATGTAAGATGCCTTCCATAATGCTGATGATTTCTGCCTGCTACT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGATGTAAGATGCCTTCCATAATGCTGATGATTTCTGCCTGCTACT  890

seq1  TCTCAGGAGCTCAGATCATTCCTGAGTACATTAAATAGCAGTGTGACCTA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGAGCTCAGATCATTCCTGAGTACATTAAATAGCAGTGTGACCTA  940

seq1  TGGCCAACACTAAGAGAAAGAAAAGTAGGAATGTTAGTTTATTAGAAACC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAACACTAAGAGAAAGAAAAGTAGGAATGTTAGTTTATTAGAAACC  990

seq1  AAGCCAATTCAATTCATAGACCTCCTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAATTCAATTCATAGACCTCCTCCTCTTCTTCCTCTTCTTCCTCCA  1040

seq1  ACCCCAAGTAATATTTTCATAAAATTTGCCACTTTAATCTCTTTTAAGAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAAGTAATATTTTCATAAAATTTGCCACTTTAATCTCTTTTAAGAA  1090

seq1  TTC  1101
      |||
seq2  TTC  1093