BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-087O06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 92,197,144 - 92,294,801
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNod2, Cyld, LOC675985, Sall1, LOC100041089, EG625801, EG384862
Downstream geneTox3, LOC100041133
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-087O06.bB6Ng01-087O06.g
ACCDH900892DH900893
length1,2071,082
definitionDH900892|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O06, 5' end.DH900893|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-087O06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,197,144 - 92,198,369)(92,293,705 - 92,294,801)
sequence
gaattcattcacttttaggagtggagtggtttgtgatggaagatacaaag
tcgtcctgtaatgataattttggaactttggtttcttaaataacaataac
aacaacaataacaacaacaacaacaacaacataagaatattgtaagaaag
tgtttttgttttaatacctggtgtgggaaattgggcttcttcaggctgtc
ctcagcagctgcctttgatttgcctcgtgctctaccagaggcatggtttt
gccagttgcagatagtttctgcgacggtgtgatatttggaactctgggaa
cttttcagaggatatataaatgctacagtcctgataggtggatgtggttg
ttgctcagggagtttggttgcagtttcttagtagttgtgctcaaagaaga
aagagattagattcagatctctctctccctctccctccctccctcacccc
cctctctctcttcctccctccatttctccctccctccctccctccctccc
tccctctatcttttctttcctatctagtgataggggctataaagcgtgga
ataaagaatagcccacaaagcagctaagacctgctacatttcccttaatt
caacttctgtgtggaattctgaagacacaggcctcctcaatcttttcttt
cctaaatgtgtttgtcctgacagataatttccagagttaccccagattct
aggcagtccttacccagttcatttatcaccgaagagtcttgcttaaggaa
agctgagattaaccatatagacagatgctctagatgaatttcccagaatt
ccactttccagcctgaagctcctgatgggaactttgggcatggtgcccac
cccagtgccttgagcagaagtgctgagcattcaagatatgcagcgtgagg
tcatgccctggcaacatccgaatggacccttctggaaaaacgtcatgaaa
ttcatgaccaactgtcatcctacatgagaggagatgtgactgagagtggc
acccttgctttgtggggttcctgcctggtgactggtgatgatatctgtgt
caccttctttgcttaatatcccgggctccactcgaatggaaatttgcaag
gggctttctctgaaacatagccgcctgtcaattagttctcgctatggtca
ggataggtacggctattaatcttcattacacatggacaatgcattacatg
ctacccg
gaattccaggtgtatagggccaagtatgcaaatgacttccttccgtctag
ctgctgatttcatagaaagccctcaaactgagaaataaaacacacagaat
aggaaagctttatggggcagtcgagaatactgtgcctttaaatagttcag
acaagcggtgcatgctgtaaattcaccacagagacaaatttgtgcaaagc
tataaaaagaacagacatgaagcagagagaagtgctggctgaggggggtc
tggaggaggaactctggctaaaccaggttggtgagtgctgacacggtgct
gggaatatggtgtggtgccctggctggctcattcttcatggaaacacata
agaaagacatacttcccgccgctcaagagccaagagcagttcttgcattt
taagcagttagaggaaaagtcaaagaatattcaaatgtcagtgtccatca
ataaacttttactgagacatggtatatgtgtctcatggcttctttatggg
aaagtgctaaggctaagggttgaatggctataatagaattgtatgccctg
catagtctatcatattgactattttggtcttataggaaaggtctggttat
tcctattctgaagcagttgttctcaaaacgaggtctacacaacctgggaa
cttggtggagaaacacttattcctacacactagccagatctatgagtaag
gcactctgtgagtgagccttggtggcctgcactttcagccggttcccctt
tgtggatctgatgtatccttgaggataggaggtgtttctgcagagtacca
tagaacagcaatcagctactgcaaaatgccacactgaatgttaatagaca
ttgggtctttgtgatagaggacagttctctagagggatggctatagccat
ctagagcatcctggaccagctagtcaactcttccttaccaaacatggtac
tactagcacttagctactcacacttagagcagcagcagctggcacatttt
tccacctcacagactgtgtttatttgttcaagtcacgtactggaagaaag
atcttatgtcaaactgtgtgacctcagtttga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_92197144_92198369
seq2: B6Ng01-087O06.b_47_1253

seq1  GAATTCATTCACTTTTAGGAGTGGAGTGGTTTGTGATGGAAGATACAAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCACTTTTAGGAGTGGAGTGGTTTGTGATGGAAGATACAAAG  50

seq1  TCGTCCTGTAATGATAATTTTGGAACTTTGGTTTCTTAAATAACAATAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTCCTGTAATGATAATTTTGGAACTTTGGTTTCTTAAATAACAATAAC  100

seq1  AACAACAATAACAACAACAACAACAACAACATAAGAATATTGTAAGAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAATAACAACAACAACAACAACAACATAAGAATATTGTAAGAAAG  150

seq1  TGTTTTTGTTTTAATACCTGGTGTGGGAAATTGGGCTTCTTCAGGCTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTTGTTTTAATACCTGGTGTGGGAAATTGGGCTTCTTCAGGCTGTC  200

seq1  CTCAGCAGCTGCCTTTGATTTGCCTCGTGCTCTACCAGAGGCATGGTTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCAGCTGCCTTTGATTTGCCTCGTGCTCTACCAGAGGCATGGTTTT  250

seq1  GCCAGTTGCAGATAGTTTCTGCGACGGTGTGATATTTGGAACTCTGGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTTGCAGATAGTTTCTGCGACGGTGTGATATTTGGAACTCTGGGAA  300

seq1  CTTTTCAGAGGATATATAAATGCTACAGTCCTGATAGGTGGATGTGGTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCAGAGGATATATAAATGCTACAGTCCTGATAGGTGGATGTGGTTG  350

seq1  TTGCTCAGGGAGTTTGGTTGCAGTTTCTTAGTAGTTGTGCTCAAAGAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCAGGGAGTTTGGTTGCAGTTTCTTAGTAGTTGTGCTCAAAGAAGA  400

seq1  AAGAGATTAGATTCAGATCTCTCTCTCCCTCTCCCTCCCTCCCTCACCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATTAGATTCAGATCTCTCTCTCCCTCTCCCTCCCTCCCTCACCCC  450

seq1  CCTCTCTCTCTTCCTCCCTCCATTTCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTCTCTTCCTCCCTCCATTTCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTCCC  500

seq1  TCCCTCTATCTTTTCTTTCCTATCTAGTGATAGGGGCTATAAAGCGTGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCTATCTTTTCTTTCCTATCTAGTGATAGGGGCTATAAAGCGTGGA  550

seq1  ATAAAGAATAGCCCACAAAGCAGCTAAGACCTGCTACATTTCCCTTAATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAATAGCCCACAAAGCAGCTAAGACCTGCTACATTTCCCTTAATT  600

seq1  CAACTTCTGTGTGGAATTCTGAAGACACAGGCCTCCTCAATCTTTTCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTCTGTGTGGAATTCTGAAGACACAGGCCTCCTCAATCTTTTCTTT  650

seq1  CCTAAATGTGTTTGTCCTGACAGATAATTTCCAGAGTTACCCCAGATTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAATGTGTTTGTCCTGACAGATAATTTCCAGAGTTACCCCAGATTCT  700

seq1  AGGCAGTCCTTACCCAGTTCATTTATCACCGAAGAGTCTTGCTTAAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTCCTTACCCAGTTCATTTATCACCGAAGAGTCTTGCTTAAGGAA  750

seq1  AGCTGAGATTAACCATATAGACAGATGCTCTAGATGAATTTCCCAGAATT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGATTAACCATATAGACAGATGCTCTAGATGAATTTCCCAGAATT  800

seq1  CCACTTTCCAGCCTGAAGCTCCTGATGGGAACTTTGGGCATGGTGCCCAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTTCCAGCCTGAAGCTCCTGATGGGAACTTTGGGCATGGTGCCCAC  850

seq1  CCCAGTGCCTTGAGCAGAAGTGCTGAGCATTCAAGATATGCAGCGTGAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGTGCCTTGAGCAGAAGTGCTGAGCATTCAAGATATGCAGCGTGAGG  900

seq1  TCATGCCCTGGCAACATCCGAAATGGACCCTTCTGGAAAAAACGTCATGA  950
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TCATGCCCTGGCAACATCCG-AATGGACCCTTCTGG-AAAAACGTCATGA  948

seq1  AATTCATGACCAACTGTCATCCTACATGAGAGGAGATGTGACTGAGAGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCATGACCAACTGTCATCCTACATGAGAGGAGATGTGACTGAGAGTG  998

seq1  GCACCC-TGCTTTAGTGTGGTTCCTGCCTTGGTGACTTGGTGATGATTAT  1049
      |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||
seq2  GCACCCTTGCTTT-GTGGGGTTCCTGCC-TGGTGAC-TGGTGATGA-TAT  1044

seq1  CTGTGTCACCTTCTTTGCTTAATATCTCTGTGCTCAACTCGAATATTGAT  1099
      |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||  || || 
seq2  CTGTGTCACCTTCTTTGCTTAATATC-CCGGGCTCCACTCGA--ATGGAA  1091

seq1  ATTTTGCAGGTGCTTCTCCTGTAACAATAGCTGCTGTTCAAATTATGTTC  1149
      ||||   ||| ||||   ||| ||| ||||| ||   || ||||| ||||
seq2  ATTTGCAAGGGGCTTTCTCTGAAAC-ATAGCCGCCTGTC-AATTA-GTTC  1138

seq1  CTGCATAT-GTCAGGTATA-GTACAGTCTAATTTAATCTTCATTACACAT  1197
        || ||| |||||| ||| |||| | |||  ||||||||||||||||||
seq2  TCGC-TATGGTCAGG-ATAGGTAC-GGCTA--TTAATCTTCATTACACAT  1183

seq1  GGCCATATTGCAATTATACATGCTACCCG  1226
      ||  | | ||||    |||||||||||||
seq2  GG--ACAATGCA---TTACATGCTACCCG  1207

seq1: chr8_92293705_92294801
seq2: B6Ng01-087O06.g_68_1149 (reverse)

seq1  TCAAACCTGAGGTCACACAGGTTTGACATAAAGGATCTTTCTTCCAGTTA  50
      ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||
seq2  TCAAA-CTGAGGTCACACA-GTTTGACATAA--GATCTTTCTTCCAG-TA  45

seq1  CGTGACTTTGAACAAATAAACACCAAGTCTGTGAGGTGGAAAAATGGTGG  100
      |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |
seq2  CGTGAC-TTGAACAAATAAACAC--AGTCTGTGAGGTGGAAAAATG--TG  90

seq1  CCAGGCTGCTGCCTGCTCTAAGTGTGGAGTAGCTAAGTGCCTAGTAGTAC  150
      ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||
seq2  CCA-GCTGCTG-CTGCTCTAAGTGT-GAGTAGCTAAGTG-CTAGTAGTAC  136

seq1  CATGTTTGGTAAGGAAGAGGTTGACTAGCTGGTCCAGGATGCTCTAGATG  200
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTTGGTAAGGAAGA-GTTGACTAGCTGGTCCAGGATGCTCTAGATG  185

seq1  GCTATAGCCATCCCTCTAGAGAACTGTCCTCTATCACAAAGACCCAATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATAGCCATCCCTCTAGAGAACTGTCCTCTATCACAAAGACCCAATGT  235

seq1  CTATTAACATTCAGTGTGGCATTTTGCAGTAGCTGATTGCTGTTCTATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTAACATTCAGTGTGGCATTTTGCAGTAGCTGATTGCTGTTCTATGG  285

seq1  TACTCTGCAGAAACACCTCCTATCCTCAAGGATACATCAGATCCACAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCTGCAGAAACACCTCCTATCCTCAAGGATACATCAGATCCACAAAG  335

seq1  GGGAACCGGCTGAAAGTGCAGGCCACCAAGGCTCACTCACAGAGTGCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAACCGGCTGAAAGTGCAGGCCACCAAGGCTCACTCACAGAGTGCCTT  385

seq1  ACTCATAGATCTGGCTAGTGTGTAGGAATAAGTGTTTCTCCACCAAGTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCATAGATCTGGCTAGTGTGTAGGAATAAGTGTTTCTCCACCAAGTTC  435

seq1  CCAGGTTGTGTAGACCTCGTTTTGAGAACAACTGCTTCAGAATAGGAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTTGTGTAGACCTCGTTTTGAGAACAACTGCTTCAGAATAGGAATA  485

seq1  ACCAGACCTTTCCTATAAGACCAAAATAGTCAATATGATAGACTATGCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACCTTTCCTATAAGACCAAAATAGTCAATATGATAGACTATGCAG  535

seq1  GGCATACAATTCTATTATAGCCATTCAACCCTTAGCCTTAGCACTTTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATACAATTCTATTATAGCCATTCAACCCTTAGCCTTAGCACTTTCCC  585

seq1  ATAAAGAAGCCATGAGACACATATACCATGTCTCAGTAAAAGTTTATTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGAAGCCATGAGACACATATACCATGTCTCAGTAAAAGTTTATTGA  635

seq1  TGGACACTGACATTTGAATATTCTTTGACTTTTCCTCTAACTGCTTAAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACACTGACATTTGAATATTCTTTGACTTTTCCTCTAACTGCTTAAAA  685

seq1  TGCAAGAACTGCTCTTGGCTCTTGAGCGGCGGGAAGTATGTCTTTCTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGAACTGCTCTTGGCTCTTGAGCGGCGGGAAGTATGTCTTTCTTAT  735

seq1  GTGTTTCCATGAAGAATGAGCCAGCCAGGGCACCACACCATATTCCCAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCCATGAAGAATGAGCCAGCCAGGGCACCACACCATATTCCCAGC  785

seq1  ACCGTGTCAGCACTCACCAACCTGGTTTAGCCAGAGTTCCTCCTCCAGAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGTGTCAGCACTCACCAACCTGGTTTAGCCAGAGTTCCTCCTCCAGAC  835

seq1  CCCCCTCAGCCAGCACTTCTCTCTGCTTCATGTCTGTTCTTTTTATAGCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTCAGCCAGCACTTCTCTCTGCTTCATGTCTGTTCTTTTTATAGCT  885

seq1  TTGCACAAATTTGTCTCTGTGGTGAATTTACAGCATGCACCGCTTGTCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACAAATTTGTCTCTGTGGTGAATTTACAGCATGCACCGCTTGTCTG  935

seq1  AACTATTTAAAGGCACAGTATTCTCGACTGCCCCATAAAGCTTTCCTATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTTAAAGGCACAGTATTCTCGACTGCCCCATAAAGCTTTCCTATT  985

seq1  CTGTGTGTTTTATTTCTCAGTTTGAGGGCTTTCTATGAAATCAGCAGCTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGTTTTATTTCTCAGTTTGAGGGCTTTCTATGAAATCAGCAGCTA  1035

seq1  GACGGAAGGAAGTCATTTGCATACTTGGCCCTATACACCTGGAATTC  1097
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGGAAGGAAGTCATTTGCATACTTGGCCCTATACACCTGGAATTC  1082