BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-100G02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 45,757,586 - 45,907,946
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039508
Upstream geneEG384814, LOC100039472, LOC547011, LOC622263
Downstream geneFat1, LOC100039673, Mtnr1a, EG622523, F11, Klkb1, Cyp4v3, BC035537, Tlr3, Sorbs2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-100G02.bB6Ng01-100G02.g
ACCDH909898DH909899
length939607
definitionDH909898|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-100G02, 5' end.DH909899|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-100G02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(45,907,006 - 45,907,946)(45,757,586 - 45,758,172)
sequence
gaattctcagctctttctatagcaccatgcctgcctggttgtgtctatac
tttctatcatgatgataatgaactaaatctctgaaactgtaagcctgtcc
ctttataagagttgccttggttatggtatcttttcgcagcaataaaaccc
taactaaggcatctaccaagcaggattatagtttaatttgaaatatcaac
tatttatcaaaacaactaatagaacagatgaaaagtacttggatttagtc
aggctgtagaacaagaagaacctatataccttgacaactgagaatacatt
gttatgaccaataacttacaaagttgtctgcattttgcatgatccttcag
tccctttcataagtggaagagatacacatgaatacaatcatcaaatcata
gagacatgatccatacctgaatgtaacccaaatcacccttattatatgtt
tactcagtggacaactacatacaaaggagaacagatgtgagcaacttgaa
tgaatggagtggatataatgtagaagaggaagcctggttcaagaaagtta
ataccatatactttcattgctattacctttcaatagtagctgtgtctcct
aaacacaacaggactactgtgctaatgaactgataacagatgtggttgcc
tgcgtaagagatgctatattgaaccagctaaaaccaaccatagattgtgg
aggagttccttatgtcccaagtataacttaggagtttttggaagtatggg
ctctaaagggaggggggagggagtcagttatctttacttgtgtagtctat
ggtatgctcccaaacacccccatatacacatagatccataatggatagca
cttaattagtttgtaatacgttataaagagaaagaaagaaaaaggaagag
gagaggaagggaagaagagatgatgttgaagtggtggca
gaattctggagactgttctcaatggatacgttatgatacaacttctcttc
ccagggttcaggaatcattgcagaagaaagattgtaaaaaccagaaaaca
gagaatttgctttcagattgtgtctcctaccacacccataaagtttcacc
aacatgatctgaacaacaacagcaacaagcccaggctgtctcaaccatac
acaaagaactaatggcaattaaggaatgctctgagaacaggagaactcgt
cttccctagggaagagcacaccacttggtgatctgataccaaatgctcag
ccttgaaaatatacatacaagcaacactatgtagactgaacaagtaacac
acacatgtgtgtatatatatacacacacatataaatcatgcatatatgca
taatataagtatgtgtgatgtatataatacatatatatacatgtaaaaac
aattaatgaaaaaagagtccatacataagaaaaagaacaaggagagttca
gaggaaggaaagggaaaacaataatctcaaaatgtaaaataaaactaaaa
gaaataataataaatccgggcagtagtggcacacgcccttaatcccagca
cttggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_45907006_45907946
seq2: B6Ng01-100G02.b_48_986 (reverse)

seq1  TACCACCACCTCAACATCATCTCTTCTTCCCCTCCTCTTCCTCTTTCCTT  50
      | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||
seq2  TGCCACCACTTCAACATCATCTCTTCTTCCCTTCCTC-TCCTCTTCCTTT  49

seq1  TTCTTTCTTTCTTCTTTTATAACCTATTACAAACTAATT-AGTGCTATCC  99
      ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTCTTTCTTTCT--CTTTATAACGTATTACAAACTAATTAAGTGCTATCC  97

seq1  A-TATGGATCTATGTGTATATGGGGGTGTTTTGGAGCATACCATAGACTA  148
      | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATTATGGATCTATGTGTATATGGGGGTGTTTGGGAGCATACCATAGACTA  147

seq1  CACAAGTAAAGATAACTGACTCCCTCCCCCCTCCCTTTAGAGCCCATACC  198
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CACAAGTAAAGATAACTGACTCCCTCCCCCCTCCCTTTAGAGCCCATA-C  196

seq1  TTCCAAAAACTCCTAAGTTATACTTGGGACATAAGGAACTCCTCCACAAT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAAAACTCCTAAGTTATACTTGGGACATAAGGAACTCCTCCACAAT  246

seq1  CTATGGTTGGTTTTAGCTGGTTCAATATAGCATCTCTTACGCAGGCAACC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGTTGGTTTTAGCTGGTTCAATATAGCATCTCTTACGCAGGCAACC  296

seq1  ACATCTGTTATCAGTTCATTAGCACAGTAGTCCTGTTGTGTTTAGGAGAC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTGTTATCAGTTCATTAGCACAGTAGTCCTGTTGTGTTTAGGAGAC  346

seq1  ACAGCTACTATTGAAAGGTAATAGCAATGAAAGTATATGGTATTAACTTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTACTATTGAAAGGTAATAGCAATGAAAGTATATGGTATTAACTTT  396

seq1  CTTGAACCAGGCTTCCTCTTCTACATTATATCCACTCCATTCATTCAAGT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAACCAGGCTTCCTCTTCTACATTATATCCACTCCATTCATTCAAGT  446

seq1  TGCTCACATCTGTTCTCCTTTGTATGTAGTTGTCCACTGAGTAAACATAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACATCTGTTCTCCTTTGTATGTAGTTGTCCACTGAGTAAACATAT  496

seq1  AATAAGGGTGATTTGGGTTACATTCAGGTATGGATCATGTCTCTATGATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGGGTGATTTGGGTTACATTCAGGTATGGATCATGTCTCTATGATT  546

seq1  TGATGATTGTATTCATGTGTATCTCTTCCACTTATGAAAGGGACTGAAGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGATTGTATTCATGTGTATCTCTTCCACTTATGAAAGGGACTGAAGG  596

seq1  ATCATGCAAAATGCAGACAACTTTGTAAGTTATTGGTCATAACAATGTAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGCAAAATGCAGACAACTTTGTAAGTTATTGGTCATAACAATGTAT  646

seq1  TCTCAGTTGTCAAGGTATATAGGTTCTTCTTGTTCTACAGCCTGACTAAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGTTGTCAAGGTATATAGGTTCTTCTTGTTCTACAGCCTGACTAAA  696

seq1  TCCAAGTACTTTTCATCTGTTCTATTAGTTGTTTTGATAAATAGTTGATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGTACTTTTCATCTGTTCTATTAGTTGTTTTGATAAATAGTTGATA  746

seq1  TTTCAAATTAAACTATAATCCTGCTTGGTAGATGCCTTAGTTAGGGTTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAATTAAACTATAATCCTGCTTGGTAGATGCCTTAGTTAGGGTTTT  796

seq1  ATTGCTGCGAAAAGATACCATAACCAAGGCAACTCTTATAAAGGGACAGG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGCGAAAAGATACCATAACCAAGGCAACTCTTATAAAGGGACAGG  846

seq1  CTTACAGTTTCAGAGATTTAGTTCATTATCATCATGATAGAAAGTATAGA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAGTTTCAGAGATTTAGTTCATTATCATCATGATAGAAAGTATAGA  896

seq1  CACAACCAGGCAGGCATGGTGCTATAGAAAGAGCTGAGAATTC  941
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACCAGGCAGGCATGGTGCTATAGAAAGAGCTGAGAATTC  939

seq1: chr8_45757586_45758172
seq2: B6Ng01-100G02.g_88_674

seq1  AATGGATACGTTATGATACAACTTCTCTTCCCAGGGTTCAGGAATCATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATACGTTATGATACAACTTCTCTTCCCAGGGTTCAGGAATCATTG  50

seq1  CAGAAGAAAGATTGTAAAAACCAGAAAACAGAGAATTTGCTTTCAGATTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGAAAGATTGTAAAAACCAGAAAACAGAGAATTTGCTTTCAGATTG  100

seq1  TGTCTCCTACCACACCCATAAAGTTTCACCAACATGATCTGAACAACAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCCTACCACACCCATAAAGTTTCACCAACATGATCTGAACAACAAC  150

seq1  AGCAACAAGCCCAGGCTGTCTCAACCATACACAAAGAACTAATGGCAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACAAGCCCAGGCTGTCTCAACCATACACAAAGAACTAATGGCAATT  200

seq1  AAGGAATGCTCTGAGAACAGGAGAACTCGTCTTCCCTAGGGAAGAGCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAATGCTCTGAGAACAGGAGAACTCGTCTTCCCTAGGGAAGAGCACA  250

seq1  CCACTTGGTGATCTGATACCAAATGCTCAGCCTTGAAAATATACATACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTTGGTGATCTGATACCAAATGCTCAGCCTTGAAAATATACATACAA  300

seq1  GCAACACTATGTAGACTGAACAAGTAACACACACATGTGTGTATATATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAACACTATGTAGACTGAACAAGTAACACACACATGTGTGTATATATAT  350

seq1  ACACACACATATAAATCATGCATATATGCATAATATAAGTATGTGTGATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACATATAAATCATGCATATATGCATAATATAAGTATGTGTGATG  400

seq1  TATATAATACATATATATACATGTAAAAACAATTAATGAAAAAAGAGTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATAATACATATATATACATGTAAAAACAATTAATGAAAAAAGAGTCC  450

seq1  ATACATAAGAAAAAGAACAAGGAGAGTTCAGAGGAAGGAAAGGGAAAACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAAGAAAAAGAACAAGGAGAGTTCAGAGGAAGGAAAGGGAAAACA  500

seq1  ATAATCTCAAAATGTAAAATAAAACTAAAAGAAATAATAATAAATCCGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATCTCAAAATGTAAAATAAAACTAAAAGAAATAATAATAAATCCGGG  550

seq1  CAGTAGTGGCACACGCCCTTAATCCCAGCACTTGGGA  587
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGTGGCACACGCCCTTAATCCCAGCACTTGGGA  587