BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-103C19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 117,096,257 - 117,238,394
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWwox
Upstream geneMon1b, 4930481F22Rik, Adamts18, Nudt7, AI427515, Clec3a
Downstream geneMaf
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-103C19.bB6Ng01-103C19.g
ACCDH911851DH911852
length1,160435
definitionDH911851|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103C19, 5' end.DH911852|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103C19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,096,257 - 117,097,429)(117,237,954 - 117,238,394)
sequence
gaattccacattgtgacactaggggcaccttccaggtgttgtcctttctg
agtaccaaatcttgtcttatagcagctaatattaattttctcttcagaga
tctatgcgcgtgccacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacaccacaaacatacgttgcacacacatacaaacatgagtcttcac
ccgatttgaatacaagggaaagacccaataggagccttccccttgtcgtg
gaaacgagatgcacttgatagagtcacagtacaagtatgcacagagtgcc
atgacatgccctcccagcccccctctaagactgtagcccgggacctgctt
gttacctaactcctttgacccttttccaagggccctgtgacttacttcta
cgctgggattagtggagcccttgtttctcatccttcctagttattgatgg
atgatccatggtatctacttacctttctgaatttaacttgaaccagcagc
atttgttaagcaaaatcttcctgaaagtcctctgtccccgcccacctcca
ccctcatttcctgtagtaaacaactggcttgctgacttcacagatctctt
gagttcttggaggtttttgcacagaatcctctctgatcagtatgatccat
gctggacaacaggaagcattccatactgcttggccaagaggaagagctcc
agcaattatcctcccttttcttcttgttcatgttaatggcatgtgaaaca
cattagagtcagggccatcattgtgagaactctggtaacagtgcagagtg
tgctcatgagcaggtctgtctggaatggaaagtcagttgaagcatcaggg
ctggccatgttgcccagggcctttcttccccattttctactgttcgtgca
gcaagctgcccaggacattgtgactagtcgtaaagaatgcactatgtcac
agaagagtcccaaactataggagatctttaaatataaactccctgggact
tcagacaagcatgagtttggagaaacagttttccattctgagcagtgtgg
ctgttcagtgggaaccctgagattgtattgtgcatcagtttatgtgaccc
ttcatctaactaggtgctgctgctgctgctgctgctgctgctgctagctt
ctttaacaca
agaatttccccagctgtacaacatatatcaaggtctcaattactatatgt
ggacaatggccagatggtgaccactagacaaatcctctgttctggagtcc
gttatttgaggtataacgtggcaggataggatgcttgagacaaattccct
accttgtcttgatggccacaggaaacactggaacttgattaggagaaatg
ctaaggagagccagttgttctactgtgccaggcagccgatggctgtcctt
gccaccaccagaaggatagctggacttatatgcctaaagacccaattttg
atcatttaaaaaaacagcaccagtaactgccaaggatctataagttcaaa
ggaaaatacttttattatttatctcatgtgtgtatttgtggaacattcat
atgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtgtgtggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_117096257_117097429
seq2: B6Ng01-103C19.b_44_1203

seq1  GAATTCCACATTGTGACACTAGGGGCACCTTCCAGGTGTTGTCCTTTCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACATTGTGACACTAGGGGCACCTTCCAGGTGTTGTCCTTTCTG  50

seq1  AGTACCAAATCTTGTCTTATAGCAGCTAATATTAATTTTCTCTTCAGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCAAATCTTGTCTTATAGCAGCTAATATTAATTTTCTCTTCAGAGA  100

seq1  TCTATGCGCGTGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGCGCGTGCCACACACACACACACACACACACACACACACACACAC  150

seq1  ACACACACCACAAACATACGTTGCACACACATACAAACATGAGTCTTCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACCACAAACATACGTTGCACACACATACAAACATGAGTCTTCAC  200

seq1  CCGATTTGAATACAAGGGAAAGACCCAATAGGAGCCTTCCCCTTGTCGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGATTTGAATACAAGGGAAAGACCCAATAGGAGCCTTCCCCTTGTCGTG  250

seq1  GAAACGAGATGCACTTGATAGAGTCACAGTACAAGTATGCACAGAGTGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACGAGATGCACTTGATAGAGTCACAGTACAAGTATGCACAGAGTGCC  300

seq1  ATGACATGCCCTCCCAGCCCCCCTCTAAGACTGTAGCCCGGGACCTGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATGCCCTCCCAGCCCCCCTCTAAGACTGTAGCCCGGGACCTGCTT  350

seq1  GTTACCTAACTCCTTTGACCCTTTTCCAAGGGCCCTGTGACTTACTTCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACCTAACTCCTTTGACCCTTTTCCAAGGGCCCTGTGACTTACTTCTA  400

seq1  CGCTGGGATTAGTGGAGCCCTTGTTTCTCATCCTTCCTAGTTATTGATGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCTGGGATTAGTGGAGCCCTTGTTTCTCATCCTTCCTAGTTATTGATGG  450

seq1  ATGATCCATGGTATCTACTTACCTTTCTGAATTTAACTTGAACCAGCAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATCCATGGTATCTACTTACCTTTCTGAATTTAACTTGAACCAGCAGC  500

seq1  ATTTGTTAAGCAAAATCTTCCTGAAAGTCCTCTGTCCCCGCCCACCTCCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTAAGCAAAATCTTCCTGAAAGTCCTCTGTCCCCGCCCACCTCCA  550

seq1  CCCTCATTTCCTGTAGTAAACAACTGGCTTGCTGACTTCACAGATCTCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCATTTCCTGTAGTAAACAACTGGCTTGCTGACTTCACAGATCTCTT  600

seq1  GAGTTCTTGGAGGTTTTTGCACAGAATCCTCTCTGATCAGTATGATCCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCTTGGAGGTTTTTGCACAGAATCCTCTCTGATCAGTATGATCCAT  650

seq1  GCTGGACAACAGGAAGCATTCCATACTGCTTGGCCAAGAGGAAGAGCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGACAACAGGAAGCATTCCATACTGCTTGGCCAAGAGGAAGAGCTCC  700

seq1  AGCAATTATCCTCCCTTTTCTTCTTGTTCATGTTAATGGCATGTGAAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATTATCCTCCCTTTTCTTCTTGTTCATGTTAATGGCATGTGAAACA  750

seq1  CATTAGAGTCAGGGCCATCATTGTGAGAACTCTGGTAACAGTGCAGAGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAGAGTCAGGGCCATCATTGTGAGAACTCTGGTAACAGTGCAGAGTG  800

seq1  TGCTCATGAGCAGGTCTGTCTGGAATGGAAAGTCAGTTGAAGCATCAGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCATGAGCAGGTCTGTCTGGAATGGAAAGTCAGTTGAAGCATCAGGG  850

seq1  CTGGCCATGTTGCCCAGGGGCCTTTCTTCCCCATTTTCTACTGTTCGTGC  900
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCATGTTGCCCA-GGGCCTTTCTTCCCCATTTTCTACTGTTCGTGC  899

seq1  AGCAAGCTGCCCAGGACATTGTGACTAGTCGTAAAGAATGCACTATGTCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCTGCCCAGGACATTGTGACTAGTCGTAAAGAATGCACTATGTCA  949

seq1  CAGAAGAGTCCCAAACTATAGGAGATCTTTTAAATATAAACTCCCTGGGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAGAGTCCCAAACTATAGGAGATC-TTTAAATATAAACTCCCTGGGA  998

seq1  CTTCAGACAAAGCATGAGTTTTGGAGAAACAGTTTTCCATTTCTGAGCAA  1050
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
seq2  CTTCAGAC-AAGCATGAG-TTTGGAGAAACAGTTTTCCA-TTCTGAGC-A  1044

seq1  GTGTGGCTGTTTCAGTGGGAACCCTGAGATTGTTAATGGTGCATCCAGTT  1100
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||
seq2  GTGTGGCTG-TTCAGTGGGAACCCTGAGATTGT--ATTGTGCAT-CAGTT  1090

seq1  TATGTGACCCTTCATCCTAGACTAGTGTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG  1150
      ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGACCCTTCAT-CTA-ACTAG-GTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG  1137

seq1  CTGCTGCTAGCTTCTTTTACACA  1173
      ||||||||||||||||| |||||
seq2  CTGCTGCTAGCTTCTTTAACACA  1160

seq1: chr8_117237954_117238394
seq2: B6Ng01-103C19.g_67_507 (reverse)

seq1  ACCACACACATACATACATACATACATACATACATATGAATGTTCCACAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACACACATACATACATACATACATACATACATATGAATGTTCCACAA  50

seq1  ATACACACATGAGATAAATAATAAAAGTATTTTCCTTTGAACTTATAGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACACATGAGATAAATAATAAAAGTATTTTCCTTTGAACTTATAGAT  100

seq1  CCTTGGCAGTTACTGGTGCTGTTTTTTTAAATGATCAAAATTGGGTCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGGCAGTTACTGGTGCTGTTTTTTTAAATGATCAAAATTGGGTCTTT  150

seq1  AGGCATATAAGTCCAGCTATCCTTCTGGTGGTGGCAAGGACAGCCATCGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATATAAGTCCAGCTATCCTTCTGGTGGTGGCAAGGACAGCCATCGG  200

seq1  CTGCCTGGCACAGTAGAACAACTGGCTCTCCTTAGCATTTCTCCTAATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTGGCACAGTAGAACAACTGGCTCTCCTTAGCATTTCTCCTAATCA  250

seq1  AGTTCCAGTGTTTCCTGTGGCCATCAAGACAAGGTAGGGAATTTGTCTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCAGTGTTTCCTGTGGCCATCAAGACAAGGTAGGGAATTTGTCTCA  300

seq1  AGCATCCTATCCTGCCACGTTATACCTCAAATAACGGACTCCAGAACAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCCTATCCTGCCACGTTATACCTCAAATAACGGACTCCAGAACAGA  350

seq1  GGATTTGTCTAGTGGTCACCATCTGGCCATTGTCCACATATAGTAATTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTTGTCTAGTGGTCACCATCTGGCCATTGTCCACATATAGTAATTGA  400

seq1  GACCTTGATATATGTTGTACAGCTGGGGAAATTCTGAATTC  441
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTGATATATGTTGTACAGCTGGGGAAATTCTGAATTC  441