BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-105D02
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,387,140 - 14,498,892
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2
Upstream geneAtp4b, Grk1, Gm687, Gas6, LOC434282, 1700029H14Rik, Rasa3, 4932443I19Rik, LOC665516, Cdc16, Upf3a, AF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140
Downstream geneC030037F17Rik, Cln8, Arhgef10, 2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599, EG234097
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-105D02.bB6Ng01-105D02.g
ACCDH913280DH913281
length1,143583
definitionDH913280|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105D02, 5' end.DH913281|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-105D02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,497,747 - 14,498,892)(14,387,140 - 14,387,722)
sequence
gaattcatttgactgttataggctggaggtaatctctgcagttggaggct
tccaagagtgaatcaagaggattcagggacaagccacagaggcctggcag
ccatgacactatgggatatttcaacacctggcaagcctgtgccttgtaaa
agaaaccacacaactgatgggcagatgagtcttccctgacatccactcat
gtgcctgtgtccttccccgccttcatccacattaagcaaatatcaaacac
tattgccggtccaactcagctcctctacgacaacatttccaccagatcct
ggtgggggctgggagaagtgtgacctcctggaagctatgaatgagacgac
acaggaataaagccaagaactatacagcagccaggtttgcattctcatta
agaagttgggaagcagggtccatcagaggagccagtgatcccagcactca
gggagagtgattgggtgaggtgggcatgggctagtaaagacatggattat
ttggtagaagtgaggattgcttttctttcctgggttcctgttatacaggt
ctaaaggctccttgtactagactaaagaatgtcccctaacctgatgtcac
agccctgactcccactgtactgtctggagagaggaccttgagagactcac
caaagccaaatgaggacacaaatgtggctttagtctgcctgactgatgtc
ctcacaggaacaaaaggcactgctggggtacacagtgaaggaaaaggcca
catggggacataggcagatggtgctgccaccagctaggtggtggcactcc
tctaccctaagacctgaacagaaaccagctctccatacctcagtcttgga
attccagccctaggacagtgaggaaaggaaattactgtttattgaacaag
acaggacttagcattctgtcacagtcttaggggactagcatgcttggtgg
tttttgtgagttgtctgctaagttaacaagttgactcacagtagcccaca
gatgcttggggctgggtgtggtaacagtgaggacatgggatggtgattac
acaggagcttgtggtcttaggtcaagggtgactgacaggacaagaaggcc
tgaaaatggtttggtcagcgctattcaggctgtagtcagagtt
gaattcttctttgggtaaattctgagaagcccagccagacgaggtcaggg
tctgggtatgtgcagttttgtaggagtcttccaagttgtccctcaaggtg
accataggcttctgtagtctcacaagcaaagaacagagttcccagtgttt
catctccgcatgagcatccagtggctctacttctgagaactggaccattc
tcatggctatgtggtcatagctaaggctgtatcactaggcagcagtgttt
ccctaatactagagaggacattatcagtgcaaagaacgtgaaggaataaa
tcgaaggagatgaggacagagaaagagaagggccagtagaccggctgcag
aacttctcatcctgtccctaacccagtttcaaccttcctaatgctgtaat
tctttaatatagttcctcatgctatggtgacccgcaaccatataattatt
tcattgatacgtcataactgtaattctgcaatgttatgattcataatgta
aatatctgatatgcaggatatctgatctgtgactcccaggtaggtcatga
cccacaggttgagagccactggtttacaggcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14497747_14498892
seq2: B6Ng01-105D02.b_45_1187 (reverse)

seq1  AACTCTTGACTACAGCCCTGGATGGCTGCCTGACACAAACCCATTTTCAG  50
      ||||| ||||||||| |||| || ||   ||||| |||| ||||||||||
seq2  AACTC-TGACTACAG-CCTGAATAGC--GCTGAC-CAAA-CCATTTTCAG  44

seq1  CCCCTTCTTGTTCCTGTCAGTCA-CCTTGACCTAAGGACACAAGCTTCTT  99
        |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || |
seq2  -GCCTTCTTG-TCCTGTCAGTCACCCTTGACCTAAGACCACAAGC-TCCT  91

seq1  GTGTAATCA-CAT-CCATGTCCTCACTGTTAACCACACCCAGCCCAAAGC  147
      ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  GTGTAATCACCATCCCATGTCCTCACTGTT-ACCACACCCAGCCCCAAGC  140

seq1  ATCTGTGGGCTACTGTGAGTCAACTTGTTAACTTAGCAGACAACTCACAA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGGGCTACTGTGAGTCAACTTGTTAACTTAGCAGACAACTCACAA  190

seq1  AA--CCCCAAGCATGCTAGTCCCCT-AGGCTGTGACAGAATGCTAGGTCC  244
      ||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||
seq2  AAACCACCAAGCATGCTAGTCCCCTAAGACTGTGACAGAATGCTAAGTCC  240

seq1  TGTCTTGTTCAATAAACAGTAATTTCC-TTCCTCACTGTCCTAGGGCTGG  293
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTGTTCAATAAACAGTAATTTCCTTTCCTCACTGTCCTAGGGCTGG  290

seq1  AATTCCAAGACTGAGGTATGGAGAGCTGGTTTCTGTTCAGGTCTTAGGGT  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAAGACTGAGGTATGGAGAGCTGGTTTCTGTTCAGGTCTTAGGGT  340

seq1  AGAGGAGTGCCACCACCTAGCTGGTGGCAGCACCATCTGCCTATGTCCCC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGTGCCACCACCTAGCTGGTGGCAGCACCATCTGCCTATGTCCCC  390

seq1  ATGTGGCCTTTTCCTTCACTGTGTACCCCAGCAGTGCCTTTTGTTCCTGT  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGCCTTTTCCTTCACTGTGTACCCCAGCAGTGCCTTTTGTTCCTGT  440

seq1  GAGGACATCAGTCAGGCAGACTAAAGCCACATTTGTGTCCTCATTTGGCT  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACATCAGTCAGGCAGACTAAAGCCACATTTGTGTCCTCATTTGGCT  490

seq1  TTGGTGAGTCTCTCAAGGTCCTCTCTCCAGACAGTACAGTGGGAGTCAGG  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGAGTCTCTCAAGGTCCTCTCTCCAGACAGTACAGTGGGAGTCAGG  540

seq1  GCTGTGACATCAGGTTAGGGGACATTCTTTAGTCTAGTACAAGGAGCCTT  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGACATCAGGTTAGGGGACATTCTTTAGTCTAGTACAAGGAGCCTT  590

seq1  TAGACCTGTATAACAGGAACCCAGGAAAGAAAAGCAATCCTCACTTCTAC  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACCTGTATAACAGGAACCCAGGAAAGAAAAGCAATCCTCACTTCTAC  640

seq1  CAAATAATCCATGTCTTTACTAGCCCATGCCCACCTCACCCAATCACTCT  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATAATCCATGTCTTTACTAGCCCATGCCCACCTCACCCAATCACTCT  690

seq1  CCCTGAGTGCTGGGATCACTGGCTCCTCTGATGGACCCTGCTTCCCAACT  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGTGCTGGGATCACTGGCTCCTCTGATGGACCCTGCTTCCCAACT  740

seq1  TCTTAATGAGAATGCAAACCTGGCTGCTGTATAGTTCTTGGCTTTATTCC  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAATGAGAATGCAAACCTGGCTGCTGTATAGTTCTTGGCTTTATTCC  790

seq1  TGTGTCGTCTCATTCATAGCTTCCAGGAGGTCACACTTCTCCCAGCCCCC  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCGTCTCATTCATAGCTTCCAGGAGGTCACACTTCTCCCAGCCCCC  840

seq1  ACCAGGATCTGGTGGAAATGTTGTCGTAGAGGAGCTGAGTTGGACCGGCA  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGATCTGGTGGAAATGTTGTCGTAGAGGAGCTGAGTTGGACCGGCA  890

seq1  ATAGTGTTTGATATTTGCTTAATGTGGATGAAGGCGGGGAAGGACACAGG  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTTTGATATTTGCTTAATGTGGATGAAGGCGGGGAAGGACACAGG  940

seq1  CACATGAGTGGATGTCAGGGAAGACTCATCTGCCCATCAGTTGTGTGGTT  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGAGTGGATGTCAGGGAAGACTCATCTGCCCATCAGTTGTGTGGTT  990

seq1  TCTTTTACAAGGCACAGGCTTGCCAGGTGTTGAAATATCCCATAGTGTCA  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTTACAAGGCACAGGCTTGCCAGGTGTTGAAATATCCCATAGTGTCA  1040

seq1  TGGCTGCCAGGCCTCTGTGGCTTGTCCCTGAATCCTCTTGATTCACTCTT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGCCAGGCCTCTGTGGCTTGTCCCTGAATCCTCTTGATTCACTCTT  1090

seq1  GGAAGCCTCCAACTGCAGAGATTACCTCCAGCCTATAACAGTCAAATGAA  1143
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCCTCCAACTGCAGAGATTACCTCCAGCCTATAACAGTCAAATGAA  1140

seq1  TTC  1146
      |||
seq2  TTC  1143

seq1: chr8_14387140_14387722
seq2: B6Ng01-105D02.g_68_650

seq1  GAATTCTTCTTTGGGTAAATTCTGAGAAGCCCAGCCAGACGAGGTCAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTTTGGGTAAATTCTGAGAAGCCCAGCCAGACGAGGTCAGGG  50

seq1  TCTGGGTATGTGCAGTTTTGTAGGAGTCTTCCAAGTTGTCCCTCAAGGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGTATGTGCAGTTTTGTAGGAGTCTTCCAAGTTGTCCCTCAAGGTG  100

seq1  ACCATAGGCTTCTGTAGTCTCACAAGCAAAGAACAGAGTTCCCAGTGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATAGGCTTCTGTAGTCTCACAAGCAAAGAACAGAGTTCCCAGTGTTT  150

seq1  CATCTCCGCATGAGCATCCAGTGGCTCTACTTCTGAGAACTGGACCATTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCGCATGAGCATCCAGTGGCTCTACTTCTGAGAACTGGACCATTC  200

seq1  TCATGGCTATGTGGTCATAGCTAAGGCTGTATCACTAGGCAGCAGTGTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGCTATGTGGTCATAGCTAAGGCTGTATCACTAGGCAGCAGTGTTT  250

seq1  CCCTAATACTAGAGAGGACATTATCAGTGCAAAGAACGTGAAGGAATAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAATACTAGAGAGGACATTATCAGTGCAAAGAACGTGAAGGAATAAA  300

seq1  TCGAAGGAGATGAGGACAGAGAAAGAGAAGGGCCAGTAGACCGGCTGCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGAAGGAGATGAGGACAGAGAAAGAGAAGGGCCAGTAGACCGGCTGCAG  350

seq1  AACTTCTCATCCTGTCCCTAACCCAGTTTCAACCTTCCTAATGCTGTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCTCATCCTGTCCCTAACCCAGTTTCAACCTTCCTAATGCTGTAAT  400

seq1  TCTTTAATATAGTTCCTCATGCTATGGTGACCCGCAACCATATAATTATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAATATAGTTCCTCATGCTATGGTGACCCGCAACCATATAATTATT  450

seq1  TCATTGATACGTCATAACTGTAATTCTGCAATGTTATGATTCATAATGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTGATACGTCATAACTGTAATTCTGCAATGTTATGATTCATAATGTA  500

seq1  AATATCTGATATGCAGGATATCTGATCTGTGACTCCCAGGTAGGTCATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTGATATGCAGGATATCTGATCTGTGACTCCCAGGTAGGTCATGA  550

seq1  CCCACAGGTTGAGAGCCACTGGTTTACAGGCAG  583
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAGGTTGAGAGCCACTGGTTTACAGGCAG  583