BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-110B10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,819,226 - 118,940,549
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneWwox, Maf
Downstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-110B10.bB6Ng01-110B10.g
ACCDH916813DH916814
length1,1841,066
definitionDH916813|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-110B10, 5' end.DH916814|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-110B10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,819,226 - 118,820,425)(118,939,465 - 118,940,549)
sequence
gaattcaactaatatgtaaacaaaatatgttccatctatccacatagcac
cattctctttctcaagggaaaagtgattcatatcacaacatagataactt
tatgccaacatttcacacagtgtatgaagccagttagaaaagccataggt
tgtaaaattccatttatctaaaatatccagaacagccaatccaaagagag
agcagatgggtagtcaacaggggcaaaggcaggagacagtgtcaggtcac
tgagagataacgtatttctctcagaatgcgagagggggtctgagatgtgg
tgatggggatgacttcacaacctgtgaaagtgttgaaaagcaatccacac
tgaatcacacacttgaaaggatgatctttggcatggaaggtgtctacctg
agcctgatagtggttactcatgagacacataacaccaggagcaatcccta
aggtaaactgtgggccatgagtgatgacaaaaacatgggtggttcctcac
tttcatcaaatacatcatgctggtacaggactgaaaataggggaaggttg
tgtgagagtggaaccagaaagaacatgggaaatcatggtggcttctattg
aacgttgactcaacgttaaactcctatagatacatgtatatgctgggtct
attcctttcactgatgattacccagccccaagtaggacaactatagcagc
agccctctaatgttcaggaaacatgccagaagatgggttagaaagggtaa
gaagagcctgcagacagagtgaaaggggtggagttctgtaaaagactgtc
tgtctttgttgtagctctggtcactaacacaagatctgtacaaggtccag
ccaatgacatcagtgaccattccaacaggcaccatgaatttggttcaatg
tgataaagacaagaaggagaggacactaagatgggaaggggacatgcaca
gggtgttcagagatcatgagaatggggaatagggttgggaatgaacaagg
tacactgaatgcatcaatgaaattgtcaagaataaaaaaaatgtccaatt
taaagttcacttttaaaatgatgtgtctgtgccatgccagtaactgctgg
taagcagtgatcataaaagagcaatggatatgtgctggacctggctgccc
aataaccatacttcccaccacaggatccttgaac
gaattcaatgatggaatgcgtatgatttgtcctatttaaatcactcaaca
agtcagttatgagctctgtaaagagtaaaaagattcactggcctccaacc
ccaaagccctaaaacaagtcctacctgacctggggcaggggaaggaagat
gcagagtttttttctgggctaggacccaatgcttgaggctcagtcacata
cgttttctctagcgactatggagccaacatttgaactcacctctgttcac
atctagggttgagcctccttaggcaaaaagtcaatgtggggtttccccct
tccttgaaactcttttgcagtgaagaactcctgaccttcctgggccctca
gcctcatggagatggacgacctctagtttagctatggataagaagaaagg
ctgccatccgtagctatgtccaggccttggatgtttctttagtcatttga
agagtgccacttagcagtgctcccccccccacctccaccccccaggctaa
gcttccacctggatatgaaacgatgtgagtgaagtgtctgtggtcctgag
gcgtaagtcagcccagagaaataaacctcaggcatagaggtgcaattcct
catgattcggtgaccctagagagctgtgagcagagcatccagagcgccgg
ttcatgattcctgtgggaggccagggcactgagccgaattgccaggctct
tggttaaggtgggcatcttagttagggttttgctgccgtggagcagacac
caacaacatggctggcactgatgccctctctgagtctgtgctgcctgcct
ttagaggtgagtgtgccgtatccaagaacgaagcatacgatgccagctca
agacagcactcgctttgcgtcagacgccctttccttcccgactgaccgtt
tcatccctcacggtcctcacatctagcttcattcactgaactcttgggtc
tctcagcagctgagcttaataccattatttgtgagtcctcaaaaaaaaaa
aaaaaaaagctctgtttgtaatcccaatctcagaaacggaggataaatgc
caatctgcatgactgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_118819226_118820425
seq2: B6Ng01-110B10.b_44_1227

seq1  GAATTCAACTAATATGTAAACAAAATATGTTCCATCTATCCACATAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACTAATATGTAAACAAAATATGTTCCATCTATCCACATAGCAC  50

seq1  CATTCTCTTTCTCAAGGGAAAAGTGATTCATATCACAACATAGATAACTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCTTTCTCAAGGGAAAAGTGATTCATATCACAACATAGATAACTT  100

seq1  TATGCCAACATTTCACACAGTGTATGAAGCCAGTTAGAAAAGCCATAGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCCAACATTTCACACAGTGTATGAAGCCAGTTAGAAAAGCCATAGGT  150

seq1  TGTAAAATTCCATTTATCTAAAATATCCAGAACAGCCAATCCAAAGAGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAATTCCATTTATCTAAAATATCCAGAACAGCCAATCCAAAGAGAG  200

seq1  AGCAGATGGGTAGTCAACAGGGGCAAAGGCAGGAGACAGTGTCAGGTCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATGGGTAGTCAACAGGGGCAAAGGCAGGAGACAGTGTCAGGTCAC  250

seq1  TGAGAGATAACGTATTTCTCTCAGAATGCGAGAGGGGGTCTGAGATGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGATAACGTATTTCTCTCAGAATGCGAGAGGGGGTCTGAGATGTGG  300

seq1  TGATGGGGATGACTTCACAACCTGTGAAAGTGTTGAAAAGCAATCCACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGGGATGACTTCACAACCTGTGAAAGTGTTGAAAAGCAATCCACAC  350

seq1  TGAATCACACACTTGAAAGGATGATCTTTGGCATGGAAGGTGTCTACCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATCACACACTTGAAAGGATGATCTTTGGCATGGAAGGTGTCTACCTG  400

seq1  AGCCTGATAGTGGTTACTCATGAGACACATAACACCAGGAGCAATCCCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGATAGTGGTTACTCATGAGACACATAACACCAGGAGCAATCCCTA  450

seq1  AGGTAAACTGTGGGCCATGAGTGATGACAAAAACATGGGTGGTTCCTCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAAACTGTGGGCCATGAGTGATGACAAAAACATGGGTGGTTCCTCAC  500

seq1  TTTCATCAAATACATCATGCTGGTACAGGACTGAAAATAGGGGAAGGTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATCAAATACATCATGCTGGTACAGGACTGAAAATAGGGGAAGGTTG  550

seq1  TGTGAGAGTGGAACCAGAAAGAACATGGGAAATCATGGTGGCTTCTATTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGAGTGGAACCAGAAAGAACATGGGAAATCATGGTGGCTTCTATTG  600

seq1  AACGTTGACTCAACGTTAAACTCCTATAGATACATGTATATGCTGGGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGTTGACTCAACGTTAAACTCCTATAGATACATGTATATGCTGGGTCT  650

seq1  ATTCCTTTCACTGATGATTACCCAGCCCCAAGTAGGACAACTATAGCAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCTTTCACTGATGATTACCCAGCCCCAAGTAGGACAACTATAGCAGC  700

seq1  AGCCCTCTAAGGTTCAGGAAACATGCCAGAAGATGGGTTAGAAAGGGTAA  750
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTCTAATGTTCAGGAAACATGCCAGAAGATGGGTTAGAAAGGGTAA  750

seq1  GAAGAGCCTGCAGACAGAGTGAAAGGGGTGGAGTTCTGTAAAAGACTGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGCCTGCAGACAGAGTGAAAGGGGTGGAGTTCTGTAAAAGACTGTC  800

seq1  TGTCTTTGTTGTAGCTCTGGTCACTAACACAAGATCTGTACAAGGTCCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTTGTTGTAGCTCTGGTCACTAACACAAGATCTGTACAAGGTCCAG  850

seq1  CCAATGACATCAGTGACCATTCCAACAGGCACCATGAATTTGGTTCAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGACATCAGTGACCATTCCAACAGGCACCATGAATTTGGTTCAATG  900

seq1  TGATAAAGACAAGAAGGAGAGGACACTAAGATGGGAAGGGGACATGCACA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAAAGACAAGAAGGAGAGGACACTAAGATGGGAAGGGGACATGCACA  950

seq1  GGGTGTTCAGAGATCATGAGAATGGGGAATAGGGTTGGGGAATGAACAAG  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GGGTGTTCAGAGATCATGAGAATGGGGAATAGGGTT-GGGAATGAACAAG  999

seq1  GTACACTGAATGCATCAATGAAATTGTCAAAGAATAAAAAAAATGTCCAT  1050
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| 
seq2  GTACACTGAATGCATCAATGAAATTGTC-AAGAATAAAAAAAATGTCCA-  1047

seq1  TTTTAAAGTTCACTTTTAAAAATGATGTGTTCTGTGGCATGCAAGTAACT  1100
       |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||
seq2  ATTTAAAGTTCACTTTT-AAAATGATGTG-TCTGTGCCATGCCAGTAACT  1095

seq1  GCTTGGTAAAGCAGTTGGATCATAAAAGAGCAAATGGATAATGTGCTGGA  1150
      || |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  GC-TGGT-AAGCAGT--GATCATAAAAGAGC-AATGGAT-ATGTGCTGGA  1139

seq1  CCTTGTCTGCCCAATAACCATACTTCTCCACACACCAGGATTCCTTGAAC  1200
      || || |||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||
seq2  CC-TGGCTGCCCAATAACCATACTTC-CCAC-CA-CAGGA-TCCTTGAAC  1184

seq1: chr8_118939465_118940549
seq2: B6Ng01-110B10.g_66_1131 (reverse)

seq1  GCAGTCATGCAGATTGGCATTTATACCTCCGTTTCTGAGATGTGGAATTT  50
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| 
seq2  GCAGTCATGCAGATTGGCATTTAT-CCTCCGTTTCTGAGAT-TGGGATTA  48

seq1  ACAACAGAGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGGACTCCACAAATAA  100
        ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  CAAACAGAGC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTGA-GGACT-CACAAATAA  92

seq1  TGGTTATTAAGCTTCAAGCTGCCTGGAGAGGAACCCAAGAGTTCAGGTGA  150
      ||| |||||||||   ||||||   |||||  ||||||||||||| ||||
seq2  TGG-TATTAAGCT--CAGCTGC--TGAGAG--ACCCAAGAGTTCA-GTGA  134

seq1  ATGAAGCTAGATGGTGAGGACCGTGAGGGATGAAACGGTCAGTCGGGAAG  200
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCTAGAT-GTGAGGACCGTGAGGGATGAAACGGTCAGTCGGGAAG  183

seq1  GAAAGGGCGTCCTGACGCAAAGCGAGTGCTTGTCTTGAGCTGGCATCGTA  250
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGCGT-CTGACGCAAAGCGAGTGC-TGTCTTGAGCTGGCATCGTA  231

seq1  TGCTTCGTTCTTGGATACGGCACACTCACCTCTAAAGGCAGGCAGCACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCGTTCTTGGATACGGCACACTCACCTCTAAAGGCAGGCAGCACAG  281

seq1  ACTCAGAGAGGGCATCAGTGCCAGCCATGTTGTTGGTGTCTGCTCCACGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGAGAGGGCATCAGTGCCAGCCATGTTGTTGGTGTCTGCTCCACGG  331

seq1  CAGCAAAACCCTAACTAAGATGCCCACCTTAACCAAGAGCCTGGCAATTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAAACCCTAACTAAGATGCCCACCTTAACCAAGAGCCTGGCAATTC  381

seq1  GGCTCAGTGCCCTGGCCTCCCACAGGAATCATGAACCGGCGCTCTGGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCAGTGCCCTGGCCTCCCACAGGAATCATGAACCGGCGCTCTGGATG  431

seq1  CTCTGCTCACAGCTCTCTAGGGTCACCGAATCATGAGGAATTGCACCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCTCACAGCTCTCTAGGGTCACCGAATCATGAGGAATTGCACCTCT  481

seq1  ATGCCTGAGGTTTATTTCTCTGGGCTGACTTACGCCTCAGGACCACAGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTGAGGTTTATTTCTCTGGGCTGACTTACGCCTCAGGACCACAGAC  531

seq1  ACTTCACTCACATCGTTTCATATCCAGGTGGAAGCTTAGCCTGGGGGGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCACTCACATCGTTTCATATCCAGGTGGAAGCTTAGCCTGGGGGGTG  581

seq1  GAGGTGGGGGGGGGAGCACTGCTAAGTGGCACTCTTCAAATGACTAAAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTGGGGGGGGGAGCACTGCTAAGTGGCACTCTTCAAATGACTAAAGA  631

seq1  AACATCCAAGGCCTGGACATAGCTACGGATGGCAGCCTTTCTTCTTATCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCCAAGGCCTGGACATAGCTACGGATGGCAGCCTTTCTTCTTATCC  681

seq1  ATAGCTAAACTAGAGGTCGTCCATCTCCATGAGGCTGAGGGCCCAGGAAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCTAAACTAGAGGTCGTCCATCTCCATGAGGCTGAGGGCCCAGGAAG  731

seq1  GTCAGGAGTTCTTCACTGCAAAAGAGTTTCAAGGAAGGGGGAAACCCCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGAGTTCTTCACTGCAAAAGAGTTTCAAGGAAGGGGGAAACCCCAC  781

seq1  ATTGACTTTTTGCCTAAGGAGGCTCAACCCTAGATGTGAACAGAGGTGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGACTTTTTGCCTAAGGAGGCTCAACCCTAGATGTGAACAGAGGTGAG  831

seq1  TTCAAATGTTGGCTCCATAGTCGCTAGAGAAAACGTATGTGACTGAGCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAATGTTGGCTCCATAGTCGCTAGAGAAAACGTATGTGACTGAGCCT  881

seq1  CAAGCATTGGGTCCTAGCCCAGAAAAAAACTCTGCATCTTCCTTCCCCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGCATTGGGTCCTAGCCCAGAAAAAAACTCTGCATCTTCCTTCCCCTG  931

seq1  CCCCAGGTCAGGTAGGACTTGTTTTAGGGCTTTGGGGTTGGAGGCCAGTG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGGTCAGGTAGGACTTGTTTTAGGGCTTTGGGGTTGGAGGCCAGTG  981

seq1  AATCTTTTTACTCTTTACAGAGCTCATAACTGACTTGTTGAGTGATTTAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTTTACTCTTTACAGAGCTCATAACTGACTTGTTGAGTGATTTAA  1031

seq1  ATAGGACAAATCATACGCATTCCATCATTGAATTC  1085
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGACAAATCATACGCATTCCATCATTGAATTC  1066