BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-118K20
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,824,701 - 118,979,074
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC384868
Upstream geneWwox, Maf
Downstream geneLOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-118K20.bB6Ng01-118K20.g
ACCDH923091DH923092
length1,1231,084
definitionDH923091|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118K20, 5' end.DH923092|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118K20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,824,701 - 118,825,464)(118,977,970 - 118,979,074)
sequence
gaattcattggcccatcctgcattttaaatgggccttttagtacaccatg
cactggtcatttggcaaatacgggcttcttatatcataggaatacttttc
aagtcattccacattgcattaatatctattttttttaatctgttaatgcc
accagtctcatctcccaaatatttgagttttcaaaagcgatggtgttccc
agttgcaaaatataaaatttcccaaaattcgacttgtctcttgaaggttg
ggctctcaccacgggcaacggatggcatcagttgttttcctgaaatgacg
ggctcgtttattcttttcccagaaactgtctgccaaacacccaagtctga
agagtcataatttgtctgtcagttgctcttccaagtgaaaatggtgttcc
gtaaataaatagcaagttcagctcacagctcagccacagcataaggagtt
ggctcgagccagtcaccacgctacactctgcacaggagagttttctgtat
gtgttcatcttatcggatctcaaatattaaaagatgtgaacacagaggtt
gagatttgatggcatttatcattgttactacttcatccagggcgttctaa
agagcgattgcttctgtttcttttctttttaattgtgatcatggcatgct
gaaggacaaggtagctgtttatatgcatggccacagctgctgggaagcct
tatgagttaccagcagggtgactcactgtgtcttttgtactatcaaagta
gcaagctatgagctgctgacaaaggtaaccacatctttatattgttaaaa
aaaaataatagtttggccctcaaaggccccctgagagatgctatgaacct
ttaagtgctagaggatcacactgtagtgagtctcaagaaactgggagatt
cagcagctcacctgatggtgatctggctgcaggcattccaactgtctctg
gtttgtttgtttgtttgtttgtttgttgtttatagaggatatgcttgtga
aaatatgactcaggtagacatatagatatcatagaaaaatggatcttatg
atcaagcatgattagggatttggatagactataaacctaattctgtgttc
tggagaggtgtgtatgtatcatg
gaattcatgaggaccacaagaagggagcctcacccttttaagacaaagtg
gttgaaactttgaatttttcaggagggtgacatatattttgaccaaacat
atcagggtttaaacacaccagctattaataaataacattccctgggaaag
caaactgtgatttgttggcagctactaagacttgaggccctgctacaaag
tgaaattgagggttgaatctggtgagactgtcagtattgaacactgagct
tttgatcaaacaaaacaagtctcaaatatttggttcttgctctgctattc
aaaggcttgatgtagaatctatagaacctgagcctacttaataccaatca
atcaaacaatcaaatggcaaagatagaccttgagttcaatgaacatggaa
gctataggagaaagtcaagtttggcttctttccaatcaaagaaaattcaa
ttattcttacttctagtgtccaattggaccacagaacatagaacaccaat
gtcagaattttagattttgctcacaaaagctttaacattcataatgtgtt
taggatcttgacagggtcttgtagctatcttgggacaattcttaatagta
cagataaggaaatgaaaggggctgtagctggagagggaaaagctgtgcct
ttgggtagacctgcatcctaatttcccctggccttgaggtgaggttgttg
tatcgatttgtggtcagtcatggttgagagccccattagaatggcaagag
tctaagaaacacaggctgttggtacatgctgctcgtctttgcccagttcc
tcatgttatccttatatctaaacacatgagatgacttttgatttgacata
ttggaacagttattggcagaactgggactagaaggaagataagaaattga
agaccccacccaccagagtctctttgtacgcagtgaacacagctgccatc
agtgacaggttctcaaggtatgggctgcatcagagcttcaacttggtgct
ctttctctgagtcactgaagacctgtctcctggagagacgaagagaaatg
tcacctcatctctgtgacatcttcctcatactga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_118824701_118825464
seq2: B6Ng01-118K20.b_425_1172

seq1  CTCTTCCAAGTGAAAATGGTGTTCCGTAAATAAATAGCAAGTTCAGCTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCCAAGTGAAAATGGTGTTCCGTAAATAAATAGCAAGTTCAGCTCA  50

seq1  CAGCTCAGCCACAGCATAAGGAGTTGGCTCGAGCCAGTCACCACGCTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCAGCCACAGCATAAGGAGTTGGCTCGAGCCAGTCACCACGCTACA  100

seq1  CTCTGCACAGGAGAGTTTTCTGTATGTGTTCATCTTATCGGATCTCAAAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGCACAGGAGAGTTTTCTGTATGTGTTCATCTTATCGGATCTCAAAT  150

seq1  ATTAAAAGATGTGAACACAGAGGTTGAGATTTGATGGCATTTATCATTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAGATGTGAACACAGAGGTTGAGATTTGATGGCATTTATCATTGT  200

seq1  TACTACTTCATCCAGGGCGTTCTAAAGAGCGATTGCTTCTGTTTCTTTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTACTTCATCCAGGGCGTTCTAAAGAGCGATTGCTTCTGTTTCTTTTC  250

seq1  TTTTTAATTGTGATCATGGCATGCTGAAGGACAAGGTAGCTGTTTATATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAATTGTGATCATGGCATGCTGAAGGACAAGGTAGCTGTTTATATG  300

seq1  CATGGCCACAGCTGCTGGGAAGCCTTATGAGTTACCAGCAGGGTGACTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCCACAGCTGCTGGGAAGCCTTATGAGTTACCAGCAGGGTGACTCA  350

seq1  CTGTGTCTTTTGTACTATCAAAGTAGCAAGCTATGAGCTGCTGACAAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTCTTTTGTACTATCAAAGTAGCAAGCTATGAGCTGCTGACAAAGG  400

seq1  TAACCACATCTTTATATTGTTAAAAAAAAATAATAGTTTGGCCCTCAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCACATCTTTATATTGTTAAAAAAAAATAATAGTTTGGCCCTCAAAG  450

seq1  GCCCCCTGAGAGATGCTATGAACCTTTAAGTGCTAGAGGATCACACTGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCCTGAGAGATGCTATGAACCTTTAAGTGCTAGAGGATCACACTGTA  500

seq1  GTGAGTCTCAAGAAACTGGGAGATTCAGCAGCTCACCTGATGGTGATCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGTCTCAAGAAACTGGGAGATTCAGCAGCTCACCTGATGGTGATCTG  550

seq1  GCTGCAGGCATTCCAACTGTCTTCTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTT  600
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGGCATTCCAACTGTC-TCTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTT  599

seq1  GTTTGTTTTATAGAGGATATGCTTGTTGAAAATATGACTCAGGGTAGACA  650
      |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||
seq2  GTT--GTTTATAGAGGATATGCTTG-TGAAAATATGACTCA-GGTAGACA  645

seq1  TATAAGATATTCATAGAAAAAATGGATC-TATGATCAAAGCCATGATTTA  699
      ||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||   ||||| |||
seq2  TAT-AGATA-TCATAG-AAAAATGGATCTTATGATCAA--GCATGA-TTA  689

seq1  GGGATTTGGATAGACTTATAAACTAATTTCTGTGTCCTGGATGTATGTGT  749
      ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||    |   ||
seq2  GGGATTTGGATAGAC-TATAAACCTAATTCTGTGTTCTGG----AGAGGT  734

seq1  GTGTATGTATACATG  764
      |||||||||| ||||
seq2  GTGTATGTAT-CATG  748

seq1: chr8_118977970_118979074
seq2: B6Ng01-118K20.g_67_1150 (reverse)

seq1  TCAGTAATTTGGAGGAAGGATGTCACAGAGATGAGTGTGACATGTCTTCT  50
      ||||||     |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||
seq2  TCAGTA----TGAGGAA-GATGTCACAGAGATGAG-GTGACATTTC-TCT  43

seq1  TCTGTCTTCTCCAGGAGAACAGGGTCTTCAGGTGACTCAGAAGAAAGAGC  100
      || ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  TC-GTC-TCTCCAGGAG-ACA-GGTCTTCA-GTGACTCAG-AGAAAGAGC  87

seq1  ACCAAGTTGGAGGCCTCCTGATGCAGCCCATACCTTGAGAAACCTGTTCA  150
      ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||
seq2  ACCAAGTTGAAG--CT-CTGATGCAGCCCATACCTTGAG-AACCTG-TCA  132

seq1  ACCTGATGGCAGCTGTGTTTCACTGCGTAACAAAGAGACTCTGGTGGGTG  200
        ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  --CTGATGGCAGCTGTG-TTCACTGCGT-ACAAAGAGACTCTGGTGGGTG  178

seq1  GGGTCTTCAATTTCTTATCTTCCTTCTAGTCCCAGTTCTGCCAATAACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCTTCAATTTCTTATCTTCCTTCTAGTCCCAGTTCTGCCAATAACTG  228

seq1  TTCCAATATGTCAAATCAAAAGTCATCTCATGTGTTTAGATATAAGGATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAATATGTCAAATCAAAAGTCATCTCATGTGTTTAGATATAAGGATA  278

seq1  ACATGAGGAACTGGGCAAAGACGAGCAGCATGTACCAACAGCCTGTG-TT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ACATGAGGAACTGGGCAAAGACGAGCAGCATGTACCAACAGCCTGTGTTT  328

seq1  CTTAGACTCTTGCCATTCTAATGGGGCTCTCAACCATGACTGACCACAAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGACTCTTGCCATTCTAATGGGGCTCTCAACCATGACTGACCACAAA  378

seq1  TCGATACAACAACCTCACCTCAAGGCCAGGGGAAATTAGGATGCAGGTCT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATACAACAACCTCACCTCAAGGCCAGGGGAAATTAGGATGCAGGTCT  428

seq1  ACCCAAAGGCACAGCTTTTCCCTCTCCAGCTACAGCCCCTTTCATTTCCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAAGGCACAGCTTTTCCCTCTCCAGCTACAGCCCCTTTCATTTCCT  478

seq1  TATCTGTACTATTAAGAATTGTCCCAAGATAGCTACAAGACCCTGTCAAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTGTACTATTAAGAATTGTCCCAAGATAGCTACAAGACCCTGTCAAG  528

seq1  ATCCTAAACACATTATGAATGTTAAAGCTTTTGTGAGCAAAATCTAAAAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTAAACACATTATGAATGTTAAAGCTTTTGTGAGCAAAATCTAAAAT  578

seq1  TCTGACATTGGTGTTCTATGTTCTGTGGTCCAATTGGACACTAGAAGTAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGACATTGGTGTTCTATGTTCTGTGGTCCAATTGGACACTAGAAGTAA  628

seq1  GAATAATTGAATTTTCTTTGATTGGAAAGAAGCCAAACTTGACTTTCTCC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAATTGAATTTTCTTTGATTGGAAAGAAGCCAAACTTGACTTTCTCC  678

seq1  TATAGCTTCCATGTTCATTGAACTCAAGGTCTATCTTTGCCATTTGATTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGCTTCCATGTTCATTGAACTCAAGGTCTATCTTTGCCATTTGATTG  728

seq1  TTTGATTGATTGGTATTAAGTAGGCTCAGGTTCTATAGATTCTACATCAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATTGATTGGTATTAAGTAGGCTCAGGTTCTATAGATTCTACATCAA  778

seq1  GCCTTTGAATAGCAGAGCAAGAACCAAATATTTGAGACTTGTTTTGTTTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTGAATAGCAGAGCAAGAACCAAATATTTGAGACTTGTTTTGTTTG  828

seq1  ATCAAAAGCTCAGTGTTCAATACTGACAGTCTCACCAGATTCAACCCTCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAAGCTCAGTGTTCAATACTGACAGTCTCACCAGATTCAACCCTCA  878

seq1  ATTTCACTTTGTAGCAGGGCCTCAAGTCTTAGTAGCTGCCAACAAATCAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCACTTTGTAGCAGGGCCTCAAGTCTTAGTAGCTGCCAACAAATCAC  928

seq1  AGTTTGCTTTCCCAGGGAATGTTATTTATTAATAGCTGGTGTGTTTAAAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGCTTTCCCAGGGAATGTTATTTATTAATAGCTGGTGTGTTTAAAC  978

seq1  CCTGATATGTTTGGTCAAAATATATGTCACCCTCCTGAAAAATTCAAAGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGATATGTTTGGTCAAAATATATGTCACCCTCCTGAAAAATTCAAAGT  1028

seq1  TTCAACCACTTTGTCTTAAAAGGGTGAGGCTCCCTTCTTGTGGTCCTCAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACCACTTTGTCTTAAAAGGGTGAGGCTCCCTTCTTGTGGTCCTCAT  1078

seq1  GAATTC  1105
      ||||||
seq2  GAATTC  1084