BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-119E10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 117,577,513 - 117,744,995
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWwox
Upstream geneNudt7, AI427515, Clec3a
Downstream geneMaf
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-119E10.bB6Ng01-119E10.g
ACCDH923535DH923536
length7881,038
definitionDH923535|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119E10, 5' end.DH923536|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-119E10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(117,744,208 - 117,744,995)(117,577,513 - 117,578,567)
sequence
gaattcaggtgaagaggcgaccttttagggtttccgagagggccagctca
atggcaagaaaccaagtcatcttgttagtaggaaaaagtgattctcttta
ctcagatttctatacaggatcaattatgacaccatgtgtggccatgcgga
acccacggctttcactaaaatgagatggttcgctccctaatgcgaagtcg
ggacatgctcacaatatcactttgagaaaaccatacttagtcctggttga
tgtaacttgtacaagtctcagcaaagcggcactggctcagatcctatgac
taatgatgcgatgtccaagatgcatctttaaaaaaatagatgacatgtag
aaagaagaaataaaacgctcgaaaggcatttgtttgcgctgttgaaaact
gggaactcgtagatatctaatgctagacttagagttaactgaagtctgac
atttattgttttatacaacaagaaccaaaacatgaccattagggactgga
gagatggctcagcatttaagagcacacactgctcttgcacaggaccaggg
ttcggttttcagtactcatctttggcagcttgcaactccccgtaacttct
gctccaggggatacaatacctttttccaacctccacacaaacttccactc
acatgtacccctccacatacatatatatacataatttttaaaaacttaaa
cataatcattaaaagcaacttcatatgtatttgaatatggttacaataga
agaaagctcattgccaagatatgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcaaggaggaaaatgagagattgagtataaagactatgggcttcgg
ggtcagactagagtttcaatacttggaaagggctggtttgctcattgggc
aggtcttcgtgagcatacggagtgtgttaattagtcttctcatagctccc
acagaatgttcaacaggaacacattaagggaaaatgcctttatccttggc
tcacagtttccaacagaatttttaaatcatggtcaggatggcataacttc
atctgtggtagtgtgtggtggtttgaatatgcttggtccatagagatcag
cactgttagggggcatgaccttgttggaggaagtgtgtcactgtgtgggt
aggctttggaggtctcctcctagttgcctgcagaaaacagtctgtcctgg
ttgcctttgaatcaagatgcagaactctcagctccttctccagcaccatg
tctgcctgcatgctgccatgatacttgctatgatgatagtggactgaacc
cctgaaactgtaagccagctccaattgcccccatatcaattcacttttgt
cagccagaccccatgtctccatttcacctcaggtatacgtttcagacaag
ggcaaaaagcagcttcactcttcaccaaaccatcacaagaactgtgccta
ggccacattcttctctgaatcgtcttaagccagggccccacagttcaaac
caccctcagcaccagtgtcttccatgctccacctagttatggcccattaa
gccctgcttaaagcatcccactgctttccaacccaaagtctcacagtcca
catttctccaaacaaagtagggttaggcctgtcacagcaagacccgagtc
cctagcactcacttctgtcttagaagagacaccatgactacagcaactct
tataaaggcagcgtttataggagcttgcttacatttcagagctttagtca
ttgtgtgcagaagcgtgacgcacacagacagatatactggtacagcagaa
gagagtactgatcctggctgagcctggactgaaagtcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_117744208_117744995
seq2: B6Ng01-119E10.b_45_832 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACATATCTTGGCAATGAGCTTTCTTCTATTGTAACC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACATATCTTGGCAATGAGCTTTCTTCTATTGTAACC  50

seq1  ATATTCAAATACATATGAAGTTGCTTTTAATGATTATGTTTAAGTTTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCAAATACATATGAAGTTGCTTTTAATGATTATGTTTAAGTTTTTA  100

seq1  AAAATTATGTATATATATGTATGTGGAGGGGTACATGTGAGTGGAAGTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATTATGTATATATATGTATGTGGAGGGGTACATGTGAGTGGAAGTTT  150

seq1  GTGTGGAGGTTGGAAAAAGGTATTGTATCCCCTGGAGCAGAAGTTACGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGAGGTTGGAAAAAGGTATTGTATCCCCTGGAGCAGAAGTTACGGG  200

seq1  GAGTTGCAAGCTGCCAAAGATGAGTACTGAAAACCGAACCCTGGTCCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTGCAAGCTGCCAAAGATGAGTACTGAAAACCGAACCCTGGTCCTGT  250

seq1  GCAAGAGCAGTGTGTGCTCTTAAATGCTGAGCCATCTCTCCAGTCCCTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAGCAGTGTGTGCTCTTAAATGCTGAGCCATCTCTCCAGTCCCTAA  300

seq1  TGGTCATGTTTTGGTTCTTGTTGTATAAAACAATAAATGTCAGACTTCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCATGTTTTGGTTCTTGTTGTATAAAACAATAAATGTCAGACTTCAG  350

seq1  TTAACTCTAAGTCTAGCATTAGATATCTACGAGTTCCCAGTTTTCAACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTCTAAGTCTAGCATTAGATATCTACGAGTTCCCAGTTTTCAACAG  400

seq1  CGCAAACAAATGCCTTTCGAGCGTTTTATTTCTTCTTTCTACATGTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAAACAAATGCCTTTCGAGCGTTTTATTTCTTCTTTCTACATGTCATC  450

seq1  TATTTTTTTAAAGATGCATCTTGGACATCGCATCATTAGTCATAGGATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTTTAAAGATGCATCTTGGACATCGCATCATTAGTCATAGGATCT  500

seq1  GAGCCAGTGCCGCTTTGCTGAGACTTGTACAAGTTACATCAACCAGGACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGTGCCGCTTTGCTGAGACTTGTACAAGTTACATCAACCAGGACT  550

seq1  AAGTATGGTTTTCTCAAAGTGATATTGTGAGCATGTCCCGACTTCGCATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTATGGTTTTCTCAAAGTGATATTGTGAGCATGTCCCGACTTCGCATT  600

seq1  AGGGAGCGAACCATCTCATTTTAGTGAAAGCCGTGGGTTCCGCATGGCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAGCGAACCATCTCATTTTAGTGAAAGCCGTGGGTTCCGCATGGCCA  650

seq1  CACATGGTGTCATAATTGATCCTGTATAGAAATCTGAGTAAAGAGAATCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGGTGTCATAATTGATCCTGTATAGAAATCTGAGTAAAGAGAATCA  700

seq1  CTTTTTCCTACTAACAAGATGACTTGGTTTCTTGCCATTGAGCTGGCCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTCCTACTAACAAGATGACTTGGTTTCTTGCCATTGAGCTGGCCCT  750

seq1  CTCGGAAACCCTAAAAGGTCGCCTCTTCACCTGAATTC  788
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGGAAACCCTAAAAGGTCGCCTCTTCACCTGAATTC  788

seq1: chr8_117577513_117578567
seq2: B6Ng01-119E10.g_73_1110

seq1  GAATTCAAGGAGGAAAATGAGAGATTGAGTATAAAGACTATGGGCTTCGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGAGGAAAATGAGAGATTGAGTATAAAGACTATGGGCTTCGG  50

seq1  GGTCAGACTAGAGTTTCAATACTTGGAAAGGGCTGGTTTGCTCATTGGGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAGACTAGAGTTTCAATACTTGGAAAGGGCTGGTTTGCTCATTGGGC  100

seq1  AGGTCTTCGTGAGCATACGGAGTGTGTTAATTAGTCTTCTCATAGCTCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTCGTGAGCATACGGAGTGTGTTAATTAGTCTTCTCATAGCTCCC  150

seq1  ACAGAATGTTCAACAGGAACACATTAAGGGAAAATGCCTTTATCCTTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAATGTTCAACAGGAACACATTAAGGGAAAATGCCTTTATCCTTGGC  200

seq1  TCACAGTTTCCAACAGAATTTTTAAATCATGGTCAGGATGGCATAACTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTTTCCAACAGAATTTTTAAATCATGGTCAGGATGGCATAACTTC  250

seq1  ATCTGTGGTAGTGTGTGGTGGTTTGAATATGCTTGGTCCATAGAGATCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTGGTAGTGTGTGGTGGTTTGAATATGCTTGGTCCATAGAGATCAG  300

seq1  CACTGTTAGGGGGCATGACCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACTGTGTGGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTTAGGGGGCATGACCTTGTTGGAGGAAGTGTGTCACTGTGTGGGT  350

seq1  AGGCTTTGGAGGTCTCCTCCTAGTTGCCTGCAGAAAACAGTCTGTCCTGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTTGGAGGTCTCCTCCTAGTTGCCTGCAGAAAACAGTCTGTCCTGG  400

seq1  TTGCCTTTGAATCAAGATGCAGAACTCTCAGCTCCTTCTCCAGCACCATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTTTGAATCAAGATGCAGAACTCTCAGCTCCTTCTCCAGCACCATG  450

seq1  TCTGCCTGCATGCTGCCATGATACTTGCTATGATGATAGTGGACTGAACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTGCATGCTGCCATGATACTTGCTATGATGATAGTGGACTGAACC  500

seq1  CCTGAAACTGTAAGCCAGCTCCAATTGCCCCCATATCAATTCACTTTTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAAACTGTAAGCCAGCTCCAATTGCCCCCATATCAATTCACTTTTGT  550

seq1  CAGCCAGACCCCATGTCTCCATTTCACCTCAGGTATACGTTTCAGACAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCAGACCCCATGTCTCCATTTCACCTCAGGTATACGTTTCAGACAAG  600

seq1  GGCAAAAAGCAGCTTCACTCTTCACCAAACCATCACAAGAACTGTGCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAAAAGCAGCTTCACTCTTCACCAAACCATCACAAGAACTGTGCCTA  650

seq1  GGCCACATTCTTCTCTGAATCGTCTTAAGCCAGGGCCCCACAGTTCAAAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCACATTCTTCTCTGAATCGTCTTAAGCCAGGGCCCCACAGTTCAAAC  700

seq1  CACCCTCAGCACCAGTGTCTTCCATGCTCCACCTAGTTATGGCCCATTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTCAGCACCAGTGTCTTCCATGCTCCACCTAGTTATGGCCCATTAA  750

seq1  GCCCTGCTTAAAGCATCCCACTGCTTTCCCAACCCAAAGTCTCACAGTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTGCTTAAAGCATCCCACTGCTTT-CCAACCCAAAGTCTCACAGTCC  799

seq1  ACATTTCTCCAAACAAAAGTAGGGTCAGGCCTGTCACAGCAAGACCCGAG  850
      |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTCTCCAAAC-AAAGTAGGGTTAGGCCTGTCACAGCAAGACCCGAG  848

seq1  TCCCTAGCACTCACTTCTGTCTTAGAAGAGACACCATGACTACAGCAACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTAGCACTCACTTCTGTCTTAGAAGAGACACCATGACTACAGCAACT  898

seq1  CTTATAAAGGCAAGCGTTTAATAGGAGCTTGCTTACATTTCAGAGCTTTA  950
      ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAAAGGC-AGCGTTT-ATAGGAGCTTGCTTACATTTCAGAGCTTTA  946

seq1  GTCCATTGTCGTGGCAGGAAGCGTGACCGCACACAGACAGATATACTGGG  1000
      || |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||
seq2  GT-CATTGT-GT-GCA-GAAGCGTGA-CGCACACAGACAGATATACT-GG  990

seq1  TACAGCAGGAAGAGAAGTACTGATCCTGGCCTGAGCCTTGGAAACCTGAA  1050
      ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||   |||||
seq2  TACAGCA-GAAGAG-AGTACTGATCCTGG-CTGAGCC-TGGA---CTGAA  1033

seq1  AGTCC  1055
      |||||
seq2  AGTCC  1038