BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-125F13
Chromosome8 (Build37)
Map Location 84,038,887 - 84,160,300
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneFrem3, Smarca5, Gab1, LOC666237, LOC100039496, LOC234501, LOC100039518, Usp38, EG70793, LOC236010, LOC384852
Downstream geneInpp4b, LOC671182, Il15, EG666564
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-125F13.bB6Ng01-125F13.g
ACCDH928009DH928010
length1,1161,085
definitionDH928009|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125F13, 5' end.DH928010|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125F13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(84,159,182 - 84,160,300)(84,038,887 - 84,039,975)
sequence
gaattccctagaccaaattggcctgtaaccatgtgggtgggggattgtct
tgatttctaactggcaatggagagctcagccctctgtgggtgttataatt
ttttggacaggaggtcctgagctgtatgaggaagccagctgaggatgagc
ctccatgagtcaagaagcacctttcccctggagtttctgctgtactcact
tggatgcgctttagttacctagtccagagaaacactgcataaaatagaaa
gtaggcttgactttgatttcctgcctggacttccagcagtgatggactat
gacctgacaacataaatcaaatagaagcttttacctactaagttactttt
ggtcaaagtgccttatcccagctacagaaatgagatagaccctgttttaa
tgtgcaatttaaagttgtggtcattggcctttgcccaaaattgaaatgac
tctttagaagcatgagaatgttgctgctagttgagtttgattatgcttat
cagcaaaaagtggaaagataattgaactgcatttataacacacacacaca
tacacacacaagcacacagacaaacatacacacacacacacacacacaca
cacacggccttggacatccactttgagcatatccagactcccctcagcac
actatgtatttgttctgtgatgtgatttgttctgttccacttgtagtccc
cacattttatacagatttactgtagggttgtgctaaaatgcatgcactta
acaactgtgatcaactttttaacaagtagtgactactcacattgggtatg
tctcctgctctgtttcctcacacactgatttttgtcttgtaaccagggac
cactgacagttgcatagaggttgtgtaaaatgtaagtgacaacatggcca
tgtcggctaatattttaaagttttaaagaagtgatcaagtcattaacact
taatatcaggacaatgagtgtagtccatagattgtgcaggaaatgcaagt
agtaaattttgactaaaattggcgagttctgagtcatcactggttctgaa
ggtgtatggcatggcagtgggagaaatacaggttcaaatgcatggaagag
agtgaattgatagggt
gaattcactttcccttcctcttttgcaaaggtatcacagacacattgaag
tccccgtgacagaaaggttacttttccctctgagctatttcaccaggctt
tgatagaaatgtggtgacattgcaactgctgataacatcaggataagaag
agggtggtgatggtcccattgtccttgatgtctggtgatgaatctgggca
catgattcctcttaagtgcttatccctgttcggttctgcaggtcagctga
gcctcatatacaggacagaatgcatcattatctatcaggacttgaatagg
cagactgacaaaagacaagtcactttctataaacccctttctcggtattg
tctaaaaatatctttgagggaaatgtggctggtgtgttgctggggtgtct
gagctcatttcttagtcctggctgtgctatgtgaagagctcactgtcatc
actgcccagaatggaaaggggatgctgggatgtgttttaagagtttaaat
tagcttctctaatgaagatgaagcagccaggggaggccctctaggttgag
aggaggtgaccacttacctttccttctctggcccttctgccatttctcca
gctgctctctgcaggagagctctgatttcttacaagattgtttccatgtt
aaatcgacactaaatcaagagcacagtgagcccccaacatacatagtctt
tttaagtgaagaaaattttgcagcagtcaggtatcctgtggggactgatg
gagaagcagggagacaactaataaaacctacccaagaggctggcacaaga
agaagtaaaagagtatcaagattagttaaaaaccctcaacccatccccac
agatcttttctgtacaatatcagctagaattacttaccttaacatgattt
ttcttattctaaaagaatccaaaagaccttcttgaaatctttctccccat
gctacagccatgtcaggcactccaggtcatcctgattctacctgtggata
ccttgtgactcaaagtttatccaggtggtccgtgccttgcacacgtcatc
tcatatatccatggaactaataaaaatgttccatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_84159182_84160300
seq2: B6Ng01-125F13.b_47_1162 (reverse)

seq1  ACCCTATCACTCCACTCTC-TCATTGCAATAAGAACC--TATTTCTCCCA  47
      ||||||||| | ||||||| ||  ||| ||  |||||  |||||||||||
seq2  ACCCTATCAATTCACTCTCTTCCATGC-ATTTGAACCTGTATTTCTCCCA  49

seq1  CTGCCCATTGCCAT-CACCTTCAGAACCAGTGATGACTCAGAACTCGCCA  96
      |||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCC--ATGCCATACACCTTCAGAACCAGTGATGACTCAGAACTCGCCA  97

seq1  ATTTTAGTCAAAATTTACTACTTGCATTTTCCTGCACAATCTATGGACTA  146
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAGTCAAAATTTACTACTTGCA-TTTCCTGCACAATCTATGGACTA  146

seq1  CACTCATTGTCCTGATATTTAAGTGTTATTGACTTGATCACTTCTTTTAA  196
      ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  CACTCATTGTCCTGATA-TTAAGTGTTAATGACTTGATCACTTC-TTTAA  194

seq1  AACTTTAAAAATATTAGCCAACATGGCAATGTTGTCACTTACATTATAAC  246
      |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||
seq2  AACTTT-AAAATATTAGCCGACATGGCCATGTTGTCACTTACATT-TTAC  242

seq1  ACAACCTCTATGCAACTGTTCAGTGGTCCCTGGTTACAAGAC-AAAATCA  295
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACAACCTCTATGCAACTG-TCAGTGGTCCCTGGTTACAAGACAAAAATCA  291

seq1  GTGTGTGAGGAAACAGAGCAGGAGACATACCCAATGTGAGTAGTCACTAC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGAGGAAACAGAGCAGGAGACATACCCAATGTGAGTAGTCACTAC  341

seq1  TTGTT-AAAAGTTGATCACAGTTGTTAAGTGCATGCATTTTAGCACAACC  394
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTAAAAAGTTGATCACAGTTGTTAAGTGCATGCATTTTAGCACAACC  391

seq1  CTACAGTAAATCTGTATAAAATGTGGGGACTACAAGTGGAACAGAACAAA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGTAAATCTGTATAAAATGTGGGGACTACAAGTGGAACAGAACAAA  441

seq1  TCACATCACAGAACAAATACATAGTGTGCTGAGGGGAGTCTGGATATGCT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCACAGAACAAATACATAGTGTGCTGAGGGGAGTCTGGATATGCT  491

seq1  CAAAGTGGATGTCCAAGGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTGGATGTCCAAGGCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAT  541

seq1  GTTTGTCTGTGTGCTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTATAAATGCAGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTCTGTGTGCTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTTATAAATGCAGT  591

seq1  TCAATTATCTTTCCACTTTTTGCTGATAAGCATAATCAAACTCAACTAGC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATTATCTTTCCACTTTTTGCTGATAAGCATAATCAAACTCAACTAGC  641

seq1  AGCAACATTCTCATGCTTCTAAAGAGTCATTTCAATTTTGGGCAAAGGCC  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACATTCTCATGCTTCTAAAGAGTCATTTCAATTTTGGGCAAAGGCC  691

seq1  AATGACCACAACTTTAAATTGCACATTAAAACAGGGTCTATCTCATTTCT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACCACAACTTTAAATTGCACATTAAAACAGGGTCTATCTCATTTCT  741

seq1  GTAGCTGGGATAAGGCACTTTGACCAAAAGTAACTTAGTAGGTAAAAGCT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTGGGATAAGGCACTTTGACCAAAAGTAACTTAGTAGGTAAAAGCT  791

seq1  TCTATTTGATTTATGTTGTCAGGTCATAGTCCATCACTGCTGGAAGTCCA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTGATTTATGTTGTCAGGTCATAGTCCATCACTGCTGGAAGTCCA  841

seq1  GGCAGGAAATCAAAGTCAAGCCTACTTTCTATTTTATGCAGTGTTTCTCT  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGGAAATCAAAGTCAAGCCTACTTTCTATTTTATGCAGTGTTTCTCT  891

seq1  GGACTAGGTAACTAAAGCGCATCCAAGTGAGTACAGCAGAAACTCCAGGG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAGGTAACTAAAGCGCATCCAAGTGAGTACAGCAGAAACTCCAGGG  941

seq1  GAAAGGTGCTTCTTGACTCATGGAGGCTCATCCTCAGCTGGCTTCCTCAT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGTGCTTCTTGACTCATGGAGGCTCATCCTCAGCTGGCTTCCTCAT  991

seq1  ACAGCTCAGGACCTCCTGTCCAAAAAATTATAACACCCACAGAGGGCTGA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCTCAGGACCTCCTGTCCAAAAAATTATAACACCCACAGAGGGCTGA  1041

seq1  GCTCTCCATTGCCAGTTAGAAATCAAGACAATCCCCCACCCACATGGTTA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTCCATTGCCAGTTAGAAATCAAGACAATCCCCCACCCACATGGTTA  1091

seq1  CAGGCCAATTTGGTCTAGGGAATTC  1119
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCAATTTGGTCTAGGGAATTC  1116

seq1: chr8_84038887_84039975
seq2: B6Ng01-125F13.g_67_1151

seq1  GAATTCACTTTCCCTTCCTCTTTTGCAAAGGTATCACAGACACATTGAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTCCCTTCCTCTTTTGCAAAGGTATCACAGACACATTGAAG  50

seq1  TCCCCGTGACAGAAAGGTTACTTTTCCCTCTGAGCTATTTCACCAGGCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCGTGACAGAAAGGTTACTTTTCCCTCTGAGCTATTTCACCAGGCTT  100

seq1  TGATAGAAATGTGGTGACATTGCAACTGCTGATAACATCAGGATAAGAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGAAATGTGGTGACATTGCAACTGCTGATAACATCAGGATAAGAAG  150

seq1  AGGGTGGTGATGGTCCCATTGTCCTTGATGTCTGGTGATGAATCTGGGCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGTGATGGTCCCATTGTCCTTGATGTCTGGTGATGAATCTGGGCA  200

seq1  CATGATTCCTCTTAAGTGCTTATCCCTGTTCGGTTCTGCAGGTCAGCTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATTCCTCTTAAGTGCTTATCCCTGTTCGGTTCTGCAGGTCAGCTGA  250

seq1  GCCTCATATACAGGACAGAATGCATCATTATCTATCAGGACTTGAATAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCATATACAGGACAGAATGCATCATTATCTATCAGGACTTGAATAGG  300

seq1  CAGACTGACAAAAGACAAGTCACTTTCTATAAACCCCTTTCTCGGTATTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTGACAAAAGACAAGTCACTTTCTATAAACCCCTTTCTCGGTATTG  350

seq1  TCTAAAAATATCTTTGAGGGAAATGTGGCTGGTGTGTTGCTGGGGTGTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAAATATCTTTGAGGGAAATGTGGCTGGTGTGTTGCTGGGGTGTCT  400

seq1  GAGCTCATTTCTTAGTCCTGGCTGTGCTATGTGAAGAGCTCACTGTCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCATTTCTTAGTCCTGGCTGTGCTATGTGAAGAGCTCACTGTCATC  450

seq1  ACTGCCCAGAATGGAAAGGGGATGCTGGGATGTGTTTTAAGAGTTTAAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCCCAGAATGGAAAGGGGATGCTGGGATGTGTTTTAAGAGTTTAAAT  500

seq1  TAGCTTCTCTAATGAAGATGAAGCAGCCAGGGGAGGCCCTCTAGGTTGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTCTCTAATGAAGATGAAGCAGCCAGGGGAGGCCCTCTAGGTTGAG  550

seq1  AGGAGGTGACCACTTACCTTTCCTTCTCTGGCCCTTCTGCCATTTCTCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGTGACCACTTACCTTTCCTTCTCTGGCCCTTCTGCCATTTCTCCA  600

seq1  GCTGCTCTCTGCAGGAGAGCTCTGATTTCTTACAAGATTGTTTCCATGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTCTCTGCAGGAGAGCTCTGATTTCTTACAAGATTGTTTCCATGTT  650

seq1  AAATCGACACTAAATCAAGAGCACAGTGAGCCCCCAACATACATAGTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCGACACTAAATCAAGAGCACAGTGAGCCCCCAACATACATAGTCTT  700

seq1  TTTAAGTGAAGAAAATTTTGCAGGCAGTCAGGTATCCTGTGGGGACTGAT  750
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTGAAGAAAATTTTGCA-GCAGTCAGGTATCCTGTGGGGACTGAT  749

seq1  GGAGAAGCAGGGAGACAACTAATAAAACCTACCCAAGAGGCTGGCACAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAGCAGGGAGACAACTAATAAAACCTACCCAAGAGGCTGGCACAAG  799

seq1  AAGAAGTAAAAGAGTATCAAGATTAGTTAAAAACCCTTCACCCATCCCCA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
seq2  AAGAAGTAAAAGAGTATCAAGATTAGTTAAAAACCCTCAACCCATCCCCA  849

seq1  CAGATCTTTTCTGTACAATATCAGCTAGAATTACTTACCTT-ACATGATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  CAGATCTTTTCTGTACAATATCAGCTAGAATTACTTACCTTAACATGATT  899

seq1  TTTCCTAATCTAAAAGAAT-CAAAAGACCATC-TGAAATCTTTCTCCCCA  947
      |||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||
seq2  TTTCTTATTCTAAAAGAATCCAAAAGACCTTCTTGAAATCTTTCTCCCCA  949

seq1  TGCTACAGCCATGTCAGGGCACTCCAGGTCATCCTGATTCTACCTGTGGG  997
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGCTACAGCCATGTCA-GGCACTCCAGGTCATCCTGATTCTACCTGT-GG  997

seq1  ATACCTTGTGACTCAAAGGTCTAATCCAGTGTGTCCGTGCCTTGCAACAC  1047
      ||||||||||||||||||   | ||||||   ||||||||||||| ||||
seq2  ATACCTTGTGACTCAAAG--TTTATCCAGGTGGTCCGTGCCTTGC-ACAC  1044

seq1  AGTCATCTCATATATTCATGGATCAATAAAAAATGTTCCATT  1089
       |||||||||||||| |||||| | |  ||||||||||||||
seq2  -GTCATCTCATATATCCATGGAACTAATAAAAATGTTCCATT  1085