BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-125N05
Chromosome8 (Build37)
Map Location 58,065,930 - 58,239,616
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneGm392, LOC100040212, Gm1153, EG664808, EG664818, EG664834, EG664859, EG664876, LOC100040356
Downstream geneLOC664916, Adam29, Glra3, LOC664812, Hpgd, LOC664948, BC088983, Fbxo8, LOC100040431, EG624433
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-125N05.bB6Ng01-125N05.g
ACCDH928353DH928354
length1,138989
definitionDH928353|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125N05, 5' end.DH928354|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-125N05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(58,065,930 - 58,067,075)(58,238,622 - 58,239,616)
sequence
gaattcacagctgtaacacatttcactgtcttcaatatgtatcagagatg
gttttctgtttatttctgcttttagaacatatatcatctggcctctttgt
gatacttctttatatgcttcaactatttatttgattgatatttgttccct
ttagtctccctagtttgagctcagaaatggtctaagaattcatttaagaa
ctctcagtgaaaccagttatgtgttttctattttctttggttgaaaatca
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aacagtggtatgaaagcatccttatttagggctgagcaatcactgactta
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aaacagactcaatttagctaaccttcatatatacttaaatacaaatacct
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tagtttcaatctaatattcacaaaaaggagtataatatcaagtatatgca
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gccttgaaggatttggagatgttattctatctcctggagaacagtcggtt
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ataagtaatttgttgacaaaaataccagtaatagatttgttaaaaataat
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agatatgtagactctctaccacgcatattatatatatatatatattttta
tatatatatatatatatatatatatatatataccacacatattatatatc
gctatataaatagctggaagatttaaaaaattatttgtcaacgataatat
aaattctctaactactgtggtttcattgaaaactttctaaacataaatga
ttgactactgtttgttctatgcattatattatctggtcttttcacttatt
tccaacgaacttaaatgctattaaaagaaaggtttagtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_58065930_58067075
seq2: B6Ng01-125N05.b_49_1186

seq1  GAATTCACAGCTGTAACACATTTCACTGTCTTCAATATGTATCAGAGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCTCCCTAGTTTGAGCTCAGAAATGGTCTAAGAATTCATTTAAGAA  200

seq1  CTCTCAGTGAAACCAGTTATGTGTTTTCTATTTTCTTTGGTTGAAAATCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  AACGAACTGGAATGGCACAAAACAGAAGAGCAACTACCAAAGGAAAAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGAACTGGAATGGCACAAAACAGAAGAGCAACTACCAAAGGAAAAGCC  450

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGCACAGACACAGAGATTAACACTTTTATACTCAGATAGACCATA  500

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TAAAATCAAGACATGGCAATGTACGTTGAGACAGAAAACCTCCAAAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATCAAGACATGGCAATGTACGTTGAGACAGAAAACCTCCAAAAATG  600

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGAGATTGTTTTGTGTTGACCATCTACTTCTGTGCATGGGATCTGA  650

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACTTGGGGTTTGTATACTCAATGACACTCCATATAAGAAGTCTAAT  700

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCTTTTTTAAGCAGTGATGATATGGAGATAGTTTCTGAGTAATGAT  750

seq1  TTTAAATGAAGTTAGGATAGCTACAGTAATTTAGTTATGCCGTGCACCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTATTATAAAAGCAATTAAGAGTTTATGACGAACTATTTTTATTAA  850

seq1  TTATATTTGTTCTTTGTTGCCTACATTTTAATTAAACATTTTGATTATTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTATATTTGTTCTTTGTTGCCTACATTTTAA-TAAACATTTTGATTATTC  899

seq1  CCACTCTCACATCCCCCATCTTCCCTATCTCTCTCTTACTTTTGTCAACT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCTCACATCCCCCATCTTCCCTATCTCTCTCTTACTTTTGTCAACT  949

seq1  TCCCTCCCTACAGGTTTTTTTATTCCATGTTAACGTCATGTCTTTAATTT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTCCCTACAGGTTTTTTTATTCCATGTTAACGTCATGTCTTTAATTT  999

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      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TAACAGTGGTATGAAAGCATCCTTATTTAGGGCTGAGCAATC-ACTGACT  1048

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      ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||
seq2  TATACTCAA-ACATTGAGC-ACCAAGG-TCTGTTCATTGTAATTCACTCC  1095

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      ||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATTTC-ATGT-TAGAAAAG-AATTATGATTAATACCAAGAAT-CTTT  1138

seq1: chr8_58238622_58239616
seq2: B6Ng01-125N05.g_70_1058 (reverse)

seq1  CACTAAACCTTTTCTTTTAACTAGCATTTAAGTTCATTGGAAATATGTGA  50
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| 
seq2  CACTAAACC-TTTCTTTTAA-TAGCATTTAAGTTCGTTGGAAATAAGTG-  47

seq1  AAAAGACCAGATAAATATAATGCATAGAAACAAACAGTAGTCAATCATTT  100
      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACCAGAT-AATATAATGCATAG-AACAAACAGTAGTCAATCATTT  95

seq1  ATGTTTAGAAAGGTTTTCAATGAAACCACAGTAGTTAGAGAATTTATATT  150
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTAGAAA-GTTTTCAATGAAACCACAGTAGTTAGAGAATTTATATT  144

seq1  ATCGTTGACAAATAATTTTTTTAAAATCTT-CAGCTATTTATATAGTGAT  199
      |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||
seq2  ATCGTTGACAAATAATTTTTT--AAATCTTCCAGCTATTTATATAGCGAT  192

seq1  ATATAATATGTGTGGTATATATATATATATATATATATATATATATATAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATATGTGTGGTATATATATATATATATATATATATATATATATAA  242

seq1  AAATATATATATATATATAATATGCGTGGTAGAGAGTCTACATATCTACA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATATATATATATATAATATGCGTGGTAGAGAGTCTACATATCTACA  292

seq1  TGACAATTTCTTCTTTTGAACACC-AAAATAATTTGCATTTTTAAAAATT  348
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATTTCTTCTTTTGAACACCAAAAATAATTTGCATTTTTAAAAATT  342

seq1  ATTTTTAACAAATCTATTACTGGTATTTTTGTCAACAAATTACTTATATA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAACAAATCTATTACTGGTATTTTTGTCAACAAATTACTTATATA  392

seq1  TATATATATATATGAACAACTAAGTGTCTTCACATATTAATTTGCTCAGA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATGAACAACTAAGTGTCTTCACATATTAATTTGCTCAGA  442

seq1  GTATAGTTGTAATTCAGATTTTCAGGCTGAAAAGTTGTCTAAATAGACCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGTTGTAATTCAGATTTTCAGGCTGAAAAGTTGTCTAAATAGACCA  492

seq1  TCCATGGCAAGACTCTGGTAAATTTCCACTATAGAAGGAACAACTTGAAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGGCAAGACTCTGGTAAATTTCCACTATAGAAGGAACAACTTGAAC  542

seq1  CGACTGTTCTCCAGGAGATAGAATAACATCTCCAAATCCTTCAAGGCAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACTGTTCTCCAGGAGATAGAATAACATCTCCAAATCCTTCAAGGCAAA  592

seq1  ATAGAACTTCTTAATTAACTTTTATGAGTTTAAATATCAAGTAGATGTGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAACTTCTTAATTAACTTTTATGAGTTTAAATATCAAGTAGATGTGC  642

seq1  ATATACTTGATATTATACTCCTTTTTGTGAATATTAGATTGAAACTATAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACTTGATATTATACTCCTTTTTGTGAATATTAGATTGAAACTATAA  692

seq1  TTAAAATGTATGTGTTGCTATTTTTATTTCTTGTCATTGGTCACAGTCAT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  CAATAGATACTATGGATAAGAAGATTAAAAATCTTCAAAAAATTTACAAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGATACTATGGATAAGAAGATTAAAAATCTTCAAAAAATTTACAAA  792

seq1  TAACTCGTTATTGGCTGTTAAATTTTATGTGTAGTGTTTTATCACCAATG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTCGTTATTGGCTGTTAAATTTTATGTGTAGTGTTTTATCACCAATG  842

seq1  AGTTATATTTTATCATGTTCTATAAATGTCACCTTTTATTGATTTTGAGG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATAATGTTAACTAGAAAATTATTTACAGAAATTTGTGGTAGGAATTC  995
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGTTAACTAGAAAATTATTTACAGAAATTTGTGGTAGGAATTC  989