BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129N10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 113,323,695 - 113,498,630
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2010004A03Rik, Sf3b3, Cog4, Fuk, St3gal2
Upstream geneAp1g1, Phlppl, Marveld3, LOC100041884, Tat, Chst4, Zfp612, Gm1467, Calb2, BC025546, Hydin, LOC672398, Vac14, BC060632
Downstream geneDdx19a, Ddx19b, Aars, Exosc6, Mrcl, 4930402E16Rik, 9430091E24Rik, Glg1, Rfwd3, LOC547023, Mlkl, Fa2h, Wdr59, Znrf1, Ldhd, Zfp1, Ctrb1, Bcar1, Cfdp1, Tmem170, Chst5, 4932417I16Rik, Gabarapl2, Adat1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129N10.bB6Ng01-129N10.g
ACCDH931318DH931319
length837822
definitionDH931318|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129N10, 5' end.DH931319|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129N10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(113,497,792 - 113,498,630)(113,323,695 - 113,324,510)
sequence
gaattcttgggtcagagttggaacatttgaagtcataattcaccaactct
gtagtattctcctactttttttgttgtttgagataagttctcactgtgta
gccctaattgtctttgaactcggaaatctgcctgcctctgcctcctaaat
gcttggattaaatgggtttatattatcaaattttaaaaaattatgtatag
tgtttgtactggctgtatgcatgctaaaagagggcattagatttcattac
agatggctatgaatccatgtggttgctgagaattgaactcaggactctgg
gtcagagcagcccatgcttttaacctctgagccatctctgcagcctttat
attatcagtttttaaaactttgccaatctaggagctggagagaagactca
atagtcaggagcacttgctgcccttataaaggacctttgtttgagtccca
gtgcccacatcatgtcaggtcattcacaactgcctggtacttcctttgct
tcagaggaagctggtacctctgctgtccttgggcacctggcagtcatgta
tactccactcccagagatgtaagttactttcaatcccagtgctctggtga
caagatcagtagttcctgaatatccggagttatattaagagaacatggct
caaaaacagaattaaaaccatctttcttgggagtcatttttatgttcatt
tagatcttaagatgttgtattggtgctcacctgtgaacctcgacagtgaa
ataaatatcatctgagcccagaattcaggatttagcctatacacaatagg
aaaggacatagatcaaacaaaacatgtttagactctt
gaattccttccaccagggcagtcgctgtgcacgcctttaatcccagcact
tggaaggcagaggcagtcggatctacagatcaagtttcgggacatccaaa
gctaaacactgtcttggaaaaagaaattccttcctataacaacttaatta
gaacatggtaatggttttaattagaacatggatagtttgataaagatcat
gcacaaatagacaacgtgcatataaaaaggtcattcactaaccaccatag
aaacataaataaataaatgcctcctagagacaccatacttccatcaggat
ggctattatcaacagtgactgccagaaaataaacttcaataaggatgtgg
agacatgggacccacaagcagtggtgcctcaaaaaaaattgaaaataaaa
ttattagcgtagggtccagcaaaagaactgaaggtagggctggagagatg
gctcagcggttaagcgggagcgtgctggctatcaaggatgatgaagggtt
gatgagctggggccaggggaagatttagaggacacctgagtgaccaggcc
agacaagagactgggtcctagttgcagaatcttgggtcacagttaggcct
ttcttgggctgtgaaagctgatgggcagataccctggaaaggtttaaagt
gggagctggagagatggctcagtggttaaggggcactgactgctcttcct
tgattcaattccccagcaaccacatggttagctcacaaccatctgtaatg
ggggtctgatgtcctctttttggtgtgtctgaaacagctacctttgtact
catatagacagctatataaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_113497792_113498630
seq2: B6Ng01-129N10.b_47_883 (reverse)

seq1  AAGAGTCTAAACATGTTTTGTTTGATCTTTGTCCTTTCCTATTGTTGTAT  50
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||
seq2  AAGAGTCTAAACATGTTTTGTTTGATCTATGTCCTTTCCTATTG-TGTAT  49

seq1  AGGCTAAATCCCTGAATTCTGGGCTCAGTTGATATTTATTTCACTGTCGA  100
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAAAT-CCTGAATTCTGGGCTCAGATGATATTTATTTCACTGTCGA  98

seq1  GGTTCACAGGTGAGCACCAATACAACATCTTAAGATCTAAATGAACATAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCACAGGTGAGCACCAATACAACATCTTAAGATCTAAATGAACATAA  148

seq1  AAATGACTCCCAAGAAAGATGGTTTTAATTCTGTTTTTGAGCCATGTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGACTCCCAAGAAAGATGGTTTTAATTCTGTTTTTGAGCCATGTTCT  198

seq1  CTTAATATAACTCCGGATATTCAGGAACTACTGATCTTGTCACCAGAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAATATAACTCCGGATATTCAGGAACTACTGATCTTGTCACCAGAGCA  248

seq1  CTGGGATTGAAAGTAACTTACATCTCTGGGAGTGGAGTATACATGACTGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGATTGAAAGTAACTTACATCTCTGGGAGTGGAGTATACATGACTGC  298

seq1  CAGGTGCCCAAGGACAGCAGAGGTACCAGCTTCCTCTGAAGCAAAGGAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGCCCAAGGACAGCAGAGGTACCAGCTTCCTCTGAAGCAAAGGAAG  348

seq1  TACCAGGCAGTTGTGAATGACCTGACATGATGTGGGCACTGGGACTCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGGCAGTTGTGAATGACCTGACATGATGTGGGCACTGGGACTCAAA  398

seq1  CAAAGGTCCTTTATAAGGGCAGCAAGTGCTCCTGACTATTGAGTCTTCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGTCCTTTATAAGGGCAGCAAGTGCTCCTGACTATTGAGTCTTCTC  448

seq1  TCCAGCTCCTAGATTGGCAAAGTTTTAAAAACTGATAATATAAAGGCTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCTCCTAGATTGGCAAAGTTTTAAAAACTGATAATATAAAGGCTGC  498

seq1  AGAGATGGCTCAGAGGTTAAAAGCATGGGCTGCTCTGACCCAGAGTCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGGCTCAGAGGTTAAAAGCATGGGCTGCTCTGACCCAGAGTCCTG  548

seq1  AGTTCAATTCTCAGCAACCACATGGATTCATAGCCATCTGTAATGAAATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAATTCTCAGCAACCACATGGATTCATAGCCATCTGTAATGAAATC  598

seq1  TAATGCCCTCTTTTAGCATGCATACAGCCAGTACAAACACTATACATAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGCCCTCTTTTAGCATGCATACAGCCAGTACAAACACTATACATAAT  648

seq1  TTTTTAAAATTTGATAATATAAACCCATTTAATCCAAGCATTTAGGAGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAATTTGATAATATAAACCCATTTAATCCAAGCATTTAGGAGGC  698

seq1  AGAGGCAGGCAGATTTCCGAGTTCAAAGACAATTAGGGCTACACAGTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGGCAGATTTCCGAGTTCAAAGACAATTAGGGCTACACAGTGAG  748

seq1  AACTTATCTCAAACAACAAAAAAAGTAGGAGAATACTACAGAGTTGGTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTATCTCAAACAACAAAAAAAGTAGGAGAATACTACAGAGTTGGTGA  798

seq1  ATTATGACTTCAAATGTTCCAACTCTGACCCAAGAATTC  839
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGACTTCAAATGTTCCAACTCTGACCCAAGAATTC  837

seq1: chr8_113323695_113324510
seq2: B6Ng01-129N10.g_68_889

seq1  GAATTCCTTCCACCAGGGCAGTCGCTGTGCACGCCTTTAATCCCAGCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTCCACCAGGGCAGTCGCTGTGCACGCCTTTAATCCCAGCACT  50

seq1  TGGAAGGCAGAGGCAGTCGGATCTACAGATCAAGTTTCGGGACATCCAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGGCAGAGGCAGTCGGATCTACAGATCAAGTTTCGGGACATCCAAA  100

seq1  GCTAAACACTGTCTTGGAAAAAGAAATTCCTTCCTATAACAACTTAATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAACACTGTCTTGGAAAAAGAAATTCCTTCCTATAACAACTTAATTA  150

seq1  GAACATGGTAATGGTTTTAATTAGAACATGGATAGTTTGATAAAGATCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATGGTAATGGTTTTAATTAGAACATGGATAGTTTGATAAAGATCAT  200

seq1  GCACAAATAGACAACGTGCATATAAAAAGGTCATTCACTAACCACCATAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAATAGACAACGTGCATATAAAAAGGTCATTCACTAACCACCATAG  250

seq1  AAACATAAATAAATAAATGCCTCCTAGAGACACCATACTTCCATCAGGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATAAATAAATAAATGCCTCCTAGAGACACCATACTTCCATCAGGAT  300

seq1  GGCTATTATCAACAGTGACTGCCAGAAAATAAACTTCAATAAGGATGTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTATTATCAACAGTGACTGCCAGAAAATAAACTTCAATAAGGATGTGG  350

seq1  AGACATGGGACCCACAAGCAGTGGTGCCTCAAAAAAAATTGAAAATAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATGGGACCCACAAGCAGTGGTGCCTCAAAAAAAATTGAAAATAAAA  400

seq1  TTATTAGCGTAGGGTCCAGCAAAAGAACTGAAGGTAGGGCTGGAGAGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTAGCGTAGGGTCCAGCAAAAGAACTGAAGGTAGGGCTGGAGAGATG  450

seq1  GCTCAGCGGTTAAGCGGGAGCGTGCTGGCTATCAAGGATGATGAAGGGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCGGTTAAGCGGGAGCGTGCTGGCTATCAAGGATGATGAAGGGTT  500

seq1  GATGAGCTGGGGCCAGGGGAAGATTTAGAGGACACCTGAGTGACCAGGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGCTGGGGCCAGGGGAAGATTTAGAGGACACCTGAGTGACCAGGCC  550

seq1  AGACAAGAGACTGGGTCCTAGTTGCAGAATCTTGGGTCACAGTTAGGCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGAGACTGGGTCCTAGTTGCAGAATCTTGGGTCACAGTTAGGCCT  600

seq1  TTCTTGGGCTGTGAAAGCTGATGGGCAGATACCCTGGAAAGGTTTAAAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGGCTGTGAAAGCTGATGGGCAGATACCCTGGAAAGGTTTAAAGT  650

seq1  GGGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAA-GGGCACTGACTGCTCTTCCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGCTGGAGAGATGGCTCAGTGGTTAAGGGGCACTGACTGCTCTTCCT  700

seq1  GAGTTCAATT-CCCAGCAACCACATGG-TAGCTCACAACCATCTGTAAT-  746
         ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| 
seq2  TGATTCAATTCCCCAGCAACCACATGGTTAGCTCACAACCATCTGTAATG  750

seq1  GGGGTCTGATGCCCTC-TTTTGGTGTGTCTGAAGACAGCTA-CATTGTAC  794
      ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||
seq2  GGGGTCTGATGTCCTCTTTTTGGTGTGTCTGAA-ACAGCTACCTTTGTAC  799

seq1  TCATATAAACAGC-AAATAAAAA  816
      ||||||| ||||| | |||||||
seq2  TCATATAGACAGCTATATAAAAA  822