BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132B07
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,902,918 - 119,086,352
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2
Upstream geneMaf
Downstream geneCdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan, 4933407C03Rik, Plcg2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132B07.bB6Ng01-132B07.g
ACCDH932975DH932976
length963546
definitionDH932975|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132B07, 5' end.DH932976|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132B07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,085,390 - 119,086,352)(118,902,918 - 118,903,469)
sequence
gaattccagtatttgcttatttaattattattttgtatcaaacaaagttt
ttgttgttgttgttgttgttgttgttgtttaatttggaggggctggggag
atggctcagtggtcacgaacgcttgtcgctcttgcagagtgctgggatgc
agttctcagaagccttcacagtggcccacagtccacagtggctcacagtc
cacagtggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacagt
cccatgggcccacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacagt
ccacagtggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacag
tcccatgggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacag
tcccatgggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacag
tccacagtggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcaca
gtccacagtggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctcac
agtccacagtggctcacagtcccatgggctcacagtccacagtggctcac
agtccacagtggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctca
cagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacagtcccatgggctca
cagtccacagtggctcacagtccacagtggctcacagtccacagtggctc
acagtcccatgggctcacagtccacagtggctcacagtcccatgggctca
catccacagtggctcacagttcacagtggctcacagtccacagtggcttc
acagtccacagggctcaacagtccacagtgtcttcacagtccacagtgct
caacagtcccatgggctcacagtccacatgctcaacagtcccacatgtct
cacagtcccatgg
acatttttaagttggcatgtgtcaaactgagcgaacgactttatgcaaat
gcagcaaaaaacagagccccccaaaagtcatcttcattaggctcatttca
acagatctaatattaattcccaggcaacaacactctttgcgatgaaaaga
cttgattactctataggggcttcagtgaatagagcctctgctcagccacc
tccaccacctcccccagggctgagaacagctctctcccttccttccatcc
cttccttcattccccactttcttcctcccactcccccttcttccctccca
ccctcccttccttattcctcttcccttccttttccctccctttctttccc
tccttccttccctttctccctccctccttccctttcttccttctctcctt
ccctggttctctccttcctctaattctttccacttcttaaaaaagtgctc
ttatctttagtgtgagaatactagcaatgtatctacagagaagccccaac
cttggcaacagggtcacagagcactggggggttgggggggatgagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_119085390_119086352
seq2: B6Ng01-132B07.b_47_1009 (reverse)

seq1  CCATGGGACTGTGAGCCACTGT-GGACTG-TGAGCCACTGTGGACTGTGA  48
      ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||   ||||||||||||
seq2  CCATGGGACTGTGAGACA-TGTGGGACTGTTGAGC--ATGTGGACTGTGA  47

seq1  GCCCATGGGACTG-TGAGCCACTGTGGACTGTG-AGCCACTGTGGACTG-  95
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||| 
seq2  GCCCATGGGACTGTTGAG-CACTGTGGACTGTGAAGACACTGTGGACTGT  96

seq1  TGAGCCACTGTGGACTGTG-AGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  144
      |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGAGCC-CTGTGGACTGTGAAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGAAC  145

seq1  TGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  194
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCACTGTGGA-TGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  194

seq1  TGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  244

seq1  TGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGAC  294

seq1  TGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGA  344

seq1  CTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCCATGGGA  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCCATGGGA  394

seq1  CTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGG  444

seq1  ACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTG  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTG  494

seq1  GACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGT  544

seq1  GGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGT  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGT  594

seq1  GGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGT  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGTGAGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGT  644

seq1  GGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTG  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTG  694

seq1  TGGACTGTGGGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGTGGGCCCATGGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTG  744

seq1  TGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGGGCCACT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGAGCCACTGTGGACTGTGGGCCACT  794

seq1  GTGAAGGCTTCTGAGAACTGCATCCCAGCACTCTGCAAGAGCGACAAGCG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGGCTTCTGAGAACTGCATCCCAGCACTCTGCAAGAGCGACAAGCG  844

seq1  TTCGTGACCACTGAGCCATCTCCCCAGCCCCTCCAAATTAAACAACAACA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGTGACCACTGAGCCATCTCCCCAGCCCCTCCAAATTAAACAACAACA  894

seq1  ACAACAACAACAACAACAAAAACTTTGTTTGATACAAAATAATAATTAAA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAACAACAACAACAAAAACTTTGTTTGATACAAAATAATAATTAAA  944

seq1  TAAGCAAATACTGGAATTC  963
      |||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAAATACTGGAATTC  963

seq1: chr8_118902918_118903469
seq2: B6Ng01-132B07.g_68_619

seq1  GAATTCACATTTTTAAGTTGGCATGTGTCAAACTGAGCGAACGACTTTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACATTTTTAAGTTGGCATGTGTCAAACTGAGCGAACGACTTTAT  50

seq1  GCAAATGCAGCAAAAAACAGAGCCCCCCAAAAGTCATCTTCATTAGGCTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAATGCAGCAAAAAACAGAGCCCCCCAAAAGTCATCTTCATTAGGCTC  100

seq1  ATTTCAACAGATCTAATATTAATTCCCAGGCAACAACACTCTTTGCGATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCAACAGATCTAATATTAATTCCCAGGCAACAACACTCTTTGCGATG  150

seq1  AAAAGACTTGATTACTCTATAGGGGCTTCAGTGAATAGAGCCTCTGCTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGACTTGATTACTCTATAGGGGCTTCAGTGAATAGAGCCTCTGCTCA  200

seq1  GCCACCTCCACCACCTCCCCCAGGGCTGAGAACAGCTCTCTCCCTTCCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCTCCACCACCTCCCCCAGGGCTGAGAACAGCTCTCTCCCTTCCTT  250

seq1  CCATCCCTTCCTTCATTCCCCACTTTCTTCCTCCCACTCCCCCTTCTTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCCTTCCTTCATTCCCCACTTTCTTCCTCCCACTCCCCCTTCTTCC  300

seq1  CTCCCACCCTCCCTTCCTTATTCCTCTTCCCTTCCTTTTCCCTCCCTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCACCCTCCCTTCCTTATTCCTCTTCCCTTCCTTTTCCCTCCCTTTC  350

seq1  TTTCCCTCCTTCCTTCCCTTTCTCCCTCCCTCCTTCCCTTTCTTCCTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTCCTTCCTTCCCTTTCTCCCTCCCTCCTTCCCTTTCTTCCTTCT  400

seq1  CTCCTTCCCTGGTTCTCTCCTTCCTCTAATTCTTTCCACTTCTTAAAAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCCCTGGTTCTCTCCTTCCTCTAATTCTTTCCACTTCTTAAAAAA  450

seq1  GTGCTCTTATCTTTAGTGTGAGAATACTAGCAATGTATCTACAGAGAAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTTATCTTTAGTGTGAGAATACTAGCAATGTATCTACAGAGAAGC  500

seq1  CCCAACCTTGGCAACAGGGTCACAGAGCACTGGGGGGTTGGGGGGGATGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACCTTGGCAACAGGGTCACAGAGCACTGGGGGGTTGGGGGGGATGA  550

seq1  GG  552
      ||
seq2  GG  552