BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134M10
Chromosome8 (Build37)
Map Location 118,586,184 - 118,703,687
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneWwox, Maf
Downstream geneLOC384868, LOC668233, Dynlrb2, Cdyl2, LOC100043053, 2310061C15Rik, 2610510J17Rik, BC060631, 1700030J22Rik, Gcsh, Pkd1l2, Bcmo1, Gan
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134M10.bB6Ng01-134M10.g
ACCDH934988DH934989
length1,1261,037
definitionDH934988|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134M10, 5' end.DH934989|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134M10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,702,552 - 118,703,687)(118,586,184 - 118,587,227)
sequence
gaattcagctaagatgtcatctttgcaagataggagcttgtctgatttca
tgtcttgggaagcttccaaatgattggcatagacagtggcttccaacctg
tgggtcacaaccatgttgagggtcaaacaaccctttcacagggtcacata
tcaaatattctgtatattatatatttacaagtcataacggtagcaaaatt
acagttataaagcagcaataaaataattttatggttgagagtcaccacca
catgaggaacatgtagggttgcatcattagaaagattgagaaccactgat
gtgggaggtggtggttcacttttatagtgaactgaaagacatttccttcc
agagatagtagaagcatgacttttaaatcttggtcctctattcttgacct
ctgcattagagatattgggacacctcattgaactaggacaagggtgaaat
gagttgcactggggatcataggaactatatgagacagggtaaatcagggc
acagtcaccagaatctcatgtaggatgttctggctcattttgtgtgtcaa
cttgatacaagctaggattatcacagagaaaggggcctccctggaggaaa
tgcctctatgagatccagctgtaagacattttctcaattagtgatcaagg
gtgggagggcccagcccattgtgggtggcaccatccctgagctggtgggc
ctgggttatataagaaatcaggttgagcaagccaggggaagcaatccagt
aagcagcacccctccatgacctctgcatcagctcctgcctccaagttcct
gccctgtgtgagttcctatacagacttcctttggtgatgaaccacaatgt
ggaagtgtaagttgaataaaccctttcttttccaacttgcttcttggtca
tgatgtttgtgctggaatagaaaccctgactaagacatagtatagtcttc
attctatcagcttttgaatttcctggccatatagaaaccgtgatgtctat
actgaacaacattttgttttaggagtctcattgtatctccacattacagt
ttgagggctttctattccaagagctgctggctttgtctccgtagccataa
gtatatgcctcaatcctagcactgaa
gaattcattccttaaacatgtgaaacctggctgcaggtaattgctttaag
ttagtgctaggggaactaggaaatggccctacccatatatatccagtaag
atgaaaacttagagcaaacacaggacagtaagtttcaaattccccaagtc
tatatcctctgaccttccttcccatctgaaaccaaacggagcagggccat
catccagaaatgttacctggtgctcacacatatgtaaaaaaatgaatatc
actgtttttgcattttggagtttctacaacaaacagcaatcactgggtgg
caagaagcaaccaaacccccttttctgacagttctgaagaccagaggttt
taagtcatggtttcagcagggacaggctcttcaagtccttccttgaacct
tcctagctcttggtcgagggccacaagctttgctgtgccccccccccccc
cagctatgatccagctgctgcatgggcctggtttcagcgtgcatgttcac
tggtttgtctgtgtatcaccttctattgcaggtgtctctccaaagccttt
cttttggtggtgttgtatgtcatcagagaataacaaccaccctaatctta
tctagacttgattactgtgaagtaactttggtcccaaacaaggccatata
ttgagggaatgggggatatatttttatgtatcttcttaattatattttaa
cttatttattggtcagtatatgccaaggctctcatgcacaggtcaaagga
caacttgtgagagttgatcttctcctctcactatgtgcatcccagaagac
tgacctcaggtatcgtgtcccatggctttttccacccgagccatctctgg
cagccttcagtgtacgtctcagtgaaggaatagacatctctttaacccct
actttgctaagaccagtgtcctcatgagttttagccattttcatggtata
gactgtgggtctgaaatgcaaaagtcatggatgcataggtgaggtgtccc
tgtgcatttaattattctcccccaaatgcattgagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_118702552_118703687
seq2: B6Ng01-134M10.b_47_1172 (reverse)

seq1  TTCA-TGCTAGGATTGTAGGCATATAATTTATGGCTACTGAGGACAAAGC  49
      |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||
seq2  TTCAGTGCTAGGATTG-AGGCATAT-ACTTATGGCTACGGA-GACAAAGC  47

seq1  CAGCAGCTCTTTGGATAGGAAGCCCTTCAAACCTGTAATTGTGGAGATAC  99
      ||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||
seq2  CAGCAGCTCTTGGAATAGAAAGCCC-TCAAA-CTGTAA-TGTGGAGATAC  94

seq1  ATGGAGACTTCTAAAACAAAATGTTGTTTCAGTATAAGACATTCACGGTT  149
      |  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||
seq2  AATGAGACTCCTAAAACAAAATGTTG-TTCAGTAT-AGACA-TCACGGTT  141

seq1  TCTATATTGCCAGGAAAATTCAAAAGCTGATAGAATG-AGACTTATACTA  198
      ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||
seq2  TCTATATGGCCAGG-AAATTCAAAAGCTGATAGAATGAAGAC-TATACTA  189

seq1  TGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCAGCACAAAACATCATGACCAAGAAGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTAGTCAGGGTTTCTATTCCAGCAC-AAACATCATGACCAAGAAGC  238

seq1  AAGTTGGGAAAGAAAGGGTTTATTCAACTTACACTTCCACATTGTGGTTC  298
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTGGAAAAGAAAGGGTTTATTCAACTTACACTTCCACATTGTGGTTC  288

seq1  ATCACCAAAGGAAGTCTGTATAGGAACTCACACAGGGCAGGAACTTGGAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCAAAGGAAGTCTGTATAGGAACTCACACAGGGCAGGAACTTGGAG  338

seq1  GCAGGAGCTGATGCAGAGGTCATGGAGGGGTGCTGCTTACTGGATTGCTT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGAGCTGATGCAGAGGTCATGGAGGGGTGCTGCTTACTGGATTGCTT  388

seq1  CCCCTGGCTTGCTCAACCTGATTTCTTATATAACCCAGGCCCACCAGCTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGGCTTGCTCAACCTGATTTCTTATATAACCCAGGCCCACCAGCTC  438

seq1  AGGGATGGTGCCACCCACAATGGGCTGGGCCCTCCCACCCTTGATCACTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGGTGCCACCCACAATGGGCTGGGCCCTCCCACCCTTGATCACTA  488

seq1  ATTGAGAAAATGTCTTACAGCTGGATCTCATAGAGGCATTTCCTCCAGGG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGAAAATGTCTTACAGCTGGATCTCATAGAGGCATTTCCTCCAGGG  538

seq1  AGGCCCCTTTCTCTGTGATAATCCTAGCTTGTATCAAGTTGACACACAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCCCTTTCTCTGTGATAATCCTAGCTTGTATCAAGTTGACACACAAA  588

seq1  ATGAGCCAGAACATCCTACATGAGATTCTGGTGACTGTGCCCTGATTTAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCCAGAACATCCTACATGAGATTCTGGTGACTGTGCCCTGATTTAC  638

seq1  CCTGTCTCATATAGTTCCTATGATCCCCAGTGCAACTCATTTCACCCTTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCTCATATAGTTCCTATGATCCCCAGTGCAACTCATTTCACCCTTG  688

seq1  TCCTAGTTCAATGAGGTGTCCCAATATCTCTAATGCAGAGGTCAAGAATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGTTCAATGAGGTGTCCCAATATCTCTAATGCAGAGGTCAAGAATA  738

seq1  GAGGACCAAGATTTAAAAGTCATGCTTCTACTATCTCTGGAAGGAAATGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACCAAGATTTAAAAGTCATGCTTCTACTATCTCTGGAAGGAAATGT  788

seq1  CTTTCAGTTCACTATAAAAGTGAACCACCACCTCCCACATCAGTGGTTCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGTTCACTATAAAAGTGAACCACCACCTCCCACATCAGTGGTTCT  838

seq1  CAATCTTTCTAATGATGCAACCCTACATGTTCCTCATGTGGTGGTGACTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATCTTTCTAATGATGCAACCCTACATGTTCCTCATGTGGTGGTGACTC  888

seq1  TCAACCATAAAATTATTTTATTGCTGCTTTATAACTGTAATTTTGCTACC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAACCATAAAATTATTTTATTGCTGCTTTATAACTGTAATTTTGCTACC  938

seq1  GTTATGACTTGTAAATATATAATATACAGAATATTTGATATGTGACCCTG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATGACTTGTAAATATATAATATACAGAATATTTGATATGTGACCCTG  988

seq1  TGAAAGGGTTGTTTGACCCTCAACATGGTTGTGACCCACAGGTTGGAAGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAAGGGTTGTTTGACCCTCAACATGGTTGTGACCCACAGGTTGGAAGC  1038

seq1  CACTGTCTATGCCAATCATTTGGAAGCTTCCCAAGACATGAAATCAGACA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGTCTATGCCAATCATTTGGAAGCTTCCCAAGACATGAAATCAGACA  1088

seq1  AGCTCCTATCTTGCAAAGATGACATCTTAGCTGAATTC  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCCTATCTTGCAAAGATGACATCTTAGCTGAATTC  1126

seq1: chr8_118586184_118587227
seq2: B6Ng01-134M10.g_69_1105

seq1  GAATTCATTCCTTAAACATGTGAAACCTGGCTGCAGGTAATTGCTTTAAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTCCTTAAACATGTGAAACCTGGCTGCAGGTAATTGCTTTAAG  50

seq1  TTAGTGCTAGGGGAACTAGGAAATGGCCCTACCCATATATATCCAGTAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTGCTAGGGGAACTAGGAAATGGCCCTACCCATATATATCCAGTAAG  100

seq1  ATGAAAACTTAGAGCAAACACAGGACAGTAAGTTTCAAATTCCCCAAGTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAACTTAGAGCAAACACAGGACAGTAAGTTTCAAATTCCCCAAGTC  150

seq1  TATATCCTCTGACCTTCCTTCCCATCTGAAACCAAACGGAGCAGGGCCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATCCTCTGACCTTCCTTCCCATCTGAAACCAAACGGAGCAGGGCCAT  200

seq1  CATCCAGAAATGTTACCTGGTGCTCACACATATGTAAAAAAATGAATATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAGAAATGTTACCTGGTGCTCACACATATGTAAAAAAATGAATATC  250

seq1  ACTGTTTTTGCATTTTGGAGTTTCTACAACAAACAGCAATCACTGGGTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTTTTGCATTTTGGAGTTTCTACAACAAACAGCAATCACTGGGTGG  300

seq1  CAAGAAGCAACCAAACCCCCTTTTCTGACAGTTCTGAAGACCAGAGGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAAGCAACCAAACCCCCTTTTCTGACAGTTCTGAAGACCAGAGGTTT  350

seq1  TAAGTCATGGTTTCAGCAGGGACAGGCTCTTCAAGTCCTTCCTTGAACCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCATGGTTTCAGCAGGGACAGGCTCTTCAAGTCCTTCCTTGAACCT  400

seq1  TCCTAGCTCTTGGTCGAGGGCCACAAGCTTTGCTGTGCCCCCCCCCCCCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGCTCTTGGTCGAGGGCCACAAGCTTTGCTGTGCCCCCCCCCCCCC  450

seq1  CAGCTATGATCCAGCTGCTGCATGGGCCTGGTTTCAGCGTGCATGTTCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTATGATCCAGCTGCTGCATGGGCCTGGTTTCAGCGTGCATGTTCAC  500

seq1  TGGTTTGTCTGTGTATCACCTTCTATTGCAGGTGTCTCTCCAAAGCCTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGTCTGTGTATCACCTTCTATTGCAGGTGTCTCTCCAAAGCCTTT  550

seq1  CTTTTGGTGGTGTTGTATGTCATCAGAGAATAACAACCACCCTAATCTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGGTGGTGTTGTATGTCATCAGAGAATAACAACCACCCTAATCTTA  600

seq1  TCTAGACTTGATTACTGTGAAGTAACTTTGGTCCCAAACAAGGCCATATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGACTTGATTACTGTGAAGTAACTTTGGTCCCAAACAAGGCCATATA  650

seq1  TTGAGGGAATGGGGGATATATTTTTATGTATCTTCTTAATTATATTTTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGGGAATGGGGGATATATTTTTATGTATCTTCTTAATTATATTTTAA  700

seq1  CTTATTTATTGGTCAGTATATGCCAAGGCTCTCATGCACAGGTCAAAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTATTGGTCAGTATATGCCAAGGCTCTCATGCACAGGTCAAAGGA  750

seq1  CAACTTGTGAGAGTTGATCTTCTCCTCTCACTATGTGCATCCCAGAAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTGTGAGAGTTGATCTTCTCCTCTCACTATGTGCATCCCAGAAGAC  800

seq1  TGACCTCAGGTCATCGTGTCCCATGGCTTTTTCCACCCGAGCCATCTCT-  849
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  TGACCTCAGGT-ATCGTGTCCCATGGCTTTTTCCACCCGAGCCATCTCTG  849

seq1  GCAGCCCTCAGTGTAACGTCTCAAGTG-AGGAATAGACATCTC-TTAACC  897
      |||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||
seq2  GCAGCCTTCAGTGT-ACGTCTC-AGTGAAGGAATAGACATCTCTTTAACC  897

seq1  CCTACTTTGCTAAGACCAGTGTCTCTATGAGTTTTAGCCATTTTCAATGT  947
      |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| 
seq2  CCTACTTTGCTAAGACCAGTGTCCTCATGAGTTTTAGCCATTTTC-ATGG  946

seq1  TATAGACTGTGGTTCTGAAATGCAAAAGTCATGGATGCATTAGGGTGAGG  997
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||
seq2  TATAGACTGTGGGTCTGAAATGCAAAAGTCATGGATGCAT--AGGTGAGG  994

seq1  ATGTACACAGTGCATTTAATTAGTTCTTCCCCCAAATGCATTGAGCA  1044
       ||| | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||
seq2  -TGT-CCCTGTGCATTTAATTA-TTC-TCCCCCAAATGCATTGAGCA  1037