BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-141D13
Chromosome8 (Build37)
Map Location 110,953,919 - 111,094,706
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneWwp2, LOC100042812, Psmd7, LOC100041744, LOC668038
Downstream geneAtbf1, 4922502B01Rik, Gm1943, LOC100042829, Pmfbp1, Dhx38, Txnl4b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-141D13.bB6Ng01-141D13.g
ACCDH939732DH939733
length885887
definitionDH939732|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141D13, 5' end.DH939733|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-141D13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(111,094,085 - 111,094,706)(110,953,919 - 110,954,801)
sequence
gaattctatccctgagactcacggtatgcgaagagatccaacctttcaga
gttgtcctctgacatccacacaggcactgtggcatgcctgttgtccccat
taaacaaataaatgtacttgtaaagaactttaaaatcttataatttaaat
atttattttggccaggtggtggtggtggtgcacacctttaatcctagcac
tctggaggcagacgaaggtggatctctataaatacaaggccagcttggtc
tacagggtgagctccaggacagccaaggctacacagagaatcctgtcttg
aaaaaccaatatatctatgtctatatccacccacccatccatccatccat
ccatccatccatccatccatccatccatccatccatccacctatcatcta
tctatctaatctatctagtctgtctgtctgtctgtctaatctatcctggt
gataaagcctctctttgtagcttaggctgccccctaactcatggtcctcc
tgcctcagtcactcaagtattggggtttcatggatggatcatcatgcctg
ccttgtgtgcagtttttacatggctggggtgagggaggaatgggaaaaag
taatcaagaagttacagttaagtacaactcagaagttctattatgctacc
acacagtgggaggctatagatatctatgcatcctgcatatcacaaaacct
tagtaaaaggattctcagtgttttttctataaagcagctataaccatttg
aggagacagttacatggtgacacaatgtattgaaacatcacaaggctccc
catctgcaagtacaacttttatatatttatatacgtttgaaattaattca
tttaaaaattaaaatacattctttaattctgtgta
gaattcacagtgccttgtacattcgtagctgcaagtgctttcggcaactt
cccatgaagcctctccacagtgctgttcacaacaggtcagcgtgcctcat
cagacgaggattagacaaggcgaacaggctttggttttatgacccttggc
tcttgacatcttgtgttcgttagaagtgacatgaagcctcagtcaaggag
caacataatgcctgccccctgagagtgaagtataagaataaggggtaggg
ggcagtgtagatgaccctagacaaagccaagacagagacttatagaagta
tctagaattttcttctttcagagagcaatgagaaatttttagagaatttg
aggcagggggatctggtgaaggctaaatttttaaaaagtaaagaaccagg
gatgttaaaagataaaagggaggggtgctgagcctcagggctgaacgtgg
gaggaagaactacctcagctaattcactactcagtacaggccatgactcc
catctacatcagctaaaatgttctcagtggaacccgattacctccacatt
tctgtcagctggactggggccaatctgctgttttcaatggcttttcgaat
ctggaatagagggttccctatagcataaacatttcttggggaaactctcc
aggatgtatgtagatggatgacctcagctctgaaactctcctacccacat
cctacagtcgttattggtgttgctgtgatctgttatctttctgttgagtt
ttctctaagctaaaaccaggtacaacaagaatttcaagaaccatgtgttt
tgaaggtgatgctctgaaatattaataggggaaatgaggggatggaccag
aaactcatagagtcagttgagtgagtgagttgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_111094085_111094706
seq2: B6Ng01-141D13.b_51_676 (reverse)

seq1  TGTACTTAACTGTAACTTCTTGATTACTTTTTCCCATTCCTCCCTCACCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACTTAACTGTAACTTCTTGATTACTTTTTCCCATTCCTCCCTCACCC  50

seq1  CAGCCATGTAAAAACTGCACACAAGGCAGGCATGATGATCCATCCATGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATGTAAAAACTGCACACAAGGCAGGCATGATGATCCATCCATGAA  100

seq1  ACCCCAATACTTGAGTGACTGAGGCAGGAGGACCATGAGTTAGGGGGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCAATACTTGAGTGACTGAGGCAGGAGGACCATGAGTTAGGGGGCAG  150

seq1  CCTAAGCTACAAAGAGAGGCTTTATCACCAGGATAGATTAGACAGACAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAGCTACAAAGAGAGGCTTTATCACCAGGATAGATTAGACAGACAGA  200

seq1  CAGACAGACTAGATAGATTAGATAGATAGATGATAGG----TGGATGGAT  246
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||
seq2  CAGACAGACTAGATAGATTAGATAGATAGATGATAGGTGGATGGATGGAT  250

seq1  GGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTGGGTGG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTGGGTGG  300

seq1  ATATAGACATAGATATATTGGTTTTTCAAGACAGGATTCTCTGTGTAGCC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGACATAGATATATTGGTTTTTCAAGACAGGATTCTCTGTGTAGCC  350

seq1  TTGGCTGTCCTGGAGCTCACCCTGTAGACCAAGCTGGCCTTGTATTTATA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCTGTCCTGGAGCTCACCCTGTAGACCAAGCTGGCCTTGTATTTATA  400

seq1  GAGATCCACCTTCGTCTGCCTCCAGAGTGCTAGGATTAAAGGTGTGCACC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATCCACCTTCGTCTGCCTCCAGAGTGCTAGGATTAAAGGTGTGCACC  450

seq1  ACCACCACCACCTGGCCAAAATAAATATTTAAATTATAAGATTTTAAAGT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACCACCACCTGGCCAAAATAAATATTTAAATTATAAGATTTTAAAGT  500

seq1  TCTTTACAAGTACATTTATTTGTTTAATGGGGACAACAGGCATGCCACAG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTACAAGTACATTTATTTGTTTAATGGGGACAACAGGCATGCCACAG  550

seq1  TGCCTGTGTGGATGTCAGAGGACAACTCTGAAAGGTTGGATCTCTTCGCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTGTGGATGTCAGAGGACAACTCTGAAAGGTTGGATCTCTTCGCA  600

seq1  TACCGTGAGTCTCAGGGATAGAATTC  622
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGTGAGTCTCAGGGATAGAATTC  626

seq1: chr8_110953919_110954801
seq2: B6Ng01-141D13.g_66_952

seq1  GAATTCACAGTGCCTTGTACATTCGTAGCTGCAAGTGCTTTCGGCAACTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGTGCCTTGTACATTCGTAGCTGCAAGTGCTTTCGGCAACTT  50

seq1  CCCATGAAGCCTCTCCACAGTGCTGTTCACAACAGGTCAGCGTGCCTCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGAAGCCTCTCCACAGTGCTGTTCACAACAGGTCAGCGTGCCTCAT  100

seq1  CAGACGAGGATTAGACAAGGCGAACAGGCTTTGGTTTTATGACCCTTGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACGAGGATTAGACAAGGCGAACAGGCTTTGGTTTTATGACCCTTGGC  150

seq1  TCTTGACATCTTGTGTTCGTTAGAAGTGACATGAAGCCTCAGTCAAGGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGACATCTTGTGTTCGTTAGAAGTGACATGAAGCCTCAGTCAAGGAG  200

seq1  CAACATAATGCCTGCCCCCTGAGAGTGAAGTATAAGAATAAGGGGTAGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACATAATGCCTGCCCCCTGAGAGTGAAGTATAAGAATAAGGGGTAGGG  250

seq1  GGCAGTGTAGATGACCCTAGACAAAGCCAAGACAGAGACTTATAGAAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTGTAGATGACCCTAGACAAAGCCAAGACAGAGACTTATAGAAGTA  300

seq1  TCTAGAATTTTCTTCTTTCAGAGAGCAATGAGAAATTTTTAGAGAATTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAATTTTCTTCTTTCAGAGAGCAATGAGAAATTTTTAGAGAATTTG  350

seq1  AGGCAGGGGGATCTGGTGAAGGCTAAATTTTTAAAAAGTAAAGAACCAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGGGGATCTGGTGAAGGCTAAATTTTTAAAAAGTAAAGAACCAGG  400

seq1  GATGTTAAAAGATAAAAGGGAGGGGTGCTGAGCCTCAGGGCTGAACGTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTAAAAGATAAAAGGGAGGGGTGCTGAGCCTCAGGGCTGAACGTGG  450

seq1  GAGGAAGAACTACCTCAGCTAATTCACTACTCAGTACAGGCCATGACTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGAACTACCTCAGCTAATTCACTACTCAGTACAGGCCATGACTCC  500

seq1  CATCTACATCAGCTAAAATGTTCTCAGTGGAACCCGATTACCTCCACATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTACATCAGCTAAAATGTTCTCAGTGGAACCCGATTACCTCCACATT  550

seq1  TCTGTCAGCTGGACTGGGGCCAATCTGCTGTTTTCAATGGCTTTTCGAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCAGCTGGACTGGGGCCAATCTGCTGTTTTCAATGGCTTTTCGAAT  600

seq1  CTGGAATAGAGGGTTCCCTATAGCATAAACATTTCTTGGGGAAACTCTCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAATAGAGGGTTCCCTATAGCATAAACATTTCTTGGGGAAACTCTCC  650

seq1  AGGATGTATGTAGATGGATGACCTCAGCTCTGAAACTCTCCTACCCACAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGTATGTAGATGGATGACCTCAGCTCTGAAACTCTCCTACCCACAT  700

seq1  CCTACAGTCGTTATTGGTGTTGCTGTGATCTGTTATC-TTCTGTTGAGTT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCTACAGTCGTTATTGGTGTTGCTGTGATCTGTTATCTTTCTGTTGAGTT  750

seq1  TTCTCTAAGCTAAAACCAGGTACAACAAGAACTTCAAGAACCATGTGTTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTAAGCTAAAACCAGGTACAACAAGAATTTCAAGAACCATGTGTTT  800

seq1  TGAAGGTGATGCTCTGAAATATTAATA-GGGAAATGA-GGGATGGA-CAG  846
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||
seq2  TGAAGGTGATGCTCTGAAATATTAATAGGGGAAATGAGGGGATGGACCAG  850

seq1  AAACCCATAGAGTCAG-TGAGTGAGTGAGTGTGTGTGT  883
      |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||
seq2  AAACTCATAGAGTCAGTTGAGTGAGTGAGT-TGTGTGT  887