BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-142M24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 14,318,629 - 14,417,479
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDlgap2
Upstream geneTmco3, Tfdp1, Atp4b, Grk1, Gm687, Gas6, LOC434282, 1700029H14Rik, Rasa3, 4932443I19Rik, LOC665516, Cdc16, Upf3a, AF366264, D8Ertd457e, 2410022L05Rik, EG665536, Fbxo25, LOC100041103, 2610019F03Rik, EG546036, Erich1, LOC100041140
Downstream geneC030037F17Rik, Cln8, Arhgef10, 2900016B01Rik, 5830468F06Rik, Kbtbd11, BB014433, Myom2, EG665599
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-142M24.bB6Ng01-142M24.g
ACCDH940914DH940915
length1,064968
definitionDH940914|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142M24, 5' end.DH940915|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142M24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,318,629 - 14,319,708)(14,416,503 - 14,417,479)
sequence
gaattccttgattttgtcttcaagaagttcatggtctatcttgatgcttg
cacccttcatgggctaaggaccttcacccctagcccttggcccagataag
ctgctcaaatcttaacaatctagttactttgtaggacctaccaaagtagt
atcaactttaaagatgcctcttaactgaaagaaaaaaatgcatttcatca
tcagtcacattgactcatgtatatgcttgcatggtttggatagaaaatga
ctccttcgtgaagatttgatcccagctgatggctttctaaggaggcaggc
ctgcttgcaggaagtccagcattagagcatgcctcagcagggagtctcgt
ctctgacccttctgtcactttgcttcctggctgccatgagatgaacagct
tcttctgccctgttctcctacaaccatgatactctgactagactcagctt
cccctacctattactacaatactctacctcaatgttttaccaccatgcta
ctctacctagactcagattctcctacaaccatgatgctctacctagactc
agcttctcctaccaccacgatcctctacttagacttagcttctcctacca
ccatgatactttattttgactcagcttctcctacaattctgctgctctac
cttgattcagcttctcctgccactaagctgctctagcttgactcagcttc
tcctaccactatgcttgactcagccccatagtagaagaaccagctgacca
cagactgaaatcactgaaactgagccaaggacaaccttcctgttttaagt
agcttctcttgagtatttgtcacagcaatgaaaaattgatgagtatgctg
tgtctatagccattatacaacccctcagaatttggaattggactgcatgg
gctaccccttgcttctctttctacacaatttccccttatgcttgtttgat
aaacacccaaacccatggttgtatgcatatgacacactgtgctgggtgta
tgagctctaatgttctgagtgatagacatgcatagcacaatggaacgtgg
gtacttgcatgaca
gaattccgagttccttttctactgatcaaacagtccagggcgcagtttcc
atagcccggccctgcttcctgtaccaactctactgtgaggtaggatggag
cccctgatgtacgtcaggctttaaacctgaagaactcttgggtgtttact
ggcagccagtgaacatttgcagcctataactgcatggagccaggtagaag
gcaacaggtcttaatctgtttgtgctcaagcccatggaaggcactacatc
cccattgttgataaaaccatggttacaacctttccagtctctgagaccta
gctctgctccatcatgactctatagggaggctcctccagaaacagagtac
taggattgctacaaatgtaagacacaacatctggacaaaaggagtagtgc
ccttttgaattacagttgaattcccctccttggcccactgaagttgaatg
tcagggagagctgagtgaatccatcaacttcatggtaccaatacagggaa
gctgcttggtgacttcactggttgtgttccatctatgaagggtacaaatc
catgagcctccatttgaggcaccctccatgtctgtgtcatcaatacttgt
tattgatagcacccttaagacctgtgctatgtcacaggcctgtttcatga
tcctaggttagacagtaggaactgccttccccaaatgctttcctgttagt
gctgccaggttgaccagatggctgtgttggagaacactcaaacccattac
tttctgggctctgcaaagaagtgctgggtttatctgaggactgcacacca
agactgtcttttagctttctcttggcaaaagcaatgttggattccccaac
atgtccagccaggatcctcaggtactggcagtcccaccttggattctgta
ctcacagctcaagctagttcacagcatctgtgtttggtcactctatactg
agatgctgtgtgggatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_14318629_14319708
seq2: B6Ng01-142M24.b_41_1104

seq1  GAATTCCTTGATTTTGTCTTCAAGAAGTTCATGGTCTATCTTGATGCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTGATTTTGTCTTCAAGAAGTTCATGGTCTATCTTGATGCTTG  50

seq1  CACCCTTCATGGGCTAAGGACCTTCACCCCTAGCCCTTGGCCCAGATAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCTTCATGGGCTAAGGACCTTCACCCCTAGCCCTTGGCCCAGATAAG  100

seq1  CTGCTCAAATCTTAACAATCTAGTTACTTTGTAGGACCTACCAAAGTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCAAATCTTAACAATCTAGTTACTTTGTAGGACCTACCAAAGTAGT  150

seq1  ATCAACTTTAAAGATGCCTCTTAACTGAAAGAAAAAAATGCATTTCATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACTTTAAAGATGCCTCTTAACTGAAAGAAAAAAATGCATTTCATCA  200

seq1  TCAGTCACATTGACTCATGTATATGCTTGCATGGTTTGGATAGAAAATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCACATTGACTCATGTATATGCTTGCATGGTTTGGATAGAAAATGA  250

seq1  CTCCTTCGTGAAGATTTGATCCCAGCTGATGGCTTTCTAAGGAGGCAGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCGTGAAGATTTGATCCCAGCTGATGGCTTTCTAAGGAGGCAGGC  300

seq1  CTGCTTGCAGGAAGTCCAGCATTAGAGCATGCCTCAGCAGGGAGTCTCGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTGCAGGAAGTCCAGCATTAGAGCATGCCTCAGCAGGGAGTCTCGT  350

seq1  CTCTGACCCTTCTGTCACTTTGCTTCCTGGCTGCCATGAGATGAACAGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGACCCTTCTGTCACTTTGCTTCCTGGCTGCCATGAGATGAACAGCT  400

seq1  TCTTCTGCCCTGTTCTCCTACAACCATGATACTCTGACTAGACTCAGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTGCCCTGTTCTCCTACAACCATGATACTCTGACTAGACTCAGCTT  450

seq1  CCCCTACCTATTACTACAATACTCTACCTCAATGTTTTACCACCATGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTACCTATTACTACAATACTCTACCTCAATGTTTTACCACCATGCTA  500

seq1  CTCTACCTAGACTCAGATTCTCCTACAACCATGATGCTCTACCTAGACTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTACCTAGACTCAGATTCTCCTACAACCATGATGCTCTACCTAGACTC  550

seq1  AGCTTCTCCTACCACCACGATCCTCTACTTAGACTTAGCTTCTCCTACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTCCTACCACCACGATCCTCTACTTAGACTTAGCTTCTCCTACCA  600

seq1  CCATGATACTTTATTTTGACTCAGCTTCTCCTACAATTCTGCTGCTCTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGATACTTTATTTTGACTCAGCTTCTCCTACAATTCTGCTGCTCTAC  650

seq1  CTTGATTCAGCTTCTCCTGCCACTAAGCTGCTCTAGCTTGACTCAGCTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATTCAGCTTCTCCTGCCACTAAGCTGCTCTAGCTTGACTCAGCTTC  700

seq1  TCCTACCACTATGCTTGACTCAGCCCCATAGTAGAAGAACCAGCTGACCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTACCACTATGCTTGACTCAGCCCCATAGTAGAAGAACCAGCTGACCA  750

seq1  CAGACTGAAATCACTGAAACTGAGCCAAGGACAACCTTCCTGTTTTAAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTGAAATCACTGAAACTGAGCCAAGGACAACCTTCCTGTTTTAAGT  800

seq1  AGCTTCTCTTGAGTATTTGTCACAGCAATGAAAAATTGATGAGTATGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTCTTGAGTATTTGTCACAGCAATGAAAAATTGATGAGTATGCTG  850

seq1  TGTCTATAGCCATTATACAACCCCTCAGAATTTGGAATTGGACTGCATGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTATAGCCATTATACAACCCCTCAGAATTTGGAATTGGACTGCATGG  900

seq1  GCTACCCCTTGCTTCTCTTTCTACACAATTTCCCCTTAATGCTTGTTTTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  
seq2  GCTACCCCTTGCTTCTCTTTCTACACAATTTCCCCTT-ATGCTTGTTT--  947

seq1  AATAAACACCCAAAACCCATGGTTTGTATGCATATGACACACTGGTGCCT  1000
       |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||
seq2  GATAAACACCC-AAACCCATGG-TTGTATGCATATGACACACT-GTG-CT  993

seq1  GGGTGGTATTGAAGCTCTAAATGTCCTTGAAGTGATAAGACATGGCAATA  1050
      |||| ||||   |||||| ||||| ||   |||||| |||||||   |||
seq2  GGGT-GTAT--GAGCTCT-AATGTTCT--GAGTGAT-AGACATG--CATA  1034

seq1  GCAC-ATGGAACGTGGGTACCTTGCATGACA  1080
      |||| |||||||||||||| |||||||||||
seq2  GCACAATGGAACGTGGGTA-CTTGCATGACA  1064

seq1: chr8_14416503_14417479
seq2: B6Ng01-142M24.g_70_1037 (reverse)

seq1  ATATCCCACACAGCATCTCAAGTATAGAAGTGACCAAACAACAGATGCCT  50
      ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||
seq2  ATATCCCACACAGCATCTC-AGTATAG-AGTGACCAAAC-ACAGATG-CT  46

seq1  GTGAACTAAGCTTGGAGGCTGTGAGTACAGAATCCAAAGGTGGGACTGCC  100
      ||||||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTGAACT-AGCTTG--AGCTGTGAGTACAGAATCC-AAGGTGGGACTGCC  92

seq1  AGTACCTGAGGATCCTGGCTGGACATGTTGGGGAATCCCAACATTGCTTT  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGTACCTGAGGATCCTGGCTGGACATGTTGGGGAAT-CCAACATTGCTTT  141

seq1  TGCCAAGAGAAAGCTAAAAGACAGTCTTGGTGTGCAGTCCTCAGATAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAGAGAAAGCTAAAAGACAGTCTTGGTGTGCAGTCCTCAGATAAAC  191

seq1  CCAGCACTTCTTTGCAGAGCCCAGAAAGTAATGGGTTTGAGTGTTCTCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACTTCTTTGCAGAGCCCAGAAAGTAATGGGTTTGAGTGTTCTCCA  241

seq1  ACACAGCCATCTGGTCAACCTGGCAGCACTAACAGGAAAGCATTTGGGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGCCATCTGGTCAACCTGGCAGCACTAACAGGAAAGCATTTGGGGA  291

seq1  AGGCAGTTCCTACTGTCTAACCTAGGATCATGAAACAGGCCTGTGACATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTTCCTACTGTCTAACCTAGGATCATGAAACAGGCCTGTGACATA  341

seq1  GCACAGGTCTTAAGGGTGCTATCAATAACAAGTATTGATGACACAGACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGGTCTTAAGGGTGCTATCAATAACAAGTATTGATGACACAGACAT  391

seq1  GGAGGGTGCCTCAAATGGAGGCTCATGGATTTGTACCCTTCATAGATGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGTGCCTCAAATGGAGGCTCATGGATTTGTACCCTTCATAGATGGA  441

seq1  ACACAACCAGTGAAGTCACCAAGCAGCTTCCCTGTATTGGTACCATGAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAACCAGTGAAGTCACCAAGCAGCTTCCCTGTATTGGTACCATGAAG  491

seq1  TTGATGGATTCACTCAGCTCTCCCTGACATTCAACTTCAGTGGGCCAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGGATTCACTCAGCTCTCCCTGACATTCAACTTCAGTGGGCCAAGG  541

seq1  AGGGGAATTCAACTGTAATTCAAAAGGGCACTACTCCTTTTGTCCAGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGAATTCAACTGTAATTCAAAAGGGCACTACTCCTTTTGTCCAGATG  591

seq1  TTGTGTCTTACATTTGTAGCAATCCTAGTACTCTGTTTCTGGAGGAGCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTCTTACATTTGTAGCAATCCTAGTACTCTGTTTCTGGAGGAGCCT  641

seq1  CCCTATAGAGTCATGATGGAGCAGAGCTAGGTCTCAGAGACTGGAAAGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTATAGAGTCATGATGGAGCAGAGCTAGGTCTCAGAGACTGGAAAGGT  691

seq1  TGTAACCATGGTTTTATCAACAATGGGGATGTAGTGCCTTCCATGGGCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACCATGGTTTTATCAACAATGGGGATGTAGTGCCTTCCATGGGCTT  741

seq1  GAGCACAAACAGATTAAGACCTGTTGCCTTCTACCTGGCTCCATGCAGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACAAACAGATTAAGACCTGTTGCCTTCTACCTGGCTCCATGCAGTT  791

seq1  ATAGGCTGCAAATGTTCACTGGCTGCCAGTAAACACCCAAGAGTTCTTCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGCTGCAAATGTTCACTGGCTGCCAGTAAACACCCAAGAGTTCTTCA  841

seq1  GGTTTAAAGCCTGACGTACATCAGGGGCTCCATCCTACCTCACAGTAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAAAGCCTGACGTACATCAGGGGCTCCATCCTACCTCACAGTAGAG  891

seq1  TTGGTACAGGAAGCAGGGCCGGGCTATGGAAACTGCGCCCTGGACTGTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTACAGGAAGCAGGGCCGGGCTATGGAAACTGCGCCCTGGACTGTTT  941

seq1  GATCAGTAGAAAAGGAACTCTGAATTC  977
      |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GATCAGTAGAAAAGGAACTCGGAATTC  968