BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146N19
Chromosome8 (Build37)
Map Location 91,415,259 - 91,548,336
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneZfp423, LOC100040328, 5033428A16Rik, Heatr3, Papd5, Adcy7, Brd7, LOC100040369, Nkd1, 9130017C17Rik, Nod2, Cyld, LOC675985
Downstream geneSall1, LOC100041089, EG625801, EG384862
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146N19.bB6Ng01-146N19.g
ACCDH943895DH943896
length1,0971,155
definitionDH943895|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146N19, 5' end.DH943896|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146N19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,547,231 - 91,548,336)(91,415,259 - 91,416,402)
sequence
gaattcaaagggtccctcggtaaggcagcaatctgagatgcacagagaca
tggaaaaggataagacaggaattaggtcatctggtccagaccccaggaaa
tatgtttagatcaaagactgcactgttagaataaacaaaacaggacccac
tgggccctcccgttagttccatctcagtgctaagagctgccaatctaacc
agctctatttgatgaaagcggtaaaaattacaactgtaaaaatgactaag
tagaaaaaaaaaaacgtcctctcgactgtaataggaagataaagatttag
atttgagctaaagagtaacgacagagaggcccagatcaacacaaacttcc
tggaattttagccctaagtaaattatctaatcccagcccattgtctcttc
cttgctggccccccaccctgtgcaatcgggaataccagataatttacatt
ttaaaatttgttaagttttaactgcagtcttaaaaacattgcaggagccc
tttggattcattcattttacaccccttaagggtgcatctccctgagaagc
tctgctgtccctgtggcgtgtggatgtgcctttaaacttagtcttacagt
ttggtccttttccactgacagaggctgggagcctatgtctataaacccag
tgttggctccatacaaatcagcagtgggtgatattttaatagctaagccc
aagtctgtgtatggctctctttcacggcctttaaaccaactgccaaggaa
cgtggggtagatagaaacatccagaacagggccaggaaatcccagagaag
aaaaattcaccagctaaatccagggccctagatccttactgagtctggtt
tcctctcaactgttcaaaatacgatttggcatttcccggctttctgcatc
catctgcactcaagttgaatgaagactcatcatggatggtgtgtagtctt
ggctgggccctgtgtgaatcaagacaccaaggtactgaatgtgagggctt
ataaacacttcaagacaggcacttcttctgtatggggcttcacttcgtta
gatcagacatttactaggttggttggtagtttggggtttttggttgt
gaattcaccagaactaggtctttgggttcctcatctaatgctttctctga
agctgcgtgctagcagctgttgaccacatgccttggagactcttgcatga
caatacgctctcacagctggtgggagactgagactcacttcctgcacctt
agctctggctagggtcgggaatggaagagagttaggggcttatcgtgaca
gaggacacagcctgtaaccagtctgctctcaaaactcaggaccctgggta
tgctttccaggtcgggctgacctaggtcaaccattgggaagaagagcaat
gctgtccctacaaactcgggtgcactgggaagagggcatgctgggacata
ttgttctttgttgaaccaagttggaggcagacaagtccttctgggagctt
ctgagctgggttagtggcagtaggactccatggtgtgggtgtacactaat
gggaagtccagagagaggtcagagctcaatgtgccctcttcccttgctca
ccatattgcctaggctggggtgtgtagacaccatcctcggccttccaagt
gaacagtaaggattgagccttggggtgacaaatacttcctttacaggtag
cattgaaactgggctcttgctgtgaagccagaatagcagaatgtgctaga
aagaggtttattcctgtgaaaagaacgaggactgtgtgagttgctctctt
aacggtagagcttgcagtgtctcctaacggtagagcttgcagcgaacagc
tcccattgtgcagactagatcacaagtgctacctgacctgctagtatgtc
ttttaggaacagcgcctccatgttgtaacccagtaggaccccccagagct
ctgctggggagataacctagacaagatgtctccttagagcattcaggacc
atggagaaagtaaaaaaatcacagcacacacacacaaaactaaaacggta
agtttttttcttctacctcccatatgaaggggaagaagtaaaactacgct
ctcggctgtatataaagccctaggagatgaattgaagaaagacatggtgg
ggttaccttcaaaaaactaccgcttcttcagctcaaactacaagcagact
cgtgggcagaaattcctggtcacagaagactccatcgatctccactggct
cctca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_91547231_91548336
seq2: B6Ng01-146N19.b_50_1146 (reverse)

seq1  ACAACAAAAAACCCCAAACAAACAAACAAACCTAGGTAAATGTCTGATTC  50
      ||||| |||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||||||  
seq2  ACAACCAAAAACCCCAAAC-TACCAACCAACCTA-GTAAATGTCTGATCT  48

seq1  TACGGAAAGTGGAGGCCCCCATACAGAAG-AGTGCCTGTTCTTGGAGGTG  99
       |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||| || |||
seq2  AACG--AAGTGAAG--CCCCATACAGAAGAAGTGCCTG-TCTT-GAAGTG  92

seq1  TTTATAAGGCCCTCACATTCAGTACCTTGGTGTCTTGATTCACACAGGGC  149
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAA-GCCCTCACATTCAGTACCTTGGTGTCTTGATTCACACAGGGC  141

seq1  CCAGCCAAGACTACACACCATCCATGATGAGTCTTCATTCAACTTGAGTG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCAAGACTACACACCATCCATGATGAGTCTTCATTCAACTTGAGTG  191

seq1  CAGATGGATGCAGAAAGCCGGGAAATGCCAAATCGTATGTTTGAACAGTT  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CAGATGGATGCAGAAAGCCGGGAAATGCCAAATCGTAT-TTTGAACAGTT  240

seq1  GAGAGGAAACCAGACTCAGTAAGGATCTAGGGCCCTGGATTTAGCTGGTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGAAACCAGACTCAGTAAGGATCTAGGGCCCTGGATTTAGCTGGTG  290

seq1  AATTTTTCTTCTCTGGGATTTCCTGGCCCTGTTCTGGATGTTTCTATCTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTTCTTCTCTGGGATTTCCTGGCCCTGTTCTGGATGTTTCTATCTA  340

seq1  CCCCACGTTCCTTGGCAGTTGGTTTAAAGGCCGTGAAAGAGAGCCATACA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCACGTTCCTTGGCAGTTGGTTTAAAGGCCGTGAAAGAGAGCCATACA  390

seq1  CAGACTTGGGCTTAGCTATTAAAATATCACCCACTGCTGATTTGTATGGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGACTTGGGCTTAGCTATTAAAATATCACCCACTGCTGATTTGTATGGA  440

seq1  GCCAACACTGGGTTTATAGACATAGGCTCCCAGCCTCTGTCAGTGGAAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACACTGGGTTTATAGACATAGGCTCCCAGCCTCTGTCAGTGGAAAA  490

seq1  GGACCAAACTGTAAGACTAAGTTTAAAGGCACATCCACACGCCACAGGGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCAAACTGTAAGACTAAGTTTAAAGGCACATCCACACGCCACAGGGA  540

seq1  CAGCAGAGCTTCTCAGGGAGATGCACCCTTAAGGGGTGTAAAATGAATGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGAGCTTCTCAGGGAGATGCACCCTTAAGGGGTGTAAAATGAATGA  590

seq1  ATCCAAAGGGCTCCTGCAATGTTTTTAAGACTGCAGTTAAAACTTAACAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAAGGGCTCCTGCAATGTTTTTAAGACTGCAGTTAAAACTTAACAA  640

seq1  ATTTTAAAATGTAAATTATCTGGTATTCCCGATTGCACAGGGTGGGGGGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTAAAATGTAAATTATCTGGTATTCCCGATTGCACAGGGTGGGGGGC  690

seq1  CAGCAAGGAAGAGACAATGGGCTGGGATTAGATAATTTACTTAGGGCTAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGGAAGAGACAATGGGCTGGGATTAGATAATTTACTTAGGGCTAA  740

seq1  AATTCCAGGAAGTTTGTGTTGATCTGGGCCTCTCTGTCGTTACTCTTTAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAGGAAGTTTGTGTTGATCTGGGCCTCTCTGTCGTTACTCTTTAG  790

seq1  CTCAAATCTAAATCTTTATCTTCCTATTACAGTCGAGAGGACGTTTTTTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAATCTAAATCTTTATCTTCCTATTACAGTCGAGAGGACGTTTTTTT  840

seq1  TTTTCTACTTAGTCATTTTTACAGTTGTAATTTTTACCGCTTTCATCAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTACTTAGTCATTTTTACAGTTGTAATTTTTACCGCTTTCATCAAA  890

seq1  TAGAGCTGGTTAGATTGGCAGCTCTTAGCACTGAGATGGAACTAACGGGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCTGGTTAGATTGGCAGCTCTTAGCACTGAGATGGAACTAACGGGA  940

seq1  GGGCCCAGTGGGTCCTGTTTTGTTTATTCTAACAGTGCAGTCTTTGATCT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCCAGTGGGTCCTGTTTTGTTTATTCTAACAGTGCAGTCTTTGATCT  990

seq1  AAACATATTTCCTGGGGTCTGGACCAGATGACCTAATTCCTGTCTTATCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATATTTCCTGGGGTCTGGACCAGATGACCTAATTCCTGTCTTATCC  1040

seq1  TTTTCCATGTCTCTGTGCATCTCAGATTGCTGCCTTACCGAGGGACCCTT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCATGTCTCTGTGCATCTCAGATTGCTGCCTTACCGAGGGACCCTT  1090

seq1  TGAATTC  1106
      |||||||
seq2  TGAATTC  1097

seq1: chr8_91415259_91416402
seq2: B6Ng01-146N19.g_69_1223

seq1  GAATTCACCAGAACTAGGTCTTTGGGTTCCTCATCTAATGCTTTCTCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACCAGAACTAGGTCTTTGGGTTCCTCATCTAATGCTTTCTCTGA  50

seq1  AGCTGCGTGCTAGCAGCTGTTGACCACATGCCTTGGAGACTCTTGCATGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCGTGCTAGCAGCTGTTGACCACATGCCTTGGAGACTCTTGCATGA  100

seq1  CAATACGCTCTCACAGCTGGTGGGAGACTGAGACTCACTTCCTGCACCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACGCTCTCACAGCTGGTGGGAGACTGAGACTCACTTCCTGCACCTT  150

seq1  AGCTCTGGCTAGGGTCGGGAATGGAAGAGAGTTAGGGGCTTATCGTGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTCTGGCTAGGGTCGGGAATGGAAGAGAGTTAGGGGCTTATCGTGACA  200

seq1  GAGGACACAGCCTGTAACCAGTCTGCTCTCAAAACTCAGGACCCTGGGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACACAGCCTGTAACCAGTCTGCTCTCAAAACTCAGGACCCTGGGTA  250

seq1  TGCTTTCCAGGTCGGGCTGACCTAGGTCAACCATTGGGAAGAAGAGCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCCAGGTCGGGCTGACCTAGGTCAACCATTGGGAAGAAGAGCAAT  300

seq1  GCTGTCCCTACAAACTCGGGTGCACTGGGAAGAGGGCATGCTGGGACATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCCCTACAAACTCGGGTGCACTGGGAAGAGGGCATGCTGGGACATA  350

seq1  TTGTTCTTTGTTGAACCAAGTTGGAGGCAGACAAGTCCTTCTGGGAGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCTTTGTTGAACCAAGTTGGAGGCAGACAAGTCCTTCTGGGAGCTT  400

seq1  CTGAGCTGGGTTAGTGGCAGTAGGACTCCATGGTGTGGGTGTACACTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCTGGGTTAGTGGCAGTAGGACTCCATGGTGTGGGTGTACACTAAT  450

seq1  GGGAAGTCCAGAGAGAGGTCAGAGCTCAATGTGCCCTCTTCCCTTGCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGTCCAGAGAGAGGTCAGAGCTCAATGTGCCCTCTTCCCTTGCTCA  500

seq1  CCATATTGCCTAGGCTGGGGTGTGTAGACACCATCCTCGGCCTTCCAAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATTGCCTAGGCTGGGGTGTGTAGACACCATCCTCGGCCTTCCAAGT  550

seq1  GAACAGTAAGGATTGAGCCTTGGGGTGACAAATACTTCCTTTACAGGTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTAAGGATTGAGCCTTGGGGTGACAAATACTTCCTTTACAGGTAG  600

seq1  CATTGAAACTGGGCTCTTGCTGTGAAGCCAGAATAGCAGAATGTGCTAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGAAACTGGGCTCTTGCTGTGAAGCCAGAATAGCAGAATGTGCTAGA  650

seq1  AAGAGGTTTATTCCTGTGAAAAGAACGAGGACTGTGTGAGTTGCTCTCCT  700
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAGAGGTTTATTCCTGTGAAAAGAACGAGGACTGTGTGAGTTGCTCTCTT  700

seq1  AACGGTAGAGCTTGCAGTGTCTCCTAACGGTAGAGCTTGCAGCGAACAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGGTAGAGCTTGCAGTGTCTCCTAACGGTAGAGCTTGCAGCGAACAGC  750

seq1  T-CCATTGTGCAGACTAGATCACAAGTGCTACCTGACCTGCTAGTATGTC  799
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTGTGCAGACTAGATCACAAGTGCTACCTGACCTGCTAGTATGTC  800

seq1  TTTTAGGAACAGCGCCTCCATGTTGTAACCCAGTAGGACCCCCCAGAGCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGAACAGCGCCTCCATGTTGTAACCCAGTAGGACCCCCCAGAGCT  850

seq1  CTGCTGGGGAGATAACCTAGACAAGATGTCTCCTTAGAGCATTCAGGACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGGGGAGATAACCTAGACAAGATGTCTCCTTAGAGCATTCAGGACC  900

seq1  AT-GAGAAAGTAAAAAAATCAACAGCACACACACACAAAACTAAAAC-GT  947
      || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  ATGGAGAAAGTAAAAAAATC-ACAGCACACACACACAAAACTAAAACGGT  949

seq1  AAGTTTTTTTCTTCTACCTCCCAAATGAAGGGGAAGA--GAAAACTACGC  995
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||
seq2  AAGTTTTTTTCTTCTACCTCCCATATGAAGGGGAAGAAGTAAAACTACGC  999

seq1  TC---GCTGTATATAAAGCACTAGGAAGAGGAA-TGAAG-AAGACA--GT  1038
      ||   |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||  ||
seq2  TCTCGGCTGTATATAAAGCCCTAGG-AGATGAATTGAAGAAAGACATGGT  1048

seq1  GGGGTAACTTTC-AGAAACTACAGCTTCTTCAGGCTC-AACTACAAAGCA  1086
      ||||| || ||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||
seq2  GGGGTTACCTTCAAAAAACTACCGCTTCTTCA-GCTCAAACTAC-AAGCA  1096

seq1  GACCCGTGGGCAGAAATCCCTGTCCACAG-AGACTTCCATCGGTTCCCAC  1135
      ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| |  ||||
seq2  GACTCGTGGGCAGAAATTCCTGGTCACAGAAGAC-TCCATCGATCTCCAC  1145

seq1  T-GCTCCTCA  1144
      | ||||||||
seq2  TGGCTCCTCA  1155