BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148I24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 100,908,996 - 100,994,707
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC546090, LOC636859, EG384885, LOC100041173, EG636915
Downstream geneCdh8, A330008L17Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148I24.bB6Ng01-148I24.g
ACCDH945129DH945130
length1,1351,096
definitionDH945129|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148I24, 5' end.DH945130|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148I24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(100,993,564 - 100,994,707)(100,908,996 - 100,910,095)
sequence
gaattcatcatactccgcacaaggattggggccagtaaagagacaagcat
catctatcagagtccccagatcatcactcagctgtgacccggtacagcag
caatgacactgttagtaattaagagtagaggtttctttctaagttgcttt
tggttgatagtgaattccaactttgaacagagcaagtcttgggagatgaa
gacagtgtaaagtcagggcgttcaaagaaaaggaaaccgatttttctgtt
aaaaagccataaaaggagtttcttcttgcatgacaaatagaagttatggt
ttcactttatgtttctatgaaacatatattgctagcaataattgtattaa
aatatatctagagaaccttttaagcagtttcactgcagtctattcgctga
ctacatagaatacgggcatcctctagtcattgcaatgctaaagctaaagc
tgcagtgctttgtacttcaagtctgaaccgtaactaatttcttacttttc
tttaagcttcttctttgttaggaatcgtcattaatatccatttataatgc
ccacaagtgggaatgtgttggcaagcacttgacaagtgcaaattattaat
tattggagtttggaccatattcctgttaccttgctctctgactattacag
cacacccagctatcatgtcttctcttttcattttacttcacaaatcatga
caacaggaatccaaattaaacaattacatgatcaccctcacagtgatgag
caaaaccacaatgggatggcatgggacatggtcatcacattacgtggcaa
tccttgccaagagttagacagataaagttatggacattgtaaaaggaaca
gactgtggtgatggagacacactagaatcaaacgaaagaacttaaatcac
tacaagaaaagttttaaatttccacgatttaccttttatcttaatttaag
tttcatatctagtgctctgtattttaaaatgactttaaaccacaatggaa
gagctgctcatttggtctcatatgattatttcctatagacagtaaatcct
ctgacagaaattgacttgaccagtaacatcttagagtttctgaataggag
atcaaaagcccaccagatatctgcacacttataca
gaattcttagaggatttggagactgtcttatctaatttctttgcttcata
gtcagggtaaatgatgcacggaccagggaaatgtcatgtcacaaatcaca
ttagtatttttttttctgagatttaggtcctaaattaacacagaagaaaa
attgataaaaattacaccatagaaaaaattcttcagttcaatttattaaa
catttaagtaccaaacaagtggaaggttgacagcatgcaaaggtttcctg
taaggaagacatatttatttaagatattatgatgagtatttaacaagtca
gccaataattactgaattatagatatctaactttttacctaaaagaatta
atttagggaaaatgatgatcatgcaagcaaaaccaggactgacatgtaat
ttaaaacaaagcaatcacagaatgtttctgaggttagaattgatcatgtg
aaatcaagagttataagacaaggttgaaaatactaaacattaaagttaag
tgatataaatatatacagcatacaatagccacaaaattcttagctcttga
tatcatccatgccaagaacagaggggatgatgagtaaaatgtcaagtaaa
tttgtaattcctgggggttcacagcatgggcaaaatatctgccatgaata
ctgtagagctgatttgattccagaaactcaacatgatggaaggagagagt
ctaagaagttatcttctgagctccacatttgaatcattgtttacgcacaa
accctcttcatacaataaagtaggtaactaataaaggataccatatgcca
tgttaattctatctgtgtacttgcatgtcagcaagcctgtttttattgta
gttgctattaacaatactcacttctactctatttaatagaatgatacttt
tattctaatttacaatgatgctaaatggtgtagggcagtcatcacttcta
atacagacagtagcacagaaacatgagggaaggttggaaatacgcagagc
catttatggttcctcaggagtgatccacactagccctgctctccctgtca
gattcactgtctaacaccaccccagatctatcctctgttctaatca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_100993564_100994707
seq2: B6Ng01-148I24.b_46_1180 (reverse)

seq1  TGTAAAAGTG-GCAGATA-CTGGT-GGCTTTTGAATCTCCTTATCAGAAA  47
      |||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||
seq2  TGTATAAGTGTGCAGATATCTGGTGGGCTTTTG-ATCTCCTATTCAGAAA  49

seq1  CTTCTAAAGATGTTACTGGTCAAGTCAATTTTCCTGTCCAGA-GATTTAC  96
      | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||
seq2  C-TCT-AAGATGTTACTGGTCAAGTCAATTT--CTGT-CAGAGGATTTAC  94

seq1  TGTCTATAGGAAATTAATCATTATGAAGACCAAATGAGCAGCTCTTCCAT  146
      ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTATAGGAAA-TAATCA-TATG-AGACCAAATGAGCAGCTCTTCCAT  141

seq1  TGTGGTTTAAAAGTCATTTTAAAATACAGAAGCACTAGATATGAAAACTT  196
      |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||
seq2  TGTGGTTT-AAAGTCATTTTAAAATACAG-AGCACTAGATATG-AAACTT  188

seq1  AAATTAAGATAAAAGGTAAAATCGTGGAAATTTAAAACTTTTCTTGTAGT  246
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAAGATAAAAGGT-AAATCGTGGAAATTTAAAACTTTTCTTGTAGT  237

seq1  GATTTAAGTTCTTTCGTTTGATTCTAGTGTGTCTCCATCACCACAGTCTG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTAAGTTCTTTCGTTTGATTCTAGTGTGTCTCCATCACCACAGTCTG  287

seq1  TTCCTTTTACAATGTCCATAACTTTATCTGTCTAACTCTTGGCAAGGATT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTTACAATGTCCATAACTTTATCTGTCTAACTCTTGGCAAGGATT  337

seq1  GCCACGTAATGTGATGACCATGTCCCATGCCATCCCATTGTGGTTTTGCT  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACGTAATGTGATGACCATGTCCCATGCCATCCCATTGTGGTTTTGCT  387

seq1  CATCACTGTGAGGGTGATCATGTAATTGTTTAATTTGGATTCCTGTTGTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCACTGTGAGGGTGATCATGTAATTGTTTAATTTGGATTCCTGTTGTC  437

seq1  ATGATTTGTGAAGTAAAATGAAAAGAGAAGACATGATAGCTGGGTGTGCT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTGTGAAGTAAAATGAAAAGAGAAGACATGATAGCTGGGTGTGCT  487

seq1  GTAATAGTCAGAGAGCAAGGTAACAGGAATATGGTCCAAACTCCAATAAT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAGTCAGAGAGCAAGGTAACAGGAATATGGTCCAAACTCCAATAAT  537

seq1  TAATAATTTGCACTTGTCAAGTGCTTGCCAACACATTCCCACTTGTGGGC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAATTTGCACTTGTCAAGTGCTTGCCAACACATTCCCACTTGTGGGC  587

seq1  ATTATAAATGGATATTAATGACGATTCCTAACAAAGAAGAAGCTTAAAGA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATAAATGGATATTAATGACGATTCCTAACAAAGAAGAAGCTTAAAGA  637

seq1  AAAGTAAGAAATTAGTTACGGTTCAGACTTGAAGTACAAAGCACTGCAGC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAGAAATTAGTTACGGTTCAGACTTGAAGTACAAAGCACTGCAGC  687

seq1  TTTAGCTTTAGCATTGCAATGACTAGAGGATGCCCGTATTCTATGTAGTC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTTTAGCATTGCAATGACTAGAGGATGCCCGTATTCTATGTAGTC  737

seq1  AGCGAATAGACTGCAGTGAAACTGCTTAAAAGGTTCTCTAGATATATTTT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGAATAGACTGCAGTGAAACTGCTTAAAAGGTTCTCTAGATATATTTT  787

seq1  AATACAATTATTGCTAGCAATATATGTTTCATAGAAACATAAAGTGAAAC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAATTATTGCTAGCAATATATGTTTCATAGAAACATAAAGTGAAAC  837

seq1  CATAACTTCTATTTGTCATGCAAGAAGAAACTCCTTTTATGGCTTTTTAA  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAACTTCTATTTGTCATGCAAGAAGAAACTCCTTTTATGGCTTTTTAA  887

seq1  CAGAAAAATCGGTTTCCTTTTCTTTGAACGCCCTGACTTTACACTGTCTT  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAAATCGGTTTCCTTTTCTTTGAACGCCCTGACTTTACACTGTCTT  937

seq1  CATCTCCCAAGACTTGCTCTGTTCAAAGTTGGAATTCACTATCAACCAAA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCCAAGACTTGCTCTGTTCAAAGTTGGAATTCACTATCAACCAAA  987

seq1  AGCAACTTAGAAAGAAACCTCTACTCTTAATTACTAACAGTGTCATTGCT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAACTTAGAAAGAAACCTCTACTCTTAATTACTAACAGTGTCATTGCT  1037

seq1  GCTGTACCGGGTCACAGCTGAGTGATGATCTGGGGACTCTGATAGATGAT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTACCGGGTCACAGCTGAGTGATGATCTGGGGACTCTGATAGATGAT  1087

seq1  GCTTGTCTCTTTACTGGCCCCAATCCTTGTGCGGAGTATGATGAATTC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTCTCTTTACTGGCCCCAATCCTTGTGCGGAGTATGATGAATTC  1135

seq1: chr8_100908996_100910095
seq2: B6Ng01-148I24.g_66_1161

seq1  GAATTCTTAGAGGATTTGGAGACTGTCTTATCTAATTTCTTTGCTTCATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGAGGATTTGGAGACTGTCTTATCTAATTTCTTTGCTTCATA  50

seq1  GTCAGGGTAAATGATGCACGGACCAGGGAAATGTCATGTCACAAATCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGGTAAATGATGCACGGACCAGGGAAATGTCATGTCACAAATCACA  100

seq1  TTAGTATTTTTTTTTCTGAGATTTAGGTCCTAAATTAACACAGAAGAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTATTTTTTTTTCTGAGATTTAGGTCCTAAATTAACACAGAAGAAAA  150

seq1  ATTGATAAAAATTACACCATAGAAAAAATTCTTCAGTTCAATTTATTAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATAAAAATTACACCATAGAAAAAATTCTTCAGTTCAATTTATTAAA  200

seq1  CATTTAAGTACCAAACAAGTGGAAGGTTGACAGCATGCAAAGGTTTCCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTAAGTACCAAACAAGTGGAAGGTTGACAGCATGCAAAGGTTTCCTG  250

seq1  TAAGGAAGACATATTTATTTAAGATATTATGATGAGTATTTAACAAGTCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGAAGACATATTTATTTAAGATATTATGATGAGTATTTAACAAGTCA  300

seq1  GCCAATAATTACTGAATTATAGATATCTAACTTTTTACCTAAAAGAATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATAATTACTGAATTATAGATATCTAACTTTTTACCTAAAAGAATTA  350

seq1  ATTTAGGGAAAATGATGATCATGCAAGCAAAACCAGGACTGACATGTAAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAGGGAAAATGATGATCATGCAAGCAAAACCAGGACTGACATGTAAT  400

seq1  TTAAAACAAAGCAATCACAGAATGTTTCTGAGGTTAGAATTGATCATGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACAAAGCAATCACAGAATGTTTCTGAGGTTAGAATTGATCATGTG  450

seq1  AAATCAAGAGTTATAAGACAAGGTTGAAAATACTAAACATTAAAGTTAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAGAGTTATAAGACAAGGTTGAAAATACTAAACATTAAAGTTAAG  500

seq1  TGATATAAATATATACAGCATACAATAGCCACAAAATTCTTAGCTCTTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATAAATATATACAGCATACAATAGCCACAAAATTCTTAGCTCTTGA  550

seq1  TATCATCCATGCCAAGAACAGAGGGGATGATGAGTAAAATGTCAAGTAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATCCATGCCAAGAACAGAGGGGATGATGAGTAAAATGTCAAGTAAA  600

seq1  TTTGTAATTCCTGGGGGTTCACAGCATGGGCAAAATATCTGCCATGAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAATTCCTGGGGGTTCACAGCATGGGCAAAATATCTGCCATGAATA  650

seq1  CTGTAGAGCTGATTTGATTCCAGAAACTCAACATGATGGAAGGAGAGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTAGAGCTGATTTGATTCCAGAAACTCAACATGATGGAAGGAGAGAGT  700

seq1  CTAAGAAGTTATCTTCTGAGCTCCACATTTGAATCATTGTTTACGCACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAAGTTATCTTCTGAGCTCCACATTTGAATCATTGTTTACGCACAA  750

seq1  ACCCTCTTCATACAATAAAGTAGGTAACTAATAAAGGATACCATATGCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTCTTCATACAATAAAGTAGGTAACTAATAAAGGATACCATATGCCA  800

seq1  TGTTAATTCTATCTGTGTACTTGCATGTCAGCAAGCCTGTTTTTATTGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAATTCTATCTGTGTACTTGCATGTCAGCAAGCCTGTTTTTATTGTA  850

seq1  GTTTGCTATTAACAATACTCACTTCTACTCTATTTAATAGAATGATACTT  900
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  G-TTGCTATTAACAATACTCACTTCTACTCTATTTAATAGAATGATAC-T  898

seq1  TTTATTCTAATTTACAATGATGCTAAAATGGTGTAGGGCAGTCATCAACT  950
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTATTCTAATTTACAATGATGCT-AAATGGTGTAGGGCAGTCATC-ACT  946

seq1  TCTAATACAGACAGTAGCACAGAAACATGAGGGAAGGTTTGAAATACGCA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TCTAATACAGACAGTAGCACAGAAACATGAGGGAAGGTTGGAAATACGCA  996

seq1  GAAGCCATTTATGG-TCCTCAGGAGTGATCCACACTAAGCCCTGCTCTCC  1049
      | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  G-AGCCATTTATGGTTCCTCAGGAGTGATCCACACT-AGCCCTGCTCTCC  1044

seq1  CTGTCCAGATTCACTGTCTACCAC--ACCCAGATCTATCCTCTGTTCTAA  1097
      |||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||
seq2  CTGT-CAGATTCACTGTCTAACACCACCCCAGATCTATCCTCTGTTCTAA  1093

seq1  TCA  1100
      |||
seq2  TCA  1096