BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-148M06
Chromosome8 (Build37)
Map Location 43,386,145 - 43,491,783
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genePcm1, Asah1, Frg1, LOC100039376, Gm1815, LOC671994, Zfp353, EG620772
Downstream geneLOC628212, Triml1, LOC622082, EG622117, LOC100039417, Zfp42
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-148M06.bB6Ng01-148M06.g
ACCDH945283DH945284
length1,1771,136
definitionDH945283|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148M06, 5' end.DH945284|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-148M06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(43,490,589 - 43,491,783)(43,386,145 - 43,387,297)
sequence
gaattccagtgatggaacccatttttaaattgtccattgcagagtggtaa
gcctttaaaccatacatactcagtcatgatttttaaaatgtttatatcct
aatcttgttaggaagacatacatataatgtagtaaaatttgattataaac
tttcattctaattaatggattattcctgataatgtggctatcatttctat
ttctattagcacaccactaagacattatgttgttttagatgaatttgaag
ctggaaactgcttctcccatgtagaaataagatatctgtgatgtgatcat
gttctgaaacatggagaaacttaaactattaatgtctgttctgaataatt
tactcagatacatattttgaaatcatatataagtgggtatctctgctaca
tcaaaatctggatttccagtgctccagtaaaaaatcactacagaagctct
tagtttgttggtaccttgttgataacttgtcatctggtttattagcatca
ccagaaccaggcaataaactgacagactaacaaggagaaaggtactgctg
ctccatccttctgaatgctagaagtctaacacaaggtgctactaagtttg
gtttcttctgagacttgtgggaaaatctattccaggagtgtccagaagtt
tctagaattagagcagttaatttttaaagtatttcttggcttattgtagt
agtgctctgacctcagacctccaatttccctggtcttatttataagaaca
cagttctaatgaactacagtttatccccatgatctcttcttaatttaact
acatttgaaacagactgggaattaagattgtaacatataaattcaaccca
taatatttactgtatgttattctcttgccttctgttagctcttttaatcc
ctaagccatgaaaggtagtgatggcctcacttcagagcaaggaaagagaa
attattcagagtcacagagtgacattggagatccatatgcccaaatggat
ccaaatccaatgtagaagataagactatatttgtagcttcttaacaaaat
actactttcaataatttagcagtgggcatgttatctgagtacagtatcca
acagttcagcattcatactgcaaatggcatagggaatataattgctgtgg
ctatggaggagaaagggatggatagag
gaattctataccttttggctaatatccacttattagagagtacatactat
actttgccaatactttacttgtatttttatccttatttcctgtgaacctt
tcatgcatgttagtatacgggaaatgcttgaggtggctcaatatgtccct
tattgtcttgatcttaaagaattatgtataagaacattgtgagtcaggga
aataattaagagtagaaatatgaagaggcttcatagcatatgcattataa
taatttattacatttgcacaaatgcatatcctccatggtagaacaattat
agaagtaataaatcttatatctgagaacatggaatatatgacctacagct
tttaattcacacttgattgctcttaatttattaatagtgattttggttta
agtgattcttcatctcacatatttcattttttctacagtggcatgagctt
agtcagttgctccactaaagttttctcatgatacttataaattctacttt
gtttagtacagtacatcttctgttgtgtaaccaatgttgatggtaaggtt
aaacaggagcataaaaagatttaaaacagaaccagaagaagaacattaat
aaactgattaacaatgagtgaaaacaaaaagcaattaattctctgttctt
gaagccagtttgaagcacatgctgacattttcagaagcagaaaacttttt
tccaaagctttatcagacactatactaattgaaacacaatagctctccaa
gtgacaggtaattacttacaatgttataaaattttaaaatgttacttcca
atggaaatgaatacaggaccaaagctactagcactctccatttataaatt
tacttgtctttgttattaaacacataatattattttcaccaataatgtta
aaaagttgttctcatcctagttgctgtcaatttgctttaattatgcctgt
atttgaaactttcttcactatataggctttgtgtactgtgcaaactacat
tgatattgcataaaccacaagagcatactgatttagtagcaatctgccac
tgttactccctattgtattatgaggcagcaaattatagaatatttgataa
tgaaattgtggccatgtcaaatagctagctctctat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_43490589_43491783
seq2: B6Ng01-148M06.b_43_1219 (reverse)

seq1  CTCTATCCCATCCCCTTTCCTCCTTCCATAGCTCATACCAATTTATATTT  50
      |||||| |||||||  || |||| |||||||| || | ||| ||||| ||
seq2  CTCTAT-CCATCCC--TTTCTCC-TCCATAGC-CACAGCAA-TTATA-TT  43

seq1  CCCTATTGCATTTGCAGTATGAATGCTG-ACTGTTTTGGATACTGTTACC  99
      ||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| 
seq2  CCCTATGCCATTTGCAGTATGAATGCTGAACTG--TTGGATACTG-TAC-  89

seq1  TTCAGAT-ACATG-CCACTGCTAAATTTATTTGAAAGTAGTATTTTGTTT  147
       |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| 
seq2  -TCAGATAACATGCCCACTGCTAAATT--ATTGAAAGTAGTATTTTGTTA  136

seq1  AGAAGCTACAAATATTAGTCTTATTCTTCTAACATTGGATTTGGATCCAT  197
      |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCTACAAATA-TAGTCTTA-TCTTCT-ACATTGGATTTGGATCCAT  183

seq1  TTGGGCATATGGATCTTCCAATTGTCACTTCTGTGACTCTGAATAATTTC  247
      ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGCATATGGATC-TCCAA-TGTCAC-TCTGTGACTCTGAATAATTTC  230

seq1  TTCTTTCCTTGCTCTGAAGTGAGGCCATCACTACCTTTCATGGCTTAGGG  297
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TCTTTCCTTGCTCTGAAGTGAGGCCATCACTACCTTTCATGGCTTAGGG  279

seq1  ATTAAAAGAGCTAACAGAAGGCAAGAGAATAACATACAGTAAATATTATG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAAGAGCTAACAGAAGGCAAGAGAATAACATACAGTAAATATTATG  329

seq1  GGTTGAATTTATATGTTACAATCTTAATTCCCAGTCTGTTTCAAATGTAG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGAATTTATATGTTACAATCTTAATTCCCAGTCTGTTTCAAATGTAG  379

seq1  TTAAATTAAGAAGAGATCATGGGGATAAACTGTAGTTCATTAGAACTGTG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTAAGAAGAGATCATGGGGATAAACTGTAGTTCATTAGAACTGTG  429

seq1  TTCTTATAAATAAGACCAGGGAAATTGGAGGTCTGAGGTCAGAGCACTAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTATAAATAAGACCAGGGAAATTGGAGGTCTGAGGTCAGAGCACTAC  479

seq1  TACAATAAGCCAAGAAATACTTTAAAAATTAACTGCTCTAATTCTAGAAA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAATAAGCCAAGAAATACTTTAAAAATTAACTGCTCTAATTCTAGAAA  529

seq1  CTTCTGGACACTCCTGGAATAGATTTTCCCACAAGTCTCAGAAGAAACCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGGACACTCCTGGAATAGATTTTCCCACAAGTCTCAGAAGAAACCA  579

seq1  AACTTAGTAGCACCTTGTGTTAGACTTCTAGCATTCAGAAGGATGGAGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAGTAGCACCTTGTGTTAGACTTCTAGCATTCAGAAGGATGGAGCA  629

seq1  GCAGTACCTTTCTCCTTGTTAGTCTGTCAGTTTATTGCCTGGTTCTGGTG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGTACCTTTCTCCTTGTTAGTCTGTCAGTTTATTGCCTGGTTCTGGTG  679

seq1  ATGCTAATAAACCAGATGACAAGTTATCAACAAGGTACCAACAAACTAAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAATAAACCAGATGACAAGTTATCAACAAGGTACCAACAAACTAAG  729

seq1  AGCTTCTGTAGTGATTTTTTACTGGAGCACTGGAAATCCAGATTTTGATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTGTAGTGATTTTTTACTGGAGCACTGGAAATCCAGATTTTGATG  779

seq1  TAGCAGAGATACCCACTTATATATGATTTCAAAATATGTATCTGAGTAAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGAGATACCCACTTATATATGATTTCAAAATATGTATCTGAGTAAA  829

seq1  TTATTCAGAACAGACATTAATAGTTTAAGTTTCTCCATGTTTCAGAACAT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTCAGAACAGACATTAATAGTTTAAGTTTCTCCATGTTTCAGAACAT  879

seq1  GATCACATCACAGATATCTTATTTCTACATGGGAGAAGCAGTTTCCAGCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACATCACAGATATCTTATTTCTACATGGGAGAAGCAGTTTCCAGCT  929

seq1  TCAAATTCATCTAAAACAACATAATGTCTTAGTGGTGTGCTAATAGAAAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATTCATCTAAAACAACATAATGTCTTAGTGGTGTGCTAATAGAAAT  979

seq1  AGAAATGATAGCCACATTATCAGGAATAATCCATTAATTAGAATGAAAGT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGATAGCCACATTATCAGGAATAATCCATTAATTAGAATGAAAGT  1029

seq1  TTATAATCAAATTTTACTACATTATATGTATGTCTTCCTAACAAGATTAG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATCAAATTTTACTACATTATATGTATGTCTTCCTAACAAGATTAG  1079

seq1  GATATAAACATTTTAAAAATCATGACTGAGTATGTATGGTTTAAAGGCTT  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATAAACATTTTAAAAATCATGACTGAGTATGTATGGTTTAAAGGCTT  1129

seq1  ACCACTCTGCAATGGACAATTTAAAAATGGGTTCCATCACTGGAATTC  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACTCTGCAATGGACAATTTAAAAATGGGTTCCATCACTGGAATTC  1177

seq1: chr8_43386145_43387297
seq2: B6Ng01-148M06.g_67_1202

seq1  GAATTCTATACCTTTTGGCTAATATCCACTTATTAGAGAGTACATACTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTATACCTTTTGGCTAATATCCACTTATTAGAGAGTACATACTAT  50

seq1  ACTTTGCCAATACTTTACTTGTATTTTTATCCTTATTTCCTGTGAACCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGCCAATACTTTACTTGTATTTTTATCCTTATTTCCTGTGAACCTT  100

seq1  TCATGCATGTTAGTATACGGGAAATGCTTGAGGTGGCTCAATATGTCCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCATGTTAGTATACGGGAAATGCTTGAGGTGGCTCAATATGTCCCT  150

seq1  TATTGTCTTGATCTTAAAGAATTATGTATAAGAACATTGTGAGTCAGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGTCTTGATCTTAAAGAATTATGTATAAGAACATTGTGAGTCAGGGA  200

seq1  AATAATTAAGAGTAGAAATATGAAGAGGCTTCATAGCATATGCATTATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTAAGAGTAGAAATATGAAGAGGCTTCATAGCATATGCATTATAA  250

seq1  TAATTTATTACATTTGCACAAATGCATATCCTCCATGGTAGAACAATTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTATTACATTTGCACAAATGCATATCCTCCATGGTAGAACAATTAT  300

seq1  AGAAGTAATAAATCTTATATCTGAGAACATGGAATATATGACCTACAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTAATAAATCTTATATCTGAGAACATGGAATATATGACCTACAGCT  350

seq1  TTTAATTCACACTTGATTGCTCTTAATTTATTAATAGTGATTTTGGTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATTCACACTTGATTGCTCTTAATTTATTAATAGTGATTTTGGTTTA  400

seq1  AGTGATTCTTCATCTCACATATTTCATTTTTTCTACAGTGGCATGAGCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGATTCTTCATCTCACATATTTCATTTTTTCTACAGTGGCATGAGCTT  450

seq1  AGTCAGTTGCTCCACTAAAGTTTTCTCATGATACTTATAAATTCTACTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTTGCTCCACTAAAGTTTTCTCATGATACTTATAAATTCTACTTT  500

seq1  GTTTAGTACAGTACATCTTCTGTTGTGTAACCAATGTTGATGGTAAGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGTACAGTACATCTTCTGTTGTGTAACCAATGTTGATGGTAAGGTT  550

seq1  AAACAGGAGCATAAAAAGATTTAAAACAGAACCAGAAGAAGAACATTAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGAGCATAAAAAGATTTAAAACAGAACCAGAAGAAGAACATTAAT  600

seq1  AAACTGATTAACAATGAGTGAAAACAAAAAGCAATTAATTCTCTGTTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGATTAACAATGAGTGAAAACAAAAAGCAATTAATTCTCTGTTCTT  650

seq1  GAAGCCAGTTTGAAGCACATGCTGACATTTTCAGAAGCAGAAAACTTTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCAGTTTGAAGCACATGCTGACATTTTCAGAAGCAGAAAACTTTTT  700

seq1  TCCAAAGCTTTATCAGACACTATACTAATTGAAACACAATAGCTCTCCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGCTTTATCAGACACTATACTAATTGAAACACAATAGCTCTCCAA  750

seq1  GTGACAGGTAATTACTTACAATGTTATAAAATTTTAAAATGTTACTTCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAGGTAATTACTTACAATGTTATAAAATTTTAAAATGTTACTTCCA  800

seq1  ATGGAAATGAATACAGGACCAAAGCTACTAGCACTCTCCATTTATAAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAATGAATACAGGACCAAAGCTACTAGCACTCTCCATTTATAAATT  850

seq1  TACTTGTCTTTGTTATTTAAACACATAATATTATTTTCACCAATAAATGT  900
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TACTTGTCTTTGTTA-TTAAACACATAATATTATTTTCACCAAT-AATGT  898

seq1  TAAAAAAGTTGTTCTCATCCTAGTTGCTGTCAATTTGCTTTTAATTATGC  950
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  T-AAAAAGTTGTTCTCATCCTAGTTGCTGTCAATTTGC-TTTAATTATGC  946

seq1  CTGTATTTGAAACTTTCTTCACTATATAGGCTTTGTGTAACTGTGGCAAA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||
seq2  CTGTATTTGAAACTTTCTTCACTATATAGGCTTTGTGT-ACTGT-GCAAA  994

seq1  CTAACATTGATATTGCATAAACCACAAGAGCATACTGAATTTAGTAGCAA  1050
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
seq2  CT-ACATTGATATTGCATAAACCACAAGAGCATACTG-ATTTAGTAGC-A  1041

seq1  ATCTGCCACTGTTACT-CCTATTGTATTATGAGGGCAAGCAAAATATATA  1099
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||  
seq2  ATCTGCCACTGTTACTCCCTATTGTATTATGAGG--CAGCAAATTATA--  1087

seq1  GGAATATTTGGATAATGAATATTGTGGCCAATGTAAAAATAGCTTAGCT-  1148
       |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| ||||| 
seq2  -GAATATTT-GATAATGAA-ATTGTGGCC-ATGT-CAAATAGC-TAGCTC  1131

seq1  TCTAT  1153
      |||||
seq2  TCTAT  1136