BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150K12
Chromosome8 (Build37)
Map Location 32,804,729 - 32,970,375
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG330731, LOC100041340, Nrg1
Upstream geneLOC547008, Dusp26, Rnf122, BC019943, Rbm13, Fut10, LOC666330, LOC666568, 7420700N18Rik, LOC100041329
Downstream gene2010007E15Rik, EG666589, EG546052
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150K12.bB6Ng01-150K12.g
ACCDH946681DH946682
length800902
definitionDH946681|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150K12, 5' end.DH946682|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150K12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,969,578 - 32,970,375)(32,804,729 - 32,805,628)
sequence
gaattcagagtctattattttgtccttgcccctgtgacaacacaagtatc
aactacaatggtaccttgccactgtaccatctcaaaccttgtggctttag
agaaataagacctattgtgaactaaacctttggaccagctagctagtcct
ttgctgggagtggggttggggttggagagcagggcaaagggagatagttt
tcttgaagtgaagcatttgatattacacatatttccttgaaaactcctgt
tcaggatgatcacacatggagtgttggcactgttttgaaaagggtctatt
tctaggttgtttggttaggtagatcttatatgaggaacatgaatattata
gatatacatctaatagcacattctataatagactgagatgatttactgct
ctgatcacaaacctagaaaagaggaacttctgggacctgtgaggaaatgt
gtggcctgaagttagccaagtgtgactgagtaggacacaccattactgct
ctattgctccataagcagcaacctttgacctttttgaagaaactgtgccc
atggaaacagaaattggctgtttatgtccacagctgtctcacatgtactg
tctggctaacttggcttgttgtagtgcatattcagtgtttttgtgaggca
tactttgtactgtaaggacaagtattctagtaagttctaaacaggattct
tgcctggagtgactgtaattcctagaagatgtgtttcaattttaaaccat
ttacattaatgtttgtctttcccaaacattttttgagatatttgcttggt

gaattcagcataactccccaacagaacaaggtaactgtatgaagacagtt
ttgttttatttgtttttaatttaaaaaagcagaatatattgaaacagagc
taacagcaggtaggtttatgagaatagatctagcattgggcagacataaa
tgatataataaaaaataatggaatattccaaatagcacatgtataaaaag
tctgctaatagattttctatgcattatatgtcagttaccttaactaaatt
ttgtaaggcaaatttttcctaagaccaaacttcatctctttgttgattgt
tctttgtttgtttgtttgattggttggttggttttgtccttggtcttgct
gtttatctgaggctggtctttacatcctccaagtgctgagattacagctg
tagctagcacactgagttcattcctgtgtccttttacctaacttagttca
gttccaagtctacaaatggctgcatcctgatgcagataccttaatgtttt
actgaatggaaacaagcaaagcagcattatggcaaatcctatgacagtgg
ggtccttcccatcagggtgaagaagaagtctactatagtctctctgcaga
tgttcttgtgagttaaggaggtggattccatcccaccatcctaatgccat
gcagcgcctgaggtgcttctgtcctaactaccattcccctctcccatttt
aaattactttgggagcccagctccattaaaatacactcagcttgcccagt
ttctgacagagatgtatgggctcttcatgtgagctaataacgcagcacac
tgacagaccaagaccctgctgccccttttcacacttggatcgtcagatca
tttgttcacacttgattgggagtggagattgagagctgccttagggaagg
gc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_32969578_32970375
seq2: B6Ng01-150K12.b_46_845 (reverse)

seq1  ACCAAGCAAATATCTCAAAAACTGTTCTGGAAAGACAAACA-TAATGCTA  49
      ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||
seq2  ACCAAGCAAATATCTCAAAAAATGTTTGGGAAAGACAAACATTAATG-TA  49

seq1  AGTGTTTTAACTTTGAAACACATC-TCTAGGAATTACAGTCACTCCAGGC  98
      | || |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTTAAAATTGAAACACATCTTCTAGGAATTACAGTCACTCCAGGC  99

seq1  AAGAATCCTGTTTAGAACTTACTAGAATACTTGTCCTTACAGTACAAAGT  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATCCTGTTTAGAACTTACTAGAATACTTGTCCTTACAGTACAAAGT  149

seq1  ATGCCTCACTAAAACACTGAATATGCACTACAACAAGCC-AGTTAGCCAG  197
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  ATGCCTCACAAAAACACTGAATATGCACTACAACAAGCCAAGTTAGCCAG  199

seq1  ACAGTACATGTGAGACAGCTGTGGACATAAACAGCCAATTTCTGTTTCCA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTACATGTGAGACAGCTGTGGACATAAACAGCCAATTTCTGTTTCCA  249

seq1  TGGGCACAGTTTCTTCAAAAAGGTCAAAGGTTGCTGCTTATGGAGCAATA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCACAGTTTCTTCAAAAAGGTCAAAGGTTGCTGCTTATGGAGCAATA  299

seq1  GAGCAGTAATGGTGTGTCCTACTCAGTCACACTTGGCTAACTTCAGGCCA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTAATGGTGTGTCCTACTCAGTCACACTTGGCTAACTTCAGGCCA  349

seq1  CACATTTCCTCACAGGTCCCAGAAGTTCCTCTTTTCTAGGTTTGTGATCA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTCCTCACAGGTCCCAGAAGTTCCTCTTTTCTAGGTTTGTGATCA  399

seq1  GAGCAGTAAATCATCTCAGTCTATTATAGAATGTGCTATTAGATGTATAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGTAAATCATCTCAGTCTATTATAGAATGTGCTATTAGATGTATAT  449

seq1  CTATAATATTCATGTTCCTCATATAAGATCTACCTAACCAAACAACCTAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAATATTCATGTTCCTCATATAAGATCTACCTAACCAAACAACCTAG  499

seq1  AAATAGACCCTTTTCAAAACAGTGCCAACACTCCATGTGTGATCATCCTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGACCCTTTTCAAAACAGTGCCAACACTCCATGTGTGATCATCCTG  549

seq1  AACAGGAGTTTTCAAGGAAATATGTGTAATATCAAATGCTTCACTTCAAG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGAGTTTTCAAGGAAATATGTGTAATATCAAATGCTTCACTTCAAG  599

seq1  AAAACTATCTCCCTTTGCCCTGCTCTCCAACCCCAACCCCACTCCCAGCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTATCTCCCTTTGCCCTGCTCTCCAACCCCAACCCCACTCCCAGCA  649

seq1  AAGGACTAGCTAGCTGGTCCAAAGGTTTAGTTCACAATAGGTCTTATTTC  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGACTAGCTAGCTGGTCCAAAGGTTTAGTTCACAATAGGTCTTATTTC  699

seq1  TCTAAAGCCACAAGGTTTGAGATGGTACAGTGGCAAGGTACCATTGTAGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGCCACAAGGTTTGAGATGGTACAGTGGCAAGGTACCATTGTAGT  749

seq1  TGATACTTGTGTTGTCACAGGGGCAAGGACAAAATAATAGACTCTGAATT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATACTTGTGTTGTCACAGGGGCAAGGACAAAATAATAGACTCTGAATT  799

seq1  C  798
      |
seq2  C  800

seq1: chr8_32804729_32805628
seq2: B6Ng01-150K12.g_68_969

seq1  GAATTCAGCATAACTCCCCAACAGAACAAGGTAACTGTATGAAGACAGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGCATAACTCCCCAACAGAACAAGGTAACTGTATGAAGACAGTT  50

seq1  TTGTTTTATTTGTTTTTAATTTAAAAAAGCAGAATATATTGAAACAGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTATTTGTTTTTAATTTAAAAAAGCAGAATATATTGAAACAGAGC  100

seq1  TAACAGCAGGTAGGTTTATGAGAATAGATCTAGCATTGGGCAGACATAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGCAGGTAGGTTTATGAGAATAGATCTAGCATTGGGCAGACATAAA  150

seq1  TGATATAATAAAAAATAATGGAATATTCCAAATAGCACATGTATAAAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATAATAAAAAATAATGGAATATTCCAAATAGCACATGTATAAAAAG  200

seq1  TCTGCTAATAGATTTTCTATGCATTATATGTCAGTTACCTTAACTAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTAATAGATTTTCTATGCATTATATGTCAGTTACCTTAACTAAATT  250

seq1  TTGTAAGGCAAATTTTTCCTAAGACCAAACTTCATCTCTTTGTTGATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGGCAAATTTTTCCTAAGACCAAACTTCATCTCTTTGTTGATTGT  300

seq1  TCTTTGTTTGTTTGTTTGATTGGTTGGTTGGTTTTGTCCTTGGTCTTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTGTTTGTTTGTTTGATTGGTTGGTTGGTTTTGTCCTTGGTCTTGCT  350

seq1  GTTTATCTGAGGCTGGTCTTTACATCCTCCAAGTGCTGAGATTACAGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATCTGAGGCTGGTCTTTACATCCTCCAAGTGCTGAGATTACAGCTG  400

seq1  TAGCTAGCACACTGAGTTCATTCCTGTGTCCTTTTACCTAACTTAGTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAGCACACTGAGTTCATTCCTGTGTCCTTTTACCTAACTTAGTTCA  450

seq1  GTTCCAAGTCTACAAATGGCTGCATCCTGATGCAGATACCTTAATGTTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAAGTCTACAAATGGCTGCATCCTGATGCAGATACCTTAATGTTTT  500

seq1  ACTGAATGGAAACAAGCAAAGCAGCATTATGGCAAATCCTATGACAGTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGAATGGAAACAAGCAAAGCAGCATTATGGCAAATCCTATGACAGTGG  550

seq1  GGTCCTTCCCATCAGGGTGAAGAAGAAGTCTACTATAGTCTCTCTGCAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCCTTCCCATCAGGGTGAAGAAGAAGTCTACTATAGTCTCTCTGCAGA  600

seq1  TGTTCTTGTGAGTTAAGGAGGTGGATTCCATCCCACCATCCTAATGCCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTGTGAGTTAAGGAGGTGGATTCCATCCCACCATCCTAATGCCAT  650

seq1  GCAGCGCCTGAGGTGCTTCTGTCCTAACTACCATTCCCCTCTCCCATTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCGCCTGAGGTGCTTCTGTCCTAACTACCATTCCCCTCTCCCATTTT  700

seq1  AAATTACTTTGGGAGCCCAGCTCCATTAAAATACACTCAGCTTGCCCAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTACTTTGGGAGCCCAGCTCCATTAAAATACACTCAGCTTGCCCAGT  750

seq1  TTCTGACAGAGATGTATGGGCTCTTCATGTGAGCTAATAACGCAGCACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGACAGAGATGTATGGGCTCTTCATGTGAGCTAATAACGCAGCACAC  800

seq1  TGACAGACCAAGACCCTGCTGCCCC-TTTCACACTTGGATCGTCAGATCA  849
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAGACCAAGACCCTGCTGCCCCTTTTCACACTTGGATCGTCAGATCA  850

seq1  TTTGTTCACAC-TGATTTGGAGTGGAGATTGAGAGCTGCCTCAGGGAAGG  898
      ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTTGTTCACACTTGATTGGGAGTGGAGATTGAGAGCTGCCTTAGGGAAGG  900

seq1  GC  900
      ||
seq2  GC  902