BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151F21
Chromosome8 (Build37)9 (Build37)
Map Location 51,719,482 - 51,719,54868,270,924 - 68,271,967
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039919, EG667495, LOC100039954, LOC100039966
Downstream geneLOC667517
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151F21.bB6Ng01-151F21.g
ACCDH947201DH947202
length2411,043
definitionDH947201|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151F21, 5' end.DH947202|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151F21, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(51,719,482 - 51,719,548)(68,270,924 - 68,271,967)
sequence
ctggcagttgtaagctgcctgatatgggtgctgagatctgaattcctgtc
ctctacaagagcagcaacagttctcaaccattggaccatcctttaagccc
ctccattttactgtctgacatagggtgtctctgaacctagagttcacact
cctgacacgagccctgggaatccttctctctctctctctctctctctctc
tctctctctctctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gaattcaaggtgtgcaccaccatgcctagccaactaattgatttgtagaa
taattaggaggcaattaatttctatgtttaggccagaaatggaaaccaca
attttgtgtttagtagtgagatagctagaggaagcaagagtgaggtgggg
agaccctcataccactgaacaccaggaggtttatggatagaaaggaaaga
ccaacttccagtagaagtctctgggaaaagaggaccagacatcagcacca
aggtggacaggccatttaaagatgcatctgagagctcttttccatgtcag
acttgggtccacagagcagatgttagataatctgggtaaccaagactcca
aatggtccagctgaagaggaccctgagaattctaaggcaggagacatggt
gttctacagtctggtgcctttgcagttgcctcttaggaggaagatgaaca
gcttagtttacaacttcaatctactagatggtgggttgttagacaggctg
ctggattgaagtagcaataggggaaaatggatggagcagaagttgaggtt
taccgctagggacacagagagatctttgagccctcatgactctctatttt
ttttttaattcttttaaccttatgtgtatggatgttttgccttgctttta
agtctgtgtgccctgtgtgtgcctggtgcctacagaggctagaagagggt
attggctccccttgaactggagctacagatggttgtagccaccatgtgga
tgctgggaattaaaccctggtacacaggaaagagcagccacttaaccact
gagctatctctccaggcacaagtctttcttgactgttaattccaaggact
acatttcttgtttttctcctctcccatggtatctagcagagtgttgcacc
tatacaagtgcttcatggttgggtaaggaatgatttggcatgtcatgtca
aggattatatggaatagtggttatgatagatggcttattatgtgtgatag
tgacaaatgattggagctgcagactttggcatctagttccctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_51719482_51719548
seq2: B6Ng01-151F21.b_222_288 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  50

seq1  AGAGAGAGAGAGAGAGA  67
      |||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAGAGAGAGA  67

seq1: chr9_68270924_68271967
seq2: B6Ng01-151F21.g_68_1110

seq1  GAATTCAAGGTGTGCACCACCATGCCTAGCCAACTAATTGATTTGTAGAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGTGTGCACCACCATGCCTAGCCAACTAATTGATTTGTAGAA  50

seq1  TAATTAGGAGGCAATTAATTTCTATGTTTAGGCCAGAAATGGAAACCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAGGAGGCAATTAATTTCTATGTTTAGGCCAGAAATGGAAACCACA  100

seq1  ATTTTGTGTTTAGTAGTGAGATAGCTAGAGGAAGCAAGAGTGAGGTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGTGTTTAGTAGTGAGATAGCTAGAGGAAGCAAGAGTGAGGTGGGG  150

seq1  AGACCCTCATACCACTGAACACCAGGAGGTTTATGGATAGAAAGGAAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCTCATACCACTGAACACCAGGAGGTTTATGGATAGAAAGGAAAGA  200

seq1  CCAACTTCCAGTAGAAGTCTCTGGGAAAAGAGGACCAGACATCAGCACCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACTTCCAGTAGAAGTCTCTGGGAAAAGAGGACCAGACATCAGCACCA  250

seq1  AGGTGGACAGGCCATTTAAAGATGCATCTGAGAGCTCTTTTCCATGTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGACAGGCCATTTAAAGATGCATCTGAGAGCTCTTTTCCATGTCAG  300

seq1  ACTTGGGTCCACAGAGCAGATGTTAGATAATCTGGGTAACCAAGACTCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGGGTCCACAGAGCAGATGTTAGATAATCTGGGTAACCAAGACTCCA  350

seq1  AATGGTCCAGCTGAAGAGGACCCTGAGAATTCTAAGGCAGGAGACATGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTCCAGCTGAAGAGGACCCTGAGAATTCTAAGGCAGGAGACATGGT  400

seq1  GTTCTACAGTCTGGTGCCTTTGCAGTTGCCTCTTAGGAGGAAGATGAACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTACAGTCTGGTGCCTTTGCAGTTGCCTCTTAGGAGGAAGATGAACA  450

seq1  GCTTAGTTTACAACTTCAATCTACTAGATGGTGGGTTGTTAGACAGGCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAGTTTACAACTTCAATCTACTAGATGGTGGGTTGTTAGACAGGCTG  500

seq1  CTGGATTGAAGTAGCAATAGGGGAAAATGGATGGAGCAGAAGTTGAGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTGAAGTAGCAATAGGGGAAAATGGATGGAGCAGAAGTTGAGGTT  550

seq1  TACCGCTAGGGACACAGAGAGATCTTTGAGCCCTCATGACTCTCTATTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCGCTAGGGACACAGAGAGATCTTTGAGCCCTCATGACTCTCTATTTT  600

seq1  TTTTTTAATTCTTTTAACCTTATGTGTATGGATGTTTTGCCTTGCTTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAATTCTTTTAACCTTATGTGTATGGATGTTTTGCCTTGCTTTTA  650

seq1  AGTCTGTGTGCCCTGTGTGTGCCTGGTGCCTACAGAGGCTAGAAGAGGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTGTGCCCTGTGTGTGCCTGGTGCCTACAGAGGCTAGAAGAGGGT  700

seq1  ATTGGCTCCCCTTGAACTGGAGCTACAGATGGTTGTAGCCACCATGTGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGCTCCCCTTGAACTGGAGCTACAGATGGTTGTAGCCACCATGTGGA  750

seq1  TGCTGGGAATTAAACCCTGGTACACAGGAAAGAGCAGCCACTTAACCACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGAATTAAACCCTGGTACACAGGAAAGAGCAGCCACTTAACCACT  800

seq1  GAGCTATCTCTCCAGGCACAAGTC-TTCTTGACTGTTAATTCCAAGGACT  849
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTATCTCTCCAGGCACAAGTCTTTCTTGACTGTTAATTCCAAGGACT  850

seq1  ACATTTCTTGTTTTTCTCCTCTCCCATGGTATCTAGCAGAGTGTTGCACC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTCTTGTTTTTCTCCTCTCCCATGGTATCTAGCAGAGTGTTGCACC  900

seq1  TATAACAAGTGC-TCATGGTTGGGTAAGGAAATGATTT-GCATGTCATGT  947
      ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
seq2  TAT-ACAAGTGCTTCATGGTTGGGTAAGG-AATGATTTGGCATGTCATGT  948

seq1  CAAGGATTATATGGAATAGTGGTTATGATAGATGGCTAATTATGTGGTGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||
seq2  CAAGGATTATATGGAATAGTGGTTATGATAGATGGCTTATTATGT-GTGA  997

seq1  TAGTGACAAATGAATTGGAGCTGCAGACATCTGGCATCAAG-TCCCTG  1044
      |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || ||||||
seq2  TAGTGACAAATG-ATTGGAGCTGCAGAC-TTTGGCATCTAGTTCCCTG  1043