BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151I24
Chromosome8 (Build37)
Map Location 10,958,046 - 11,086,688
singlet/doubletdoublet
Overlap geneIrs2
Upstream geneLig4, Abhd13, Tnfsf13b, Myo16, LOC100040008, LOC384782, LOC100040507, LOC665306
Downstream geneCol4a1, Col4a2, Rab20, 0710008K08Rik, Cars2, Ing1, Ankrd10, 1700016D06Rik, EG665271, LOC665363, LOC624710, LOC665373, Arhgef7, 1700018L24Rik, LOC100040155
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151I24.bB6Ng01-151I24.g
ACCDH947350DH947351
length1,1411,114
definitionDH947350|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151I24, 5' end.DH947351|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151I24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(11,085,537 - 11,086,688)(10,958,046 - 10,959,163)
sequence
gaattccttaagtaagagatctttgttttcttaaagatattcttatctgg
taagtaattagtctgagcacacacacacacacacacatacactgatctac
atgcacacgcatgtatatgcacatgcatgagtatgcacattttgaaaaaa
ttagcatacaatagaagggatggctgtaggaaggaggttggggagatgcc
agtcaggaaacacacagttgcagatgagaaaggttgttcaagagttttac
ttcacagcccggtgagcagggtgaaggccgactgcctggactcttgacaa
gtgtcaagagatcatatacatgctctcatgaaaaggagagctgtgtgagg
tactactgaaattcctaaccagacaaaaacctctacccctcccactgagg
ttcccaaacacacagaaagcaggattctgccaaagtccactctggagaac
cagaggttaattgagcattggttacttagaggggtctagatgcccctccc
cacaacaggccaccctggaaagctttcactcagcagggatagggtttacc
tgcagccaaatagagggagtccttcttctagtctttccttgtgtgtatac
tctcattcctcatcaagagcacaaggcattaaggcagacttgtataccac
agatggtagagagtggctgcactctcatgtgatggtctggtgacccttcc
cacccctccatgaggaggtgtaaacaaccagcaagcccagattggatact
ctttctgcaagagggtagtatagatgaactcccaagatggccactgcttg
gctcggagagcagtgacttacaacacgaggtgatggttcttagccatcta
ggagcaacaagtcctcagtgtgtctacacttcaatcattgcattttttca
cagcaaacacatacaaccctggtcagctgaggggaatgtaaatagagata
cacttgtccggctccttacgttctgatgatgggcatagacaggaacgggc
tcattgagactgcgctttgaaatggtttgtttcctgtccttggaaagccc
agcatgctaaagaatcttcgagcaatggcagtggagatcttcgaatttca
gaaccctgtcagatgttgtcaccataatacccttcaggccc
gaattcctcaggttcttgaaccctgcaaggaagatgcagaaggaacaggg
atgatgggttcttcttgctactctgagcactatatgtgatgtcctcgtgg
gctgtctacatcaccttcaaaccctgctgattgctgggtgtggctctaaa
gaccccaggcatttaggaacctgtgtcaccctgtgagactaaggatgtcc
ccgtgctgtgtaagtgagctaggctgcatgctctgaatctgggttttact
gtgtgttaataatccagtttttcagactctcttcagaccatagtcatctg
gatccataggcactgactctgcacatgagagtacccaccgtgactctcgg
gacctctgagccttctcccagaatcgggctgaacaagctttgcactgttg
aattgacctctttggatccatgcctgtattatgactgtattgtggaacct
agtggcctttaggatcaccccaagagctgttgagtgaggattttgttaac
atgccctgaattcataccatgtcagcatggctcccctcctgatgatgcaa
aagcctgtgtcctggagagaagacacatgagaattctgcaaactccattt
tcctgtagatcctcatcttctttgccataatcctttacggtcattagatg
caggtagcaaaagacaagcaaatgccattcctactgcagcttcatggttc
aagggctgagggtatttgtatactccagtgaatgttaaactcattttaaa
gtgaccatgaagacaaaagacgtttgtccctgggtgctttcaggacacac
acttccaggtctgccctaggcccttaagggtggagtgataaggacagaaa
gtgtctttcgcacagcaatactattctaactggcaggacagtaatgctta
cccaccacaatactgttggcatttggcttctgctggtaacatccaaggcc
acagcatccgtggtggcctcagacaaacccacgtgttccctccactggaa
ctctgtctctataaaactgtcactggccacaaggatgtgaatcttgcctg
tcttaaattctgtgggtacaggtgagcagagtggaagagcattggtggta
aagacaatgccact
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_11085537_11086688
seq2: B6Ng01-151I24.b_48_1188 (reverse)

seq1  GGGCCTGAGGGATAATTATGGGTGACAACATACCTGACAGGGTTCTGAAA  50
      |||||||| || | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||
seq2  GGGCCTGAAGGGT-ATTAT-GGTGACAACAT--CTGACAGGGTTCTGAAA  46

seq1  ATCTGAAAGATCTCCACTGCCATTGCT-GCAGATTCTGTTAGGCATGCTG  99
       ||   ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||
seq2  TTC--GAAGATCTCCACTGCCATTGCTCGAAGATTCT-TTA-GCATGCTG  92

seq1  GGCTTTCCCAAGGACAGGAAACAAACCATTTCAAAGCGCAGTTCTCAATG  149
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  GGCTTT-CCAAGGACAGGAAACAAACCATTTCAAAGCGCAG-TCTCAATG  140

seq1  AGCCCGTTCCTGTCTATGCCCATCATCAGAACGTAAGGAGCCGGACAAGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCGTTCCTGTCTATGCCCATCATCAGAACGTAAGGAGCCGGACAAGT  190

seq1  GTATCTTCTGTTTACATTCCCCTCAGCTGACCAGGGTTGTATGTGTTTGC  249
      ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATC-TCTATTTACATTCCCCTCAGCTGACCAGGGTTGTATGTGTTTGC  239

seq1  TGTGAAAAAATGCAATGATTTGAAGTGTAGACACACTGAGGACTTGTTGC  299
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAAAAATGCAATGA-TTGAAGTGTAGACACACTGAGGACTTGTTGC  288

seq1  TCCTAGATGGCTAAGAACCATCACCTCGTGTTGTAAGTCACTGCTCTCCG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGATGGCTAAGAACCATCACCTCGTGTTGTAAGTCACTGCTCTCCG  338

seq1  AGCCAAGCAGTGGCCATCTTGGGAGTTCATCTATACTACCCTCTTGCAGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAGCAGTGGCCATCTTGGGAGTTCATCTATACTACCCTCTTGCAGA  388

seq1  AAGAGTATCCAATCTGGGCTTGCTGGTTGTTTACACCTCCTCATGGAGGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTATCCAATCTGGGCTTGCTGGTTGTTTACACCTCCTCATGGAGGG  438

seq1  GTGGGAAGGGTCACCAGACCATCACATGAGAGTGCAGCCACTCTCTACCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAAGGGTCACCAGACCATCACATGAGAGTGCAGCCACTCTCTACCA  488

seq1  TCTGTGGTATACAAGTCTGCCTTAATGCCTTGTGCTCTTGATGAGGAATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGGTATACAAGTCTGCCTTAATGCCTTGTGCTCTTGATGAGGAATG  538

seq1  AGAGTATACACACAAGGAAAGACTAGAAGAAGGACTCCCTCTATTTGGCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTATACACACAAGGAAAGACTAGAAGAAGGACTCCCTCTATTTGGCT  588

seq1  GCAGGTAAACCCTATCCCTGCTGAGTGAAAGCTTTCCAGGGTGGCCTGTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGGTAAACCCTATCCCTGCTGAGTGAAAGCTTTCCAGGGTGGCCTGTT  638

seq1  GTGGGGAGGGGCATCTAGACCCCTCTAAGTAACCAATGCTCAATTAACCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGGAGGGGCATCTAGACCCCTCTAAGTAACCAATGCTCAATTAACCT  688

seq1  CTGGTTCTCCAGAGTGGACTTTGGCAGAATCCTGCTTTCTGTGTGTTTGG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTCTCCAGAGTGGACTTTGGCAGAATCCTGCTTTCTGTGTGTTTGG  738

seq1  GAACCTCAGTGGGAGGGGTAGAGGTTTTTGTCTGGTTAGGAATTTCAGTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCTCAGTGGGAGGGGTAGAGGTTTTTGTCTGGTTAGGAATTTCAGTA  788

seq1  GTACCTCACACAGCTCTCCTTTTCATGAGAGCATGTATATGATCTCTTGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTCACACAGCTCTCCTTTTCATGAGAGCATGTATATGATCTCTTGA  838

seq1  CACTTGTCAAGAGTCCAGGCAGTCGGCCTTCACCCTGCTCACCGGGCTGT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGTCAAGAGTCCAGGCAGTCGGCCTTCACCCTGCTCACCGGGCTGT  888

seq1  GAAGTAAAACTCTTGAACAACCTTTCTCATCTGCAACTGTGTGTTTCCTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTAAAACTCTTGAACAACCTTTCTCATCTGCAACTGTGTGTTTCCTG  938

seq1  ACTGGCATCTCCCCAACCTCCTTCCTACAGCCATCCCTTCTATTGTATGC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCATCTCCCCAACCTCCTTCCTACAGCCATCCCTTCTATTGTATGC  988

seq1  TAATTTTTTCAAAATGTGCATACTCATGCATGTGCATATACATGCGTGTG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTTTTCAAAATGTGCATACTCATGCATGTGCATATACATGCGTGTG  1038

seq1  CATGTAGATCAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCAGACTAATTAC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTAGATCAGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTCAGACTAATTAC  1088

seq1  TTACCAGATAAGAATATCTTTAAGAAAACAAAGATCTCTTACTTAAGGAA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCAGATAAGAATATCTTTAAGAAAACAAAGATCTCTTACTTAAGGAA  1138

seq1  TTC  1152
      |||
seq2  TTC  1141

seq1: chr8_10958046_10959163
seq2: B6Ng01-151I24.g_66_1179

seq1  GAATTCCTCAGGTTCTTGAACCCTGCAAGGAAGATGCAGAAGGAACAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCAGGTTCTTGAACCCTGCAAGGAAGATGCAGAAGGAACAGGG  50

seq1  ATGATGGGTTCTTCTTGCTACTCTGAGCACTATATGTGATGTCCTCGTGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGGGTTCTTCTTGCTACTCTGAGCACTATATGTGATGTCCTCGTGG  100

seq1  GCTGTCTACATCACCTTCAAACCCTGCTGATTGCTGGGTGTGGCTCTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTCTACATCACCTTCAAACCCTGCTGATTGCTGGGTGTGGCTCTAAA  150

seq1  GACCCCAGGCATTTAGGAACCTGTGTCACCCTGTGAGACTAAGGATGTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCCCAGGCATTTAGGAACCTGTGTCACCCTGTGAGACTAAGGATGTCC  200

seq1  CCGTGCTGTGTAAGTGAGCTAGGCTGCATGCTCTGAATCTGGGTTTTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGCTGTGTAAGTGAGCTAGGCTGCATGCTCTGAATCTGGGTTTTACT  250

seq1  GTGTGTTAATAATCCAGTTTTTCAGACTCTCTTCAGACCATAGTCATCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTTAATAATCCAGTTTTTCAGACTCTCTTCAGACCATAGTCATCTG  300

seq1  GATCCATAGGCACTGACTCTGCACATGAGAGTACCCACCGTGACTCTCGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCCATAGGCACTGACTCTGCACATGAGAGTACCCACCGTGACTCTCGG  350

seq1  GACCTCTGAGCCTTCTCCCAGAATCGGGCTGAACAAGCTTTGCACTGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTCTGAGCCTTCTCCCAGAATCGGGCTGAACAAGCTTTGCACTGTTG  400

seq1  AATTGACCTCTTTGGATCCATGCCTGTATTATGACTGTATTGTGGAACCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGACCTCTTTGGATCCATGCCTGTATTATGACTGTATTGTGGAACCT  450

seq1  AGTGGCCTTTAGGATCACCCCAAGAGCTGTTGAGTGAGGATTTTGTTAAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGCCTTTAGGATCACCCCAAGAGCTGTTGAGTGAGGATTTTGTTAAC  500

seq1  ATGCCCTGAATTCATACCATGTCAGCATGGCTCCCCTCCTGATGATGCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCTGAATTCATACCATGTCAGCATGGCTCCCCTCCTGATGATGCAA  550

seq1  AAGCCTGTGTCCTGGAGAGAAGACACATGAGAATTCTGCAAACTCCATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGTGTCCTGGAGAGAAGACACATGAGAATTCTGCAAACTCCATTT  600

seq1  TCCTGTAGATCCTCATCTTCTTTGCCATAATCCTTTACGGTCATTAGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTAGATCCTCATCTTCTTTGCCATAATCCTTTACGGTCATTAGATG  650

seq1  CAGGTAGCAAAAGACAAGCAAATGCCATTCCTACTGCAGCTTCATGGTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTAGCAAAAGACAAGCAAATGCCATTCCTACTGCAGCTTCATGGTTC  700

seq1  AAGGGCTGAGGGTATTTGTATACTCCAGTGAATGTTAAACTCATTTTAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCTGAGGGTATTTGTATACTCCAGTGAATGTTAAACTCATTTTAAA  750

seq1  GTGACCATGAAGACAAAAGACGTTTGTCCCTGGGTGCTTTCAGGACACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCATGAAGACAAAAGACGTTTGTCCCTGGGTGCTTTCAGGACACAC  800

seq1  ACTTCCAGGTCTGCCCTAGGCCCTTAAGGGTGGAGTGATAAGGACAGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCAGGTCTGCCCTAGGCCCTTAAGGGTGGAGTGATAAGGACAGAAA  850

seq1  GTGTCTTTCGCACAGCAATACTATTCTAACTGGCAGGGACAGTAATGCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GTGTCTTTCGCACAGCAATACTATTCTAACTGGCA-GGACAGTAATGCTT  899

seq1  ACCCACCACAAATACTGTTGGCATTTGGCTTCTGCTGGTAACATCCAAGG  950
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCACCAC-AATACTGTTGGCATTTGGCTTCTGCTGGTAACATCCAAGG  948

seq1  CCACAGCATCCGT-GTGGCCTCAGACAAACCCACGTG-TCCCTCCACTGG  998
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCACAGCATCCGTGGTGGCCTCAGACAAACCCACGTGTTCCCTCCACTGG  998

seq1  AACTCTGTCTCCTATAAAAACTGTCAACTGGCCACAAGGATGTGAATCCT  1048
      |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
seq2  AACTCTGTCT-CTAT-AAAACTGTC-ACTGGCCACAAGGATGTGAATCTT  1045

seq1  GCCTGTTCTTAAATCCTGTGGGTACAGGTTGAGCA-AGGTGAAGAGCATT  1097
      ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||
seq2  GCCTG-TCTTAAATTCTGTGGGTACAGG-TGAGCAGAGTGGAAGAGCATT  1093

seq1  GGTGGGTAAAGAC-ATGCCACT  1118
      ||| ||||||||| ||||||||
seq2  GGT-GGTAAAGACAATGCCACT  1114