BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152B18
Chromosome8 (Build37)
Map Location 24,834,964 - 24,939,684
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZmat4
Upstream genePlat, Ap3m2, Myst3, LOC100042253, Ank1, Nkx6-3, Agpat6, Gins4, Golga7, Sfrp1, LOC100040931
Downstream gene1810011O10Rik, Indol1, Indo, Adam18, Adam3, Adam5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152B18.bB6Ng01-152B18.g
ACCDH947765DH947766
length875959
definitionDH947765|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152B18, 5' end.DH947766|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152B18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,938,810 - 24,939,684)(24,834,964 - 24,835,926)
sequence
ccaagatttctgtttaaaggctcttctctggcccctctaccaatacaatt
gatagttgaggtgcaaatgctaaacacctgaaatgattggacagaaatgt
ttactgatattacaaggatagtaggttctcataacctcataatttttcac
ctctctaatagaatcattacacttgtctaagaccaactatttcagttgat
tgtatacccttcagcagaacttcacttgcagaacactaatttttggtaaa
tacataggtgtatttgcatacacacacaaaacttgtttccaaagttaaag
caatttcatggactggggatgaaccctaaagaacaaaatagaaaaggcag
tagagataaatggcacaatcatagaaagatctgtaaagacttagaaaatg
ttgacacagacacaggaaagtatgctaagtcttgcttcttaccaaatctg
tgttaacgaaataaggaaattacctttctgtacatcaaacagacaataag
taagaagattaattatatctaggttttgtgtgcatgaggtaaaaatatag
gctttcatacatccttcatgggaatacgagtcagtactgcctttctgaac
agcaacctggtaatgaatggtagataaatgcataaataatacagaaatag
acagatagatgatagagtgggtgatagaagaaagttgatacataatagat
agaaaataggtaaataataggtatatatgtaggtacatagatagggagat
agatgatgacagatgatgatgatgatgaagatagacagggagacagacag
acagtcagacagacagataataggtagatagattgatggatagatgattg
atggatgatagatagatagatagat
gaattcagtttctcttgctaatacatatagagggtgagaagggaagagac
agaatggtccacaagatctcagactatgtcccgaacatcttagtgaaggt
gttgagtgggaagccactggggtggtgaccaggtaggtcaattgagtagt
tcttcctggccccaagtcagggttgagctctgctgaatgtcctcagttga
gtagatattgttccaagtgcctactccgtgcaagacactgagttggatgc
tagaggggattctcatgagtgtgactcataatacaaagctctatttatct
cccgtcatggtactgtagaagcatagaagacacagtgagtaatactttct
gtgtgagttatcttcttctttccaccctttgaggagtgtgttgagcatga
tccaggtctagggaaatacctgataagcaatgtatgtgtgtgctttccag
gggacaaggcggcatgactcggcaactattttctaagatctgggtgcaca
agagatgtgaatacagctttttcatctctttctcttgggaggctaatagc
atttcatcttactcctcctttctgtgtctgtaggagagaggtgggtggag
aaatgtcattacttataaatatattacaagtaaataatgcaagtactcag
agaggcagagggatgactcttccctgtgcagtgctggcccgtgtctgtat
gcttgatggtttaaagacgatgacattagggatgggagagtggctcattg
gtagagctcttgtctagcctaattgggggtctggatcacatctccgttac
tgaaaagcaaagaagcagggatattactcatgagagtgttcagggctcct
gcagatcagggaggatgttgacagcttgtgctaatccctctacacagtct
cccccttcctttctagatagactgtggggctgggctcccactaggcactg
tgcaggctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_24938810_24939684
seq2: B6Ng01-152B18.b_52_926 (reverse)

seq1  ATCTATCTATCTATCTATCATCCATCAATCATCTATCCATCAATCTATCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCTATCTATCTATCATCCATCAATCATCTATCCATCAATCTATCT  50

seq1  ACCTATTATCTGTCTGTCTGACTGTCTGTCTGTCTCCCTGTCTATCTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTATTATCTGTCTGTCTGACTGTCTGTCTGTCTCCCTGTCTATCTTCA  100

seq1  TCATCATCATCATCTGTCATCATCTATCTCCCTATCTATGTACCTACATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATCATCATCTGTCATCATCTATCTCCCTATCTATGTACCTACATA  150

seq1  TATACCTATTATTTACCTATTTTCTATCTATTATGTATCAACTTTCTTCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCTATTATTTACCTATTTTCTATCTATTATGTATCAACTTTCTTCT  200

seq1  ATCACCCACTCTATCATCTATCTGTCTATTTCTGTATTATTTATGCATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACCCACTCTATCATCTATCTGTCTATTTCTGTATTATTTATGCATTT  250

seq1  ATCTACCATTCATTACCAGGTTGCTGTTCAGAAAGGCAGTACTGACTCGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTACCATTCATTACCAGGTTGCTGTTCAGAAAGGCAGTACTGACTCGT  300

seq1  ATTCCCATGAAGGATGTATGAAAGCCTATATTTTTACCTCATGCACACAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCATGAAGGATGTATGAAAGCCTATATTTTTACCTCATGCACACAA  350

seq1  AACCTAGATATAATTAATCTTCTTACTTATTGTCTGTTTGATGTACAGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAGATATAATTAATCTTCTTACTTATTGTCTGTTTGATGTACAGAA  400

seq1  AGGTAATTTCCTTATTTCGTTAACACAGATTTGGTAAGAAGCAAGACTTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAATTTCCTTATTTCGTTAACACAGATTTGGTAAGAAGCAAGACTTA  450

seq1  GCATACTTTCCTGTGTCTGTGTCAACATTTTCTAAGTCTTTACAGATCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATACTTTCCTGTGTCTGTGTCAACATTTTCTAAGTCTTTACAGATCTT  500

seq1  TCTATGATTGTGCCATTTATCTCTACTGCCTTTTCTATTTTGTTCTTTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGATTGTGCCATTTATCTCTACTGCCTTTTCTATTTTGTTCTTTAG  550

seq1  GGTTCATCCCCAGTCCATGAAATTGCTTTAACTTTGGAAACAAGTTTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCATCCCCAGTCCATGAAATTGCTTTAACTTTGGAAACAAGTTTTGT  600

seq1  GTGTGTATGCAAATACACCTATGTATTTACCAAAAATTAGTGTTCTGCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATGCAAATACACCTATGTATTTACCAAAAATTAGTGTTCTGCAA  650

seq1  GTGAAGTTCTGCTGAAGGGTATACAATCAACTGAAATAGTTGGTCTTAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAAGTTCTGCTGAAGGGTATACAATCAACTGAAATAGTTGGTCTTAGA  700

seq1  CAAGTGTAATGATTCTATTAGAGAGGTGAAAAATTATGAGGTTATGAGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGTAATGATTCTATTAGAGAGGTGAAAAATTATGAGGTTATGAGAA  750

seq1  CCTACTATCCTTGTAATATCAGTAAACATTTCTGTCCAATCATTTCAGGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTATCCTTGTAATATCAGTAAACATTTCTGTCCAATCATTTCAGGT  800

seq1  GTTTAGCATTTGCACCTCAACTATCAATTGTATTGGTAGAGGGGCCAGAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGCATTTGCACCTCAACTATCAATTGTATTGGTAGAGGGGCCAGAG  850

seq1  AAGAGCCTTTAAACAGAAATCTTGG  875
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCCTTTAAACAGAAATCTTGG  875

seq1: chr8_24834964_24835926
seq2: B6Ng01-152B18.g_67_1025

seq1  GAATTCAGTTTCTCTTGCTAATACATATAGAGGGTGAGAAGGGAAGAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTCTCTTGCTAATACATATAGAGGGTGAGAAGGGAAGAGAC  50

seq1  AGAATGGTCCACAAGATCTCAGACTATGTCCCGAACATCTTAGTGAAGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGTCCACAAGATCTCAGACTATGTCCCGAACATCTTAGTGAAGGT  100

seq1  GTTGAGTGGGAAGCCACTGGGGTGGTGACCAGGTAGGTCAATTGAGTAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGTGGGAAGCCACTGGGGTGGTGACCAGGTAGGTCAATTGAGTAGT  150

seq1  TCTTCCTGGCCCCAAGTCAGGGTTGAGCTCTGCTGAATGTCCTCAGTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCCTGGCCCCAAGTCAGGGTTGAGCTCTGCTGAATGTCCTCAGTTGA  200

seq1  GTAGATATTGTTCCAAGTGCCTACTCCGTGCAAGACACTGAGTTGGATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGATATTGTTCCAAGTGCCTACTCCGTGCAAGACACTGAGTTGGATGC  250

seq1  TAGAGGGGATTCTCATGAGTGTGACTCATAATACAAAGCTCTATTTATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGGGATTCTCATGAGTGTGACTCATAATACAAAGCTCTATTTATCT  300

seq1  CCCGTCATGGTACTGTAGAAGCATAGAAGACACAGTGAGTAATACTTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGTCATGGTACTGTAGAAGCATAGAAGACACAGTGAGTAATACTTTCT  350

seq1  GTGTGAGTTATCTTCTTCTTTCCACCCTTTGAGGAGTGTGTTGAGCATGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAGTTATCTTCTTCTTTCCACCCTTTGAGGAGTGTGTTGAGCATGA  400

seq1  TCCAGGTCTAGGGAAATACCTGATAAGCAATGTATGTGTGTGCTTTCCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGTCTAGGGAAATACCTGATAAGCAATGTATGTGTGTGCTTTCCAG  450

seq1  GGGACAAGGCGGCATGACTCGGCAACTATTTTCTAAGATCTGGGTGCACA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACAAGGCGGCATGACTCGGCAACTATTTTCTAAGATCTGGGTGCACA  500

seq1  AGAGATGTGAATACAGCTTTTTCATCTCTTTCTCTTGGGAGGCTAATAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGTGAATACAGCTTTTTCATCTCTTTCTCTTGGGAGGCTAATAGC  550

seq1  ATTTCATCTTACTCCTCCTTTCTGTGTCTGTAGGAGAGAGGTGGGTGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCATCTTACTCCTCCTTTCTGTGTCTGTAGGAGAGAGGTGGGTGGAG  600

seq1  AAATGTCATTACTTATAAATATATTACAAGTAAATAATGCAAGTACTCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTCATTACTTATAAATATATTACAAGTAAATAATGCAAGTACTCAG  650

seq1  AGAGGCAGAGGGATGACTCTTCCCTGTGCAGTGCTGGCCCGTGTCTGTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGAGGGATGACTCTTCCCTGTGCAGTGCTGGCCCGTGTCTGTAT  700

seq1  GCTTGATGGTTTAAAGACGATGACATTAGGGATGGGAGAGTGGCTCATTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGATGGTTTAAAGACGATGACATTAGGGATGGGAGAGTGGCTCATTG  750

seq1  GTAGAGCTCTTGTCTAGCCTAATTGGGGTTCTGGATCACATCTCCGTTAC  800
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAGCTCTTGTCTAGCCTAATTGGGGGTCTGGATCACATCTCCGTTAC  800

seq1  TGAAAAGCAAAGAAGCAGGGATATTACTCATTGAGAGTGGTCCAGGGCTC  850
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||
seq2  TGAAAAGCAAAGAAGCAGGGATATTACTCA-TGAGAGT-GTTCAGGGCTC  848

seq1  CTGCAGATCAGGGAGGATGTTGACAGCCTGTGCTTATCCCTCTCACACAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||
seq2  CTGCAGATCAGGGAGGATGTTGACAGCTTGTGCTAATCCCTCT-ACACAG  897

seq1  TCTCCCCCCTCCCTTCTAGATAGATTTGTGGGCTGGGCTCCCACTAGGCA  950
      |||||||| ||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCCCTTCCTTTCTAGATAGACTGTGGGGCTGGGCTCCCACTAGGCA  947

seq1  GCTGTGCAGGCTG  963
       ||||||||||||
seq2  -CTGTGCAGGCTG  959