BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-152H23
Chromosome8 (Build37)
Map Location 61,162,912 - 61,279,654
singlet/doubletdoublet
Overlap gene4930431L04Rik
Upstream geneLOC100040711
Downstream geneBC030500, LOC665116, LOC436042
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-152H23.bB6Ng01-152H23.g
ACCDH948057DH948058
length1,1151,066
definitionDH948057|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152H23, 5' end.DH948058|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-152H23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,278,537 - 61,279,654)(61,162,912 - 61,163,983)
sequence
gaattcataaactataattcagtgcactgaaggataggtgtaaaactttg
gtatctgttcctccccacttgccacttatacctattaaatgctcgtcttc
ttttctttcctcattaagtttatacttttgttaaaatgctgaatcttaga
cagttatatatcattttatcattgtcatagtttgaatatacttaacccag
ggaatcatactatttggaggtatggtcttgtgagaataggtgtgtcactc
tgggtctggattttaaaaactctcatcctagctgcctgcaagtcagtctt
ccactagcagccttcagatgaagatgtagaactctcagttccacctgcac
catgcctgcctagatgatgtcatgctcttgccttggtgattatggagtga
acttctgaaacctgtaagccaggtccaattaaatgtcatccttataagag
ttgcctttgtcatggtgtctgttcacagcaataaaaccctaactaagaca
atgatattcaaccagatgaaccatattagataaaaatgaaatcacattcc
acgaattgtttagcacattcttcaaaaatttattaatatcatcttcaaaa
cttaaattgtttatctgataaatgttaatagttctttaagaatattcttt
aagaatagttctttaagatagatattttacacttggaagaacaagaacat
aaaaattttataactgtaaacaatatatatatatataatctatttgacaa
gaaaggagatgaaacctgttaaacataagaaatatgaattagatatggtg
aaagtgaaatcacacctaaactgaagagaaatgttttaaactaattttta
cactgttgcttagaatgaagctcccctgtaactttgaaaaatgtaccatg
gcatcatgtcagtaaaatgctcttgtggctatattgttagctatagaaaa
ggctgcatttcacataggagcagtgtctgtggagctgtctcttctaaact
tacctttattagaggaaatactgcaaggtatacctcttgaatacccttac
tctttcacagtgggctacagcacagtaccagagatcttctactgctggct
ctaataatcttaatt
gaattcaatttcactgtgtccattttcctctgggcttaatgaaatttggg
tgggctagaattcaatttaatatctgctcatgaaaaaaaccaaggagcaa
cctgggaaggacgtgtgtggcagcagtgctgtgttcacacaacgtgtcca
cactgaggtcctgctagtaagattgtttagaggaggtgctctggctgcca
ccactcctcagagtaacagctcatacaaaacaaccagcatgcaagggctt
tactttcattgtccagttgactaagtcagcttcagattagctctgctgtc
ttctcaatcttttaattaggtgtaggatcagagacaaaaccagatataat
tggatttctagacagaaactacaatctctagtctcaatttaaggaaaaaa
tcctattctgatttatttatttatttatttatttatttatttatttattg
gtatgagtcacatgcattgaaattgaattttttcctcttccctataatgc
cctataatcgtctgggaagaagttgcatttactctaataaaaactgttgg
aaagagagggggtggcaacaaagggacatttgagcatcatggcagaattc
aacttgagggatggatttattttggtctctggcttctatgggtcacagtc
tgatatgccagaaatggcatttaggagtgggtcaaggagatggttggttc
acatcttcacaatgtaagcatagacagctggccagagatagcacgcacaa
agggacaagtcccaccccttatacttgtttctgcaaaggatgctgcacat
cataaatatcctctatgttgagaagaggtgaggactgagtgttcaaattg
atgaatatggtagtattacatggtccatccataatatccaccttgcttag
agaagctttagtgtacttgttccttattcttgaatttcttgcctacactt
gaaagagaaacacactgcaatgagctttggccactcagtatagtgattcc
tagtgttttgttgttttctctgctttgagagtccttcaaaacaagcactg
gtatagcatatcataa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr8_61278537_61279654
seq2: B6Ng01-152H23.b_39_1153 (reverse)

seq1  AATTAAGGATAATTAGAAGCCAGCAGTAGAAGA--TCTGGTACTGTGCTG  48
      |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| 
seq2  AATTAA-GATTATTAG-AGCCAGCAGTAGAAGATCTCTGGTACTGTGCT-  47

seq1  GTAGCCAACTGTGAAAGAGTTAGGGGTATTCAAGAGGTATACCCTGCAGT  98
      |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTAGCCCACTGTGAAAGAG-TAAGGGTATTCAAGAGGTATACCTTGCAGT  96

seq1  ATTTCCTTCTAATAAAGGTAAGTTTAGAAGAGACAGCTCCACAGACACTG  148
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCC-TCTAATAAAGGTAAGTTTAGAAGAGACAGCTCCACAGACACTG  145

seq1  CTCCTATGTGAAATGCAGCCTTTTCTATAGCTAACAATATAGCCACAAGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTATGTGAAATGCAGCCTTTTCTATAGCTAACAATATAGCCACAAGA  195

seq1  GCATTTTACTGACATGATGCCATGGTACATTTTTCAAAGTTACAGGGGAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTACTGACATGATGCCATGGTACATTTTTCAAAGTTACAGGGGAG  245

seq1  CTTCATTCTAAGCAACAGTGTAAAAATTAGTTTAAAACATTTCTCTTCAG  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATTCTAAGCAACAGTGTAAAAATTAGTTTAAAACATTTCTCTTCAG  295

seq1  TTTAGGTGTGATTTCACTTTCACCATATCTAATTCATATTTCTTATGTTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGTGTGATTTCACTTTCACCATATCTAATTCATATTTCTTATGTTT  345

seq1  AACAGGTTTCATCTCCTTTCTTGTCAAATAGATTATATATATATATATTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGTTTCATCTCCTTTCTTGTCAAATAGATTATATATATATATATTG  395

seq1  TTTACAGTTATAAAATTTTTATGTTCTTGTTCTTCCAAGTGTAAAATATC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGTTATAAAATTTTTATGTTCTTGTTCTTCCAAGTGTAAAATATC  445

seq1  TATCTTAAAGAACTATTCTTAAAGAATATTCTTAAAGAACTATTAACATT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTAAAGAACTATTCTTAAAGAATATTCTTAAAGAACTATTAACATT  495

seq1  TATCAGATAAACAATTTAAGTTTTGAAGATGATATTAATAAATTTTTGAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGATAAACAATTTAAGTTTTGAAGATGATATTAATAAATTTTTGAA  545

seq1  GAATGTGCTAAACAATTCGTGGAATGTGATTTCATTTTTATCTAATATGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTGCTAAACAATTCGTGGAATGTGATTTCATTTTTATCTAATATGG  595

seq1  TTCATCTGGTTGAATATCATTGTCTTAGTTAGGGTTTTATTGCTGTGAAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTGGTTGAATATCATTGTCTTAGTTAGGGTTTTATTGCTGTGAAC  645

seq1  AGACACCATGACAAAGGCAACTCTTATAAGGATGACATTTAATTGGACCT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACCATGACAAAGGCAACTCTTATAAGGATGACATTTAATTGGACCT  695

seq1  GGCTTACAGGTTTCAGAAGTTCACTCCATAATCACCAAGGCAAGAGCATG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTACAGGTTTCAGAAGTTCACTCCATAATCACCAAGGCAAGAGCATG  745

seq1  ACATCATCTAGGCAGGCATGGTGCAGGTGGAACTGAGAGTTCTACATCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATCTAGGCAGGCATGGTGCAGGTGGAACTGAGAGTTCTACATCTT  795

seq1  CATCTGAAGGCTGCTAGTGGAAGACTGACTTGCAGGCAGCTAGGATGAGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGAAGGCTGCTAGTGGAAGACTGACTTGCAGGCAGCTAGGATGAGA  845

seq1  GTTTTTAAAATCCAGACCCAGAGTGACACACCTATTCTCACAAGACCATA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAAAATCCAGACCCAGAGTGACACACCTATTCTCACAAGACCATA  895

seq1  CCTCCAAATAGTATGATTCCCTGGGTTAAGTATATTCAAACTATGACAAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAAATAGTATGATTCCCTGGGTTAAGTATATTCAAACTATGACAAT  945

seq1  GATAAAATGATATATAACTGTCTAAGATTCAGCATTTTAACAAAAGTATA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAATGATATATAACTGTCTAAGATTCAGCATTTTAACAAAAGTATA  995

seq1  AACTTAATGAGGAAAGAAAAGAAGACGAGCATTTAATAGGTATAAGTGGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAATGAGGAAAGAAAAGAAGACGAGCATTTAATAGGTATAAGTGGC  1045

seq1  AAGTGGGGAGGAACAGATACCAAAGTTTTACACCTATCCTTCAGTGCACT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGGGAGGAACAGATACCAAAGTTTTACACCTATCCTTCAGTGCACT  1095

seq1  GAATTATAGTTTATGAATTC  1118
      ||||||||||||||||||||
seq2  GAATTATAGTTTATGAATTC  1115

seq1: chr8_61162912_61163983
seq2: B6Ng01-152H23.g_66_1131

seq1  GAATTCAATTTCACTGTGTCCATTTTCCTCTGGGCTTAATGAAATTTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATTTCACTGTGTCCATTTTCCTCTGGGCTTAATGAAATTTGGG  50

seq1  TGGGCTAGAATTCAATTTAATATCTGCTCATGAAAAAAACCAAGGAGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTAGAATTCAATTTAATATCTGCTCATGAAAAAAACCAAGGAGCAA  100

seq1  CCTGGGAAGGACGTGTGTGGCAGCAGTGCTGTGTTCACACAACGTGTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGAAGGACGTGTGTGGCAGCAGTGCTGTGTTCACACAACGTGTCCA  150

seq1  CACTGAGGTCCTGCTAGTAAGATTGTTTAGAGGAGGTGCTCTGGCTGCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAGGTCCTGCTAGTAAGATTGTTTAGAGGAGGTGCTCTGGCTGCCA  200

seq1  CCACTCCTCAGAGTAACAGCTCATACAAAACAACCAGCATGCAAGGGCTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCTCAGAGTAACAGCTCATACAAAACAACCAGCATGCAAGGGCTT  250

seq1  TACTTTCATTGTCCAGTTGACTAAGTCAGCTTCAGATTAGCTCTGCTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTTCATTGTCCAGTTGACTAAGTCAGCTTCAGATTAGCTCTGCTGTC  300

seq1  TTCTCAATCTTTTAATTAGGTGTAGGATCAGAGACAAAACCAGATATAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAATCTTTTAATTAGGTGTAGGATCAGAGACAAAACCAGATATAAT  350

seq1  TGGATTTCTAGACAGAAACTACAATCTCTAGTCTCAATTTAAGGAAAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTTCTAGACAGAAACTACAATCTCTAGTCTCAATTTAAGGAAAAAA  400

seq1  TCCTATTCTGATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATTCTGATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTG  450

seq1  GTATGAGTCACATGCATTGAAATTGAATTTTTTCCTCTTCCCTATAATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAGTCACATGCATTGAAATTGAATTTTTTCCTCTTCCCTATAATGC  500

seq1  CCTATAATCGTCTGGGAAGAAGTTGCATTTACTCTAATAAAAACTGTTGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATAATCGTCTGGGAAGAAGTTGCATTTACTCTAATAAAAACTGTTGG  550

seq1  AAAGAGAGGGGGTGGCAACAAAGGGACATTTGAGCATCATGGCAGAATTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGAGGGGGTGGCAACAAAGGGACATTTGAGCATCATGGCAGAATTC  600

seq1  AACTTGAGGGATGGATTTATTTTGGTCTCTGGCTTCTATGGGTCACAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTGAGGGATGGATTTATTTTGGTCTCTGGCTTCTATGGGTCACAGTC  650

seq1  TGATATGCCAGAAATGGCATTTAGGAGTGGGTCAAGGAGATGGTTGGTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATATGCCAGAAATGGCATTTAGGAGTGGGTCAAGGAGATGGTTGGTTC  700

seq1  ACATCTTCACAATGTAAGCATAGACAGCTGGCCAGAGATAGCACGCACAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTCACAATGTAAGCATAGACAGCTGGCCAGAGATAGCACGCACAA  750

seq1  AGGGACAAGTCCCACCCCTTATACTTGTTTCTGCAAAGGATGCTGCACAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACAAGTCCCACCCCTTATACTTGTTTCTGCAAAGGATGCTGCACAT  800

seq1  CATAAATATCCTCTATGTTGAGAAGAGGTGAGGACTGAGTGTTCAAAATT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CATAAATATCCTCTATGTTGAGAAGAGGTGAGGACTGAGTGTTC-AAATT  849

seq1  GATGAATATGGTAGGTATTACATGGTCCATCCATAATATCCACCTTGCTT  900
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAATATGGTA-GTATTACATGGTCCATCCATAATATCCACCTTGCTT  898

seq1  AGAGAAGCTTTAGTGTAACTTGTTCCTTATTC-TGAATTTCTTGCCTACA  949
      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGCTTTAGTGT-ACTTGTTCCTTATTCTTGAATTTCTTGCCTACA  947

seq1  CTTGAAAGAGAAACACACCTGCAATGAGCTTTGGCCACTCAGTATAGTGA  999
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAAGAGAAACACA-CTGCAATGAGCTTTGGCCACTCAGTATAGTGA  996

seq1  TACCTAGTTGTTTTGTTTGTTTTCTCTGTTTTAGAGAGCCCTTCAGAAAC  1049
      | ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||
seq2  TTCCTAG-TGTTTTG-TTGTTTTCTCTGCTTT-GAGAGTCCTTCA-AAAC  1042

seq1  AGGCACTGGTATAGCATA-CATAA  1072
      | |||||||||||||||| |||||
seq2  AAGCACTGGTATAGCATATCATAA  1066